肝脏缺血再灌注损伤的ceRNA网络构建和潜在治疗药物筛选

背景与目的 肝脏缺血-再灌注（I/R）损伤是肝移植和肝切除手术过程中常涉及的共同病理生理变化。竞争性内源性RNA（ceRNA）调控网络可参与多种疾病的发生发展。然而ceRNA网络在肝脏I/R损伤中的功能仅有少量报道。本研究旨在应用生物信息学方法构建与肝脏I/R损伤相关的ceRNA网络,同时基于差异表达基因筛选潜在治疗药物。方法 从GEO数据库获取肝脏I/R损伤的mRNA及miRNA表达芯片数据。使用R语言中的limma包进行基因差异表达分析,并使用ggplot2包进行散点图、火山图和热图绘制。使用String数据库及Cytoscape软件进行蛋白互作（PPI）网络构建。利用Metascape数据库对筛选出的差异mRNA进行GO/KEGG功能富集分析。通过转录调控网络数据库分析可能调控这些差异基因的转录因子。使用miRTarBase数据库构建miRNA-差异表达基因网络。通过starBase：ceRNA数据库构建ceRNA网络。使用比较毒物基因组学数据库（CTD）筛选对关键差异基因表达具有潜在作用的天然药物。结果 从GEO数据库获得2个肝脏I/R损伤mRNA数据集（GSE10654和GSE117066）和1个肝脏I/R损伤miRNA数据集（GSE72315）。通过limma包及Venn图分析mRNA表达数据集,筛选到16个在I/R组上调表达,在缺血后适应（IPO）组下调表达的基因;7个在I/R组下调表达,在IPO组上调表达的基因。GO/KEGG功能富集分析结果显示差异基因主要参细胞死亡的正调控及对细胞外刺激反应的生物学过程,并参与MAPK信号通路。转录调控网络数据库分析获得6个转录因子（Trp53、Cebpb、Crebbp、Fos、Nfkb1及SP1）可能参与这些差异基因的调控。通过miRTarBase数据库分析,并结合GSE72315数据集中miRNA在I/R损伤后的差异表达,获得两个可能在肝脏I/R损伤中发挥重要的作用miRNA-mRNA轴（mmu-miR-32-5p-Btg2与mmu-miR-9-5p-Mt2）。通过starBase：ceRNA数据库分析,最终获得9条ceRNA网络,分别是：XIST/MEG8/LINC00963/MALAT1-miR-32-5p-Btg2轴、XIST/NEAT1-miR-132-3p-Btg2轴及HSPA9P1/RALGAPA1P1/RPS26P39-miR-9-5p-Dusp6轴。CTD数据库筛选到7种植物药（槲皮素、白藜芦醇、染料木黄酮、香豆雌酚、姜黄素、辣椒素及东莨菪碱）可降低关键基因的表达发挥潜在治疗作用。结论 通过生物信息学方法筛选了肝脏I/R损伤过程中的关键ceRNA网络及治疗的潜在天然药物,为进一步研究肝脏I/R损伤的发病机制及治疗药物提供重要依据。     

速度向量成像技术评价维持性血液透析患者颈动脉弹性的应用价值

背景 维持性血液透析(maintenance?hemodialysis,MHD)是终末期肾衰竭(end?stage?renal?disease,ESRD)患者最主要的治疗方式.而心血管疾病是维持性血液透析患者的主要死亡原因,与动脉粥样硬化关系密切.早期发现和防治动脉粥样硬化具有重要的临床意义.目的 探讨速度向量成像技术...     

ACR TI-RADS分类在初学者中的诊断准确性与可重复性

目的 评估初学者运用ACR TI-RADS分类的诊断准确性和可重复性.方法 收集2018年7月～2020年1月在我院行甲状腺超声检查(有完整、合格的影像学资料)、超声引导下甲状腺细针抽吸活检(FNA)细胞学检查并经手术后病理证实的甲状腺结节,通过符合要求的影像学资料对初学者进行循环式的测试-训练-再测试,记录并比较各个...     

ACR TI-RADS分类中各超声特征对甲状腺恶性结节的诊断效能

目的 探讨2017年美国放射学会甲状腺影像报告和数据系统(ACR TI-RADS)中各超声特征在甲状腺恶性结节中的诊断效能.方法 回顾性分析2018年6月～2020年5月我院诊断为甲状腺结节患者的临床资料.1004个结节均于超声检查后接受FNA细胞学检查或外科手术治疗确诊.用ACR TI-RADS方法对上述结节进行分类...     

极速脉搏波成像技术评估中年志愿者颈动脉弹性与心血管疾病风险的相关性研究

目的 应用极速脉搏波技术评估中年志愿者颈动脉弹性，分析其与心血管疾病风险的关系。方法 选取2020年1月至2021年11月我院招募的273例中年志愿者为研究对象，应用极速脉搏波技术测量颈动脉收缩起始脉搏波速度(PWV-BS)、收缩末期脉搏波速度(PWV-ES),采用China-PAR模型评估10年内发生动脉粥样硬化性心血管病危险度并分为低危组(n=214)和中危组(n=59)。结果 低危组和中危组间IMT、PWV-BS、PWV-ES存在明显差异(P<0.05),使用Pearson相关性分析PWV-BS、PWV-ES与China-PAR模型评估的危险度显著相关(r=0.621、0.727,P均<0.001),IMT呈弱相关(r=0.405,P<0.001)。多元逐步回归分析结果提示低危组中与PWV-BS呈明显正相关的是舒张压、腰围、LDL-C、年龄、收缩压(P均<0.05),中危组中与PWV-BS呈明显正相关的是舒张压、腰围、ALT(P均<0.05);低危组中与PWV-ES呈明显正相关的是舒张压、LDL-C、收缩压、年龄(P均<0.05),呈明显负相关...