宏基因组二代测序技术在儿童细菌性脑膜炎病原诊断中的价值北大核心CSCD

目的:探讨宏基因组二代测序技术在儿童细菌性脑膜炎病原诊断中的应用价值。方法:回顾性分析2019年1月1日至2020年12月31日复旦大学附属儿科医院住院诊断为“细菌性脑膜炎”或“化脓性脑膜炎”或“中枢神经系统感染”的189例患儿的病原学检测结果。分别采用培养和宏基因二代测序检测方法检测细菌性脑膜炎患儿的脑脊液,分析2种检测方法病原检出率的差异。根据就诊时患儿年龄分为新生儿组(≤28日龄)和非新生儿组(>28日龄),采用χ^(2)检验进行组间比较。以脑脊液培养为金标准,分析宏基因组二代测序技术在儿童细菌性脑膜炎诊断中的灵敏度和特异度。结果:189例细菌性脑膜炎患儿中男116例、女73例。血和(或)脑脊液培养共检出76株病原菌,其中革兰阳性菌50株(65.8%),检出率较高的致病菌有无乳链球菌18株(23.7%)、大肠埃希菌17株(22.4%)、肺炎链球菌15株(19.7%)。非新生儿组革兰阳性菌感染率高于新生儿组[76.0%(38/50)比50.0%(13/26),χ^(2)=5.24,P=0.020]。48例患儿脑脊液同时送检宏基因二代测序检测和培养,宏基因二代测序检测的病原检出率高于培养方法[20例(41.7%)比12例(25.0%),χ^(2)=16.45,P<0.001]。脑脊液宏基因二代测序和培养检测结果的一致性为79.2%(38/48),其中同时阳性的11例患儿均检出同一种病原菌。以脑脊液培养结果为金标准,宏基因组二代测序技术在细菌性脑膜炎的诊断中的灵敏度为91.7%,特异度为75.0%。结论:宏基因组二代测序技术可提高儿童细菌性脑膜炎的病原检出率,且与脑脊液培养检出结果一致性较高。在诊断细菌性脑膜炎时,尤其在疑似诊断患儿中传统病原学无法明确病原时应尽早完善宏基因二代测序检测。     

2000~2004京沪穗渝5家儿童医院革兰阳性球菌耐药情况分析

[摘要]探讨我国不同地区儿科主要革兰阳性球菌耐药的情况。方法 对五家儿童专科医院从2000年1月1日至2004年12月31日内检验科送检标本分离出的四种革兰阳性球菌(共计8215株)进行Kirby-Bauer琼脂扩散法进行抗生素敏感试验，并按照每年NCCLS标准进行判读，并计算出所测细菌对抗菌药物的耐药率（R%＋I%）和敏感率（S%）。 结果 从感染患儿中分离出4004株金黄色葡萄球菌，甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌（MRSA）的检出率为7.15%，红霉素总耐药率为61.96%,并且有逐年上升的趋势，4004株金葡菌中未发现对万古霉素耐药或中介的金葡菌；肺炎链球菌共2402株，青霉素不敏感肺炎链球菌（PNSP）的检出率为63.42%，红霉素耐药率为86.22%，两者耐药率均在上升；β溶血性链球菌共432株，对青霉素全部敏感，对红霉素的耐药率为68.47%，且耐药率在逐年增加；肠球菌共1377株，对万古霉素的中度敏感率为2.73%，对氨苄西林的耐药率为51.91%，对红霉素的耐药率高达88.10%。 结论 除了β溶血性链球菌之外，多数G＋细菌对广谱青霉素的耐药率都偏高；G＋细菌对万古霉素和环丙沙星的敏感率较高,但对红霉素的耐药率居高不下并有逐年上升的趋势。MRSA及仍在较低水平，在本研究中没有发现VRSA及VISA，但是仍然要加强各地对革兰阳性球菌耐药性和抗生素使用情况的监测,合理使用抗生素。     

气泡式管理策略在儿童定点医院新型冠状病毒变异株院内感染防控中的效果观察

目的 研究奥密克戎变异株流行期间气泡式管理策略应用于儿童定点医院新冠门急诊及新冠病房内人群的实施效果。方法 前瞻性观察2022年3月1日—5月31日在复旦大学附属儿科医院新冠门急诊和新冠病房内接受诊治的儿童和工作人员,调查其在气泡管理策略下奥密克戎变异株院内感染的发生情况。结果 共纳入763名患儿（其中确诊新型冠状病毒感染患儿432例）和98名工作人员。观察期内医院感染发生率和工作人员职业暴露发生率均为0。结论 气泡式管理在奥密克戎变异株流行期间用于儿童定点医院对高风险区域的管控是一种可行、有效的策略。     

2009年上海地区细菌耐药性监测

Soriano A,Marco F,Martinez JA,et al.Influence of vancomycin minimum inhibitory concentration on the treatment of methicillin-resistant Staphylococcus aureus bacteremia[J].Clin Infect Dis,2008,46(2):193-200.

Sun W,Chen H,Liu Y,et al,Prevalence and characterization of heterogeneous vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus isolates from 14 cities in China?[J].Antimicrob Agents Chemother,2009,53(9):3642-3649.

Clinical and Laboratory Standads Institute.Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing[S].Eighth Informational Supplement,1998,M100-S8.

Clinical and Laboratory Standads Institute.Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing[S].Sixteenth Informational Supplement,2006,M100-S16.

Lahey Clinic.Amino acid sequences for TEM,SHV and OXA extended-spectrum and inhibitor-resistant β-lactamases[EB/OL].URL:http://www.lahey.org/studies/webt.asp.

Clinical and Laboratory Standads Institute.Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing[S].Twentieth Informational Supplement,2010,M100-S20.

沈继录,朱德妹,吴卫红,等.革兰阴性杆菌碳青霉烯酶产生与细菌耐药性关系的研究[J].中华检验医学杂志,2008,31(4):408-414.

Clinical and Laboratory Standads Institute.Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing[S].Twentieth Informational Supplement(June 2010 Update),2010,M100-S20-U.

>>更多...     

儿科产超广谱β内酰胺酶大肠埃希菌耐药的流行特征分析

目的 研究我国4个地区儿科产超广谱β内酰胺酶(ESBL)大肠埃希菌的耐药流行特征,为临床儿科其致病菌感染治疗提供参考.方法 2005-2006年4个地区5家儿童专科医院临床分离大肠埃希菌5127株,酶抑制剂增强试验初筛及确证产ESBL,琼脂稀释法测定349株产ESBL大肠埃希菌对9种儿科常用抗生素最小抑菌浓度(MIC).结果 判断标准根据美国临床标准化委员会2005年版执行.结果 5127株大肠埃希菌产ESBL率为46.7%.349株产ESBL大肠埃希菌对阿莫西彬克拉维酸耐药率为23.1%,中介率为38.5%;头孢噻肟、头孢他啶、头孢吡肟耐药率分别为67.2%、24.5%和48.4%,中介率分别为26.4%、5.7%和19.1%;阿米卡星耐药率为5.4%,未检出亚胺培南耐药株.分离株对阿莫西林/克拉维酸、头孢吡肟、环丙沙星及庆大霉素耐药性存在地区差异.结论 ESBL在中国儿科临床分离大肠埃希菌中广泛流行,除亚胺培南、阿米卡星外,产ESBL大肠埃希菌对β内酰胺类药物耐药现象严重,部分药物耐药性存在地区差异.     

氯化高铁血红素诱导血红蛋白合成的作用机制

氯化主铁血红素（Ｈｅｍｉｎ，Ｈｍ）通过对红系特异性转录因子（ＮＦ－Ｅ２）、铁效应性元件连接蛋白（ＩＲＥ－ＢＰ）、血红素调节性翻译抑制因子以及钙调蛋白依赖性蛋白激酶等反式作用元件活性的调节，增加红系特异性血红素合成所需酶的基因（σ－氨基γ酮戊酸合成酶及亚铁螯合酶基因）以及γ、β珠蛋白基因的表达。Ｈｍ还可通过增加红系细胞ＥＰＯ受体ｍＲＮＡ的表达，来提高诱导细胞对ＥＰＯ的敏感性。     

儿童ICU患儿感染脑膜败血伊丽莎白菌与肠杆菌科病原菌的临床特征及耐药性分析

目的探讨儿童重症监护病房(ICU)内血流及下呼吸道脑膜败血伊丽莎白菌(Elizabethkingia meningoseptica,EME)与肠杆菌科细菌感染/定植患者的临床特征并分析病原菌耐药性,为临床合理使用抗菌药物提供依据。方法回顾性分析医院2016年1月-12月ICU患者1595例,分析血流及下呼吸道检出的EME与肠杆菌科细菌感染/定植患者临床特征并检测病原菌耐药性。结果医院共收治ICU患者1595例,血流及下呼吸道共分离到52株EME,其中医院感染16例,定植36例,共分离到肠杆菌科细菌28株,其中医院感染13例,定植15例;EME血流及下呼吸道医院感染定植率(3.26%)高于肠杆菌科细菌(1.76%)(P0.05);EME感染患儿气管插管比例高于肠杆菌科细菌(P0.05);EME对包括头孢类、碳青霉烯类等多种抗菌药物表现出耐药。结论 EME血流及下呼吸道医院感染/定植率高于肠杆菌科细菌,且耐药形势更加严峻。     

新生儿重症监护病房多重耐药鲍曼不动杆菌β-内酰胺酶的基因型

目的 了解新生儿重症监护病房内多重耐药鲍曼不动杆菌耐药性及其β-内酰胺酶基因携带情况.为控制医院感染及合理用药提供依据.方法 收集本院新生儿重症监护病房分离出的26株多重耐药鲍曼不动杆菌,采用琼脂稀释法检测其对抗菌药物的最低抑菌浓度,聚合酶链反应技术检测多重耐药鲍曼不动杆菌菌株β-内酰胺酶基因携带情况.结果 26株多重耐药鲍曼不动杆菌临床分离菌株对头孢他啶、头孢西丁、哌拉西林一他唑巴坦及环丙沙星耐药率100.0%,对其余抗菌药物耐药率为80.8%～96.2%.26株测试菌株中oxa-51均为阳性,20株(77%)oxa-23阳性,14株(54%)ampC阳性,11株(42%)oxa-23和ampC同时阳性.未检出携带oxa-24、oxa-58、imp-1、imp-4和vim-2基因的菌株.结论 鲍曼不动杆菌的耐药性严重,oxa-23和ampC是本院新生儿重症监护病房内多重耐药鲍曼不动杆菌携带的主要β-内酰胺酶基因.

Abstract：

Objective To investigate the correlation between drug resistance and β-actamase genes of multi-drug resistance Acinetobacter baumannii (MDR-AB) in neonatal intensive care unit to provide evidence for rational antibiotics administration and nosocomial infection control.Methods Twenty-six MDR-AB strains were separated and collected from clinical specimens.The minimum inhibitory concentrations of 13 antimicrobial agents were determined by agar dilution method.Genotypes of β-lactamase were detected by polymerase chain reaction.Results The resistant rates of the 26 strains to Ceftazidime,Cefoxitin,Piperacillin-tazobactam and Ciprofloxacin were 100.0%.About 80.8% to 96.2% of these strains were resistant to the other antimicrobial drugs.Among the 26 MDR-AB strains,100% (26/26) strains possessed oxa-51,77% (20/26) possessed oxa-23 gene,54% (14/26) carried arnpC gene,both oxa-23 and ampC were identified in 42% (11/26) strains,while oxa-24,oxa-58,imp-1,imp-4 and vim-2 gene were not identified.Conclusions The drug resistance of Acinetobacter baumannii is serious,oxa-23 and ampC are the major plactamase genes carried by MDR-AB in neonatal intensive care unit.     

��ͯ���ɫ���������Ⱦ�������²��������ؿ��ƶ��Ŵ�Ԫ���о�

目的研究儿童金黄色葡萄球菌(金葡菌)感染分离株中致病基因和相关可移动遗传元件的流行。方法对2005年6月至2009年7月于北京、上海等国内8家医院收集到的109株金葡菌,通过聚合酶气边反应(PCR)方法检测19种超抗原基因、2种剥脱毒素基因和3种黏附基因,并比较致病基因在不同感染菌株中的分布。结果 60株金葡菌分离自肺炎患儿,49株分离自皮肤软组织感染患儿。90.8%的菌株携带超抗原基因,最常见的超抗原基因为sek(57.8%),seq(57.8%),其次为seb(45.9%),sea(40.4%)。未检测到sed和etd。发现了37种超抗原基因型,最常见的为seb-sek-seq(20.2%),78.4%的超抗原基因型可被认为是携带超抗原基因的可移动遗传元件组合。有12株菌携带sek-seq,但不携带seb,另有1株菌携带seb-seq但不携带sek,有1株携带seb-sek但不携带seq。在tst-1阳性的菌株中,有10株同时携带seb基因。在sej阳性的菌株中,有4株同时携带ser基因。3种黏附基因bbp、sdrE、cna分别存在于91.7%、77.1%、30.3%的菌株中。seb,seq,bbp,sd...     

2011年中国CHINET细菌耐药性监测

目的了解国内主要地区临床分离菌对常用抗菌药的敏感性和耐药性。方法国内主要地区15所教学医院(13所综合性医院、2所儿童医院)临床分离菌采用纸片扩散法或自动化仪器法按统一方案进行细菌药敏试验。按CLSI 2011年版判断结果。结果 2011年1 12月收集各医院临床分离菌共59 287株,其中革兰阳性菌16 872株,占28.5%,革兰阴性菌42 415株,占71.5%。金葡菌(SA)和凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)中甲氧西林耐药株的检出率平均分别为50.6%和74.6%。甲氧西林耐药株对β内酰胺类抗生素和其他测试药的耐药率显著高于甲氧西林敏感株。MRSA中有73.3%的菌株对甲氧苄啶磺胺甲噁唑敏感;MRCNS中有88.2%的菌株对利福平敏感。未发现万古霉素、替考拉宁和利奈唑胺耐药株。肠球菌属细菌中粪肠球菌对所测试的抗菌药(氯霉素除外)的耐药率均显著低于屎肠球菌,两者中均有少数万古霉素耐药株,根据表型推测多数为VanA型耐药。肺炎链球菌非脑膜炎株成人株和儿童株中PSSP所占比例较2010年均略有升高,PRSP的检出率均有所下降。大肠埃希菌、克雷伯菌属细菌(肺炎克雷伯菌和产酸克雷伯菌)和奇异变形杆菌中产ESBLs株分别平均为50.7%、38.5%和13.8%。肠杆菌科细菌中产ESBLs株对测试药物的耐药率均比非产ESBLs株高。肠杆菌科细菌对碳青霉烯类抗生素仍高度敏感,总耐药率4%～6%。不动杆菌属细菌(鲍曼不动杆菌占88.6%)对亚胺培南和美罗培南的耐药率分别为60.4%和61.4%。肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌中仍有少数泛耐药株。结论细菌耐药性仍呈增长趋势,多重耐药和泛耐药菌株在某些科室内的流行播散对临床构成严重威胁,应进行流行病学调查并采取有效的控制措施。