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51.
目的探讨与前列腺癌发生进展有关的核心基因及其调控网络。方法获取2018年11月1日至2018年12月31日在癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载的495例前列腺癌和52例对照样本的基因表达数据、498例前列腺癌和50例对照样本的甲基化芯片数据、494例前列腺癌和52例对照样本的miRNA表达谱数据, 核对及更新于2020年12月1日至2020年12月30日, 整合NCBI-gene和OMIM上的前列腺癌相关基因, 构建前列腺癌致病基因表达谱矩阵, 包括编码蛋白基因、非编码基因及甲基化基因, 并进行差异分析、共表达网络及pivot分析。结果共筛选出1 083个差异表达的蛋白编码基因, 筛选出149个差异lncRNA。挖掘到9个模块, 与前列腺癌最相关的模块是棕色和青绿色模块(均P<0.001)。青绿色模块可以将样本分成两个聚类, 两个聚类中的前列腺癌样本数比较, 差异有统计学意义(163例vs. 332例, P<0.05)。富集分析发现青绿色模块基因与细胞黏附、细胞迁移等生物学过程有关, 这些基因参与了转化生长因子-β(TGF-β)、过氧化物酶体增殖剂激活受体(PPAR)信号...  相似文献   
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