泛太平洋西岸地区部分H5N1亚型禽流感病毒毒株血凝素基因特性的研究

目的了解泛太平洋西岸各个国家H5N1亚型人禽流感病毒血凝素(HA)基因分子特征,寻求HA基因变异规律。方法从Genebank中下载泛太平洋西岸国家或地区(包括泰国、越南、香港、印度尼西亚、中国大陆、蒙古、俄罗斯)50株H5N1亚型高致病性流感病毒(HAPI)毒株血凝素基因序列,利用生物信息学软件DNASTAR5.0进行核酸同源性分析,用MEGA3.1进行核酸和氨基酸序列比对和进化树分析。结果50株高致病性H5N1亚型流感病毒毒株可以分成3个相对独立的进化簇。第1簇为泰国越南簇;第2簇为中国印尼北亚簇(包含中国、印度尼西亚、蒙古以及俄罗斯);第3簇主要为1996~2001年期间分离的毒株,该簇毒株HA基因与Gs/Gdlike毒株核酸同源性更为接近,其基因亚型更多表现为Gs/Gdlike或其他基因亚型。HA基因分子特征分析表明在HA蛋白抗原性上,泰国越南分离株表现基本一致,而其他地域分离株存在表现各异,但也存在地域的一致性。结论泛太平洋西岸地区分离的H5N1亚型禽流感病毒血凝素蛋白在分子特征上表现出一定的地域特异性,在一定地域范围内保持一致性。     

深圳市SARS临床诊断病例血清学及病原学实验研究

严重急性呼吸综合症（severe acute respiratory syndrome,SARS）是一种新的急性呼吸道传染病.该病于2002年11月16日最早发现于广东省佛山市,随后广东多个城市均出现SARS病例.广东省共发生SARS病例1 511例,死亡58例.我国共发生SARS病例5 326例,死亡346例.全世界共32个国家和地区出现SARS病例8454例,死亡792例.2003年2月下旬,香港、德国和美国的实验室通过病毒分离培养、电镜、RT-PCR检测和免疫荧光抗体检测,发现一种新型的冠状病毒（又称SARS病毒,SARS-Cov）,是导致SARS的病原体.     

深圳经济特区国家城市饮用水监测网络水质分析

目的了解深圳特区城市生活饮用水出厂水水质卫生状况。方法选取深圳特区内10家市政水厂,于2008-2009年丰水期和枯水期分别采集市政供水水厂出厂水水样40份。水样的采集和检验按照GB/T5750.2-2006《生活饮用水标准检验方法——水样的采集与保存》进行,检测结果按照GB5749-2006《生活饮用水卫生标准》进行评价。结果出厂水水样合格率为85.0%(34/40)。在检测的66项指标中,部分水厂出厂水存在浑浊度、铝、三卤甲烷和二氧化氯不合格情况。经Spearman相关分析,铝与浑浊度呈正相关(r=0.518,P<0.01)。结论深圳市集中式供水出厂水水质良好。     

深圳市HFRS疫源地鼠携带汉坦病毒与人感染汉坦病毒的基因特征对应性研究

目的 了解深圳市肾综合征出血热(HFRS)疫源地鼠携带汉坦病毒与人感染汉坦病毒二者的病原学特征及联系,为HFRS的防控提供科学依据.方法 收集疑似HFRS病人急性期血清标本,并在相同区域开展笼日法捕鼠,无菌取鼠肺.分别采用ELISA和直接免疫荧光法筛选阳性标本,选择代表性血清标本以及鼠肺标本进行逆转录-套式聚合酶链反应(RT-nested PCR)扩增部分M和S片段及核苷酸序列测定,与国内外的汉坦病毒毒株一起进行同源性比对和系统进化树分析.结果 472份鼠肺经直接免疫荧光检测共获得阳性鼠肺47份,带毒率为9.96%.对60份IgM抗体阳性的血液标本进行RT-nested PCR扩增,检出12份阳性,阳性率为20%.从代表性的8份鼠肺和8份病人血清中提取的标本二者之间M片段核苷酸序列的同源性高达95%以上,S片段之间的同源性高达96.5%以上.其推导的氨基酸序列同源性分别为98.0%～100%、98.4%～100%.深圳市HFRS疫源地鼠携带的汉坦病毒和人感染汉坦病毒均为汉城型S2亚型.结论 深圳市流行的汉坦病毒为SEO型S2亚型.无论是同一地区的鼠和人之间,还是不同地区的鼠和人之间,汉坦病毒都是具有较高的同源性.     

深圳市2005-2007年H3N2亚型流行性感冒病毒流行病学和分子变异特征

Objective To determine the epideroiological characteristics of seasonal influenza in Shenzhen from 2005 to 2007 and the molecular variation of HA1 domain of influenza H3N2 viruses. Methods The consultation rate for influenza-like illness (ILI) were calculated weekly for indicating the influenza activities(the Shenzhen Influenza Surveillance System mainly consisted of 16 institutions with 9 hospitals,6 districts and one municipal centers of disease control and prevention). Pharyngeal swabs from the cases of ILI, which were collected during 2005 to 2007 from the city-wide and quality-controlled surveillance network, were used to propagate the viruses. The HA1 region of the influenza A/H3N2 viruses were detected by RT-PCR and sequenced subsequently. The analyses of pairwise amino acid variations, genetic clustering and phylogeneties was performed. Results The activity levels of influenza showed certain changes during each year from 2005 to 2007,and there were summer peaks from May to July in 2006 and 2007. The positive rates of influenza virus were 4.78% (114/2385),5.77% (212/3674) and 12.12% (343/2831) from 2005 to 2007 respectively. The weekly isolating rates changed accordantly with the trend of the percentages of ILI. The proportions of influenza H3N2 virus were 25.46% (28/114) and 2. 83% (6/212) in 2005 and in 2006 respectively,but the proportion increased to 62. 68% (215/343), which indicated that H3N2 virus became the predominant strain in 2007. Phylogenetic clustering analysis of influenza H3 N2 virus revealed that there were 5 elades. The viruses which were isolated in 2005 contained in the clade Ⅰ and Ⅱ,the viruses in 2006 were comprised in clade Ⅲ, and clade Ⅳ and Ⅴ included the viruses isolated in 2007. Although the stem of cladogram developed with one accord of the time isolated viruses, the viruses which were similar to vaccine strains had circulated in Shenzhen before a given strain was determined as vaccine strain by WHO. It was also noticed that more amino acid changes at antigenic sites,especially at sites A and B in the H3N2 viruses,were found in 2007 than that in 2005 and in 2006. But the sequences at the receptor-binding sites and disulphide bond sites were conserved and no new circulating strain for genetic reassortment had been found in the period. Conclusion Shenzhen might be one of areas where the ongoing genetic drift of influenza H3N2 viruses appeared earlier in China. The changes of influenza H3N2 virus showed the active status in the population. The results suggested that monitoring seasonal influenza viruses by sequence analysis could provide important and timely information on the appearance of strains with epidemiologic significance.     

荧光定量RT-PCR快速检测N_2亚型流感病毒的研究

目的利用荧光定量RT-PCR技术建立快速检测甲型流感病毒N2亚型的方法。方法根据N2亚型流感病毒HA基因的相对保守序列,分别设计一对引物及其相应的Taqman探针,利用一步法RT-PCR试剂盒建立、优化反应体系后,采用十倍稀释法检验建立体系的灵敏度并建立相对定量标准曲线;采用N1亚型毒株核酸进行方法特异性检验并对临床疑似流感样病例样本进行检测。结果N2亚型流感病毒的检测灵敏度为2.56×10-6,扩增效率为99.9%,标准曲线r=0.997,特异性为100%。临床ILI样本检测结果与HAI鉴定结果相符。结论本研究建立的荧光定量RT-PCR技术可以快速、准确的检测N2亚型流感病毒。     

深圳市市政供水出厂水水质卫生状况分析

目的 了解深圳市生活饮用水水质的卫生状况.方法 选取该市特区内全部市政供水水厂和宝安区、龙岗区主要的市政供水水厂共35家,予2008年5月采集市政供水水厂出厂水水样.水样的采集和检验按照GB/T 5750-2006<生活饮用水标准检验方法>进行.检测结果按照GB 5749-2006<生活饮用水卫生标准>进行评价.结果 市政供水出厂水水样合格率为82.9%(29/35).在检测的106项指标中,部分水厂出厂水存在浑浊度、铝、锰和余氯不合格情况.经Spearman相关分析,铝与浑浊度呈正相关,差异有统计学意义(r=0.417,P＜0.05);菌落总数与游离余氯含量呈负相关,差异有统计学意义(r=0.481,P＜0.05).结论 深圳市市政供水出厂水水质良好.     

季节性流感监测中病毒分子变异分析的意义

目的探讨季节性流感监测的同时,针对人群中循环的优势毒株开展基因变异分析的意义。方法以2007年深圳市流感监测系统累积的数据为基础,按周分析不同监测医院流感样病例占门诊和急诊就诊者的比例,并对病毒型别进行常规分离鉴定,对优势毒株扩增HA1区基因片段,并进行基因变异分析。结果深圳市流感样病例2007年流感样病例（ILI）比例为6．67％,以低年龄为高发人群;按市、区医院和社区健康服务中心等分别分析,ILI的比例按周分布一致,呈现明显的夏季高峰,最活跃季节在5～7月;ILI暴发疫情比散发病例提早2周出现。流感病毒分离率为11．63％,优势株为H3N2亚型（占59．5％）,B型次之（占37．0％）。H3N2亚型流感病毒HA1基因进化分析分成两支,WHO当年疫苗株和我国代表株仅与1～4月毒株接近,而与5月之后分离株产生了遗传距离,虽然还不能确定新的变异株出现,但提示A／sz／9／2007和A／sz122／2007两个分离株值得高度关注。B型流感病毒HAl基因进化分析发现,2007年以Yamagata系最活跃。结论季节性流感监测中开展病毒分子变异分析,可以进一步查明人群中所发生的优势毒株的特性,便于流行病学综合分析。     

应用加权TOPSIS法与秩和比法评价深圳市区级疾病预防控制中心业务工作质量

目的探讨加权TOPSIS法和秩和比法在疾病预防控制工作质量评价中的应用范围和实际意义。方法应用加权TOPSIS法和秩和比法评价深圳市7个区疾病预防控制中心2009年的年度业务考核结果。结果 7个区级疾病预防控制中心在"疾病预防与控制"、"实验室建设与管理"、"信息管理"和"健康教育"方面工作完成情况较好,平均得分率较高均在90.0%以上。应用加权TOPSIS法和秩和比法,7个区工作质量排序依次为BA、NS、LG、FT、LH、YT和GM,工作质量分档:BA、NS工作质量为"优,"LG、FT和LH为"良,"YT和GM为中。结论加权TOPSIS法结合秩和比法提高了综合评价能力,操作简便,结果可靠,适合在疾病预防控制工作质量评价中推广应用。