深圳市某福利院一起急性结膜炎疫情的病原学分析

目的 鉴定深圳市某福利院一起急性结膜炎疫情的病原体.方法 采用荧光定量PCR方法对12份眼拭子标本进行检测以确定病原,阳性标本进行病毒分离培养,扩增特异基因并测序,对序列进行进化分析和分子分型.结果 12份标本荧光定量PCR检测结果为人腺病毒阳性,分离9株病毒.人腺病毒Hexon基因测序显示9株腺病毒之间核苷酸相似性在98.3％-100％之间,系统进化分析显示9株腺病毒与人腺病毒7型参考株位于同一进化分支.结论 本起疫情由人腺病毒7型引起,与我国近期流行的腺病毒7型同源.     

荧光定量RT-PCR快速检测人副流感病毒3型的研究

[目的]利用荧光定量RT-PCR技术建立一种快速检测人副流感病毒3型的方法. [方法]根据人副流感病毒3型NP基因的相对保守序列分别设计一对引物及Taqman探针,建立、优化反应体系后,利用10倍稀释法检验方法的灵敏度并建立定量标准曲线;特异性检验后利用临床标本与传统的细胞培养法进行比较.[结果]人副流感病毒3型检测反应的灵敏度为0.016TCID50,标准曲线相关系数为1.00,扩增效率为89.8%,6种非人副流感病毒3型病原体检测均为阴性,说明此方法具有很高的准确性、稳定性和特异性. [结论]本研究建立荧光定量RT-PCR技术可以准确检测人副流感病毒3型,不仅灵敏度高、稳定性好,而且可以对病毒滴度进行定量检测.     

深圳市2005-2007年H1N1亚型流感病毒HA1基因分子流行病学研究

目的 探讨2005-2007年深圳市H1N1流感病毒HA1基因变异特征.方法 选取深圳市2005-2007年分离的H1N1流感毒株,提取病毒RNA,用RT-PCR扩增HA1区基因片段,产物纯化后测序并进行基因序列分析.结果 2005-2007年流感病毒分离率平均为7.16%,H1N1流感病毒在2005年和2006年的分离数占总分离数的比例分别为56.14%和66.03%,而2007年仅占3.61%.核苷酸同源性和基因进化树结果一致,2005年4月份之前分离株与A/New Caledonia/20/1999为同一分支,2005年5月份之后的分离株与A/Solomon Island/3/2006为一支,而2006-2007年分离株又与国家代表株A/GDLH/219/2006在一个分支.氨基酸序列分析显示,绝大多数的毒株均在第130位点缺失一个赖氨酸;2005年5月以后的大部分毒株出现以下氨基酸变异:T82K、Y94H、R146K、R209K、T267N,2006年5月份之后的毒株在抗原决定簇B区发生了A190T、H193Y、E195D氨基酸变异,同时也发生A区R146K的置换.但所有毒株的潜在糖基化和受体结合位点均比较保守.发现1株病毒A/SZ/68/2007具特殊性,经与参照毒株比较,其326个氨基酸中有50个发生变化,其中有11个位于抗原决定簇位点、6个位于受体结合位点,且有4个氨基酸变化导致糖基化位点丢失.结论 2005-2007年深圳市人群中至少有3个类型HA1基因不同的H1N1流感病毒株;由于氨基酸变异引起病毒发生抗原漂移,其代表株为A/GDLH/219/2006;发现的A/SZ/68/2007病毒毒株具有特殊性,其抗原特性和流行病学意义还有待探讨.     

深圳市2005—2007年H1N1亚型流感病毒HAl基因分子流行病学研究

目的 探讨2005-2007年深圳市H1N1流感病毒HA1基因变异特征。方法 选取深圳市2005-2007年分离的H1N1流感毒株，提取病毒RNA，用RT-PCR扩增HA1区基因片段，产物纯化后测序并进行基因序列分析。结果 2005-2007年流感病毒分离率平均为7.16%，H1N1流感病毒在2005年和2006年的分离数占总分离数的比例分别为56.14%和66.03%，而2007年仅占3.61%。核苷酸同源性和基因进化树结果一致，2005年4月份之前分离株与A/New Caledonia/20/1999为同一分支，2005年5月份之后的分离株与A/Solomon Island/3/2006为一支，而2006-2007年分离株又与国家代表株A/GDLH/219/2006在一个分支。氨基酸序列分析显示，绝大多数的毒株均在第130位点缺失一个赖氨酸；2005年5月以后的大部分毒株出现以下氨基酸变异：T82K、Y94H、R146K、R209K、T267N，2006年5月份之后的毒株在抗原决定簇B区发生了A190T、H193Y、E195D氨基酸变异，同时也发生A区R146K的置换。但所有毒株的潜在糖基化和受体结合位点均比较保守。发现1株病毒A/SZ/68/2007具特殊性，经与参照毒株比较，其326个氨基酸中有50个发生变化，其中有11个位于抗原决定簇位点、6个位于受体结合位点，且有4个氨基酸变化导致糖基化位点丢失。结论 2005-2007年深圳市人群中至少有3个类型HA1基因不同的H1N1流感病毒株；由于氨基酸变异引起病毒发生抗原漂移，其代表株为A/GDLH/219/2006；发现的A/SZ/68/2007病毒毒株具有特殊性，其抗原特性和流行病学意义还有待探讨。     

深圳市不同人群和鸡群感染禽流感病毒H9N2亚型状况研究

目的分析禽流感病毒H9N2亚型毒株在深圳市不同人群和鸡群中的感染状况。方法采用常规的鸡胚双腔法分离流感病毒；采用红细胞凝集抑制试验（H1）和中和试验测定流感病毒抗体。结果从深圳市农贸市场300只鸡只样本中分离到27株H9N2亚型流感病毒，其抗体阳性率为7％，但未能从人群中分离到H9N2亚型流感病毒。人群血清中其抗体阳性率与职业高度相关，与鸡只密切接触的人群明显高于非密切接触的人群。结论禽流感病毒H9N2亚型对人群和鸡群均易感，可通过近距离的密切接触传播；推测人所感染的H9N2可能主要来源于鸡只等家禽。     

A型流感病毒核蛋白噬菌体单链抗体体外表达鉴定

目的　从构建的A型流感病毒核蛋白(Nucleoprotein)噬菌体单链抗体库中筛选阳性克隆,在大肠杆菌HB2 15 1中表达流感病毒核蛋白噬菌体单链抗体,为研究A型流感病毒免疫渗漏试剂盒建立基础。方法　经过连续三轮固相“亲和-洗脱-富集”筛选,丰富噬菌体抗体库中阳性克隆的比例,采用ELISA、SDS PAGE和Western blot方法对大肠杆菌培养上清液和细菌周质腔蛋白进行分析目的产物。采用亲和层析方法对细菌周质腔蛋白进行分离纯化并进行单链抗体滴度分析。结果　从96个克隆中筛选到10个阳性克隆,其中三个阳性信号较强,分别为A1、E1和G3。其A4 50 分别达到0 . 4 6 9、0 . 5 82和0 . 5 0 7。A型流感病毒核蛋白噬菌体单链抗体主要表达于细菌周质腔中,亲和纯化产物稀释4 0 .96倍,ELISA结果仍为阳性。结论　利用噬菌体抗体库技术,初步在大肠杆菌中表达了A型流感病毒噬菌体单链抗体。     

改良分子信标-双重实时荧光PCR快速检测SARS病毒

目的建立改良分子信标-双重实时荧光PCR检测SARS病毒的方法,用于SARS的早期诊断和动物溯源。方法利用改良分子信标技术、装甲RNA和双片段双色荧光技术,根据GenBank公布的SARS病毒聚合酶基因1b的阅读开放框架结构的保守序列,自行设计一对引物和探针,以部分临床标本的酶联吸附实验结果和传统细胞培养方法作为对照,建立分子信标检测SARS病毒的方法。对368份临床标本(咽漱液、血液、粪便、尿液)、52份细胞培养液和50份动物标本进行荧光PCR扩增。结果分子信标检测SARS病毒的方法灵敏度为10～100个拷贝ml,与流感病毒等呼吸道病毒无交叉反应。分子信标检测368份临床标本,20份阳性。其中确诊病例阳性率为21.27%(1047),确诊病例的咽漱液阳性率为43.48%,还分别从粪便和血清中检测到SARS病毒。52份细胞培养液,29份阳性,阳性率为55.77%。50份动物标本,23份阳性,阳性率为46%。结论改良分子信标-双重实时荧光PCR检测SARS病毒方法灵敏度高、特异性强,可用于SARS的临床早期诊断和动物溯源。     

深圳市流感指数的制定及应用

目的 探索疾病监测数据的应用新模式,提升疾病监测质量。方法 采用综合评分法,对流感样病例百分比的基线值和平均值、每周流感病毒检测阳性率和每周流感样病例暴发疫情起数的高低程度评分和计算权重系数,建立“流感指数”判定方程。结果 “流感指数”分为4个等级,分别为极易发生（Ⅰ级,指数值3.6~4）、易发生（Ⅱ级,指数值2.6~3.5）、较易发生（Ⅲ级,指数值1.6~2.5）和较少发生（Ⅳ级,指数值1~1.5）。结论 “流感指数”是将疾病监测数据转化为实际应用的新尝试,具有良好的社会效益。     

16s～23s rDNA间隔区序列聚合酶链反应鉴定术后龟分支杆菌暴发感染

目的　从基因水平上确认深圳市某医院术后暴发感染的致病菌,并建立一套快速的ＰＣＲ方法鉴定龟分支杆菌脓肿亚种。方法　根据分支杆菌的１６ｓ～２３ｓｒＤＮＡ间隔区序列,设计合成一对引物和龟分支杆菌脓肿亚种ＤＮＡ探针,采用ＰＣＲ 和ＤＮＡ 斑点杂交技术,对５３ 株龟分支杆菌脓肿亚种临床分离株进行ＰＣＲ扩增和ＤＮＡ杂交。在此基础上,采用１６ｓ～２３ｓｒＤＮＡＰＣＲ扩增体系检测２５９份临床标本,对部分标本做ＤＮＡ探针斑点杂交反应。结果　５３ 株龟分支杆菌脓肿亚种临床分离株均被扩增出一条特异的３８０ ｂｐ ＤＮＡ 带和出现特异的杂交斑点。２５９ 份临床标本,ＰＣＲ 扩增阳性率为６０－６％ 。结论　在基因水平上确认此次引起院内术后暴发感染的致病菌为龟分支杆菌脓肿亚种。１６ｓ～２３ｓｒＤＮＡＰＣＲ扩增检测体系灵敏、特异,能鉴定龟分支杆菌。     

深圳市人群庚型肝炎病毒感染状况调查

目的 探讨深圳市一般人群中庚型肝炎病毒（HGV）感染情况及其影响因素。方法 随机抽取研究对象,用酶联免疫反应法（ELISA）检测该人群中抗－HGV,对阳性者用逆转录PCR（RT－PCR）检测血清中HGV RNA。结果 抗－HGV阳性率为9.33%。男女分别为9.51%和9.13%;HGV RNA阳性率为2.33%,男女分别为2.45%和2.20%,年龄组间抗－HGV和HGV RNA阳性率差异均无显著性;单因素和logistic回归分析未显示肝炎病史、近期手术史、注射史、拔牙史及乙型肝炎疫苗接种史等因素与HGV感染有关,职业人员中以中学生及教师的HGV RNA阳性率较高。结论 深圳市一般人群中HGV感染率较高,但其流行因素尚等进一步研究。