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Modeling of gene regulatory networks with hybrid differential evolution and particle swarm optimization. 总被引:2,自引:0,他引:2
In the last decade, recurrent neural networks (RNNs) have attracted more efforts in inferring genetic regulatory networks (GRNs), using time series gene expression data from microarray experiments. This is critically important for revealing fundamental cellular processes, investigating gene functions, and understanding their relations. However, RNNs are well known for training difficulty. Traditional gradient descent-based methods are easily stuck in local minima and the computation of the derivatives is also not always possible. Here, the performance of three evolutionary-swarm computation technology-based methods, known as differential evolution (DE), particle swarm optimization (PSO), and the hybrid of DE and PSO (DEPSO), in training RNNs is investigated. Furthermore, the gene networks are reconstructed via the identification of the gene interactions, which are explained through corresponding connection weight matrices. The experimental results on two data sets studied in this paper demonstrate that the DEPSO algorithm performs better in RNN training. Also, the RNN-based model can provide meaningful insight in capturing the nonlinear dynamics of genetic networks and revealing genetic regulatory interactions. 相似文献
183.
本文应用电力载波技术,实现远端时钟的中央控制。系统通过电力载波芯片从电力线上收发控制信号,中央控制端发送的时钟校准信号到电力线网络,接人网络的远端时钟接收到校准信号后,由微处理器解析数据调整受控端时钟显示,从而实现时钟的中央控制。 相似文献
184.
背景与目的:研究过氧化氢(H2O2)对不同时相HepG2细胞作用的选择性,以进一步探讨H2O2:诱导肿瘤细胞凋亡的机制.材料与方法:以胸腺嘧啶核苷(TdR)阻断法获得不同细胞周期时相的同步化细胞,分别加入800 μmol/L的H2O2作用3 h,并检测各组细胞的丙二醛(MDA)含量、黄嘌呤氧化酶(XOD)和5'核苷酸酶(5'NT)的活性及抗羟自由基(抗·OH)和抗超氧阴离子自由基(抗O2)的活性.结果:经H2O2处理的各组MDA含量和XOD、抗·OH、抗O2活性显著高于对照组,其差异均具有统计学意义(P均<0.01),5'NT活性低于对照组(P<0.01).与未同步化组比较,同步化于S期和G2/M期的细胞MDA含量和XOD、5'NT、抗·OH和抗O2活性显著升高,其差异均具有统计学意义(P均<0.01),而同步化于G1期的细胞MDA含量、XOD、5'NT和抗O2-活性显著降低,差异均具有统计学意义(P均<0.01).结论:H2O2作用同步化HepG2细胞后,代谢产生自由基的酶活性,脂质过氧化产物含量以及抗氧化水平均表现出细胞周期特异性,这可能是过氧化氢对不同时相HepG2细胞损伤作用不同的原因. 相似文献
185.
妊娠期肝病约占妊娠的3%,对母婴危害较大。正确判断孕周和发病时期对疾病的种类作出正确的诊断,是最重要的治疗措施。[第一段] 相似文献
186.
本文应用放射免疫测定的方法检测了13例输精管结扎后(平均15.3年,平均年龄50岁)的男性精浆双氢睾酮和睾酮的浓度,另取同年龄组男性13例作为对照。结果表明,精浆睾酮在结扎组(374.54p/ml)和正常对照组(315.64Pg/ml)中没有明显差异,而结扎组精浆中双氢睾酮(46.21pg/ml)却明显低子对照组(184.27pg/ml(p<0.01)。作者认为,输精管结扎对精浆DHT有长期影响,这可能是其对前列腺增生过程产生抑制作用的原因之一。 相似文献
187.
讨论了一系列N-酰化壳聚糖膜的抗张强度、透水性、VB_(12)的透过性、透氧性以及血液相容性。N-已酰化壳聚糖膜具有良好的血液相容性。在制膜过程中,加入分子量为1500的聚乙二醇为致孔剂,则可使N-己酰化壳聚糖膜的渗透性有较大提高。同时保持较好的血液相容性和强度。 相似文献
188.
本实验对培养中的大鼠胎胰胰岛组织及其移植后的形态功能进行了观察。结果表明,大鼠胎胰经短期培养,不仅内分泌胰岛β细胞的活力保存良好,而且胰外分泌腺泡大大减少以致消失。21只糖尿病大鼠,同种移植经过7天培养的胎胰胰岛,未用免疫抑制剂,术后糖尿病缓解率76.2%。 相似文献
189.
[目的]探讨不同起搏模式对病人生存质量(QOL)的影响。[方法]以健康调查问卷(SF一36量表)对112例不同起搏模式病人进行问卷调查,比较3种起搏模式下病人的QOL水平。[结果]除机体疼痛、角色情绪2个维度外其余6个维度(生理功能、角色限制、活力、社会功能、精神健康、总体健康)3种起搏模式间比较差异有统计学意义(P〈0.05)。[结论]应用AAI型、DDD型起搏器的病人生存质量优于VVI型起搏。 相似文献
190.