我国东北林区蜱中伯氏疏螺旋体的分离及分型鉴定

目的从我国东北地区全沟硬蜱中分离新的伯氏疏螺旋体菌株,了解其基因型及分布.方法应用BSKH培养基从硬蜱中分离菌株,PCR扩增5S～23S rRNA基因间隔区,进行限制性片段长度多态性分析及序列测定.结果新分离出伯氏疏螺旋体25株,其中11株来自内蒙古自治区,13株来自黑龙江省,1株来自吉林省.RFLP结果显示其中22株属于Borrelia garinii基因型,3株属B.afazenii基因型,1株产生了新的酶切带型,序列测定表明其属于B.garinii.结论东北地区的伯氏疏螺旋体菌株为B.garinii和B.afzelii两种基因型,B.garinii为主要基因型.采用5S～23S rRNA间隔区RFLP分型方法对菌株进行分型研究时应结合序列分析方法,以保证分型结果的可靠性.     

伯氏疏螺旋体活体成像动物模型穿梭载体的构建

莱姆病是由伯氏疏螺旋体(Borrelia burgdorferi,又称莱姆病螺旋体)引起的重要的动物疫源性疾病.伯氏疏螺旋体的分子遗传学研究缺乏相关载体,遗传学转化异常困难,因此对于伯氏疏螺旋体致病因子的研究进展缓慢.     

中国大林姬鼠携带Amur类汉坦病毒及其分子生物学特征分析

目的 确定中国大林姬鼠是否存在Amur类汉坦病毒及其分子生物学特征。方法 应用RT-PCR法扩增大林姬鼠肺组织中汉坦病毒M基因片段和S基因全长,目的片段经测定其核苷酸序列后,用DNASTAR软件进行同源性比对和系统发育分析。结果 从东北大林姬鼠肺标本JilinAP06中分别扩增出长度383 bp（M基因）和1696 bp（S基因）大小的目的eDNA片段,其S基因全长由1696个核苷酸组成,完整的开放阅读框从37位核苷酸至1323位核苷酸,共1287个核苷酸,编码429个氨基酸的蛋白。JilinAP06 S基因与1378、Liu株同源性最高,与H5株同源性次之,与AP63、AP61和AP1371同源性为91．0%～91．7%,与76．118同源性为81．0%。S全序列基因推导的氨基酸序列与其他汉坦病毒已知序列比较显示：JilinAP06与AP1371同源性最高（98．4%）,与AP61同源性为98．1%,与AP63和Liu、B78和H5株同源性为97．2%～97．9%,与76-118同源性为95．1%。系统发育分析结果显示：JilinAP06与Amur类汉坦病毒构成一个相对独立的分支。M基因片段同源性比较和系统发育分分析结果与基于S基因全长得到的结果一致.结论 中国大林姬鼠存在Amur类病毒，大林姬鼠很可能为Amur类病毒的自然宿主和人群Amur类病毒感染的重要来源。     

部分省区啮齿动物中斑点热群立克次体的检测

目的了解我国部分省区啮齿动物中斑点热群立克次体的自然感染情况，比较南北地区不同鼠种带菌率的差异。方法在黑龙江、内蒙古、新疆、浙江和贵州5省（自治区）共捕获鼠473只，用聚合酶链反应检测鼠脾脏中的斑点热群立克次体DNA序列片段。结果共检测鼠473只，69只阳性，阳性率为14．6％；在黑龙江、内蒙古、新疆、浙江和贵州省（自治区）都检测出阳性标本，阳性率分别为3．1％、21．6％、30．0％、10．8％和21．4％。结论我国黑龙江、内蒙古、新疆、浙江和贵州省（自治区）的鼠中都存在斑点热群立克次体的感染，南北地区鼠的带菌率差异无统计学意义（P〉0．05）。     

云南省Nam Dinh病毒的首次鉴定

本研究对云南省分离的一株Nam Dinh病毒(NDiV)进行鉴定,并对其全基因组特征进行分析.采用白纹伊蚊C6/36细胞对2009年在云南省采集的蚊虫进行病毒分离;采用RT-PCR方法对阳性病毒分离物进行鉴定,在电镜下观察其形态特征;采用Mega 5软件对病毒全基因组序列进行系统进化分析.结果从一组三带喙库蚊标本中分离出一株NDiV.该病毒为球形颗粒,直径约100 ～ 160 nm;基因组全长为20 126bp,包括6个开放读码框架,与越南NDiV 02VN178株和中国深圳SZ11706Z株核苷酸和氨基酸同源性分别为94.0％ ～ 100％和97.4％ ～ 100％,同属于套式病毒目Mesoniviridae病毒科.本研究获得的NDiV毒株及其全基因组序列特征系云南省首次报告.     

190 kD R.rOmpA基因序列对斑点热群立克次体的检测

目的为探讨190 kD R.rOmpA基因序列对斑点热群立克次体的检测作用.方法从立氏立克次体190 kD外膜蛋白A(R.rOmpA)基因序列设计引物,利用PCR检测的方法,检测了683只蜱类标本和146个鼠类脏器标本,并随机抽取1株森林革蜱阳性扩增产物进行克隆与序列测定.结果从蜱类标本和鼠类脏器标本中检测出了斑点热立克次体DNA片段;所测序列的分型结果表明与前苏联的DnS 14株型别一致,与我国曾经检测出的斑点热立克次体株差异较大.结论190kD外膜蛋白A基因序列可用于斑点热立克次体检测,并可用于斑点热群立克次体基因型或亚型之间的鉴别.     

维生素D受体基因多态性与肺结核易感性的病例对照研究

目的 探讨维生素D受体(VDR)基因多态性与中国汉族人群肺结核发病间的关系。方法 采用病例对照研究设计，用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性分析(PCR—RFLP)检测VDR基因中T／C多态性位点，对肺结核相关的环境因素进行问卷调查，并进行单因素分析和多因素1ogistic回归分析。结果 对76例病例和171名对照进行了VDR的基因分型，VDR—FF、VDR—Ff与VDR—ff三种基因型在病例组和对照组中的分布频率分别为38．2％、44．7％、17．1％和52．6％、40．9％、6．4％，其中ff基因型在病例组中的频率显著高于对照组，OR值95％CI：3．668(1．483—9．071)；在多因素分析中调整卡介苗接种史和吸烟状况后，VDR—ff基因型与肺结核发病仍有显著性关联，调整OR值95％CI：3．036(1．117—8．253)。结论 VDR—ff基因型可能是中国汉族人群肺结核病的易感基因型。     

云南省澜沧江流域蚊虫流行性乙型脑炎病毒分子特征分析

目的确定2007-2009年从云南省澜沧江流域采集蚊虫中分离的13株流行性乙型脑炎病毒(JEV)基因型及其E基因序列特征。方法用反转录-聚合酶链反应(RTPCR)扩增E蛋白核苷酸序列,测序后用DNAStar软件包中的MegAlign程序完成核苷酸相似性和氨基酸同源性分析;用ClustalX1.83软件进行碱基配对后采用Mega5.0软件做进化树分析。结果 13株JEVE基因的核苷酸相似性为98.0%～100%,氨基酸的同源性为99.8%～100%,与我国乙脑减毒活疫苗株SA14-14-2的核苷酸相似性为86.1%～86.9%,氨基酸同源性为96.8%～97.2%;进化树分析发现,13株JEV均属于基因Ⅰ型。结论 2007-2009年从云南省澜沧江流域采集蚊虫中分离的13株病毒属于JEV基因Ⅰ型。     

中国汉族人群肺结核易感基因的病例对照研究

目的 :探讨VDR ,NRAMP1基因多态性与中国汉族人群肺结核发病间的关联。方法 :采用病例对照研究设计 ,用聚合酶链反应_限制性片段长度多态性分析 (PCR_RFLP)法检测VDR基因FoKⅠ和TaqⅠ位点 ,NRAMP1基因中INT4 ,D5 4 3N及 3'UTR位点的基因型别 ,并对肺结核相关危险因素进行问卷调查 ,应用SPSS软件进行单因素和多因素非条件Logistic回归分析。结果 :2 0 0 1年 4月到 2 0 0 2年 6月 ,共有 110名肺结核病例 [平均年龄 (2 7.6 5± 12 .72 )岁 ]和 180名对照 [平均年龄 (2 7.2 6± 9.2 1)岁 ]纳入本研究 ,单因素分析表明病例组中FoKⅠ_ff,D5 4 3NG A及 3′UTRTGTG + del基因型频率显著高于对照组 ,OR值 (95 %CI)分别为 3.36 (1.4 3～ 7.89) ,2 .2 2 (1.0 3～ 4 .78)和 1.93(1.14～ 3.2 6 ) ,TaqⅠ与INT4位点各基因型在病例和对照中的分布无显著性差异。多因素分析中调整了接触史和卡介苗接种史两个因素后 ,FoKⅠ_ff,D5 4 3NG A及 3′UTRTGTG + del基因型仍与肺结核发病显著性相关 ,调整OR值 (95 %CI)分别为 3.15 (1.0 6～ 9.33) ,3.0 4 (1.12～ 8.2 7)和 2 .36 (1.2 0～ 4 .6 4 ) ,而TaqⅠ和INT4位点多态性与肺结核发病仍无显著关联。结论 :中国汉族人群VDR_FoKⅠ ,NRAMP1_D5 4 3N和NRAMP1_3′UTR位点多态性可     

粒细胞埃立克体444-Epank基因的检测与序列分析

目的 进一步证实中国大陆粒细胞埃立克体感染的病原学证据。方法 从粒细胞埃立克体结构蛋白基因序列高变区构建特异引物，对蜱标本，动物标本，人血标本进行聚合酶链反应（PCR）检测；收集全沟硬蜱特异PCR产物，进行克隆和序列测定，与GenBank中注册的序列进行同源性比较。结果 从黑龙江省采集的全沟硬蜱（62组，310只）2组中扩增出444bp的特异DNA片段，而从内蒙古的动物脏器标本（8份）没有扩增出该片段，从内蒙古林业局人员血标本（129份）中扩增出1份该片段。对该片段的克隆和序列测定结果显示其DNA序列与美国人粒细胞埃立克体分离株（AF047897）对应位置相差23个核苷酸，同源性为94．9％，推测的氨基酸同源性为88．44％。结论 通过粒细胞埃立克林444－Epank基因的检测与分析进一步证实中国大陆存在粒细胞埃立克体的感染。