基于生物信息学分析探究肺动脉高压关键基因和通路

目的通过生物信息学方法寻找肺动脉高压中差异表达的基因,为肺动脉高压的预防和早期诊断及治疗提供新思路。方法从公共基因数据库(GEO)中下载基因芯片数据集GSE113439,使用在线分析工具GEO2R筛选出肺动脉高压肺组织和正常肺组织的差异表达基因。利用在线数据库DAVID和STRING分别进行功能、通路富集分析和蛋白互作分析,使用Cytoscape软件来筛选蛋白相互作用网络中的核心网络基因及显著相互作用模块。结果共筛选出559个差异基因,其中87个为上调基因,472个为下调基因(调整后P<0. 05,|log2FC|>1)。对差异基因进行GO和KEGG富集分析,GO富集分析(P<0. 05)结果提示:(1)生物过程:差异表达基因显著富集于DNA双解、DNA修复、有丝分裂等;(2)细胞单位:差异表达基因显著富集于核质、膜、核仁、细胞质、中心体、核、核斑点、染色体、高尔基体等;(3)分子功能:差异表达基因显著富集于聚(A) RNA结合、ATP结合、蛋白质结合、解旋酶活性、微管结合、ATP依赖性DNA解旋酶活性等。KEGG富集分析结果提示差异表达基因显著富集于真核生物的核糖体生物发生、RNA转运、类风湿性关节炎、RNA降解、血管平滑肌收缩、疟疾、癌症中的蛋白多糖等(P<0. 05)。STRING分析发现了蛋白质网络互作图中的10个关键基因,分别为CDK1、CDC5L、KIF11、SMC2、CENPE、TOP2A、NCAPG、CENPF、SMC4和SKIV2L2。结论细胞增殖与凋亡等生物学过程和肺血管平滑肌等通路可能在肺动脉高压发生发展过程中起着重要的作用,采用生物信息学方法筛选可能的核心靶点有利于从基因层面上了解疾病的发生机制,为肺动脉高压发生机制的进一步研究提供方向。     

HPLC-MS/MS法测定芪葵颗粒中25个成分的含量

目的:建立高效液相色谱-串联质谱(HPLC-MS/MS)法测定芪葵颗粒中25个成分(7,2’-二羟基-3’,4’-二甲氧基异黄烷、L-苯丙氨酸、毛蕊异黄酮-7-O-葡萄糖苷、芦丁、2,3,5,4’-四羟基二苯乙烯-2-O-葡萄糖苷、美迪紫檀苷、异黄芪皂苷Ⅱ、杨梅素、无水柠檬酸、紫檀烷、黄芪皂苷Ⅲ、黄芪甲苷、黄芪皂苷Ⅰ、环黄芪苷Ⅱ、异黄芪皂苷Ⅰ、L-色氨酸、黄芪皂苷Ⅱ、异槲皮苷、刺芒柄花苷、金丝桃苷、没食子酸、槲皮素、毛蕊异黄酮、芒柄花素、大黄素)的含量。方法:采用Agilent Poroshell 120 SB-C₁₈色谱柱(100 mm×3.0 mm, 2.7μm),以含0.1%甲酸和1 mmol·L^-1甲酸铵的水溶液(A)-甲醇(B)为流动相,梯度洗脱,流速0.4 mL·min^-1,柱温45℃,进样体积2μL;采用电喷雾离子源(ESI),多反应监测(MRM)模式,负离子模式扫描。结果:25个成分在测定的质量浓度范围内线性关系良好,相关系数(r)均>0.995 0,精密度、重复性、稳定性均良好,平均加样回收率在8...     

基于新冠肺炎潜在威胁下的耳鼻咽喉科诊疗防护模式的转变

新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)已经进入全球大流行,鉴于新冠病毒的高传染性,作为在日常诊疗活动中与患者有密切接触的耳鼻咽喉科,既往的诊疗模式无疑将会给医务人员及患者带来极大风险。基于新冠肺炎的潜在威胁,如何正常开展耳鼻咽喉科诊疗活动,本文将从新冠病毒传染的各个环节入手,探讨一个安全有效的诊疗模式,以期现在及将来可以减少耳鼻咽喉科医务人员的感染,并保障患者就医安全。     

L型解剖锁定钢板微创内固定治疗胫骨远端骨折

目的探讨L型解剖锁定钢板微创内固定治疗胫骨远端骨折的,临床效果和影响因素。方法回顾性分析单一创伤骨科中心连续应用L型解剖锁定钢板微创治疗20例患者22例肢体胫骨远端骨折,统计分析切口愈合情况、入院到手术时间、出血量、手术时间、骨折愈合时间及并发症等。结果22例肢体胫骨远端骨折按AO分型,A型2例,B型8例,C型12例（其中Pilon骨折9例）。19例患者得到随访,1例失访,随访时间为9～24个月,平均14．8个月;除1例患者骨折延迟愈合（40周）外,18例骨折术后愈合时间为12～24周,平均17．3周;伤口均一期愈合,无腓深神经、足背动脉损伤,无皮瓣坏死、钢板外露,无内固定松动和失败等并发症发生。按Johner-Wruhs评分标准评分,优17例,良3例,可0例,差1例;分别按有无合并伤、各年龄纽因素分析住院天数、入院到手术时间、出血量、手术时间,差异均无显著性（P〉0．05）。结论胫骨远端骨折选择L型锁定钢板微创内固定,手术安全、骨折愈合良好、早期疗效可靠。年龄和合并伤不是影响胫骨远端骨折应用L型锁定钢板微创治疗效果的决定因素。     

高氟摄入对儿童TT3、TT4和TSH水平的影响

目的探讨高氟摄入对儿童血清总三碘甲状腺原氨酸(TT3)、总甲状腺素(TT4)和促甲状腺素(TSH)水平的影响,为地方性氟中毒防治提供参考依据。方法选择1个地方性氟中毒重病区村和1个非病区村为调查点,调查点所有在校的8～13岁儿童为调查对象(外地转入、有明显甲状腺疾病及代谢性疾病者除外),对其氟斑牙患病情况进行调查,检测血清TT3、TT4和TSH水平,并用Student-T、χ~2检验等方法对资料进行流行病学分析。结果重病区儿童氟斑牙患病率为85.37%,非病区为6.82%,差异有统计学意义(χ~2=105.94,P0.001);重病区儿童家庭饮用水氟含量为(2.36±0.70)mg/L,高于非病区的(0.36±0.10)mg/L,差异有统计学意义(t=-26.47,P0.001);儿童的血清TT3、TT4和TSH含量,重病区分别为(1.42±0.28)ng/mL、(9.67±1.76)μg/dL和(3.88±2.15)μIU/mL,非病区分别为(1.47±0.33)ng/mL、(9.22±2.54)μg/dL和(2.54±2.07)μIU/mL,其中TSH水平差异有统计学意义(t=3.604,P0.001)。饮水氟和血清氟含量与TSH含量均有显著的负相关性(P值均0.01)。重病区村氟斑牙不同患病程度组儿童的TT3和TSH水平差异均有统计学意义(t值分别为-4.680、-2.57,P值均0.05)。结论高氟暴露可引起甲状腺功能异常,不同的氟斑牙患病程度儿童血清中的甲状腺素水平差异有统计学意义。     

血液透析治疗慢性肾衰存活期生存率及死因分析

为评估血液透析(HD)治疗慢性肾功衰竭(CRF)病人的存活期和生存率及对死亡原因进行分析,我们对我院血液透析病人的临床资料进行了回顾性研究,结果报告如下。 1 资料与方法 1.1 一般资料:1988年～1995年因尿毒症进行Hb病人共224例,年龄18～74岁,平均43.8岁。其中男143例,女81例。原发病:慢性肾小球肾炎176     

成人爆发性心肌炎相关miRNA的生物信息学分析

目的 通过生物信息学方法寻找成人爆发性心肌炎中的差异表达miRNA、关键靶基因和通路,为成人爆发性心肌炎的预防和早期诊断及治疗提供新思路。方法 从公共基因数据库（GEO）中下载miRNA表达谱GSE148153,使用在线分析工具GEO2R筛选出成人爆发性心肌炎患者血清和正常对照者血清的差异表达miRNA,并利用在线数据库TargetScan预测差异表达miRNA的靶基因。使用DAVID和STRING分别对靶基因进行功能、通路富集分析和蛋白互作分析,使用Cytoscape软件来筛选蛋白相互作用网络中的核心网络基因及显著相互作用模块。结果 共筛选出31个差异表达miRNA,其中下调miRNA 18个,上调miRNA 13个（调整后P<0.05,|logFC|>1）。使用TargetScan预测miRNA的靶基因,按照context++得分各取前50个靶基因进行分析,故上调miRNA靶基因为643个,下调miRNA靶基因879个（剔除无注释的基因）。对靶基因进行GO和KEGG富集分析,上调miRNA靶基因GO分析结果提示：生物过程：miRNA靶基因显著富集于以DNA为模板的转录调...     

基于TCGA数据库构建肝癌预后相关的mRNAs风险评分模型

目的 寻找肝癌(hepatocellular carcinoma)特异性预后相关mRNAs,为肝癌的预后预测及个性化治疗提供策略.方法 从癌症和肿瘤基因图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载365例肝癌组织样本的Rna-seq数据和临床数据作为训练集,从NCBI(美国国立生物技术信息...