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脉冲凝胶电泳分型在伤寒暴发中的应用 总被引:3,自引:0,他引:3
目的:探讨深圳市某区伤寒暴发在不同厂区,不同来源的伤寒沙门菌之间的遗传相关性,建立分子流行病学研究,进行同源性分析,并与表型分型比较。方法:对深圳市某街道社区10个工厂的伤寒患者分离的28株伤寒沙门菌,根据不同厂区、不同来源的伤寒菌株,采用传统的生化分型、血清学分型,肥达反应,药物敏感分型,荧光PCR及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子生物学分型的技术进行研究。结果:从93例发热现症病人的血和粪便中分离出28株伤寒沙门菌,肥达反应阳性(“O”≥1∶80;“H”≥1∶160;)59例,分离出伤寒沙门菌患者中,肥达反应阳性19例。从伤寒沙门菌菌株中抽取4个工厂患者中分离的11株伤寒沙门菌和1株乙型副伤寒沙门菌,进行了荧光PCR和脉冲场凝胶电泳(PFGE)全基因DNA指纹图谱分析,12株伤寒沙门菌的指纹图谱完全相同,有高度的同源性。对12株伤寒沙门菌荧光PCR检测均呈阳性,28株伤寒沙门菌生化表型相同,血清学分型相同,药敏结果有差异,肥达实验抗体滴度与健康人群比较,差异有统计学意义。结论:生化表型和血清学分型不能进行同源性分析,而通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)全基因DNA指纹图谱分析,可追溯其同源性,通过12株伤寒菌株的PFGE分型图谱分析,菌株之间有高度的同源性,确认是由相同病原菌引起的一宗伤寒疫情。 相似文献
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目的 了解消毒剂在使用过程中污染菌的质粒谱和耐药谱。方法 采用Kado-liu改良法提取质粒DNA,药敏试验采用WHO推荐的K-B法。结果 选取从深圳市龙岗区各医疗卫生单位常用的5种使用中消毒剂中分离到的48株细菌进行质粒图谱分析发现:消毒剂在使用过程中的污染菌质粒与标准菌株相比较,质粒谱发生了改变;质粒均在6.3-11.2MD之间,但在此范围外常伴有1个或多个质粒同时出现。污染菌对CRO、AM、P耐药。结论 消毒剂在使用过程中污染菌的质粒谱和耐药谱发生了改变。 相似文献
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目的 了解深圳市龙岗区手足口病暴发疫情的流行病学与病原学特征,为手足口病的预防控制策略提供科学依据.方法 采用描述流行病学方法对龙岗区某社区手足口病暴发疫情的流行病学资料进行统计分析,采集手足口病患儿发病3日内、疫点周围健康人群及密切接触者、疫区3岁以下易感儿童的粪便、肛拭子或疱疹液标本以及外环境涂抹棉拭子标本,采取实时荧光定量反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法进行EV71和CoxA16核酸检测.结果 流行期6月30日-7月27日,持续28 d.发病以4岁以下儿童为主,占88.46%;男性多于女性,男女性别比1.36∶1;职业以散居儿童和托幼儿童为主,占73.08%和19.23%.病原学检测结果显示,手足口病患儿标本EV71病毒核酸阳性率为87.50% (7/8).2名死亡病例及其中1名死亡病例的密切接触者均检出EV71病毒核酸阳性.疫点周围健康人群及密切接触者EV71病毒核酸阳性率为4.17%(1/24).外环境标本EV71病毒核酸阳性率为零(0/25).疫区3岁以下易感儿童EV71病毒核酸阳性率1.92%(12/262).结论 该起手足口病暴发疫情病原体为EV71病毒引起.手足口病暴发流行已经成为我国南方城市重要的公共卫生问题. 相似文献
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目的建立一种检测肠出血型大肠埃希菌(EHEC)产毒基因stx1和stx2的TaqMan双重实时荧光PCR法。方法根据GenBank公布的EHECstx1和stx2基因序列进行比对后设计相应的PCR引物和TaqMan探针,探针报告基团分别使用FAM和HEX标记,淬灭基团使用BHQ1标记。建立双重实时荧光PCR反应体系并对反应条件进行优化,对方法的灵敏度、特异性及其重复性进行分析。结果建立了EHEC双重实时荧光PCR检测方法。菌液浓度为102~108cuf/ml时,均可观察到扩增曲线,且扩增曲线平滑;检测30份模拟临床样品,均检测到stx1和stx2基因,且均培养出EHEC,该方法灵敏度为100%;3次重复测定108、105、102cfu/ml3个高、中、低浓度的菌液DNA模板,得到其扩增曲线,计算各浓度的Ct值标准差及变异系数,均小于5%,在误差允许范围内。结论建立的双重实时荧光PCR法可快速、灵敏、特异、有效地检出EHEC。 相似文献
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目的 探究影响川射干总灰分超标的因素。方法 采用灰分测定法、显微鉴别法、HPLC法对6个主产区及3批市售川射干样品及其肉质茎和外皮进行总灰分、酸不溶性灰分检查,草酸钙含量测定,显微特征观察。结果 饮片总灰分为4.06%~6.31%,肉质茎总灰分为3.11%~3.86%,外皮总灰分为4.77%~5.29%;饮片各部位均纵向排列有草酸钙柱晶,数量很多,长10~180μm,最长可达300μm,直径20~50μm;饮片酸不溶性灰分为0.57%~0.96%,肉质茎酸不溶性灰分为0.55%~0.70%,外皮酸不溶性灰分为0.70%~0.86%;饮片草酸钙含量为2.76%~3.90%,肉质茎草酸钙含量为2.56%~3.26%,外皮草酸钙含量为3.17%~3.57%。结论 川射干因含有大量的草酸钙,导致饮片均不符合2020年版《中国药典》总灰分不得超过2.0%的要求。因此,建议调整川射干总灰分限度至合理范围,或是以酸不溶性灰分代替现行的总灰分检查项。 相似文献