SAGE遗传分析系统的功能及应用

SAGE是集多功能于一体的医学遗传学群体与家系资料计算机分析系统。本文概述SAGE系统的主要功能及应用环境。重点介绍了FCOR2和TDTEX两个功能模块的数学原理和使用方法。应用TDTEX模块 ,我们发现微卫星标记 85ca与小儿失神症存在连锁不平衡 ,提示在该位点附近存在小儿失神症的易感基因     

结合蛋白质互作与功能类的可分性预测蛋白质功能

当前蛋白质功能注释体系的欠完备性限制了生物学及医药研究的进一步发展和应用,有必要将基因本体功能知识体系 (GO)的功能注释信息进一步深化,把蛋白质注释到GO中更具体的功能节点.为此,提出一种结合互作信息的新的预测策略,将酵母蛋白质准确地预测到更具体的功能类中.针对GO中的每个候选预测空间来构建分类器,并选用功能类分离性指标对候选预测空间进行评价,选出该指标大于一定阈值的候选预测空间,再将父节点中的蛋白质预测到子节点中.通过扩展深化预测的范围,可将预测空间一直上溯到根节点,对蛋白质功能进行深层预测,得到很好的预测结果.以上溯两层的预测空间为例,平均真阳性率和覆盖率分别达到94.02%和95.82%.     

缺血后适应对树鼩脑缺血信号转导及转录激活因子3过磷酸化的调控作用

目的观察信号转导及转录激活因子3(STAT3)磷酸化在树鼩脑缺血后适应(PC)神经保护中的作用,并探讨其可能机制。方法将50只健康成年树鼩随机分为对照组、脑缺血4 h组、脑缺血24 h组、后适应4 h组和后适应24 h组(每组n=5),其中10只动物做HE染色(n=5)及电子显微镜观察(n=5)。本实验通过光化学反应建立树鼩血栓性脑缺血模型;于缺血后4 h夹闭患侧颈总动脉3次(每次5 min)实施缺血PC。采用TTC染色观察树鼩脑梗死面积的变化,通过HE和电子显微镜观察脑皮质和海马组织学改变及其超微结构变化,应用Western blotting检测皮层总STAT3(t-STAT3)及磷酸化STAT3(p-STAT3)蛋白表达变化。结果脑缺血后皮层血管内皮细胞肿胀,皮层及海马神经元损伤,线粒体肿胀、嵴溶解,以缺血24 h损伤最为明显,脑梗死面积达到(24.78±2.06)%。而皮层p-STAT3蛋白表达随缺血时间延长呈增高趋势,缺血4 h p-STAT3蛋白表达明显增高(0.24±0.1,P<0.01),缺血24 h p-STAT3蛋白表达则持续增高(0.32±0.1,P<0.01)。缺血PC处理后皮层血管内皮细胞水肿好转,皮层及海马神经元损伤减轻,脑梗死面积减小为(17.67±1.90)%(P<0.01)。与缺血组相比,缺血PC 4 h p-STAT3蛋白表达进一步升高(0.41±0.09,P<0.01),缺血PC 24 h p-STAT3蛋白表达增高更加显著(0.70±0.11,P<0.01)。结论树鼩脑缺血可导致STAT3磷酸化代偿性增强,缺血PC的脑保护作用可能与其促进STAT3过磷酸化有关。     

妊娠早期孕妇发生亚临床甲减的影响因素分析

目的调查本地区妊娠早期孕妇发生亚临床甲减(SCH)的患病情况及分析其影响因素。方法采用横断面流行病学调查方法,纳入妊娠早期孕妇2036例,按照TSH、FT4水平分为亚甲减组、正常对照组,描述两组孕妇一般情况,比较两组间实验室检测指标等因素的差异。结果2036例孕妇中亚甲减组116例(5.7%)。亚甲减组年龄、孕次、BMI的均值高于正常组,差异具有统计学意义(P<0.05)。实验室检测指标分析,亚甲减组血清TSH、TG-Ab、CHO水平高于正常组,FT4水平低于正常组,差异均有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示BMI[OR=2.187(1.593~3.003)]、孕次[OR=2.584(1.184~5.638)]是妊娠早期发生亚临床甲减的危险因素(P<0.05);而FT4[OR=0.630(0.496~0.800)]则是其保护因素(P<0.05)。结论BMI、孕次是妊娠早期亚临床甲状腺功能减退发生的独立危险因素,低水平FT4也是以后发生SCH的危险因素,应积极检测并预防,以降低不良妊娠结局的发生。     

人类与医学遗传学群体与家系资料分析计算机系统的功能与菜单结构（Ⅱ）

本文继续介绍PPAP系统中的疾病关联分析、遗传异质性分析、通径分析、数量性状的混合分布分析等程序的功能。四7突病关联分析该子系统可根据群体或家庭资料进行疾病关联分析。选择疾病关联分析系统，将进入第二级子菜单疾病与标记因子的关联分析（特定因子）疾病与标记因子的关联分析（多个因子）单休型相对风险关联分析（特定因子）单休型相对风险关联分析（多个因子）关联强度比较多份资料的RR联合估计与异质性检验单体型关联分析（Porta法）1．疾病与标记因子的关联分析（特定因子）”‘：可利用常规关联分析实验的数据，根据某特定因…     

孕期和哺乳期1，25-（OH）2D3干预对子代哮喘大鼠肺组织TGF-β1和Smad3表达的影响

目的：探讨孕期和哺乳期1,25-二羟维生素D3［1,25-（OH）2D3］干预对子代哮喘大鼠肺组织中转化生长因子β1（TGF-β1）及Smad3表达的影响。方法：雌性Wistar大鼠32只,随机分为4组（n=8）：低剂量、中剂量及高剂量1,25-（OH）2D3干预组和对照组。受孕第7天起,以隔天灌胃的方式分别给予低、中剂量及高剂量组2、10、20 μg/mL 1,25-（OH）2D3,对照组以生理盐水代替,直到子代大鼠生后21 d断乳为止。制备子代大鼠哮喘模型。采用RT-PCR和免疫组织化学方法分别从mRNA和蛋白水平检测TGF-β1和Smad3的表达变化。结果：(1)各组仔鼠哮喘模型支气管炎症程度不同,与对照组相比,低、中剂量组炎症反应减轻,而高剂量组则加重。(2)免疫组织化学结果显示,与对照组相比,TGF-β1及pSmad3在低、中剂量组表达明显降低（P<0.05）,而在高剂量组则表达明显增高（P<0.05）。(3) 荧光定量PCR结果显示,与对照组相比,低、中剂量组TGF-β1和Smad3 mRNA表达降低（P<0.05）,而高剂量组两者的mRNA表达增高（P<0.05）。结论：在大鼠哮喘模型中,1,25-（OH）2D3可能通过维生素D受体信号通路,进而调节TGF-β/Smad信号通路相关蛋白的表达而发挥免疫调节作用。     

2型糖尿病患者线粒体基因8个突变位点的研究

目的：探讨线粒体DNA tRNA Leu (UUR)基因及其相邻的ND1基因8个位点的突变与2型糖尿病的关系。 方法： 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）的分析方法，对174例2型糖尿病患者和207名健康对照的mtDNA的3 243、3 256、3 290、3 316、3 394、3 421、3 426、3 460和3 593共9个已报道的突变位点同时进行筛选，并采用测序、反向斑点杂交和基因芯片进行方法学比较和确证，对检出的突变位点采用DNASTAR和Antherprot软件进行分析。 结果： 糖尿病组检出3 316(G→A) 突变5例(2.9%)，其中2例为多个位点突变：1例伴随3 256(C→T)和3 688(G→C)，另1例伴随3 606(A→G)；3 394(T→C)突变4例(2.3%)，3 593(T→C)、3 290(T→C)和3 618(T→C)突变各1例(0.6%)； 其中3 606(A→G)、3 618(T→C)和3 688(G→C) 为新突变位点，GenBank登录号为DQ092356；对照组只检出3 316(G→A)突变1例(0.5%)。两组间仅3 394(T→C) 突变率差异显著(P<0.05)。以上8个突变位点的测序、反向斑点杂交和基因芯片检测结果完全一致。3 606(A→G)为Leu的无意义突变，3 618(T→C)为Phe的无意义突变，3 688(G→C)为有意义突变，Ala→Pro,导致ND1蛋白的二级结构发生改变。 结论： 线粒体DNA ND1基因3 316(G→A)突变伴随3 688(G→C)突变，3 394(T→C) 突变可能与2型糖尿病发病有关。     

瘦素对人类外周血T淋巴细胞增殖作用的影响

目的：探讨瘦素（Leptin）对人外周血T淋巴细胞增殖作用的影响.方法：分离并培养人外周血T淋巴细胞,采用[^3H]TdR掺入试验方法,观察不同浓度Leptin的单独作用及其与PHA的协同作用对人外周血T淋巴细胞增殖作用的影响.结果：不同浓度Leptin的单独作用对人类外周血T淋巴细胞均无刺激增殖作用,但可协同PHA的刺激增殖作用,并在一定浓度范围内呈现剂量依赖性.结论：瘦素可协同PHA刺激人类外周血T淋巴细胞增殖.     

脑梗死后抑郁的整体护理

脑梗死是危害人类健康的常见疾病之一,脑梗死患者不仅生理功能发生了改变,也会出现多种情感障碍。主要表现为焦虑、抑郁、恐惧、认知紊乱等,情感障碍严重的患者常不配合药物治疗,从而影响患者神经功能的恢复及生活质量。2001年以来我们对146例脑梗死合并抑郁症的63例患者在进行常规治疗、躯体护理的同时进行整体护理,使患者在最佳心理状态下接受治疗,取得了较好效果,报道如下。     

基于视频流的非接触式连续血压检测算法研究

高血压是危害人类健康的首要疾病,方便准确的血压测量方法将有助于高血压的防控。本文提出了一种基于面部视频信号的连续血压测量方法。采用颜色失真滤波与独立成分分析法提取面部视频信号中感兴趣区域的视频脉搏波,基于时频域以及生理学原理对脉搏波进行多维特征提取;设计了一种集成特征选择方法提取具有通用性的最优特征子集;比较基于粒子群优化的Elman神经网络、支持向量机与深度信念网络所建立的单人血压测量模型;采用支持向量回归算法构建通用血压预测模型,并与真实血压值进行比较与评价。实验结果表明：基于面部视频的血压测量结果与标准血压值具有较好的一致性,由视频估计出的收缩压与标准收缩压的平均绝对误差（MAE）为4.9 mm Hg,标准差（STD）为5.9 mm Hg;舒张压的MAE为4.6 mm Hg,STD为5.0 mm Hg,符合AAMI标准。本文所提出的基于视频流的非接触式血压检测方法可以用于血压的测量。