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基于GEO结直肠癌芯片数据的生物信息学分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 利用生物信息学分析方法,挖掘结直肠癌(CRC)的关键基因并探索其发病机制.方法 在公共基因芯片数据库(GEO)中下载结直肠癌表达谱芯片数据,在GCBI实验室中筛选出结直肠癌显著差异的基因,分别对显著差异基因作GO富集分析、KEGG通路分析、蛋白质相互作用(PPI)网络分析.进一步利用cytoscape将PPI结果建立互作模块.结果 通过差异分析得出在正常结直肠组织、结直肠腺瘤、结直肠癌中表达量逐步明显下调的基因有492个,逐步明显上调的有248个,共有740个显著差异基因.GO富集分析主要体现在各种代谢过程、细胞增殖、信号调节、RNA聚合酶Ⅱ转录因子活性等.KEGG信号通路主要富集在癌症转录失调、细胞周期及p53信号通路等.并利用互作模型筛选出CDK1、MCM2、CDC6、CCNA1、CCNB2、CDKN1B、ORC1、E2F1、CHEK1、PCNA等45个与结直肠癌发生发展关系密切的关键基因.关键基因主要富集在细胞周期、病毒致癌机理、癌症相关、p53及PI3K-Akt等信号通路.结论 通过生物信息学对基因芯片数据的分析,能获取结直肠癌的关键基因及其相关通路,为后续研究提供依据. 相似文献
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目的:探讨在结直肠息肉中采用结直肠镜联合腹腔镜治疗对肠功能恢复与手术指标的影响。方法:选取2016年6月至2017年8月广东省第二人民医院收治的结直肠息肉患者76例,随机将其分为观察组与对照组,各38例。对照组采用结直肠镜手术治疗,观察组采用结直肠镜联合腹腔镜治疗。比较两组手术相关指标、肠功能恢复时间、并发症发生率。结果:观察组患者手术时间、肠功能恢复时间、住院时间均短于对照组,术中出血量少于对照组,并发症发生率低于对照组,差异具有统计学意义(P 0.05)。结论:在结直肠息肉中采用腹腔镜联合结直肠镜治疗能减少术中出血量、加快肠功能恢复,提高临床疗效,减少并发症发生率,缩短住院时间。 相似文献
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