大熊猫核糖体蛋白L10亚基基因的cDNA克隆及序列分析

目的 了解大熊猫(ailuropoda melanoleuca) 核糖体蛋白L10亚基基因(RPL10)的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基RPL10基因的异同. 方法根据已报道的部分哺乳动物RPL10基因的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术,从大熊猫的肌肉组织总RNA 中对核糖体蛋白亚基RPL10 基因的进行克隆、测序;采用Genescan 软件,对所克隆的基因序列进行氨基酸序列推定;采用ORF finder软件进行DNA 序列的开放阅读框查找;采用DNAMAN Version 6软件,对基因序列和氨基酸序列进行同源性比较;采用Ex2PASy Proteomics Server 软件,进行蛋白质功能位点和生化特性预测分析;采用http://www.imtech.res.in/raghava/apssp2/对蛋白质二级结构进行模拟分析.结果 大熊猫RPL10基因的表达序列长为685 bp,开放阅读框(ORF)为645 bp,编码214个氨基酸的蛋白质,该蛋白的相对分子质量为24.599 7×103,等电点为10.74,含有4个功能位点,分别为:2个蛋白激酶C磷酸化位点,2个N化位点,2个酰胺化位点,1个核糖体蛋白L10e信号位点.进一步分析发现,该基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的人、牛、家犬、褐家鼠、小家鼠有很高的相似性,其表达序列同源性分别为92.4%、92.4%、97.21%、88.84%与89.61%;其编码的氨基酸序列除与牛的同源性为99.07%外,与其他哺乳动物同源性为100%.而且,其蛋白质的高级结构除牛外其他物种也具有一致性.结论 无论是从RPL10基因的序列、结构、功能位点,还是从其编码的氨基酸的序列和二级结构进行分析,都表明大熊猫的RPL10基因和已报道的哺乳动物的RPL10基因具有高度的遗传稳定性和功能一致性.     

德钦乌头中的二萜生物碱

目的 研究乌头属植物德钦乌头Aconitum ouvrardianum根的二萜生物碱类化学成分.方法 采用反复硅胶柱色谱进行分离纯化,根据谱学数据和对照TLC分析鉴定化合物的结构.结果 从德钦乌头根的醋酸乙酯提取物中分离得到12个化合物,分别鉴定为塔拉乌头胺(1)、彭乌碱乙(2)、卡马考宁(3)、黄草乌碱亭(4)、粗茎乌头碱甲(5)、贡乌生(6)、14-乙酰黄草乌碱亭(7)、展花乌头碱(8)、黄乌宁(9)、膝乌亭丁(10)、异塔拉乌头定(11)、翠雀它灵(12).结论 12个化合物均为C-3位或C-6位无含氧取代的C19-二萜生物碱,且均为首次从该植物中分离得到.乌头碱型C19-二萜生物碱为德钦乌头药材的主要药用化学成分.     

大熊猫核糖体蛋白亚基RPS7基因的克隆及序列分析

目的 了解大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)核糖体蛋白亚基RPS7基因的结构及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基RP57基因的同源性.方法 运用RT-PCR技术,从大熊猫的肌肉组织总RNA中对核糖体蛋白亚基RPS7基因的表达序列进行克隆、测序;采用Gnescan软件,对所克隆的基因序列进行氨基酸序列推定;采用ORF finder软件进行DNA序列的开放阅读框(ORF)查找;采用DNAMAN Version 6,对基因序列和氨基酸序列进行同源性比较;采用Ex2PASy Proteomics Server软件进行蛋白质功能位点和生化特性预测分析.结果 大熊猫RP57基凶的表达序列全长为589 bp,ORF为585 bp,编码194个氨基酸,该蛋白的相对分子质量为22.126 85 × 103,等电点为10.09,含有1个N-糖基化位点,2个依赖于cAMP和cGMP的蛋白激酶磷酸化位点,4个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,2个十四(烷)酰化位点,2个酰胺化位点及1个RPS7蛋白signature位点.进一步分析结果 显示,大熊猫RPS7基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的部分哺乳动物具有很高的相似性.结论 运用分子生物学原理与相应的技术手段,成功地扩增出大熊猫RPS7基因的表达序列,并对其编码的蛋白进行了初步分析,丰富和完善了哺乳动物RPS7基因资料库.     

转录组分析松茸多糖诱导T细胞增殖的分子机制

目的转录组分析松茸多糖(TMP-A)诱导T细胞增殖的分子机制。方法分别用TMP-A(10μg/mL)、LPS(10μg/mL)处理T细胞24 h,采用RNA-seq测序技术对T细胞进行测序并进行生物信息学分析。结果空白对照组、TMP-A组和LPS阳性对照组分别得到46 574 489、50 259 600、57 439 600条Clean reads,对应的总大小分别为6.99、7.54、8.62 G。线粒体色素C氧化酶基因家族、钙网蛋白基因等是TMP-A组的超高表达基因,在T细胞增殖过程中细胞运动、蛋白质合成及线粒体代谢增强,且氧化磷酸化所产生的能量是T细胞增殖过程的主要能量来源。TMP-A组相比于空白对照组有485个基因差异表达,其中上调的基因482个,下调的基因3个,主要与离子转运和系统过程,外周和质膜以及分子功能中转运活性有关;且通路涉及神经活性配体-受体相互作用、Ras信号途径、MAPK信号途径等。结论 T细胞在TMP-A作用下的生物代谢发生差异,离子转运、质膜、转运活性相关基因是TMP-A诱导T细胞增殖的关键基因,且Ras-Raf-Erk-MAPK信号通路是TMP-A诱导T...