产KPC-2 肺炎克雷伯菌的MLST 和wzi 分型分析

目的探讨产KPC-2肺炎克雷伯菌的多位点序列分型(MLST)并确定其wzi分型。方法收集南京鼓楼医院2012—2014年分离的耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌108株,采用改良Hodge试验筛选产碳青霉烯酶菌株,PCR和DNA测序技术鉴定KPC-2编码基因。对产KPC-2菌株,用MLST技术分析其遗传相关性,并用PCR技术对其进行wzi分型。结果 108株碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌中,72株产KPC-2。72株产KPC-2菌株经MLST分型分为9个不同克隆型,其中ST11(61/72,84.7%)最为流行,其次为ST15(4/72,5.6%);72株产KPC-2细菌有7种wzi分型,wzi209(K47荚膜型)最为流行(58/72,80.6%),其次为wzi64(K64荚膜型)(6/72,8.3%)。结论产KPC-2肺炎克雷伯菌ST11型在我院存在克隆播散,大多为wzi209,荚膜型为K47,需加强感染控制措施。     

徐州市区三级以上综合医院检验科设备配置现状的调研

目的：：了解徐州市区三级以上综合医院检验科设备配置的现状,讨论造成该现状的原因,提出相应对策。方法：以问卷调查的形式,走访徐州市区6家三级以上综合医院,采用Excel建立数据库并转化为相应的图表数据。结果：采访对象的设备配置情况不一,仪器设备使用及维护制度有待健全,人员结构基本合理,相关管理有待完善。结论：检验科的设备须提高质和量;科室需更加注重人才培养;行政部门及医院内部应完善相关管理制度。     

全基因组测序技术的发展及其在临床微生物实验室的应用前景

正随着感染性疾病的治疗在医疗环境中的重要性日益加强,微生物学实验室通过提供鉴定、分析和追踪病原体的相关信息,在感染控制中发挥着越来越重要的作用。随着人们生活水平的提高和生活方式的改变,医师需要对病原菌进行快速准确地鉴定。但由于病原体自身不断变化(如耐药性的改变,结核分枝杆菌复发等),临床偶然出现如病原菌无法培养等紧     

肺炎克雷伯菌的敏感性及其质粒介导的耐药基因的分布特点分析

目的分析肺炎克雷伯菌的敏感性和质粒介导的耐药基因在肺炎克雷伯菌中的分布特点。方法收集我院肺炎克雷伯菌115株,微量肉汤稀释法测定细菌的敏感性;使用PCR和DNA测序技术检测超广谱β内酰胺酶、AmpC酶、碳青霉烯酶及16S rRNA甲基化酶的编码基因和喹诺酮耐药基因。根据亚胺培南的MIC,将菌株分为碳青霉烯不敏感肺炎克雷伯菌(CNSKP)和碳青霉烯敏感肺炎克雷伯菌(CSKP),分析上述基因在两组中的分布差异。结果 115株细菌对所测药物的不敏感率在30%以上;DNA分析显示blaCTX-M-14是最主要的blaESBL;oqxAB的流行率最高,为60.9%,并且在CSKP中的分布显著高于CNSKP组,而blaCTX-M、blaTEM和rmtB在CRKP组的分布在CNSKP显著高于CSKP组(P0.05)。结论应加强抗生素的合理使用和感染控制措施的实施,以减缓耐药元件的播散,预防CNSKP的产生。     

血培养大肠埃希菌的耐药特点、毒力基因分布及种系分型

摘要:目的﹑检测并分析血培养大肠埃希菌的耐药特点,种系分型和毒力基因分布。方法收集我院2019年1月1日至2020年12月13日连续且非重复血培养大肠埃希菌。采用微量肉汤法测定大肠埃希菌对17种抗菌药物的敏感性;水煮法提取细菌基因组DNA,采用PCR法检测arpA ,chuA ,yjaA 、T''spE4C2 、ArpAgpE和trpAgpC基因以确定细菌的种系分型;采用多重PCR法检测毒力基因iutA fimHl fyuA ,.kpsMT''Ⅱl .cnfl cxac ,hlyA ,traT kpsMT Ⅲ和PAl;使用卡方检验分析种系分型之间的耐药率及毒力基因分布差异。结果270株血培养大肠埃希菌对头孢曲松,复方新诺明、氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦,头孢唑林和环丙沙星的耐药率较高,均大于50.0%;对亚胺培南,厄他培南,阿米卡星和哌拉西林/他唑巴坦的敏感性较高,耐药率均低于5.0%。在种系分型方面,最常见的型别是B2型和D型,分别占总数的38.0%和16.2% ,而E型和隐分支I型占比<1.0% ,较为少见。毒力基因分析发现,fimH和fyuA基因的分布率最高,均在99.0%以上, 而 hpsMTⅢ、hlyA和cvalC3种基因的分布率较低,均低于20.0%。卡方检验显示,毒力基因iutA fimHl fyuA ,krsMTl,cnfl PAI在B型的分布显著高于非B2型(P<0.05) ,且B2型携带的iutA fyuA ,kpsMT Ⅱ cnfl PAI基因显著高于D型(P<0.05)。结论―在治疗引起血流感染的大肠埃希菌时,应慎用头孢曲松、复方新诺明,氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦,头孢唑林和环丙沙星等药物。血流感染的大肠埃希菌为B2型时,应同时进行中段尿培养以确认感染源并监测治疗的成功率。     

多黏菌素耐药基因在全球肺炎克雷伯菌中的流行分布特点

摘要:目的探讨多黏菌素耐药基因( mobile colitin resistance , mcr)在肺炎克雷伯菌中的流行分布特点。方法﹐使用Aspera软件从NCBI基因组数据库下载肺炎克雷伯菌的基因组序列,采用CheckM v1.1.3和Quest 5.0.2软件进行质量过滤,使用Prokka v1.13对基因组进行注释。从NCB网站下载所有mcr 基因序列,采用makeblastdb命令构建数据库,再采用自编写的Perl脚本程序从注释文件提取所有基因核苷酸序列为Query ,进行本地BLASTN分析,获得mcar阳性的菌株。从PubMLST网站下载肺炎克雷伯菌7个管家基因的基因序列文件和Profiles文件为数据库,采用自编写的Perl脚本程序提取基因核苷酸序列为Query ,进行本地BLASTNV分析,确定每个基因组的序列类型(ST'')。使用自编写的perl程序从下载的肺炎克雷伯菌基因组GenBank文件中批量提取菌株元信息(如分离源,样本类型、国家和日期等)以分析mcr 阳性菌株的分布特点。使用卡方检验对比不同ST型之间mer分布的差异。结果在本研究纳入分析的全球11 429个肺炎克雷伯菌基因组中,207株细菌中检出229个mcr。mcr变异体共有6种, 认mer-l(87/229,38.0% ) ,mcr-8(59/229,25.8%)和mcr-9(59/229,25.8%)为主;207株细菌检出76种ST型,以ST15(21/207,10.1%) ,ST43( 17/207,8.2%) ,ST11(16/207,7.7%)和ST147(16/207,7.7%)为主。87株mer-l阳性菌株有31种ST,以ST43(17/87,19.5%)和ST15(10/87,11.5%)为主;59株mcr-8菌株有17种ST, 以ST43(17/59,28.8%)和ST11(9/59,15.3%)为主;59株mer-9菌株有27种ST,以ST147(11/59,18.6%)和ST274(11/59,18.6%)为主。不同的ST型携带的mcr变异体之间的差异亦有统计学意义。mcr阳性肺炎克雷伯菌来自全球五大洲的28个国家,以中国(68/207,32.9%)和泰国(45/207,21.7%)为主,主要来源于人体(100/207,48.3%) ,流行时间集中于2015年至2018年。结论在全球肺炎克雷伯菌中, mer的流行以mcr-l ,mcr-8,mer-9为主。mer-l的流行以ST15和ST43为主, mer-8的流行以STI1和ST43为主, mcr-9的流行以ST147和ST274为主。加强该类细菌的监测对于预防院内感染控制具有重要作用。