EMD-BP神经网络在传染病发病趋势和预测研究中的应用

正医学研究中的时间序列是指将某种疾病或者某个现象的某一指标,在每个时间点上的数据,按照时间先后顺序排列而成的一维数据。由于疾病的发生发展多与时间相关,尤其是传染病,因此时间序列往往蕴含着一定的规律。在以往的流行病学研究中,研究者们习惯于使用滑动平均模型(ARIMA)或者季节性差分自回归滑动平均模型(SARIMA)描述传染病的时间分布特征,并对未来的发病情况进行预测~([1])。然而,这些     

上海地区孕妇MTHFR C677T基因多态性与血浆同型半胱氨酸水平的关联性分析

目的 了解上海市孕妇MTHFR基因型的分布情况,分析MTHFR C677T基因多态性与高同型半胱氨酸血症的关联性,为高危孕妇的遗传筛查及围产期叶酸摄入的个性化提供依据。方法 选取上海市五所社区医院2015年1月~2015年6月门诊建卡孕妇1000例,随访了解基本信息、孕期危险因素暴露及叶酸摄入情况,以基因芯片法检测MTHFR基因型,循环酶法检测血浆同型半胱氨酸。结果 上海地区孕妇MTHFR C677T基因CC型、CT型、TT型的检出频率分别为33.0%、49.2%、17.8%,等位基因C、T的频率为57.6%、42.4%,样本人群处于H-W平衡状态。血浆同型半胱氨酸浓度为11.22（9.15,13.52）μmol/L,其中911例（91.6%）正常,84例（8.4%）属轻度高同型半胱氨酸血症。经多因素logistic回归分析,CT型与TT型发生高同型半胱氨酸血症的OR值分别为2.18（95%CI：1.11~4.25）和6.26（95%CI：3.13~12.53）。结论 MTHFR基因C677T多态性与孕妇血浆同型半胱氨酸水平存在关联,携带等位基因T者可视为高危孕妇,孕期叶酸补充可适量增加。     

新型冠状病毒肺炎流行病学特征分析

  目的  对上海市一起发生在公共场所的新型冠状病毒肺炎（COVID-19）聚集性疫情回顾性流行病学调查,分析疫情的感染来源、传播方式和传播链。  方法   2020年1月 — 2月,对病例的基本情况、发病与诊疗、临床表现、发病前14天内暴露史和危险因素、密切接触者等信息现场流行病学调查,采集病例的呼吸道标本进行rRT-PCR新型冠状病毒核酸检测,分析病例间的流行病学关联及聚集性疫情的传播链。  结果  该起聚集性疫情涉及4例确诊病例,其中3例曾在同一公共场所内活动。病例一2020年1月11日 — 16日至武汉出差,1月21日确诊;1月17日,病例一发病后至某客户服务中心,与病例二、病例三之间在未佩戴口罩和手套的情况下有多次接触;病例二1月28日发病,2月2日确诊;病例三1月21日发病,2月1日确诊;病例三的妻子病例四2月2日发病,2月4日确诊。与病例一的接触可能为病例二、病例三的感染来源,与病例三的共同生活可能为病例四的感染来源。  结论   COVID-19可通过在公共场所的接触而传播导致聚集性疫情,需关注室内公共场所可能的传播风险、加强针对性的防控措施。     

上海市新型冠状病毒肺炎疫情时空扩散特征和防控效果分析

目的 对上海市2020年1月20日—3月24日报告的所有新型冠状病毒肺炎(COVID-19)确诊病例进行疫情特征和防控情况分析,掌握本市疫情时空扩散特征、传播和变动的空间差异及与落实的防控措施之间的内在联系.方法 通过整理上海市卫生健康委员会官方网站疫情通告和COVID-19确诊病例流行病学调查资料,收集汇总病例的年龄...     

上海市一起潜伏期病例传播的新型冠状病毒肺炎聚集性疫情调查

目的 对上海市一起由新型冠状病毒肺炎（COVID-19）病例在潜伏期传染的聚集性疫情开展流行病学调查,查明感染来源和病例传播链。方法 按照新型冠状病毒感染的肺炎防控方案（第三版）要求,2020年1月采用现场流行病学调查方法,对5例病例开展个案调查,采集鼻咽拭子和痰液等标本,采用real time RT-PCR检测新型冠状病毒核酸,追踪排查密切接触者并采取隔离医学观察,调查病例间的流行病学联系,分析传播链等,并及时落实相关防控措施。结果 病例一于2020年1月20日发病,有与COVID-19确诊病例共同环境的暴露史,2月1日确诊;病例二于1月22日发病,1月27日确诊;病例三于1月25日发病,1月30日确诊;病例四于1月20日发病,2月1日确诊;病例五于1月23日发病,1月31日确诊。5例病例中,除病例二死亡外,其余4例病例病情均得到有效控制。本起疫情中,排除其他的共同暴露因素后,1月19日病例一和病例二及病例三参加了6 h的聚会,病例一在潜伏期内可能造成病例二和病例三的感染,这是流行病学调查的关键节点。结论 COVID-19病例在潜伏内可能具有传染性,这对后面的疫情防控工作带来一定的警示和借鉴作用。     

浙江省首例新型冠状病毒肺炎报告病例流行病学调查

  目的  对上海市2020年1月20日 — 3月24日报告的所有新型冠状病毒肺炎（COVID-19）确诊病例进行疫情特征和防控情况分析,掌握本市疫情时空扩散特征、传播和变动的空间差异及与落实的防控措施之间的内在联系。  方法  通过整理上海市卫生健康委员会官方网站疫情通告和COVID-19确诊病例流行病学调查资料,收集汇总病例的年龄、性别、确诊日期、感染来源等,运用描述性流行病学方法分析本市COVID-19确诊病例的疫情扩散特征和采取的各项防控措施。  结果  上海市COVID-19确诊病例中,18～40岁青年人感染的比重较大,占39.03 %（169/433）;疫情共分为5个阶段,分别为第一次缓慢上升阶段、高速增长阶段、升速放缓阶段、维持“0”报告阶段和再次缓慢上升阶段;各阶段各类COVID-19确诊病例的报告和上海市采取的各项防控措施密不可分;本市疫情扩散比最高为0.5022,各区在不同疫情发展阶段,疫情扩散比均表现为不同形态;总体而言,上海市COVID-19疫情防控措施是卓有成效的。  结论   上海市疫情已进入新的防控阶段,应根据国外COVID-19疫情形势,采取针对性的防控措施,及时发现境外输入性病例。     

我国2004-2014年戊型肝炎流行的时空特征及趋势分析

目的 描述和分析我国2004-2014年间戊型肝炎（戊肝）的流行趋势特征。方法 收集2004-2014年我国31个省（直辖市、自治区）的戊肝发病率数据,对发病率数据进行经验模态分解,以识别发病率的总体变化趋势,并采用数学模型对不同地区和不同年龄组发病率的变化趋势进行估计,得到发病率年度相对改变量;最后采用ArcGIS 10.1软件和SaTScan 9.01软件对发病率数据进行时空聚集分析。结果 2004-2014年全国共发生245 414例戊肝;发病率总体呈现上升趋势,但是趋势较为平缓（OR=1.05,95% CI：1.03~1.10）。全国各省份发病率变化情况不一,其中南部和西北地区发病率呈上升趋势;老年组增加幅度最大,尤其是65~69岁组和70~74岁组。局部自相关分析显示,"高-高聚集区"随着时间推移,出现由北向南的移动,而"低-低聚集区"则随着时间变化逐渐消失。时空聚集分析显示,全国共扫描出5个时空聚集区。结论 2004-2014年我国戊肝发病总体呈上升趋势,不同地区、不同年龄组变化趋势情况不同。     

上海市一起公共场所新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行病学调查

目的 对上海市一起发生在公共场所的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)聚集性疫情回顾性流行病学调查,分析疫情的感染来源、传播方式和传播链.方法 2020年1月-2月,对病例的基本情况、发病与诊疗、临床表现、发病前14天内暴露史和危险因素、密切接触者等信息现场流行病学调查,采集病例的呼吸道标本进行rRT-PCR新型冠状病...     

上海社区自然人群急性传染病前瞻性随访研究方法的建立与应用

【目的】以新型冠状病毒感染为例,介绍基于社区自然人群的急性传染病前瞻性随访研究方法在传染病监测中的探索与应用,为完善传染病监测预警体系提供参考。【方法】采用多阶段按概率比例抽样方法,在上海市16个行政区所有街镇进行抽样,建立基于社区自然人群的急性传染病监测队列,对所有监测对象开展基线调查,并发放新型冠状病毒(简称“新冠病毒”)抗原检测试剂。收集2022年12月21日—2023年9月30日前瞻性随访监测对象每周新冠病毒抗原、核酸检测情况,描述监测对象的基线特征以及随访情况。【结果】急性传染病监测队列共纳入12 881名监测对象,男性6 098人(47.3%),女性6 783人(52.7%),基线调查显示35.2%(4 540/12 881)的监测对象既往有新冠病毒感染史。2022年12月21日—2023年9月30日随访期间,该队列人群发病密度为0.61/人·年,女性(0.63/人·年)发病密度高于男性(0.59/人·年)。60岁及以上老年人(0.64/人·年)和有基础性疾病者(0.67/人·年)发病密度较高。医务人员的发病密度(0.84/人·年)明显高于其他职业人群。截至2023年9月3...     

零膨胀计数数据回归模型的选择与比较及R语言的实现

目的探讨和比较不同模型在零膨胀数据回归分析中的应用。方法在R语言中,拟合HIV合并血友病数据的对数线性模型、零膨胀模型、随机森林、决策树以及支持向量机模型,通过比较标准化均方误差和均方根误差,对模型进行评价与选择。结果从标准化均方误差和均方根误差来看,随机森林是对原始数据拟合的最好的模型,随后是支持向量机和决策树模型,而经典的计数模型表现则相对较差。结论在对零膨胀计数资料进行回归预测时,机器学习方法的效果优于经典的计数模型。