基于多数据库分析APOBEC3B在肺鳞癌组织中的表达及意义

目的 APOBEC3B的异常激活与多种癌症的发生发展密切相关,本研究利用生物信息学技术分析APOBEC3B在肺鳞癌中的表达情况及功能。方法 利用TCGA比较不同分组间APOBEC3B的表达水平。通过Kaplan-Meier评估APOBEC3B表达对肺鳞癌预后的意义。使用GSEA对APOBEC3B高、低表达组样本进行功能富集分析。使用“CIBERSORT”评估分析组间免疫细胞浸润比例的差异。分析组间免疫相关功能的差异。分析组间TIDE评分的差异。计算APOB3C3B高、低表达组基因突变情况,分析肿瘤突变负荷(TMB)的差异。结果 与正常组织相比,肺鳞癌组织中APOBEC3B的表达明显上调。其表达水平与年龄、性别、临床分期、TNM分期均无显著相关性,UALCAN数据库的分析结果显示吸烟患者组、TP53突变组中APOBEC3B的表达显著上调。Kaplan-Meier生存分析显示,APOBEC3B高、低表达组间生存时间无显著差异。GSEA结果显示,APOBEC3B高表达组主要富集在DNA复制等过程。免疫相关功能的分析结果表明,APOBEC3B高、低表达组间在APC共抑制和嵌合共刺激受体功能存在...     

基于多数据库分析TICRR在肺腺癌中的表达及意义

目的 TICRR的异常激活与多种癌症的发生发展密切相关,本研究利用生物信息学技术分析TICRR在肺腺癌中的表达情况及作用机制。方法 从癌症基因组图谱-肺腺癌(TCGA-LUAD)数据集获得RNA转录本数据及临床数据,比较不同分组组间TICRR的表达水平。使用ROC曲线、Cox回归分析和Kaplan-Meier法评估TICRR表达对LUAD诊断及预后的意义。使用cBioPortal筛选TCGA-LUAD中与TICRR共表达的基因,对TICRR及共表达基因进行蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络的绘制并筛选枢纽基因(Hub genes),对TICRR及共表达基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。使用基因集富集分析(GSEA)分析与TICRR高表达相关的标志基因集。使用ESTIMATE R包分析TICRR与肿瘤免疫的相关性。结果 TICRR在LUAD中高表达,与LUAD的恶性程度呈正相关,是LUAD不良预后的独立危险因素。TICRR在LUAD中富集的功能主要与肿瘤细胞的增殖相关,本研究还发现TICRR的表达可能与肿瘤代谢及免疫逃逸具有一定相关性。结论 TICRR...     

正畸治疗对根管治疗牙及对侧同名活髓牙根吸收影响的Meta分析

目的    分析正畸治疗对根管治疗牙及对侧同名活髓牙根吸收的影响。方法    计算机检索Cochrane Library、PubMed、Embase、Google Scholar、中国知网、万方等数据库,查找研究根管治疗牙经正畸治疗后牙根吸收情况的相关文献。应用Meta分析比较正畸治疗对根管治疗牙及对侧同名活髓牙根吸收的影响。结果    纳入了10篇相关文献。Meta分析结果发现,正畸治疗患者根管治疗牙根吸收情况与对侧同名活髓牙比较,差异无统计学意义（P > 0.05）。在男性正畸治疗患者中,根管治疗牙牙根吸收量小于对侧同名活髓牙,差异有统计学意义（P < 0.05）;而女性正畸治疗患者两侧牙根吸收量比较,差异无统计学意义（P > 0.05）。正畸治疗方式（拔牙矫治与非拔牙矫治）和牙位（前牙与后牙）对正畸治疗患者根管治疗牙及对侧同名活髓牙根吸收的影响比较,差异均无统计学意义（均P > 0.05）。结论    正畸治疗过程中移动根管治疗后的牙齿是一种相对安全的操作。     

基于TCGA数据库的肺腺癌G2/M检查点基因预后模型的建立与应用

目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库建立肺腺癌(LUAD)的G2/M检查点相关基因风险预后模型。方法 通过TCGA数据库获取并整合了LUAD基因表达数据及临床数据,根据Reactome定义的G2/M检查点相关基因集筛选出影响预后的G2/M检查点相关基因,通过单因素和多因素COX分析建立风险预后模型,对模型高、低风险组进行生物学标志基因集和KEGG通路富集的差异分析并进行免疫相关性分析。结果 预后模型由7个基因组成,该模型生存预测性能的AUC值为0.726。高风险组的总体生存率明显低于低风险组(P<0.05)。细胞增殖的相关通路在高风险组中富集。风险评分的增高与多种免疫细胞的浸润比例存在一定相关性(P<0.05)。结论 由7个基因组成的风险预测模型可作为独立预测因子来有效预测LUAD的预后。