临床实践指南实施性促进研究之六：临床实践指南知识图谱构建中关于基本信息、背景和方法的建模表征研究

在计算机辅助临床决策和实践中,现行临床实践指南的可读性和可操作性存在诸多不足。通过对指南的结构、知识及知识间的关系进行规范化的表示,发掘指南通用性的结构框架;通过建模表证,促进指南知识的标准化、规范化表达,构建便于共享和可移植的标准化指南知识库,有利于满足临床决策支持系统发展的需要,推动临床实践指南的实施和临床诊疗服务质量的提升。知识图谱的引入为指南数字智能化提供了坚实的基础,然而目前介绍指南知识图谱构建的方法学研究较为罕有。本研究以《中国非肌层浸润性膀胱癌治疗与监测循证临床实践指南(2018年标准版)》的知识图谱构建为例,通过梳理指南模块,解析指南基本信息、背景和方法内容范围,结合专家意见设置各概念间的层级关系,根据多级概念层及概念实例设计概念结构表,调整概念间的关系结构,并改进实体与实体间的关系。本文旨在探讨指南中基本信息、背景和方法部分的建模和表征方法,以期为今后其他临床实践指南的知识图谱构建提供参考。     

临床实践指南实施性促进研究之三: 中医/中西医结合指南知识图谱框架设计

临床实践指南存在的意义在于它的实施性.然而,目前指南的实施存在诸多问题,临床证据转化存在瓶颈.知识图谱技术的引入为指南智能化提供了坚实的基础,为解决指南实施问题提供了良好的手段.中医/中西医结合体现了我国医疗体系的特色.本研究基于心血管疾病中医/中西医结合诊疗现状及相关指南实施存在的问题,明确心血管疾病中医/中西医结合...     

中西医结合卒中知识图谱的构建与应用的研究进展

目前知识图谱在国内外被广泛应用于医学领域，尤其是西医方面，通过构建知识图谱将临床思维进行降维，并运用到临床诊疗中，为临床医师诊疗提供重要依据，同时节省患者诊疗时间。由于中医相对特殊的医疗理论体系，中医相关知识图谱的构建与应用仍有许多困难，中西医结合卒中知识图谱的构建仍需要克服许多障碍。现从中西医结合治疗卒中的现状、中西医结合知识图谱的现状、中西医结合卒中知识图谱的应用三方面出发，对中西医结合卒中知识图谱的构建与应用的研究进展进行综述。     

基于中成药知识图谱的知识推理及智能推荐

目的/意义构建中成药说明书知识图谱,实现基于知识推理的智能推荐。方法/过程基于Py2neo结合Neo4j图数据库搭建知识图谱的技术,整理1 380种中成药信息并构建数据库,基于三元闭包算法实现知识推理,运用概率模型计算中成药推荐评分。结果/结论共形成实体概念11 103个,语义关系24种。构建了中成药智能推荐知识图谱,搭建中成药智能推荐平台实现中成药的准确推荐。实现中成药与知识图谱领域结合,为中医辅助诊疗提供方法借鉴,为进一步开展中成药知识可视化研究提供参考。     

中医类流感知识图谱的构建

目的：以《中国百年百名中医临床家丛书》、中医书籍等为知识图谱构建素材,借鉴国际系统医学术语全集（SNOMED）、统一医学语言系统（UMLS）和中医药学语言系统（TCMLS）的语义关系构建“症状-证候-治法”及“所用方剂-中药”之间关系的语义网络。方法：采用人工知识抽取的方法,利用知识图谱构建素材和SQL Server 2008对数据进行预处理,选取图数据库Neo4j构建中医类流感温病理论知识图谱。结果：构建的知识图谱包含实体812个和关联4 759个。结论：通过Cypher语言使“证-治”“证-症”“症-药”等关联知识图谱可视化,能够直观地展示各个实体之间的关系,为今后将中医类流感知识图谱与深度学习技术相结合应用于中医奠定了基础。     

痰湿体质知识图谱构建研究初探

目的 基于Neo4j图数据库探索痰湿体质知识图谱的构建方法,为后续开展知识问答、智能辅助诊疗、养生方案推荐研究提供前期基础。方法 通过检索中国知网、万方数据知识服务平台、维普资讯中文期刊服务平台,全面收集痰湿体质相关资料,并采用人工标注的方法抽取痰湿体质相关实体及实体之间的关系。参考中医临床术语及语义网络标准,从形成因素、发病倾向、特征和调理方法等方面构建痰湿体质知识图谱。结果 在Neo4j图数据库中,共创建19类节点标签、6种关系类型,包含383个节点和844条连线,实现了痰湿体质知识图谱的初步构建及可视化功能展示。结论 结合Neo4j图数据库技术构建痰湿体质知识图谱具有直观、高效的特点,为建立中医体质知识共享平台奠定了基础。     

中医不寐知识图谱构建与知识发现

目的 系统梳理中医不寐知识,构建中医不寐知识图谱,实现知识关联、知识融合及深度挖掘,为智能化诊疗提供新的路径与方法。方法 以《景岳全书》《类证治裁》等中医古籍和《中医内科学》《针灸学》等国家规划教材为数据来源,通过本体构建、语义消歧等方法得到结构化数据,利用Cypher语言导入Neo4j数据库,构建中医不寐知识图谱,并进行知识检索和知识发现。结果 构建出包含527个节点、1 067条关系的中医不寐知识图谱,并从理、法、方、药4个方面入手,完成了知识检索与知识发现。结论 中医不寐知识图谱可以使用户直观、高效地获取相关知识,了解改善睡眠的方法,有效助推传统医学的继承与发展,为中医智能辅助诊疗提供新思路。     

中医诊断学辨证知识图谱构建研究与实践

阐述中医诊断学辨证知识图谱构建方法和过程,包括知识梳理、知识图谱结构模型构建、命名实体获取、关系提取、图谱表示、可视化等方面,实现中医诊断学辨证知识地图Web服务,在利用知识图谱技术开展中医智能辅助辨证研究方面进行探索和初步实践。     

基于Neo4j的中医导引学知识图谱构建

目的：以中医导引学的特点为基础构建知识图谱,方便用户查询、学习,传播中医养生保健传统文化,提高健康素质。方法：使用BERT-CRF模型辅以人工校对,对导引功法相关文献进行命名实体识别,根据学科特征制定实体之间的关系,并使用Neo4j构建中医导引学知识图谱。结果：纳入相关文献3 152篇,构建的知识图谱共包含2 262个实体节点,5 108条关系数据,7种实体类别属性,7种关系,并可以使用Neo4j的Cypher查询语言进行知识检索。结论：本知识图谱将中医导引学知识进行可视化展示,可用于构建导引知识检索、智能问答、功法推荐等应用程序与网络平台,开发相关人工智能应用设备,应用于计算机、自动化等学科的研究与生产创新中,同时也可用于深入数据挖掘,发现新研究方向。     

面向临床决策支持的肿瘤知识图谱构建与应用研究

基于肿瘤领域中文临床指南和相关文献构建肿瘤知识图谱,依据该肿瘤知识图谱实现智能问答应用,详细阐述该图谱构建方法及应用结果,指出该图谱可为肿瘤诊疗提供一定的临床决策支持,为其他领域知识图谱构建和应用提供参考。     

中医古籍《灵枢》的知识图谱构建与可视化探讨

【目的】探讨《灵枢》的知识图谱构建与可视化方法,以期为中医古籍理论知识的结构化存储与展示提供思路。【方法】借鉴专业领域知识图谱的构建思路,利用文本挖掘技术,进行词库构建,对《灵枢》原文进行分词、实体识别、关系抽取等处理,得到知识图谱的构建基础。再利用图数据库Neo4j进行知识图谱的存储与查询,实现知识图谱的可视化展示。【结果】得到《灵枢》词库的1 216个高质量词汇,实现了《灵枢》理论的知识图谱构建。构建的知识图谱可基本展示《灵枢》文本中描述的中医理论,如藏象与精气之间的关系、情志与五脏的关系等,使得相关实体与关系的检索调用成为可能,为中医古籍理论知识的结构化存储与展示提供了思路。【结论】通过知识图谱构建可以得到《灵枢》的中医理论知识图谱,展示《灵枢》中表达的阴阳五行、脏腑经络等的知识联系。知识图谱的构建与在图数据库中的存储,可使《灵枢》文本涉及的知识图谱能以可视化语义网络图的形式进行展示,还可使嵌入语义搜索、语义维基等系统成为可能,为中医智能医疗服务发展助力。     

消渴病经方知识图谱构建与知识发现

[目的] 构建经方领域的消渴病知识图谱,并在此基础上进行知识查询和发现。[方法] 筛选经方古籍中消渴病的相关内容,通过本体七步法构建消渴病本体,以结构化的三元组数据来表示研究内容,并进行语义消歧,用Excel软件存储结构化数据,再导入Neo4j图数据库,构建消渴病的经方知识图谱。[结果] 构建了包含1 432个节点、3 067个关系的消渴病经方知识图谱,其模式层包含24个节点、24个标签、54条关系和24种关系类型,通过Cypher语言可以从辨证、立法、处方、遣药四个方向进行描述性检索与知识发现。[结论] 以知识图谱的方式结构化展示消渴病经方相关内容,模拟经方理论体系与临床诊疗思维,通过实现复杂知识之间的多途径联系,有助于更深入地进行知识发现与探索。     

国内外冠心病临床指南研究现状调查及对中医临床指南的思考

目的 了解国内外中西医诊疗指南的研究状况和差距,为建立中医临床指南提供思路.方法 仅以冠心病为例,通过PubMed,CNKI,CMB等网络检索系统查找近年资料,从指南的开发程序、方法、内容等方面进行分析和比较,进而对中医临床指南的研究方向进行思考.结果 中医临床指南的制定工作不可能完全套用国际上现有的循证指南模式,但要为世界所认可,又必须在方法上与国际接轨.结论 中医学应借鉴循证医学的方法,建立符合自身理论特点和临床实际的中医证据评价体系,并据此制定出为国际同行所认可同时又符合中医学理论的中医临床指南.     

中医药知识图谱研究现状及发展趋势

知识图谱研究在中医药领域迅速发展,已经应用于中医药的基础理论、临床辅助、方剂用药等多个方面.对知识图谱的概念、关键技术及中医药知识图谱研究现状进行综述,总结中医药知识图谱研究面临的问题,包括中医术语标准统一问题、知识图谱模式层构建问题、中医知识融合技术规范问题、推理方法设计和选择问题等,并对中医药知识图谱研究的发展趋势...     

基于自然语言处理的临床合理用药知识图谱构建

目的：构建基于自然语言处理的临床合理用药知识图谱。方法：以国家食品药品监督管理总局（CFDA）、美国食品药品监督管理总局（FDA）及某大型三甲医院药品库中药品说明书为数据源，构建了一种基于深度学习算法的临床合理用药知识图谱库。对随机抽取的500份药品说明书进行人工标注，将标注的数据划分为训练集、测试集、验证集。基于深度学习模型BRET进行训练，通过训练集训练模型和验证集验证训练过程中的性能及训练后通过测试集测试模型性能，用优化后的机器学习模型预测未标注的药品说明书。结果：最终抽取出30余万条“实体-关系-实体”的三元组关系，将机器学习模型产生的三元组与领域专家标注产生的三元组一起导入Neo4j图形数据库中存储，以知识图谱的形式展现给临床药师。结论：通过基于深度学习算法的临床合理用药知识库构建，在标引少量药品说明书的前提下，挖掘出药品说明书中所有的医疗关系和实体。自动构建基于药品说明书的合理用药知识图谱，可提高合理用药的自动化程度和准确度，降低不合理用药。     

面向决策支持的临床指南知识表示方法研究

目的：更好地表示临床指南知识,以支持临床决策支持系统的构建。方法：以缺血性卒中为例,在系统梳理临床指南知识表示方法的基础上,提出使用解释节点、数据获取节点、动作节点、复合节点,以及有向边和无向边对指南诊疗流程进行表示,同时考虑实际的电子病历数据格式,设计自然语言处理模块,提高指南与电子病历系统的数据交互能力。结果：在实证研究中,使用8个节点、7条边,以及节点和边中的4个逻辑推理式表示了缺血性卒中患者临床类型判断流程,同时使用9个节点、8条边,以及节点和边中的6个逻辑推理式表示了缺血性卒中急性期的血糖管理,详细说明了临床指南知识表示建模过程。结论：本研究提出的临床指南知识表示方法可以使用节点、边、数据、逻辑推理算法等表示临床指南知识及推理逻辑,以支撑临床决策支持系统的构建。     

中医临床诊疗指南制修订现状调研、分析与工作建议

背景 2014年底,国家中医药管理局政策法规与监督司开展中医临床诊疗指南制修订工作,对中医13个专科领域的240项中医临床诊疗指南项目进行制修订,中华中医药学会承担本部分工作。目的 为了解中医领域临床诊疗指南制修订现状,从方法学角度对项目组工作中存在的问题进行分析并给出建议,本项目组对中华中医药学会中医临床诊疗指南制修订项目组进行调研。方法 2020年6—12月,以中华中医药学会中医临床诊疗指南制修订项目组为调研对象,每个项目组人员填写一份问卷,汇集项目组整体意见。采用问卷星电子问卷,通过中华中医药学会工作文件的方式下发通知至各项目组进行调查,网络端收取调查结果。围绕调研主题,问卷内容包括5大方面：对中医临床诊疗指南的认识、指南制修订程序和方法学应用、指南制修订工作重点问题和关键环节、指南实施推广和应用情况、指南制修订工作情况整体调研。问卷为半结构化设计,共30个结构化问题、4个开放性问题。调研完成后对结果进行数据汇总与描述性分析。结果 本调研最终收回有效问卷198份,调研结果提示,在对中医临床诊疗指南的认识上,大多数项目组（94.45%,187/198）认为本领域内依然需要更多的中医...     

《暴聋中医诊疗指南》的德尔菲法评价与结果分析

目的:根据中医耳鼻喉科行业专家对<暴聋中医诊疗指南>初稿框架以及诊治意见的集中程度与协调程度,制定科学实用的<暴聋中医诊疗指南>.方法:采用德尔菲(Delphi)法,在文献计量研究基础上编制<暴聋中医诊疗指南专家问卷调查表>,向全国中医及中西医耳鼻喉科专家分别发送57份和53份问卷调查并进行1次专家会议,时第一、二轮问...     

基于中医药标准文献的痰瘀互结证治疗体系可视化研究

目的 系统梳理中医药标准文献中不同疾病痰瘀互结证的治疗认识,对其共性特点和规律进行挖掘和可视化展示,为痰瘀互结证治疗理论研究与临床应用提供支持。方法 检索中国学术期刊全文数据库、万方数据库、维普数据库、中国生物医学文献数据库,并人工检索《中医内科学》《中药新药临床研究指导原则试行》《中医病证诊断疗效标准》《国家中医诊疗方案》《神志病中西医结合临床诊疗指南》等包含痰瘀互结的教材、指南等著作,期刊文献及著作类文献的检索日期均截至2021年11月30日。采用SPSS Modeler进行矩阵共现,采用Aprior建模,最后利用Gephi进行可视化分析。结果 通过图谱检索发现胸闷、乏力、皮下肿块、皮肤麻木是不同疾病痰瘀互结证常见的临床症状,舌质紫暗、瘀斑、舌苔厚腻、脉涩是不同疾病痰瘀互结证常见的舌脉,化痰、活血、祛瘀、通络是不同疾病痰瘀互结证常见的治法,半夏、茯苓、桃仁、甘草是不同疾病痰瘀互结证常用的中药。结论 痰瘀互结几乎可见于临床各系统疾病,中医诊疗应既注重共性药物的使用,也关注不同疾病特色治法方药的发现,未来可进一步构建宏观与微观融合的痰瘀互结知识图谱,为痰瘀相关疾病的综合应对提供辅助。     

面向文献组织的重大公共卫生事件知识图谱构建研究

提出一种融合中西医知识的新型冠状病毒肺炎知识模型及基于自然语言处理的领域知识自动发现方法,从等级体系结构、主题分类、关系类型等多维度对语义知识进行组织与关联。收集新冠肺炎专题文献、诊疗方案及网络新媒体数据,在自动知识发现基础上进行人工审核和标注,构建新冠肺炎知识图谱并实现可视化呈现与在线检索,以期支撑生物医学科技文献资源深度组织和有效利用。