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1.
目的 探讨宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)检测支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid, BALF)中病原微生物在社区获得性肺炎中的诊断价值。方法 选取2018年11月~2021年7月至苏州市立医院住院的初始治疗失败的社区获得性肺炎患者57例,所得BALF同时进行传统方法和mNGS检测,比较两种方法的诊断价值。结果 在57例患者BALF病原学检测中,mNGS的检出率高于传统方法(80.70%vs 33.33%),差异有统计学意义(P<0.05)。mNGS检测的采信率为84.78%,敏感度为90.70%,特异性为50.00%,阳性预测值为84.78%,阴性预测值为63.64%。mNGS检测细菌阳性率高于传统方法(43.86%vs 15.79%),差异有统计学意义(P<0.05),但两者检测真菌、结核及病毒的阳性率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。mNGS联合传统方法检测后,75.44%(43/57)患者确诊,43.86%(25/57)患者根据mNGS检测结...  相似文献   

2.
目的 探究宏基因检测(mNGS)在中枢神经系统感染性疾病诊断中的作用。方法 回顾性分析新兴县人民医院于2022年7月至2023年9月收治的20例疑似中枢神经系统感染患者的病历资料,收集脑脊液mNGS检测报告结果、脑脊液微生物培养及病原学等检查结果进行分析。结果 20例患者中13例确诊为中枢神经系统感染,7例排除中枢神经系统感染。脑脊液mNGS结果中,6例脑脊液mNGS报告结果呈阴性,14例检出可疑的致病病原体或特异序列,其中8例检出细菌(结核分枝杆菌4例、金黄色葡萄球菌2例,肺炎克雷伯菌1例,链球菌属1例),5例检出病毒(水痘-带状疱疹病毒2例,EB病毒2例,巨细胞病毒1例),1例检出真菌(白色念珠菌)。mNGS与脑脊液微生物培养的特异度、阳性及阴性预测值均相当,差异无统计学意义(P>0.05)。mNGS诊断中枢神经系统感染性疾病的敏感度和准确度分别为76.92%、75.00%,明显高于脑脊液微生物培养的30.77%、35.00%,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论 相对于脑脊液微生物培养,mNGS在中枢神经系统感染性疾病中诊断的准确率较高,但其检出结果与最终诊断结果...  相似文献   

3.
目的:评估重症社区获得性肺炎(SCAP)患者的气管肺泡灌洗液(BALF)宏基因组二代测序(mNGS)与常规检测法在病原体的检测方面的性能。方法:回顾性分析2019年1月至2021年10月期间就诊于兰州大学第二医院临床诊断为SCAP的88例患者,统计患者住院期间BALF标本送检结果,分析mNGS法和常规检测法检测病原体的性能,并分析其对混合性感染的诊断价值。结果:mNGS法共检出56种病原体,包括细菌、真菌、病毒、非典型病原菌共188个菌株。88名患者中,53例样本mNGS法与常规检测法检测结果一致,相比传统检测法mNGS检出的病原体菌株数更多。在mNGS及常规检测法的对比中,mNGS法检测到病原体阳性率94.31%,传统检测法阳性率39.77%,两者差异有统计学意义(χ2=65.480,P<0.001)。与常规检测法相比,mNGS法诊断细菌的敏感性和特异性分别为97.14%、33.96%,阳性预测值为49.28%,阴性预测值为94.74%。mNGS法检测真菌的敏感性和特异性分别为57.69%、75.81%,阳性预测值为50.00%,阴性预测值为81.03%。...  相似文献   

4.
曹蕴  李伟  刘传苗 《当代医学》2021,27(13):82-84
目的探讨隐球菌性脑膜炎的临床表现及墨汁染色联合隐球菌抗原检测的诊断意义。方法选取2018年1月至2019年6月本院收治的中枢神经系统感染患者40例。其中10例隐球菌性脑膜炎患者作为观察组,其他30例中枢神经系统感染患者作为对照组,比较两组患者临床症状表现。采用墨汁染色法和墨汁染色联合隐球菌抗原检测(联合检测)患者脑脊液中隐球菌阳性率,比较两种方法的阳性检测结果及敏感度。结果两组患者头痛、呕吐、发热、视力下降、盗汗、听力下降及意识水平下降等临床症状表现比较差异无统计学意义;观察组中联合检测阳性率为90.00%,高于墨汁染色的50.00%(P<0.05);联合检测敏感度为90.00%,高于墨汁染色的50.00%(P<0.05),两种检测方法特异度、阳性预测值及阴性预测值比较差异均无统计学意义。结论墨汁染色联合隐球菌抗原检测隐球菌性脑膜炎的阳性率及敏感度高,临床诊断价值较高。  相似文献   

5.
目的:探讨高通量测序技术(mNGS)在儿童脓毒症病原学的诊断效能。方法:前瞻性纳入2019年3月至2020年12月江门市妇幼保健院PICU收治的脓毒症患儿,采集其血液标本进行血培养及mNGS同步检测。以儿童序贯器官功能障碍评分(pSOFA)作为儿童脓毒症临床诊断标准,应用Kappa评价方法对临床诊断标准、血培养结果、mNGS结果进行诊断一致性分析。以临床诊断标准为“金标准”,计算血培养与mNGS的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、准确度及Youden指数,以评估比较两者的诊断效能。结果:行血培养及mNGS同步检测的62例脓毒症患儿中,中位年龄为17个月,婴幼儿占85.5%;pSOFA评分≥2分共40例,占64.5%,感染灶以呼吸系统为主。血培养与mNGS具有诊断一致性,同时差异具有统计学意义(P<0.05)。临床诊断标准与血培养、mNGS结果的Kappa值均为0.745,具有诊断一致性。在40例符合临床诊断标准的患儿中,其中18例血培养及mNGS结果均为阳性且病原体一致,17例血培养阴性而mNGS结果阳性。血培养与mNGS的敏感度分别为45%、87.5%,特异度为68.1%...  相似文献   

6.
目的:分析宏基因组学二代测序(mNGS)技术在不明原因发热患者病原检测中的应用价值。方法:选择不明原因发热51例患者,留取可疑部位标本送传统细菌培养,同时外送进行病原mNGS检测。比较细菌培养与mNGS病原二代测序结果,统计病原微生物检出敏感性、特异性、诊断效能等。结果:51例患者中传统培养共检出细菌8例(含结核分枝杆菌1例),真菌4例,病原mNGS在30份标本中鉴定出60个病原体,其中细菌22例(含结核分枝杆菌4例)、真菌12例,mNGS检出的病原体数量和种类明显多于传统培养。病原mNGS检测阳性率41.18%(21/51),高于传统培养阳性率23.53%(12/51),差异有统计学意义(P=0.012)。病原mNGS检测细菌、真菌的灵敏度,特异性,阳性预测值,阴性预测值和约登指数分别为91.67%,74.36%、52.38%、96.67%、0.6603,将mNGS检测到的病毒、支原体计算在内,检测阳性率从传统培养的23.53%(12/51)增至60.78%(31/51)。结论:mNGS用于临床病原学检测较传统培养更敏感,有助于不明原因发热患者的诊断和抗菌药物的合理使用。  相似文献   

7.
《中国现代医生》2021,59(5):1-4
目的 探讨支气管肺泡灌洗液Gene X-pert MTB/RIF(简称X-pert)检查对成年人肺结核的诊断价值。方法收集2019年10月至2020年7月湖北省十堰市太和医院165例高度疑似肺结核患者的肺泡灌洗液,完善X-pert检查及BALF涂片检测,分别以病原学诊断和临床诊断为诊断金标准,分析X-pert诊断结核的阳性率,评估X-pert对BALF涂片阴性肺结核的诊断价值,并分析X-pert在成人肺结核中的诊断准确性。结果 最终诊断结核81例,X-pert诊断结核阳性率为39.39%(65/165),BALF涂片的阳性率22.42%(37/165),X-pert诊断结核的阳性率明显高于BALF涂片,差异有统计学意义(P0.05);在81例结核病例中,X-pert真阳性率为77.78%(63/81),分别以病原学诊断和临床诊断为诊断金标准,X-pert在病原学诊断结核中阳性率为82.00%(41/50),敏感度为82.00%,特异度为79.13%。在临床诊断结核中阳性率为70.97%(22/31),敏感度为70.97%,特异度为67.91%。在非结核组出现X-pert阳性2例,假阳性率为2.38%(2/84);以BALF涂片为金标准,在44例BALF涂片阴性的疑似病例中,X-pert检测出结核分枝杆菌阳性27例,检出率为61.36%(27/44)。结论 支气管肺泡灌洗液Gene Xpert MTB/RIF在结核诊断中敏感性高,且在BALF涂片阴性时可快速检测出结核分枝杆菌,具有较高的临床实用价值。  相似文献   

8.
目的评价宏基因组高通量测序(mNGS)在免疫缺陷患者肺部感染诊断与治疗中的应用价值。方法回顾性选取2018年11月至2022年5月在解放军总医院呼吸与危重症医学部第一医学中心重症监护室的78例免疫缺陷肺部感染患者[男55例, 女23例, 年龄(50.3±16.9)岁]和61例非免疫缺陷肺部感染患者[男42例, 女19例, 年龄(63.6±15.9)岁]。两组患者在临床诊断为肺部感染的同时, 均行支气管肺泡灌洗液(BALF)的mNGS及常规微生物学检测(CMTs)。比较两种检测方法的诊断阳性率、病原体检出率以及与临床符合率的差异。同时比较两组患者根据mNGS检测结果抗感染治疗策略调整率的差异。结果免疫缺陷组与非免疫缺陷组肺部感染患者mNGS诊断阳性率分别为94.9%(74/78)和82.0%(50/61), CMTs诊断阳性率分别为64.1%(50/78)和75.4%(46/61), 免疫缺陷组mNGS与CMTs诊断阳性率差异有统计学意义(P<0.001)。mNGS在免疫缺陷组中耶氏肺孢子菌、巨细胞病毒的检出率分别为41.0%(32/78)、37.2%(29/78), 在非免疫缺陷...  相似文献   

9.
目的 通过比较实体器官移植术后肺部感染患者支气管肺泡灌洗液的病原学检测方法,探索宏基因测序技术的应用价值。 方法 57例诊断为肺部感染的肝移植和肾移植受者均采集支气管肺泡灌洗液,对标本仅采用传统病原学检测方法的有38例,为传统方法组。接受mNGS和传统病原学检测方法的有19例,为mNGS组。传统方法组进行细菌、真菌、抗酸杆菌涂片及培养,呼吸道多项病原体抗原抗体、Gene Xpert MTB/RIF检测等传统病原学检测方法。mNGS组除行常规传统检测方法外,标本同时送检宏基因组测序。比较两组病原学检出情况、确诊时间、采信率和住院时间等。采用SPSS 21.0对数据进行统计分析。 结果 mNGS组病原学检出阳性率94.74%(18/19),传统方法组病原学阳性率47.36%(18/38),两组差异有统计学意义(χ2=13.36,P <0.01)。病原学阳性的36例病例中,传统方法组和mNGS组的中位确诊时间分别为3.0(2.0,4.8)天和1.0(1.0,1.25)天,差异具有统计学意义(Z=4.746, P <0.01)。mNGS结果被采信的有94.4%(17/18),传统方法组仅72.2%(13/18),两组病原学结果临床采信率(F=3.446, P =0.063),无显著统计学差异。mNGS组和传统方法组的中位住院天数分别为24.0(13.0,40.0)天和21(12.0,30.0) 天,两组住院天数分布差异无统计学意义(Z=0.373,P=0.709)。 结论 实体器官移植后肺部感染患者支气管肺泡灌洗液mNGS检测阳性率显著高于传统检测方法,且缩短确诊时间,尤其在耶氏肺孢子菌、巨细胞病毒、军团菌等特殊病原体检测中有较大优势。  相似文献   

10.
目的探讨脑脊液宏基因组测序技术(mNGS)在新型隐球菌性脑膜炎(CM)诊断中的应用价值。方法分析7例于2017年3—12月在河南省人民医院确诊为CM患者脑脊液的实验室和mNGS检测病原体的数据。结果 7例患者脑脊液检测中,隐球菌荚膜抗原检测阳性5例(71.4%),墨汁染色阳性3例(42.9%),培养阳性2例(28.6%),mNGS阳性3例(42.9%)。结论 mNGS可快速检测病原体,可作为新型隐球菌性脑膜炎早期诊断的补充手段。  相似文献   

11.
目的探究脑部CT联合血清CRP、LDH联合诊断中枢系统感染患儿的诊断价值。方法选取2016年2月至2019年1月我院诊治的110例中枢系统感染患儿进行研究。根据脑脊液病原学检查分为细菌组(化脓性脑膜炎)和病毒组(病毒性脑膜炎),每组各55例。患儿均接受CT检查,检查血清C反应蛋白(CRP)、乳酸脱氢酶(LDH)阳性率,并对检测结.果进行评价。结.果CT检测化脓性.脑膜炎灵敏度67.27%.、特异度92.73%、约.登指数0.600、阳性预测值90.27%、阴.性预测值73.91%.;CRP检测化脓性脑膜炎灵敏度78.18%.、特异度87.27%、约.登指数0.655、阳性预测值86.00%、阴性预.测值80.00%;LD.H检测化脓性脑.膜炎灵敏度76.36%.、特异度89.09%、约.登指数0685、阳性预测值87.50%、阴性.预测值79.03%;.联合检测化脓性.脑膜炎灵敏度98.18%.、特异度94.55%、约.登指数09.27、阳性预测值94.74%、阴性预测值98.11%明显高于单纯的CT和CRP、LDH检测。结论脑部CT与血清CRP、LDH联合诊断中枢系统感染的诊断价值明显高于单纯的脑部CT和血清CRP、LDH检查。  相似文献   

12.
对儿童幽门螺杆菌粪便抗原检测方法的评价   总被引:2,自引:0,他引:2  
刘敏  张艳玲  贾立英  刘春燕 《北京医学》2005,27(12):726-727
目的探讨适合诊断儿童幽门螺杆菌(Hp)感染的检测方法.方法收集93例儿童粪便,用酶免疫反应进行Hp粪便抗原(HpSA)试验,以13C-尿素呼气实验(13C-UBT)和(或)胃镜检查作为诊断Hp感染的金标准.结果金标准诊断阳性44例,阴性49例."金标准"阳性的44例中HpSA检测阳性40例,"金标准"阴性4例;阴性的49例中HpSA检测阴性43例,阳性6例.HpSA检测诊断儿童Hp感染的敏感性为90.91%(40/44),特异性为87.76%(43/49),阳性预测值为86.96%(40/46),阴性预测值为91.49%(43/47),诊断准确性为89.25%(83/93).结论HpSA实验是一种简便、准确的诊断儿童Hp感染的检测方法,特别适用于儿童.  相似文献   

13.
目的 探讨脑脊液宏基因组二代测序(mNGS)技术对临床高度疑似颅内感染病原学诊断的价值。方法 回顾性分析2021年9月1日至2022年10月31日就诊于郑州大学第一附属医院急诊重症监护室的30例高度疑似颅内感染患者的病例资料,共留取脑脊液mNGS标本30例,同时进行微生物培养。采集患者病史、体征、实验室及辅助检查结果。分析脑脊液mNGS技术对高度疑似颅内感染病原学诊断的价值。结果 脑脊液mNGS总体检测阳性率(43.33%)高于常规培养法(10.00%),mNGS检测时间中位数(36.3 h)低于常规培养(104.2 h),差异有统计学意义(P<0.05)。mNGS对总体颅内感染特异度为76.92%,灵敏度为58.82%;常规培养对颅内感染特异度为100.00%,灵敏度为17.65%,mNGS对颅内感染预测的灵敏度较常规培养高,且其对于颅内感染的诊断价值较高。结论 mNGS能够快速检测脑脊液感染病原体,可为临床早期精准治疗提供重要的病原学依据,且具有较高的诊断价值。  相似文献   

14.
目的 探讨粪便Hp抗原(HpSA)及14C-尿素呼气试验(14C-UBT)2种非侵入性检测方法 对幽门螺杆菌(Hp)感染的诊断价值.方法 采用胃黏膜快速尿素酶法(RUT) 和活组织切片染色法联合检测的结果 作为Hp感染诊断的"金标准",对2009年1月-2011年6月在新疆医科大学附属中医医院门诊就诊的因上消化道症状接受胃镜检查的132例患者进行粪便Hp抗原(HpSA)及14C-尿素呼气试验(14C-UBT)的检测,并与"金标准"进行对比分析.结果 132例患者中RUT法检出Hp阳性95例,组织切片染色法检出Hp阳性92例,其中81例2种方法 检测均阳性,将此81例患者作为Hp感染的现症患者,26例2种方法 均阴性者作为Hp非感染者.对"金标准"检测的81例Hp阳性患者及26例阴性患者再行HpSA及14C-UBT检测.以"金标准"作为Hp感染的诊断标准,14C-UBT检测的敏感性为95.06%(77/81),特异性为92.31%(24/26),阳性预测值为97.47%(77/79),阴性预测值为85.71%(24/28),准确性为94.40%(101/107);HpSA检测的敏感性为91.36%(74/81),特异性为88.46%(23/26),阳性预测值为96.10%(74/77),阴性预测值为76.67%(23/30),准确性为90.65%(97/107).结论 HpSA及14C-UBT检测是非侵入性诊断Hp感染的较理想的方法,值得在临床推广,临床医生可根据具体情况选择检测方法,也可以联合运用检测方法 来减少假阴性或假阳性结果 的出现.  相似文献   

15.
目的 探讨宏基因组二代测序技术(m NGS)在呼吸系统感染病原学诊断中的应用价值。方法 选取2020年12月-2021年1月在南方医科大学珠江医院就诊的48例呼吸系统感染者为研究对象,比较痰mNGS检测和痰培养检出病原体的分布、阳性率、符合率、混合感染率,对检出的部分特殊病原体采用PCR、质谱技术进行验证,分析痰mNGS检测的优势和可行性。结果 痰mNGS检出75株病原体,其中细菌20株,真菌24株,病毒16株,特殊病原体15株;痰培养检出20株病原体,其中细菌8株,真菌11株,特殊病原体1株。痰mNGS与痰培养检测病原体总符合率为35.42%(17例),阳性符合率为22.92%(11例)。痰mNGS检测病原体阳性率87.50%(42例)和混合感染率60.42%(29例)均显著高于痰培养的阳性率29.17%(14例)和混合感染率8.33%(4例),差异均有统计学意义(χ2=32.685、28.860,P均<0.05)。特殊病原体鹦鹉热衣原体、结核分枝杆菌复合群(MTB)和诺卡菌,验证结果与痰mNGS检测符合率均为100.00%(各2例)。鹦鹉热衣原体患者根据...  相似文献   

16.
目的探讨实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)法检测结核分枝杆菌在结核性脑膜炎诊断中的价值。方法对181例临床确诊的结核性脑膜炎患者、可疑结核性脑膜炎患者和非结核性脑膜炎患者的脑脊液标本采用涂片、实时荧光定量PCR 2种方法进行检测,对其结果进行对比分析。结果 181例脑脊液标本中,脑脊液涂片检测阳性率为2.21%(4/181),PCR检测阳性率为12.15%(22/181);脑脊液涂片、PCR法检测51例临床确诊的结核性脑膜炎患者脑脊液标本阳性率分别为5.88%(3/51)和25.49%(13/51);检测80例临床可疑结核性脑膜炎患者脑脊液标本阳性率分别为1.25%(1/80)和11.25%(9/80),2种方法的阳性检测率比较差异有统计学意义(χ2=10.654,P<0.05)。50例非结核性脑膜炎患者脑脊液标本涂片及PCR检测均为阴性。结论实时荧光定量PCR法检测结核分枝杆菌具有较高的临床价值,可作为临床结核病检测诊断的有效方法之一。  相似文献   

17.
目的:探讨宏基因组二代测序(mNGS)在重症肺炎肺泡灌洗液中的检测优势。方法:选取2019年12月至2021年10月在武汉大学中南医院收治的70例重症肺炎患者,所有患者均已行mNGS和传统培养(肺泡灌洗液培养、痰培养),回顾性分析mNGS在重症肺炎患者中病原体检测的优势。结果:mNGS病原体检测的阳性率高于传统培养(98.6%vs 62.9%,P<0.001)。在传统培养阴性而mNGS阳性的患者中,mNGS能进一步识别出多种病原体感染。在病原体分布上,mNGS检出细菌71株、真菌39株和病毒3株。在混合感染中,mNGS诊断阳性率更高(67.1%vs 12.9%,P<0.001)。此外,在合并基础疾病的患者中,mNGS有更高的病原体检出率(98.0%vs 69.4%,P<0.001),尤其在合并免疫低下的患者中,mNGS可识别出特殊病原体(肺孢子菌、巨细胞病毒)感染。结论:mNGS可以提高重症肺炎患者病原微生物的检出率,可作为传统培养阴性的重症肺炎患者的补充检测技术。mNGS在混合感染诊断中有优势,能同时识别多种病原体感染。临床上,推荐合并免疫缺陷的重症肺炎患者尽早应用...  相似文献   

18.
目的 比较宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)与实验室传统培养在肺部感染病原中诊断的应用价值。方法 回顾性分析2021年2月—2022年9月中部战区总医院收治的310例疑诊肺部感染患者临床资料,分析mNGS与实验室传统培养检测结果,对比2种检测方法检测肺部感染病原的阳性率、灵敏性、特异性、准确性(accuracy, ACC)、阳性预计值(positive predictive value, PPV)、阴性预计值(negative predictive value, NPV)。结果 研究发现,mNGS能够同时检出多种病原,对细菌的检出效率最高,对真菌的检出阳性率最低,且mNGS检出的细菌、真菌与病毒的序列数之间有显著差异(H=70.361,P<0.001)。在比较分析mNGS与实验室传统培养方法中发现,mNGS检出阳性率(88.40%)高于实验室传统培养(29.70%),差异有统计学意义(χ2=162.373,P<0.001),检测结果一致性比较Kappa=-0.003,P=0.90...  相似文献   

19.
目的 :探讨中枢神经系统感染性疾病的病原学特点。方法 :分别用双抗体夹心ELISA法和传统的细菌及真菌培养等方法检测患者血清IgM ,IgG抗体和脑脊髓液中病原体。结果 :82 3例中枢神经系统急症患者中有 12 6例 (15 .3%)单纯疱疹病毒IgM和 /或IgG阳性 ,其中 10岁以下年龄为高峰。 10 (1.2 %)例巨细胞病毒特异性IgM和 /或IgG阳性 ;8(0 .97%)例水痘 带状疱疹病毒特异性IgM和 /或IgG阳性 ;7(0 .85 %)例为结核性脑膜炎 ;6 (0 .72 %)例为新生隐球菌性脑膜炎 ;1(0 .12 %)例为脑膜炎球菌性脑膜炎。结论 :病毒 ,特别是单纯疱疹病毒 ,是中枢神经系统感染性疾病的常见病原 ;结核杆菌和新生隐球菌感染也占一定比例。  相似文献   

20.
目的 分析研究宏基因二代测序技术(mNGS)在肺部感染病原菌检测中的应用价值,为临床诊断提供理论依据。方法 回顾性选取疑似肺部感染患者161例为研究对象,采集肺泡灌洗液标本、痰液、肺组织活检标本、胸水和血液同时进行常规培养、呼吸道病原体核酸检测及病原微生物mNGS检测,分别计算3种检测方法的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值,评估mNGS的临床应用价值。结果 161例疑似肺部感染患者中,确定为肺部感染的有113例。入组的161例患者中,mNGS灵敏度、阴性预测值相比常规培养及呼吸道病原体核酸检测提高,差异有统计学意义(P<0.001)。mNGS的特异度虽然高于呼吸道病原体核酸检测,但差异无统计学意义。mNGS阳性预测值最高,高于呼吸道病原体核酸检测,但是与常规培养相比差异无统计学意义。结论 mNGS在肺部感染病原微生物诊断中灵敏度均超过了常规培养及呼吸道病原体核酸检测,降低了诊断的假阴性率,综合评价较好;常规培养检测灵敏度低,但特异度较高;呼吸道病原体核酸检测灵敏度相较常规培养有所提高,但其特异度下降。  相似文献   

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