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目的:基于网络药理学方法研究六君子汤抗肺癌的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP)获得LJS活性成分,采用Swiss Target Prediction平台预测活性成分的潜在靶点,并检索Online Mendelian Inheritance in Man等疾病靶点数据库,以获得LJS抗肺癌的作用靶点。借助String数据库和Cytoscape 3.2.1软件构建PPI网络,筛选degree值排名前10的靶点。采用Metascape平台对LJS抗肺癌作用靶点进行KEGG通路分析。结果:从LJS中筛选出178个活性成分,59个与LJS抗肺癌相关靶蛋白。KEGG通路富集结果显示其参与调节PI3K-Akt信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药、白介素17信号通路等信号通路。结论:LJS通过"多成分-多靶点-多通路"方式发挥抗肺癌作用。 相似文献
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目的 基于网络药理学预测黄连解毒汤治疗溃疡性结肠炎(UC)的有效成分、靶点和作用机制.方法 通过TCMSP、GeneCards、OMIM数据库筛选黄连解毒汤的活性成分、作用靶点和UC疾病相关的基因.使用Cytoscape软件构建"药物活性成分-靶点-疾病"网络.通过STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络,推测核心... 相似文献
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《中国民族民间医药杂志》2020,(10)
目的:通过网络药理学方法探究金荞麦治疗慢性咽炎的有效成分、关键靶点、相关通路信息。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台TCMSP数据库检索,找出药物金荞麦的主要成分及作用靶点;利用人类基因组数据注释系统(Gene Cards)和联机孟德尔人类遗传数据库(OMIM)找出与疾病相关的作用靶点,将金荞麦的主要成分的作用靶点与慢性咽炎的相关靶点取交集,将交集靶点导入STRING数据库得到PPI网络,对该网络进行拓扑分析找出关键靶点,且通过Cytoscape3. 7. 0软件构建"药物-主要成分-疾病-作用靶点"网络图;把关键靶点导入DAVID数据库,找出金荞麦治疗慢性咽炎关键靶点参与的生物学过程、分子功能、细胞组分和KEGG通路。结果:通过TCMSP数据库的口服利用度(OB)和类药性(DL)条件筛选出15个金荞麦主要化合物,相应作用靶点100个;与慢性咽炎发病机制有关的作用靶点40个,经拓扑分析得到14个关键靶点; GO分析富集得到生物过程109个,分子功能30个,细胞组分9个,47条KEGG信号通路。结论:采用网络药理学的方法初步判断金荞麦治疗慢性咽炎是多成分-多靶点-多通路实现的,可进一步揭示金荞麦的药用价值。 相似文献
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《中药材》2020,(1)
目的:运用网络药理学分析甘露消毒丹抗手足口病的有效成分、作用靶点及通路,探讨其抗手足口病的作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选甘露消毒丹的有效成分、潜在靶点及相关疾病信息,构建化合物靶点相互作用网络图;利用OMIM数据库、GeneCards数据库筛选手足口病的相关靶点,进而构建疾病靶点相互作用网络图;采用Cytoscape3.2.1软件构建"成分-靶点"网络,采用String数据库和Cytoscape3.2.1软件绘制蛋白相互作用网络,通过Systems Dock Web Site对成分与靶点进行分子对接验证。采用DAVID数据库对靶点进行GO及KEGG通路分析,通过DisGeNET数据库对靶点所属的类型进行归属。结果:共筛选出甘露消毒丹有效成分25种,潜在抗手足口病靶点73个,其中30个核心靶点,20个显著富集通路。结论:通过网络药理学初步探究了甘露消毒丹抗手足口病主要潜在靶点和相关通路,结合课题组前期研究,证实了该方多成分、多靶点、整体调节的作用特点。 相似文献
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中药白鲜皮挥发油中含有多种化学成分,采用网络药理学方法可以揭示"成分-靶点-疾病"复杂网络关系,揭示白鲜皮的药效作用机制。该研究通过Swiss Target Prediction数据库预测作用靶点;通过STRING数据库构建蛋白相互作用网络;采用Cytoscape软件构建"成分-靶点-疾病"网络。结果显示:白鲜皮抗菌、抗炎、抗过敏等作用与麝香草酚甲醚、榄香醇、茴香脑、侧柏烯、肉豆蔻醚等成分密切相关,且各个成分的相关作用靶点相互交联,共同发挥多靶点药效作用。该研究为中药白鲜皮的药效物质基础研究与质量控制评价奠定了基础,并为进一步深入揭示其作用机制提供了科学依据。 相似文献
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《中医药导报》2019,(23)
目的:利用网络药理学的方法探索"桃仁-红花"治疗股骨颈骨折(Femoral neck fracture)的可能作用机制。方法:通过TCMSP数据库、文献检索获取"桃仁-红花"的活性成分,利用DRAR-CPI服务器、GeneCards和OMIM数据库筛选其活性成分影响骨代谢的潜在作用靶点。用Cytoscape软件构建"桃仁-红花"的活性成分-作用靶点网络。通过String数据库和Cytoscape软件的Generate style from statistics工具,获得蛋白质相互作用网络。采用Systems Dock Web Site网络服务器与"桃仁-红花"的活性成分进行分子对接。利用DAVID数据库对其作用靶点进行GO分类富集分析和KEGG通路富集分析。结果:从"桃仁-红花"中筛选出活性成分45个、作用靶标53个。"桃仁-红花"治疗股骨颈骨折主要涉及PGE_2、Cox-2、EGFR、Wnt、RNKL和LGR4等信号通路。结论:本研究运用网络药理学的方法初步预测出"桃仁-红花"治疗股骨颈骨折的主要作用机制,但仍需要进一步的实验验证。 相似文献
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目的:运用网络药理学方法和技术,研究"当归-菟丝子"药对治疗多囊卵巢综合征(PCOS)的主要活性成分、靶点、通路等药理学作用机制。方法:通过数据挖掘获得PCOS肾虚血瘀型核心药对当归-菟丝子;检索中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选出当归和菟丝子的活性成分和潜在靶点;查询NCBI数据库获得PCOS疾病靶点,找到药物和疾病的共靶点;通过David数据库和Omicshare数据库对共靶点进行基因功能GO富集分析和KEGG富集分析;采用Cytoscape软件构建成分-靶标-通路网络。结果:从"当归-菟丝子"药对中筛选得到42个候选活性分子,作用于719个靶点,其中与PCOS重合的22个疾病靶点主要涉及炎性反应、细胞因子、雌激素、胰岛素抵抗等生物学过程中的多条信号通路。结论:当归-菟丝子药对治疗PCOS是通过补肾活血化瘀达到抗炎、抗肿瘤、调节血脂、促进微循环及改善胰岛素抵抗,通过多成分、多靶点、多途径之间的协同作用来恢复机体的平衡,与现代治疗PCOS的作用机制相符合。 相似文献
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目的:借助网络药理学研究人参-三七药对治疗无症状性心肌缺血的作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),以"人参""三七"为检索词获取药物成分及作用靶点,运用UniProt对基因靶点标准化处理,利用Cytoscape 3.7.2软件构建成分-靶点网络图;以GeneCards平台挖掘SMI作用靶点;... 相似文献
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目的:运用网络药理学理念和技术研究"川芎-延胡索"药对的主要活性成分、靶点和药理学作用机制。方法:通过检索中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库,结合口服生物利用度和类药性分析,筛选出川芎和延胡索的主要成分、靶点信息,采用Cytoscape软件构建活性成分-作用靶点网络,获取的靶点信息,筛选核心靶点。利用DAVID在线分析工具对靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和KEGG通路分析。结果:从"川芎-延胡索"药对中筛选得到58个主要活性成分相关作用于靶点220个,主要涉及在癌症、信号传导、免疫、细胞通讯及凋亡等生物学过程中的多条信号通路。结论:本研究初步揭示了"川芎-延胡索"药对的主要活性成分、靶点及协同作用机制,为进一步深入探讨其药理学作用提供了参考。 相似文献
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《新中医》2020,(3)
目的:运用网络药理学方法和技术,研究"当归-菟丝子"药对治疗多囊卵巢综合征(PCOS)的主要活性成分、靶点、通路等药理学作用机制。方法:通过数据挖掘获得PCOS肾虚血瘀型核心药对当归-菟丝子;检索中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选出当归和菟丝子的活性成分和潜在靶点;查询NCBI数据库获得PCOS疾病靶点,找到药物和疾病的共靶点;通过David数据库和Omicshare数据库对共靶点进行基因功能GO富集分析和KEGG富集分析;采用Cytoscape软件构建成分-靶标-通路网络。结果:从"当归-菟丝子"药对中筛选得到42个候选活性分子,作用于719个靶点,其中与PCOS重合的22个疾病靶点主要涉及炎性反应、细胞因子、雌激素、胰岛素抵抗等生物学过程中的多条信号通路。结论:当归-菟丝子药对治疗PCOS是通过补肾活血化瘀达到抗炎、抗肿瘤、调节血脂、促进微循环及改善胰岛素抵抗,通过多成分、多靶点、多途径之间的协同作用来恢复机体的平衡,与现代治疗PCOS的作用机制相符合。 相似文献
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《中药材》2017,(9)
目的:运用网络药理学理念和技术研究"黄芪-当归"药对的主要活性成分、靶点和药理学作用机制。方法:通过检索中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库,结合口服生物利用度和类药性分析,筛选出黄芪和当归的成分、靶点信息,采用Cytoscape软件构建成分-靶标网络,获取的靶点信息利用MAS 3.0生物分子功能注释系统进行基因功能和通路的注释和分析。结果:从"黄芪-当归"药对中筛选得到58个候选活性分子,作用于206个靶点,主要涉及在信号转导、抗凋亡、炎症反应等生物学过程中的多条信号通路。结论:本研究初步揭示了"黄芪-当归"药对的主要活性成分、靶点及协同作用机制,为进一步深入探讨其药理学作用提供了参考。 相似文献
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目的 应用网络药理学方法探讨玄参-麦冬药对治疗焦虑症的作用机制,为临床应用玄参-麦冬药对提供依据。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中医药整合药理学研究平台(TCMIP)收集玄参、麦冬的化学成分,结合TCMSP、SwissADME数据库及文献筛选活性成分,利用Swiss TargetPrediction数据库预测活性成分作用靶点;通过OMIM、GeneCards、DrugBank数据库获取焦虑症的相关靶点,与活性成分作用靶点取交集;利用STRING数据库建立活性成分-疾病共同靶点蛋白相互作用(PPI)网络,采用Cytoscape3.8软件对PPI网络进行MCODE聚类分析,得出关键靶点;利用DAVID6.8数据库对活性成分-疾病共同靶点进行GO和KEGG富集分析,通过活性成分-靶点-通路网络筛选核心活性成分,用分子对接模拟核心活性成分与关键靶点的结合强度。结果 共筛选出玄参-麦冬药对37个活性成分,潜在靶点471个,焦虑症相关靶点753个,活性成分-疾病共同靶点42个,对其PPI网络进行MCODE聚类分析得到4种类簇,筛选出关键靶点14个。GO和KEGG富集分析显... 相似文献
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目的:基于网络药理学方法分析金蝉口服液抗呼吸道合胞病毒感染的主要活性成分、靶点和作用机制.方法 :通过中药系统药理学数据库(TCMSP)和文献资料筛选出金蝉口服液主要活性成分,通过Swiss Target Prediction、STICH数据库预测主要活性成分的作用靶点.利用GAD、DisGeNET数据库查找呼吸道合胞... 相似文献
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