基于网络药理学探讨加味过敏煎治疗荨麻疹的作用机制

目的：通过网络药理学方法探讨加味过敏煎治疗荨麻疹的作用机制。方法：检索中药系统药理学平台(TCMSP)选取加味过敏煎君药中的有效元素和作用靶点;通过检索人类基因信息数据库选取荨麻疹的疾病靶点;应用R语言筛选药物与疾病共同靶点,应用Cytoscape软件构建药物-化合物-作用靶点-疾病互作网络;运用STRING平台构建蛋白质间相互作用网络（PPI）,并将结果进行可视化展示;使用Bioconductor生物信息软件包进行GO功能富集分析和KEGG通路分析。结果：包含了45个化合物和相应靶点409个,并得到61个疾病相关作用靶点。富集分析得到84个GO功能条目和126条KEGG信号通路。结论：加味过敏煎作用于荨麻疹的PPI网络中IL-6、AKT1、VEGFA等靶点起着关键作用,这些靶点主要涉及细胞因子受体结合、细胞因子及受体配体活性等生物学过程,并主要富集在AGE-RAGE、PI3K/Akt等多条信号通路上,发挥抗炎和免疫调节等作用,这可能是加味过敏煎治疗荨麻疹的关键作用机制。     

基于网络药理学和分子对接探究天冬治疗过敏性哮喘的作用机制

目的：运用网络药理学方法和分子对接技术探究天冬治疗过敏性哮喘的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、TCMID及BATMAN-TCM、STP数据库获取天冬活性成分和靶点,通过GeneCards和OMIM、TTD数据库获得过敏性哮喘的治疗靶点,利用Venny 2.1得到交集靶点,并采用STRING数据库绘制蛋白互作(PPI)网络。应用Metacape进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析,使用Cytoscape 3.9.1构建“药物-活性成分-疾病-靶点网络”,运用Autodock vina 1.1.2进行分子对接验证。结果：筛选得到天冬8个活性成分、323个活性成分靶点基因和2629个疾病靶点基因以及169个交集基因,关键靶点包括蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、SRC、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体1(ESR1)、MMP9、白细胞介素2(IL2)等;涉及治疗过敏性哮喘的GO分析2212条,KEGG分析193条,主要通过磷酯酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、受体相关蛋白1(Rap...     

过敏煎加味方治疗过敏性支气管哮喘20例

目的：观察过敏煎加味方对过敏性支气管哮喘的临床疗效，并探讨其机制。方法：以疏风祛痰，柔肝理肺平喘为基本治疗方法，拟出过敏煎加味方对20例支气管哮喘发作期轻、中度患者进行治疗，并进行服药前后对照，观察治疗前后哮喘症状及体征、嗜酸性粒细胞的变化。结果：临床总有效率85％，在改善临床症状和体征，降低外周血嗜酸性粒细胞方面作用明显。结论：过敏煎加味方对过敏性支气管哮喘疗效显著，具有平喘、止咳、祛痰的作用，可能有抗气道炎症作用。     

基于网络药理学预测射干治疗支气管哮喘作用机制

目的:基于网络药理学预测射干治疗支气管哮喘的作用机制。方法:通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索射干化学成分,Swiss Target Prediction数据库得到射干的预测靶点,通过Gene Cards数据库获取哮喘相关靶点将射干的预测靶点与哮喘相关靶点进行映射得到射干治疗哮喘的预测靶点。通过Cytoscape(3.6.0)软件,生成射干治疗哮喘的蛋白与蛋白相互作用(PPI)网络。通过DAVID网站(基因百科全书)进行KEGG通路分析,运用systems Dock网站对预测靶标与其对应的成分进行分子对接。结果:射干活性化合物有17种,筛选出射干可能与哮喘相关的靶点74个,关键靶点共16个,包括雌激素受体α(ESR1)、蛋白激酶C-α(PRKCA)、醛糖还原酶(AR)、蛋白激酶C-delta(PRKCD)、蛋白质激酶C-β(PRKCB)等。通过KEGG通路分析得到128条通路,结合文献检索,筛选出治疗哮喘的可能通路为20条,主要分为以下四类,①气道炎症相关通路:PI3K-Akt信号通路、趋化因子信号通路、MAPK信号通路等;②气道平滑肌相关通路:Ras信号通路、Hippo信号通路、钙信号通路等;③血管增生相关通路:VEGF信号通路;④免疫相关通路:T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路。结论:射干通过多靶点、多通路治疗哮喘,其机制可能与气道炎症相关通路、气道平滑肌相关通路、血管增生相关通路、免疫相关通路的作用相关。     

基于网络药理学探讨白果治疗哮喘作用机制

目的 基于网络药理学探讨白果治疗哮喘作用机制.方法 基于TCMSP数据库获取白果化学成分及其对应靶点,基于OMIM、Gene Cards数据库获取哮喘相关靶点,利用Venny2.1绘制白果靶点与哮喘疾病靶点的韦恩图,利用Cytoscape3.6.1软件构建中药-靶点网络及应用STRING平台构建蛋白相互作用网络(PPI...     

基于网络药理学探讨温胆汤治疗哮喘作用机制

目的 基于网络药理学探讨温胆汤治疗哮喘作用机制.方法 基于TCMSP数据库获取温胆汤中主要药物的化学成分及其对应靶点,基于OMIM、Gene Cards数据库获取哮喘相关靶点,利用Cytoscape3.6.1软件构建中药-靶点网络及应用STRING平台构建蛋白相互作用网络(PPI),应用R语言软件对关键靶点进行GO富集...     

基于网络药理学的丹参治疗哮喘作用机制初探

目的 运用网络药理学方法探讨丹参治疗哮喘的作用靶点及通路。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取丹参活性成分及潜在靶点;应用OMIM、GeneCards、TTD、DrugBank和DisGeNET数据库收集哮喘靶点,利用R语言获得丹参治疗哮喘的作用靶点,依据STRING 11.0数据库获取蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;在Metascape平台进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）和基因本体（GO）分析,运用Cytoscape 3.5.1软件构建丹参治疗哮喘的成分-靶点-通路网络,并筛选核心靶点,采用MOE 2019软件对重要化合物进行分子对接验证。结果 筛选得到丹参治疗哮喘的59个化学成分、108个靶点及20条关键通路。其中,隐丹参酮主要通过肿瘤坏死因子（TNF）、Toll样受体4（TLR4）等蛋白抑制核转录因子-κB（NF-κB）通路,减轻哮喘气道炎症;丹参酮Ⅱ_A主要通过核转录因子-κB抑制剂α（NFKBIA）等减弱TNF-α和NF-κB表达,抑制NF-κB通路,减轻炎症损伤;木犀草素主要通过蛋白激酶B1（Akt1）、白细胞介素-6（IL-6）和信号传导与转录激活因子3（STAT3）等介导磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）-Akt和Janus激酶-信号转导子与转录激活因子（JAK-STAT）通路,通过缓解气道炎症、改善气道重塑和免疫调节治疗哮喘。分子对接显示,三者与疾病靶点生物亲和力高。结论 丹参可以通过多成分、多靶点、多途径发挥治疗哮喘的作用。     

基于网络药理学探讨麻杏二三汤治疗支气管哮喘作用机制

目的：联合网络药理学数据库研究麻杏二三汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法：运用传统中药系统药理学数据库和分析平台与有机小分子生物活性数据库获取麻黄、苦杏仁、陈皮、半夏、茯苓、紫苏子、莱菔子、白芥子、诃子、甘草的有效成分及对应靶点;从人类基因数据库和在线人类孟德尔遗传数据库获取支气管哮喘相关靶标,同时利用Venny 2.1在线网络获取交集基因;运用Cytoscape (Version3.7.2)和STRING数据库构建药物-成分-靶标-疾病网络图和蛋白质-蛋白质相互作用网络,进而运用cytoHubba插件鉴定出核心靶标。最后,运用Metascape数据库进行基因本体（GO）富集分析与京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：研究筛选得到麻杏二三汤治疗支气管哮喘的主要治疗靶标包括血管内皮生长因子A (VEGFA)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子（TNF）、禽肉瘤病毒17(JUN)、p53肿瘤蛋白（TP53）、信号转导及转录激活蛋白3 (STAT3)、促分裂素原活化蛋白激酶3 (MAPK3)、前列腺内过氧化物合成酶2 (PTGS2)、促分裂素原活化蛋白激酶1 (MAPK...     

基于微阵列芯片对三子养亲汤治疗过敏性哮喘的分子作用研究

目的：研究三子养亲汤治疗过敏性哮喘的作用机制。方法：使用GEO2R找到GSE40889芯片的差异基因,利用GCBI数据库制作差异基因热图,借助DAVID6.8对差异基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,使用Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选核心基因,分析网络,再进一步利用Cytoscape的MCODE插件对差异表达基因进行模块分析。结果：共查询有效成分21个,对应靶点268个;筛选出213个差异基因,差异表达基因主要富集在膜组织、RNA结合及转录翻译方面等,涉及通过TNF-α、B细胞受体、TGF-β、PI3K/AKT信号通路。得到一个重要模块,功能主要集中在基因沉默的调控、蛋白质异构化、细胞-细胞黏附、病毒过程等方面及RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、p53介导的内源性凋亡信号通路对DNA损伤的响应、DNA模板、宿主对病毒转录的正调控等,涉及Notch信号通路、FoxO信号通路、PI3K-AKT信号通路等信号通路。结论：三子养亲汤可能通过TNF-α、B细胞受体、TGF-β、PI3K/AKT信号通路,调控基因沉默、使蛋白质异构...     

基于网络药理学探讨蠲哮汤治疗哮喘的作用机制

目的：运用网络药理学方法探讨蠲哮汤对哮喘的防治作用及可能的分子机制。方法：利用中药系统药理数据库和分析平台（TCMSP）筛选蠲哮汤药物活性成分及作用的靶蛋白,通过PubChem和Swiss Target Prediction数据库收集活性成分作用靶点的基因名,从GeneCards和OMIM数据库中获得哮喘疾病相关靶点,利用Venny 2.1.0获得的二者交集靶点即为蠲哮汤治疗哮喘的潜在作用靶点。利用Cytoscape 3.9.0软件构建“中药-活性成分-作用靶点”网络图,采用STRING数据库构建蠲哮汤治疗哮喘潜在作用靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并利用Cytoscape 3.9.0软件对其进行拓扑学分析,筛选出核心靶点。进一步利用DAVID数据库对筛选得到的靶点进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,进一步筛选重要化合物与疾病靶点,进行分子对接预测。结果：共得到蠲哮汤60个潜在活性成分,预测到110个作用靶点。收集哮喘靶点1 432个,取交集得到蠲哮汤治疗哮喘的作用靶点36个,对应活性成分23个,其中以槲皮素、山柰酚、芦丁和柚皮素为主。拓扑分析得到3...     

基于网络药理学的鼻渊通窍颗粒治疗过敏性鼻炎的分子机制研究

目的：通过网络药理学方法筛选鼻渊通窍颗粒化学成分,构建成分-疾病靶点网络,研究其治疗过敏性鼻炎的潜在分子机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和DrugBank数据库,筛选鼻渊通窍颗粒所含的化学成分,并获取其作用靶点;应用GeneCards数据库,以“Allergic Rhinitis”为关键词检索过敏性鼻炎疾病靶点;获得药物和疾病的共同靶点并导入STRING数据库得到蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）关系,通过Cytoscape 3.7.2构建PPI网络。使用clusterProfiler进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。以药物网络分子中结合位点较多的槲皮素、芹菜素、山柰酚通过AutoDock软件同PTGS1、PTGS2,以及与过敏性鼻炎密切相关的血清因子IgE抗体进行分子对接。结果：网络药理学研究发现鼻渊通窍颗粒治疗过敏性鼻炎可能的活性成分为槲皮素、芹菜素、山柰酚、熊果酸、迷迭香酸,通过调节PTGS2、PTGS1、CHRM2、ADRB2、NOS2等靶点,调控MAPK、HIF-1、核因子κB、cAMP等信号通路,发挥其抑制炎症的作用。分子对接结果显示,关键成分对PTGS1、PTGS2和IgE抗体具有良好的亲和性。结论：本研究基于网络药理学理论和分子对接技术揭示了鼻渊通窍颗粒以多成分、多靶点、系统调节过敏性鼻炎,为临床药物治疗提供依据。     

基于网络药理学探析补中益气汤治疗变应性鼻炎的作用机制

目的：基于网络药理学探析补中益气汤治疗变应性鼻炎的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选得到补中益气汤的化学成分和作用靶点,同时利用GeneCards数据库获得与变应性鼻炎治疗相关的靶基因,利用Cytoscape3.7.1软件将所获得数据进行“药物-成分-疾病-靶点”网络可视化模型构建,使用STRING数据库构建共有靶基因的蛋白质-蛋白质相互作用（ PPI）网络,最后采用R软件以P<0.05、Q<0.05进行关键靶基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG） 功能富集分析。结果：筛选出补中益气汤有效活性成分172个,其治疗变应性鼻炎的机制可能与IL6、VEGFA、JUN、MMP9、MMP2等核心靶蛋白密切相关,推测其主要通过参与IL-17、TNF、HIF-1、Toll样受体、PI3K-AKT、核因子κB、MAPK、Th1和Th2细胞分化、JAK-STAT等信号通路干预调控变应性鼻炎。结论：本研究揭示了补中益气汤治疗变应性鼻炎多基因、多靶点、多通路的网络调节机制,从整体角度阐述了中医药有效的作用机制,为下一步实验研究提供分子层面的思路。     

玉锁丹治疗糖尿病的网络药理学研究＊

目的 运用网络药理学方法探讨玉锁丹（YSD）治疗糖尿病（DM）潜在活性成分和作用机制。方法 根据TCMSP、TCMID、BATMAN-TCM平台及文献报道筛选YSD（茯苓、五倍子、龙骨）有效成分，并以SiwssTargetPrediction平台预测上述活性成分潜在靶点，同时利用Gencards、DisGeNET、DrugBank数据库挖掘DM相关靶点，将获取的活性成分靶点与疾病靶点交集得到YSD抗DM的预测靶点。利用String平台对预测靶点构建蛋白相互作用（PPI）网络并结合Mcode探索其蛋白质功能模块；通过Metascape数据库对预测靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析，并以Cytoscape3.7.1 软件构建“玉锁丹成分-糖尿病靶点-通路”网络，最后采用SiwssDock平台对YSD的化学成分与重要靶点进行分子对接验证。结果 玉锁丹抗DM的核心活性成分为麦角胺、啤酒甾醇、杨梅素、猪苓酸C、25-羟基-3-表去氢土莫酸等，核心靶点为PTPN1、TNF、PIK3CA、PPARA、AGTR1等。分子对接验证显示G < -7 kcal / mol占总数71%，介于-6至-7占29%，即多数成分与靶点结合活性稳定。玉锁丹抗糖尿病的生物通路主要作用于Endocrine resistance、Insulin resistance、PI3K-Akt signaling pathway等，其功能主要调节激素水平及细胞内有机氮化合物等生命活动。结论 玉锁丹抗糖尿病具有多成分-多靶点-多通路的作用特点，尤其与预防胰岛素抵抗，调节激素水平密切相关。     

基于网络药理学探讨乌梅治疗哮喘的作用机制

目的基于网络药理学方法,探讨乌梅治疗哮喘的作用机制。方法运用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)检索乌梅的活性成分和靶标蛋白。运用治疗靶点数据库(TTD)检索哮喘的靶标蛋白。通过Cytoscape软件对二者的靶标蛋白进行交集,得到交集靶标蛋白并在Unitprot数据库查询交集靶标蛋白的基因名称。将交集靶标蛋白输入STRING数据库中构建蛋白相互作用网络。使用DAVID在线分析工具对交集靶标蛋白基因进行GO富集及KEGG通路富集分析。结果从乌梅中筛选出8种活性成分,涉及哮喘的靶标有14个。其治疗机制可能与神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、脂肪细胞脂解的调控、cAMP信号通路、利什曼病、胆碱能突触、TNF信号通路、弓形虫病有关。结论乌梅治疗哮喘涉及多种黄酮类、甾醇类化合物,可能与肾上腺素受体、肿瘤坏死因子、趋化因子、白三烯等有关,并涉及神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路等通路。     

基于网络药理学的四逆汤抗心肌缺血损伤的分子机制研究

目的:运用网络药理学方法预测分析四逆汤抗心肌缺血作用机制和配伍规律。方法:采用TCMSP、TCMID、TCM-PTD数据库以及文献挖掘的方法收集四逆汤的活性化合物,利用DRAR-CPI服务器预测活性化合物的靶点,同时应用DisGeNET和CTD数据库收集抗心肌缺血损伤药物作用靶点,然后将两种方法收集到的靶点进行比对分析,筛选出四逆汤抗心肌缺血的作用靶点,分别利用MAS 3.0和Cytoscape 3.3.0软件对筛选出的靶点进行GO富集、KEGG分析和构建四逆汤药物分子-靶点-通路网络图。结果:共预测出91个四逆汤抗心肌缺血的共同作用靶点和120条信号通路,其中23条信号通路直接或间接与心肌缺血有关。结论:四逆汤主要通过调控补体系统、细胞因子及MAPK信号通路等途径发挥拮抗减毒和协同增效作用,推测其可能通过参与调节细胞凋亡和炎症反应、增强心肌功能等发挥抗心肌缺血的作用。     

基于网络药理学探寻淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制

目的:基于网络药理学与分子对接方法,系统挖掘淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制.方法:利用多种数据库寻找淫羊藿的活性成分与作用靶标,建立预测模型并利用分子对接技术对靶标进行筛选与验证;查找疾病数据库得到哮喘相关靶标;构建靶标互作网络筛选关键靶标;利用数据库进行GO功能富集分析与KE GG通路富集分析;构建生物网络并进行...     

血脂异常的分子机制研究＊

目的 基于网络药理学方法分析枳术丸治疗血脂异常的药理机制，为新药研发及经典方剂临床拓展运用提供参考。方法 通过TCMSP（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform）数据库获取白术、枳实、荷叶的主要化学成分及其靶点，根据ADME筛选中药活性组分；通过Gencards、OMIM、TTD、DRUGBANK数据库获取血脂异常主要靶点，利用String平台进行蛋白质相互作用分析，构建PPI网络并挖掘网络中潜在的蛋白质功能模块。采用Metascape平台分析“药物-成分-靶点”及其参与的生物过程及通路，而后采用Cytoscape3.7.1软件构建“枳术丸成分-血脂异常靶点-通路”网络，最后通过Systems Dock Web Site进行分子对接验证。结果 枳术丸调治血脂异常的核心活性成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素、柚皮素等，核心靶点有ESR1、NOS2、ESR2、PPARG、PTGS2、PTGS1、MAPK14、ACHE、ADRB2、F7等，分子对接验证亦显示评分大于4.25者占总数85%,大于5者占63.6%，即大部分靶点与成分的结合活性较好。枳术丸调治血脂异常的生物学通路主要作用于AGE-RAGE信号通路、HIF-1信号通路以及脂肪细胞中脂肪分解等通路，其功能主要为调节细胞内类固醇受体的生命活动等。结论 本研究初步揭示了枳术丸调治血脂异常的多成分、多靶点、多通路的作用机制，为枳术丸的临床开发利用提供基础。     

基于网络药理学探讨国医大师张磊运脾汤治疗高脂血症的分子机制＊

目的 基于网络药理学探讨运脾汤治疗高脂血症的分子作用机制。方法 通过TCMSP、Pharm Mapper、GeneCards、DisGeNET等多个数据库检索，预测并收集运脾汤的有效化学成分和对应的靶蛋白以及高脂血症的相关疾病基因，筛选关键靶点，对关键靶点及相关有效化学成分做分子对接验证，利用DAVID数据库的富集分析功能，得到运脾汤的有效化学成分干预高脂血症的过程中涉及的相关功能和通路，并构建“中药材-有效化学成分-靶点-通路”综合网络。结果 运脾汤干预高脂血症的核心成分为木犀草素、槲皮素、山奈酚、柚皮素等；核心靶点PPARG、NOS3、EGFR、APOB和ESR1，分子对接验证，大部分靶点与化合物有结合活性较好；DAVID富集分析，运脾汤可能通过细胞内外刺激、脂多糖反应和调节凋亡等生物过程和HIF-1信号通路、AGE-RAGE信号通路、胰岛素信号通路、TNF信号通路等途径干预高脂血症。结论 本研究初步预测了运脾汤干预高脂血症的多成分、多靶点、多通路的作用机制，为进一步实验研究提供理论依据。     

基于网络药理学与分子对接探讨川楝子治疗痛经的作用机制

目的:通过对含川楝子的处方分析,基于网络药理学与分子对接的方法探讨川楝子治疗痛经的作用机制.方法:收集上海浦东新区光明中医医院2015年11月1日 至2020年10月31日含川楝子的处方,采用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacolog...