基于方证对应探讨中药复方分期治疗新型冠状病毒肺炎的网络药理学机制

目的 运用网络药理学的方法,以《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案》第7版中的轻型(湿热蕴肺证)、普通型(湿毒郁肺证)、重型(气营两燔证)、危重型(内闭外脱证)和恢复期(气阴两虚证)5个证型及其对应复方为研究对象,分析探讨中医分期治疗新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)过...     

基于网络药理学探讨穿心莲治疗新型冠状病毒肺炎机制研究

目的:通过网络药理学方法探索穿心连治疗新型冠状病毒肺炎的作用靶点及分子机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选穿心莲的活性成分及相关的药物靶点,同时在GeneCards数据库筛选出新型冠状病毒肺炎的相关疾病靶点,交集基因即为穿心莲治疗新冠肺炎的核心靶点。随后利用Cytoscape3.7.2软件和String数据库构建药物活性成分-靶点网络和蛋白质相互作用关系的网络图。最后通过DAVID数据库对交集靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,并构建成分-靶点-通路图。结果:筛选出穿心莲的活性成分24个及作用靶点53个,新型冠状病毒肺炎的靶点259个,交集靶点14个。KEGG富集分析涉及通路17条,主要包括癌症、细胞凋亡、肌萎缩性侧索硬化症(ALS)、MAPK信号通路、神经营养蛋白信号通路等。结论:穿心莲中的多种活性成分可以通过介导多靶点、多通路发挥治疗新型冠状病毒肺炎的作用。     

复方中药网络药理学的研究进展

中医药在整体观和辩证论治理论指导下,对复杂疾病的治疗有着独特优势,但因复方中药"多成分、多途径、多靶点"协同作用的特点,使其现代化进程缓慢。随着网络药理学的兴起,其整体性、系统性的特点与中医药整体观、辩证论治原则一致,目前已被广泛应用于中药研究。本文将对中药复方研究现状、网络药理学概况进行概述,主要从药效物质基础、作用机制、新药研发、新适应症、中药配伍规律等方面介绍网络药理学在中药复方研究领域中的应用及存在的问题。     

基于网络药理学的麻黄汤治疗新型冠状病毒肺炎潜在机制研究

目的:运用网络药理学探究麻黄汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在机制。方法:从TCMSP、TCM-ID数据库检索并筛选得到麻黄汤中的主要活性成分;通过检索Pub Chem数据库得到每种活性成分的SMILES结构并导入Swiss数据库得到预测靶点;采用CTD数据库筛选得到ARDS的已知治疗靶点,使用Uniprot数据库对所有靶点进行名称校正后,取靶点的交集部分导入String数据库筛选得到网络核心靶点;再采用Cyoscape 3.7.1软件构建药物-靶点-疾病网络进行数据可视化,通过CTD数据库进行GO的生物学过程富集分析和KEGG通路富集分析,预测其潜在作用机制。结果:从麻黄汤中筛选得到78个活性成分、24个潜在靶点;GO富集分析得到生物学过程809条;信号通路分析得到249条显著相关通路。结论:麻黄汤通过作用于多个靶点和多条信号通路,协同干预ARDS进程,从而实现对COVID-19的防治作用。     

基于网络药理学的中药复方防治阿尔茨海默病研究进展

阿尔茨海默病(AD)是一种以进行性记忆力减退、认知功能障碍、行为异常和社交障碍为特征的临床综合征。其病因及病理机制尚未完全阐明,西医缺乏有效的治疗方法,中医药因其多靶点、多途径的协同作用,在防治AD方面具有一定的优势。近年来,网络药理学兴起,因其整体性、系统性的特点,与中医药的整体观、辨证论治原则相一致,目前已在中医药研究领域广泛应用。现通过分析近年来利用网络药理学方法研究中药复方防治AD的临床及实验研究资料,探讨网络药理学在中药复方防治AD领域中的应用及存在的问题,为开展同类研究提供参考。     

基于网络药理学的宣肺败毒汤治疗新型冠状病毒肺炎机制研究

挖掘整理宣肺败毒汤(Xuanfei Baidu Tang,XFBD)的主要活性成分及其靶标,分析靶标与新型冠状病毒肺炎(COVID-19)之间的关联,探讨宣肺败毒汤多成分、多靶标治疗COVID-19的作用机制。从TCM-PTD,ETCM,TCMSP,SymMap数据库检索该方各味药的主要化学成分,从2015年版《中国药典》获取每味药材的归经信息,并从TCM-PTD,ETCM,TCMSP,TargetNet等数据库获取主要化学成分的靶标信息。采用Cytoscape软件构建网络模型并进行网络分析,用DAVID和STRING进行靶标功能富集分析。宣肺败毒汤13味中药有10味归肺经,其主要化学成分的1 224个潜在靶标中有326个与COVID-19相关,其中109个重要靶标富集在病毒感染和肺部损伤相关的疾病通路。这些重要靶标调控的主要通路涉及病毒感染、能量代谢、免疫炎症、细菌感染等方面。宣肺败毒汤通过多味中药配伍发挥多成分、多靶标整体调控作用,其主要作用病位在肺,其主要成分可通过调控病毒感染、免疫炎症、肝胆代谢功能和能量代谢等与新型冠状病毒肺炎发生发展相关的生物学过程,发挥平衡免疫炎症反应、对抗病毒感染与病毒蛋白转录、恢复机体肝胆代谢和能量代谢平衡等作用。     

基于中药系统药理学研究达原饮防治新型冠状病毒肺炎的科学内涵

目的 基于中药系统药理学探讨达原饮治疗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19,新冠肺炎)的药效成分、靶点及其作用,并阐释其科学内涵。方法 通过中药综合数据库(TCMID)检索达原饮中已知化合物(药效成分);使用中医药分子机制生物信息学分析工具预测药效成分作用靶点;使用DrugBank数据库等获取COVID-19相关靶点;采用Cytoscape 3.7.2软件及其插件对相关靶点进行富集分析,并绘制达原饮-化合物-靶点网络关系图。结果 在达原饮7味中药中检索已知结构和可信靶点的药效成分,共197个化合物;共鉴定到1602个可信靶点;达原饮靶点涵盖COVID-19的新冠状病毒进入细胞的关键基因ACE2,参与3061种生物学过程,经MCODE聚类后归为20种主要生物学过程,涵盖以与共生体、宿主相互作用、初始病毒感染等与COVID-19高度相关的生物学过程;234种细胞作用位点,经MCODE聚类主要位于顶端膜、细胞内小管、DNA聚合酶引物酶复合物、细胞质囊;具有648种分子功能,MCODE聚类显示主要为乙酰胆碱受体的活性、细胞内配体门控离子通道活性和...     

中药治疗不同临床分期新型冠状病毒肺炎的研究进展

2019年12月上旬,我国湖北省武汉市陆续发现多例不明原因肺炎患者,并蔓延至全国各地.2020年1月7日,中国疾病预防控制中心通过全基因组序列检测及病原核酸检测检出一种不同于以往发现的新型冠状病毒,随后世界卫生组织将此病毒命名为2019新型冠状病毒(2019-nCOV),国家卫健委将此病毒感染的肺炎统称为新型冠状病毒肺...     

基于网络药理学研究清肺排毒汤治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制

目的:基于网络药理学研究清肺排毒汤在治疗新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的作用机制。方法:使用TCMSP数据库对清肺排毒汤的中药活性成分进行检索、筛选;运用Gene Gards数据库对疾病靶点进行预测、筛选,构建活性成分-靶点网络图。将得到的靶点利用STRING进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络构建,并进行基因本体(gene ontology,GO)和KEGG富集分析,构建靶点-信号通路网络图。结果:本文显示共筛选到217个中药成分靶点,新型冠状肺炎(COVID-19) 200个相关靶点,从而得到药物-疾病的共同靶点51个,富集于生物过程及30条信号通路上,如TNF信号通路、IL-17信号通路、NF-κB信号通路及Th17细胞分化等。结论:本研究预测出清肺排毒汤治疗COVID-19的前五个主要活性成分是槲皮素、木犀草素、山奈酚、柚皮素、异鼠李碱;其主要是通过调节MAPK1、MAPK3、MAPK8、MAPK14、IL-6、RELA、STAT1等靶点,调控TNF、NF-κB等信号通路来抑制炎症反应、调节免疫功能,减轻肺损伤,保护神经功能,从而达到治疗COVID-19的目的。     

基于网络药理学探讨柴胡-黄芩治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制

基于网络药理学预测柴胡-黄芩药对治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用靶点及信号通路,探讨其作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选柴胡-黄芩药对有效成分及对应作用靶点,运用GeneGards数据库对疾病靶点进行预测,将两者进行映射,利用Cytoscape 3.7.2软件构建PPI网络并进行GO富集分析与KEGG通路分析。结果:根据筛选条件得到53个化合物、730个对应的作用靶点、247个疾病潜在靶点。GO功能富集分析得到GO条目1131个,其中生物过程(BP)条目1087个,细胞组成(CC)条目11个,分子功能(MF)条目33个。KEGG通路富集筛选得到102条信号通路。结论:本研究预测出柴胡-黄芩药对治疗COVID-19的主要成分前六位是黄芩素、汉黄芩素、金合欢素、槲皮素、山柰酚、异鼠李碱。通过调节IL-6、IL1B、AKT1、IL1A、MAPK8、CASP8、STAT1、CCL2等靶点,调控TNF、IL-17等信号通路达到抑制炎症、调节细胞凋亡、减轻肺损伤的作用,从而达到治疗COVID-19的目的。     

基于网络药理学探讨金柴饮治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制

目的 运用网络药理学方法研究金柴饮治疗新冠肺炎的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库(TCMSP)、SwissTarget Prediction平台、GeneCards、OMIM等疾病靶点数据库,得到金柴饮治疗新冠肺炎的作用靶点.借助String数据库和Cytoscape3.8.0软件构建蛋白质相互作用网络(PPI...     

疏风解毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎机制的网络药理学探讨

目的:基于网络药理学研究疏风解毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制.方法:使用TCMSP数据库对疏风解毒颗粒的中药活性成分进行检索、筛选;运用GeneGards数据库对疾病靶点进行预测、筛选,将上述二者的共同靶点输入String数据库获取靶标蛋白互作网络关系,利用Cytoscape 3.7.2软件构...     

清肺排毒汤治疗新型冠状病毒肺炎机制的网络药理学探讨

目的收集清肺排毒汤(QFPDT)的主要活性成分、靶标,探讨其靶标与新型冠状病毒肺炎(COVID-19)之间的联系以及多成分、多靶标的治疗机制。方法从ETCM、TCMID、NPASS数据库搜索QFPDT每味中药的归经、成分和靶标,用Cytoscape软件构建和分析网络,用DAVID和STRING对靶标进行功能富集分析。结果QFPDT里的中药大多数归肺经,其790个潜在靶标中的232个与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的受体血管紧张素转化酶II(ACE2)是共表达的;靶标包含7个两两相互作用的核糖体蛋白;重要靶标富集在病毒感染和肺部损伤2大类疾病通路上,且与HIV病毒的6个蛋白具有密切的相互作用;重要靶标调控内分泌系统、免疫系统、信号转导、翻译等生物学过程的一系列信号通路。结论QFPDT通过多成分、多靶标对机体起到整体调控作用。其首要作用部位是肺,其次是脾;通过调控若干与ACE2共表达的蛋白以及与疾病发生发展密切相关的一系列信号通路,起到平衡免疫、消除炎症的作用;靶向病毒复制必需的蛋白--核糖体蛋白而抑制病毒m RNA翻译,并抑制与病毒蛋白相互作用的蛋白而起到抗病毒作用。     

十神汤治疗新型冠状病毒肺炎机制的网络药理学探讨

目的:基于网络药理学探寻十神汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的活性成分、关键靶点和作用机制,为该方的临床应用提供参考。方法:采用TCMSP数据库检索十神汤中葛根、升麻、陈皮、甘草、川芎、紫苏叶、白芷、麻黄、赤芍、香附的化学成分和作用靶点,并通过UniProt数据库查询靶点对应的基因;采用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,通过度值(Degree)筛选关键靶点、通过DisGeNET数据库对关键靶点所属的类型进行归属;运用Cytoscape 3.7.2软件构建、分析网络;使用DAVID数据库对十神汤治疗COVID-19关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和KEGG通路富集分析,以探究其作用机制。结果:十神汤中的中药大多归肺、脾经,共有活性化合物213个,其265个靶点中有73个靶点是与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的受体血管紧张素转化酶2 (ACE2)在结肠中呈现共表达;关键靶点涉及CASP3、MAPK3、EGF、CTNNB1、CASP8、BCL2L1等;GO分析得到GO条目136个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目91个,细胞成分(CC)条目2...     

基于网络药理学方法探索麻杏石甘汤治疗新型冠状病毒肺炎机制研究

目的:采用网络药理学方法探索麻杏石甘汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的机制。方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中国天然产物化学成分库,BATMAN-TCM等数据库检索麻杏石甘汤相关中药化学成分及潜在靶点,通过CTD、TTD、DrugBank数据库挖掘新型冠状病毒肺炎相关的作用靶点,两者取交集筛选,再进行富集分析。结果:筛选出麻杏石甘汤生物活性成分279个,预测出麻杏石甘汤相关的靶点1417个,新型冠状病毒肺炎相关的作用靶点49个,通过韦恩图取交集得到麻杏石甘汤中参与新型冠状病毒肺炎的靶点24个,靶点质相互作用网络构建筛选出关键靶点24个。DAVID富集分析显示,麻杏石甘汤治疗新型冠状病毒肺炎的关键靶点主要参与美洲锥虫病通路、TNF信号通路、麻疹风疹通路、疟疾通路、乙型肝炎通路、炎症性肠病通路、PI3K-Akt信号通路、单纯疱疹病毒感染、甲型流感通路、人类嗜T淋巴细胞病毒I型(HTLV-I)感染通路、哮喘通路、肺结核通路、toll样受体信号通路、Jak-STAT信号通路、cGMP-PKG信号通路等重要通路。结论:麻杏石甘汤治疗新型冠状病毒肺炎主要参与抗病毒...