首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
相似文献
 共查询到18条相似文献,搜索用时 93 毫秒
1.
目的 通过网络药理学和整体动物实验分析丹皮酚治疗经前烦躁障碍症(premenstrual dysphoric disorder,PMDD)的靶点及相关通路。方法 通过Swiss Target Prediction数据库获取丹皮酚作用靶点;通过OMIM、Drug Bank、Gene Cards、DisGeNET数据库获取PMDD发病机制靶点;使用STRING数据库对丹皮酚-PMDD交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析;使用DAVID网站对交集靶点进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;并对核心靶点进行分子对接验证。复制PMDD大鼠模型,检测海马脑区5-HT1A、MAOA、MAOB的mRNA的表达水平及5-HT水平,验证丹皮酚治疗PMDD的作用通路及靶点。结果 网络药理学发现丹皮酚与PMDD交集靶点16个,主要涉及5-HT信号通路的基因如5-HT1AMAOAMAOB等;整体动物实验发现丹皮酚可以提高模型大鼠5-HT1A、MAOA、MAOB的mRNA的表达水平,降低海马脑区5-HT水平。结论 本研究利用网络药理学成功预测了丹皮酚治疗PMDD作用靶点,结合整体动物试验证实丹皮酚治疗PMDD的作用机制与促进5-HT分解及提高5-HT1A表达相关,为丹皮酚临床治疗PMDD的机制研究提供理论和实验依据。  相似文献   

2.
目的:探讨苦参碱对HCCLM3人高转移肝癌细胞体外转移的作用及其机制.方法:CCK-8检测不同浓度的苦参碱对HCCLM3癌细胞的增殖作用,选取不具有直接抑制细胞增殖效应的药物浓度进行细胞划痕实验,研究苦参碱对HCCLM3癌细胞迁移的影响;Transwell实验研究苦参碱对HCCLM3癌细胞侵袭的抑制影响;实时定量PCR(RT-PCR)和WesternBlot实验研究苦参碱对HCCLM3癌细胞E-钙粘蛋白(E-cadherin)、N-钙粘蛋白(N-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)、基质金属蛋白酶(Matrix Metalloprotinase,MMP)-2和MMP-9因子mRNA和蛋白的表达.结果:苦参碱4、8、16 mg·mL-1剂量对HCCLM3癌细胞不产生直接抑制作用(P>0.05);苦参碱4、8、16 mg·mL-1剂量能够抑制HCCLM3癌细胞的迁移和侵袭,且与苦参碱0 mg·mL-1组相比,差异具有统计学意义(P<0.05);苦参碱4、8、16 mg·mL-1剂量能够减少HCCLM3癌细胞的N-cadherin、Vimentin、MMP-2和MMP-9因子mRNA和蛋白的表达,并增加E-cadherin mRNA和蛋白的表达.结论:苦参碱能够抑制HCCLM3癌细胞的转移和侵袭,其机制可能与抑制细胞上皮间质转化(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关蛋白以及MMP-2和MMP-9有关.  相似文献   

3.
目的 基于网络药理学和分子对接分析丹参酮Ⅰ治疗心肌损伤的作用机制,并进行实验验证。方法 运用网络药理学选取丹参酮Ⅰ治疗心肌损伤的关键靶点,利用分子对接预测潜在核心蛋白,并进一步探究丹参酮Ⅰ药效作用,验证其作用机制。以300μmol/L H2O2作用HL-1细胞建立细胞损伤模型,模型建立后将细胞分为对照组、模型组、卡托普利组及丹参酮Ⅰ 0.1、1、10μmol/L组。给药干预24 h后用CCK-8法和LDH法检测细胞活力,F-actin法检测细胞骨架损伤情况,Elisa法检测细胞损伤后炎症因子表达。最后通过Western blotting验证其对核心蛋白的影响。结果 网络药理学预测显示,丹参酮Ⅰ治疗心肌损伤交集靶点72个。通过PPI网络筛选得到丹参酮Ⅰ对治疗心肌损失的关键治疗靶点7个,即表皮生长因子受体(EGFR)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)、蛋白酪氨酸磷酸酶受体C(PTPRC)、基质金属蛋白酶2(MMP2)、血管内皮生长因子受体2(KDR)、沉默调节蛋白1(SIRT1)。分子对接筛选出丹参酮Ⅰ治疗心肌损伤核心靶蛋白主要是PTGS2、MMP2和MAPK14。细胞药效结果显示,丹参酮Ⅰ能显著抑制细胞凋亡率,改善细胞生长状况及细胞损伤情况,调控细胞损伤后炎症因子白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平。Western blotting结果进一步证实丹参酮Ⅰ通过对核心蛋白PTGS2、MMP2、MAPK14的抑制发挥调控作用。结论 丹参酮Ⅰ能有效抑制H2O2诱导的HL-1细胞损伤,其机制可能与调控PTGS2、MMP2和MAPK14蛋白的表达有关。  相似文献   

4.
侣慧  王琪  马翔 《现代药物与临床》2024,39(7):1704-1716
目的 通过网络药理学及分子对接技术,筛选环丙沙星调控主动脉夹层发生发展的关键靶点基因,并通过动物及细胞实验进一步探究其潜在致病机制。方法 通过TargetPrediction、PharmMapper、GeneCards、CTD数据库分别筛选环丙沙星及主动脉夹层的相关靶点,二者取交集后得到环丙沙星调控主动脉夹层的潜在靶点;使用基因与蛋白质相互作用检索数据库(STRING)构建蛋白质相互作用(PPI)网络分析潜在靶点间的关联。通过对潜在靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因本体(GO)功能富集分析,构建“药物-靶点-通路-疾病”网络。利用Cytoscape软件及蛋白质复合物聚类算法(MCODE)等插件进一步筛选出关键靶点,通过AutoDock vina和PyMol软件把环丙沙星化学结构与筛选出的关键靶点进行分子对接及可视化呈现。最后结合动物模型构建、苏木精-伊红(HE)染色法、细胞增殖和毒性检测实验、体内外实时荧光定量反应(RT-qPCR)实验及蛋白质免疫印迹(Western blotting),检测小鼠主动脉组织及人主动脉平滑肌细胞(HASMCs)关键靶点基因表达。结果 本研究筛选出515个环丙沙星相关靶点,9 004个主动脉夹层相关靶点,并得到412个环丙沙星介导主动脉夹层的潜在靶点。KEGG通路富集分析结果显示,主要富集于血脂与动脉粥样硬化、白细胞介素(IL)-17信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等。GO功能富集分析结果显示,细胞定位(CC)主要富集于膜筏、膜微区等;分子功能(MF)主要富集于受体结合、异生物跨膜转运蛋白活性等;生物学过程(BP)主要富集于对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应等。STRING及Cytoscape分析构建PPI网络图及关键子模块,获得了15个关键靶点,分别为B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、转录因子AP-1(JUN)、CD44、胱天蛋白酶3(CASP3)、Toll样受体4(TLR4)、γ干扰素(IFNG)、肿瘤蛋白P53(TP53)、蛋白激酶B1(Akt1)、白蛋白(ALB)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、白细胞介素(IL)-6、IL-10、IL-1β、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、肿瘤坏死因子(TNF)。分子对接结果显示,环丙沙星与MMP9、ALB、GAPDH、Akt1、TP53、CASP3、IL-1β的对接模式较好。体内实验表明,相较于模型组,模型+环丙沙星组在成膜率和死亡率上均增加,管壁弹性结构破坏也更加严重;促凋亡基因及促炎基因的mRNA表达水平及蛋白表达水平均增加。体外实验发现,相较于对照组,不同浓度环丙沙星刺激HASMCs细胞后,MMP9、IL-6、CASP3、JUN、IL-1β、TP53和TLR4表达水平明显上调,Akt1表达水平明显下调。结论 环丙沙星是介导主动脉夹层发生发展的重要因素之一,可能通过刺激炎症因子表达及VASMCs凋亡发挥调控作用。  相似文献   

5.
目的通过研究丹皮酚对TNF-α诱导的真皮成纤维细胞MMP-9 mRNA及细胞因子表达的影响,探讨丹皮酚抗皮肤炎症的可能机制。方法采用RT-PCR法考察正常人真皮成纤维细胞中MMP-9 mRNA表达情况以及丹皮酚对TNF-α诱导的真皮成纤维细胞MMP-9 mRNA表达的影响。采用ELISA法测定丹皮酚对TNF-α诱导的真皮成纤维细胞表达IL-1β、IL-6及IL-8的影响。结果MMP-9在正常真皮成纤维细胞上表达极弱,TNF-α可以诱导MMP-9 mRNA的表达,丹皮酚可以抑制TNF-α诱导引起的MMP-9 mRNA表达的上调。成纤维细胞可分泌少量的IL-1β、IL-6及IL-8,TNF-α可以明显增加成纤维细胞IL-1β和IL-8的分泌量,丹皮酚可以抑制TNF-α诱导的IL-1β和IL-8的产生,但对IL-6的分泌无影响。结论丹皮酚可以抑制TNF-α诱导真皮成纤维细胞引起的MMP-9 mRNA及炎症因子IL-1β和IL-8表达水平的上调。  相似文献   

6.
王猛 《中国药师》2020,(11):2162-2167
摘要:目的:基于网络药理学方法探讨黄连改善糖尿病血管内皮损伤的潜在活性成分及作用机制。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台筛选黄连有效成分及对应的作用靶点;使用OMIM数据库中的Genemap检索与血管内皮细胞损伤有关的靶点;将药物和疾病的靶点合并进行交集,分别通过Cytoscape软件和String数据库绘制药物有效成分-靶点网络和蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;通过R语言中的Bioconductor对筛选出的基因靶点进行GO和KEGG通路分析。结果:共筛选出黄连有效成分14个,获得有效成分与血管内皮损伤的交集靶点133个,主要包括JUN、MAPK1、IL-6、CXCL-8、ESR1、IL-10、RB1、FOS、IL1B、STAT1等,其中JUN,MAPK1为PPI网络中的核心蛋白。根据GO及KEGG通路分析,黄连有效成分作用靶点多分布于细胞膜和细胞核中,主要通过调节Hepatitis B、Fluid shear stress and atherosclerosis等相关通路靶向于JUN、MAPK1等靶标蛋白起到改善血管内皮损伤的作用。结论:通过网络药理学预测了黄连改善血管内皮细胞损伤的作用靶点及机制,为进一步研究其药效物质基础提供参考依据。  相似文献   

7.
目的 利用网络药理学探讨百部发挥止咳作用的活性成分、作用靶点及相关通路,探究百部止咳的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取并筛选百部主要活性成分及其对应的作用靶点,利用Uniprot蛋白质数据库将作用靶点标准化,利用Cytoscape构建百部"成分–靶点"网络;利用GeneCards获取...  相似文献   

8.
目的观察丹皮酚对高脂血清损伤的人脐静脉内皮细胞(HUVECs)的保护作用,并探讨其作用机制。方法 20%高脂血清作用于HUVECs细胞24 h制备高脂血清损伤模型。丹皮酚组细胞加入20%高脂血清24 h后再分别加入丹皮酚124,247和495μmol.L-1。采用倒置显微镜观察HUVECs形态学变化;MTT法检测细胞存活率;用硝酸还原酶法检测一氧化氮(NO)含量;用RT-PCR法检测内皮型一氧化氮合酶(eNOS)mRNA的表达。结果与正常对照组相比,模型组中大部分细胞出现片状分离和脱落,然而丹皮酚干预后细胞形态趋于正常。丹皮酚能够显著提高细胞存活率(P<0.01)。经丹皮酚124,247和495μmol.L-1干预后,细胞存活率从模型组的(53.0±10.1)%依次升高至(68.4±9.1)%,(84.5±6.7)%,(98.1±7.5)%。丹皮酚能够显著提高NO含量和eNOS mRNA水平(P<0.01)。NO含量从模型组的(54±4)μmol.L-1依次升高至79±6,115±5和(136±6)μmol.L-1;eNOS mRNA的表达水平由模型组的0.215±0.060增加至0.451±0.045,0.563±0.013,0.704±0.068。结论丹皮酚可能通过上调高脂血清损伤人脐静脉内皮细胞eNOS的表达促进NO的合成,从而发挥其对高脂血清损伤内皮细胞的保护作用。  相似文献   

9.
目的 运用网络药理学的方法挖掘中药复方急支糖浆治疗咳嗽的有效成分、关键靶点以及潜在作用通路。方法 分别利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Genecards数据库筛选急支糖浆的活性成分作用靶点和咳嗽的疾病靶点,两者靶点取交集后利用Cytoscape软件构建成分-靶点网络,String数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络,拓扑分析获取关键靶点和成分。通过David数据库进行基因本体论(GO)生物学功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。通过分子对接技术进一步佐证网络药理学结果的可靠性,通过小鼠咳嗽模型进行实验验证。结果 急支糖浆中共筛选出活性成分163种,可干预咳嗽相关靶点154个,GO富集586个,KEGG通路119条。其中,槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等可能为急支糖浆治疗咳嗽的关键成分,CXCL8、MAPK8、STAT3、TNF等为潜在靶点,GO富集分析的生物功能涉及到细胞增殖、血管生成、炎症反应等,KEGG通路富集分析涉及到TNF、PI3K-Akt、FoxO、HIF-1等信号通路。超过90%的分子对接结果均具有一定的结合活性。使用流式细胞术、实时荧光定量PCR(qRT-PCR)、酶联免疫吸附(ELISA)的方法验证了急支糖浆对咳嗽小鼠淋巴细胞分化、炎症因子和部分关键靶点表达的影响。结论 急支糖浆治疗咳嗽的作用机制是通过多种活性成分作用于多靶点、多通路产生了调控炎症过程、调节免疫功能、促进细胞增殖、修复受损机体等综合效果,该结果为进一步研究急支糖浆有效成分和作用机制奠定基础。  相似文献   

10.
郑华艳 《现代药物与临床》2023,38(11):2690-2697
目的 采用网络药理学结合实验验证方法探索去甲汉黄芩素对口腔鳞状细胞癌的抗肿瘤活性及靶点。方法 采用网络药理学方法分析去甲汉黄芩素及口腔鳞状细胞癌的靶点。使用STRING和Cytoscape软件构建蛋白相互作用(PPI)网络。基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析生物学功能。采用分子对接和CETSA验证去甲汉黄芩素与其关键靶标之间的结合能力。MTT和吖啶橙/溴化乙锭(AO/EB)法检测去甲汉黄芩素对口腔鳞状细胞癌细胞增殖以及凋亡的影响。免疫蛋白印迹法检测相关蛋白的表达。结果 去甲汉黄芩素与口腔鳞状细胞癌共有71个重叠靶点;分别涉及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶(Akt)、氧化应激以及凋亡通路中相关基因;其中前5位的Hub基因为表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体1(ESR1)、非受体酪氨酸激酶(SRC)、前列腺素内过氧化物酶2(PTGS2)、基质金属蛋白酶9(MMP9)。分子对接结果显示,去甲汉黄芩素与EGFR的结合力最强(-6.6 kcal/mol);CETSA实验和Kaplan-Meier生存曲线结果显示,EGFR对口腔鳞状细胞癌患者生存影响最大...  相似文献   

11.
周仕敏  谭雅琴  张丽  邓志鹏 《安徽医药》2024,28(7):1312-1317
目的基于网络药理学和体外实验探究左归丸作用于头颈部鳞状细胞癌( HNSCC)的靶点并分析潜在机制。方法自 2022年 11月至 2023年 3月分别通过 TCMSP、BATMAN-TCM、GeneCards、CTD、OMIM数据库筛选左归丸的活性成分并筛选左归丸作用于 HNSCC的潜在靶点;使用 String数据库构建潜在靶点互作网络,并进行多步拓扑分析筛选出核心靶点;使用 DAVID和 Metascape数据库对潜在靶点进行富集分析;最后运用 Auto Dock Vina进行核心成分与靶点的分子对接并通过细胞计数试剂盒(CCK-8)、蛋白质印迹法验证左归丸对 HNSCC的治疗作用及机制。结果左归丸的 8种活性成分具有 487个药物靶点,其中 440个为 HNSCC相关基因;两步拓扑结构分析得到表皮生长因子( EGFR)、细胞周期蛋白 D1(CCND1)、热休克蛋白 90α家族 A类成员 1(HSP90AA1)、核因子 kappa B激酶亚基 β抑制剂( IKBKB)和螺旋环螺旋结构域扩散激酶( CHUK)5个核心靶点;富集结果提示左归丸通过影响多种生物学功能和信号通路在 HNSCC中发挥作用;分子对接结果显示,左归丸与核心靶点之间结合稳定。体外实验显示,与对照组相比,左归丸处理组显著抑制了 WSU-HN6和 CAL-27细胞增殖能力( P<0.001)并且可以降低 CCND1,IKBKB和 CHUK(P<0.05)的蛋白表达水平。结论左归丸能够靶向多条促癌信号通路从而对 HNSCC起到抑制作用。  相似文献   

12.
目的 研究麝香保心丸治疗动脉粥样硬化的作用机制,为临床长期应用提供理论依据。方法 利用TCMSP、TCMID、ETCM和BATMAN数据库对麝香保心丸有效成分及靶点进行收集与筛选;利用GeneCards、OMIM、TCMSP、DrugBank和DisGeNet对动脉粥样硬化相关靶点进行收集与筛选;构建药物-化合物-靶点网络和靶点相互作用网络;通过MetaScape平台对麝香保心丸治疗动脉粥样硬化相关靶点进行GO和KEGG富集分析。结果 筛选出麝香保心丸对动脉粥样硬化潜在治疗成分114个,对应175个靶点。网络分析结果表明,麝香保心丸主要活性成分为鹅去氧胆酸、熊去氧胆酸、肉桂醛和人参皂苷Rb1等入血成分。通路富集结果显示,麝香保心丸抗动脉粥样硬化的作用机制与调节免疫、炎症和代谢相关。结论 麝香保心丸的活性成分可作用于ALB、INS、AKT1、ACTB、TNF、IL-6等靶点,调节多条通路实现对动脉粥样硬化的治疗作用。  相似文献   

13.
目的 利用网络药理学方法,探究暖宫七味丸治疗痛经的作用机制并采用痛经模型大鼠对其进行实验验证。方法 使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药整合药理学研究平台(TCMIP)和网络药理学在线数据库(TCMID)结合文献报道确定暖宫七味丸的活性成分,通过Swiss Target Prediction在线平台得到活性成分对应的靶点。利用DisGeNET数据库和GeneCard数据库确定原发性痛经的相关靶点,手动筛选化合物-疾病的共同靶点,将潜在共同靶点蛋白上传至Biogrid平台,获取药物-疾病靶蛋白相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape 3.7.2软件对PPI网络进行网络图优化和拓扑学分析。利用DAVID 6.8数据库对潜在靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析及基因本体论(GO)注释分析。动物实验验证采用缩宫素致痛经大鼠模型观察暖宫七味丸高、中、低剂量(2.0、1.0、0.5 g·kg-1)的镇痛作用,采用Western blotting方法观察暖宫七味丸高、低剂量(2.0、0.5 g·kg-1)对痛经模型大鼠子宫组织环氧合酶-2(COX-2)蛋白表达的影响,并测定各组大鼠子宫组织中前列腺素F2α(PGF2α)水平。通过大鼠离体子宫肌张力实验观察暖宫七味丸水溶液(22.5、11.25 mg·mL-1)对大鼠子宫收缩幅度和收缩频率的影响。结果 网络药理学预测结果显示,暖宫七味丸治疗痛经的潜在靶点有68个,PPI核心靶点有IL-6、PTGS2、TNF和TP53等。涉及到的通路有炎症相关的信号通路、癌症通路和雌激素信号通路等,涉及到的生物功能有炎症反应、一氧化氮的生物调节过程和对激素的反应和对血管的调节功能等。动物实验结果显示,与模型组比较,暖宫七味丸高、中、低剂量组和阳性药组大鼠的扭体反应次数显著减少(P<0.01、0.001),同时扭体反应的潜伏期均明显延长(P<0.01、0.001);暖宫七味丸高、低剂量组痛经模型大鼠子宫组织中过氧化物合成酶2(PTGS2)相关蛋白COX-2表达显著下调(P<0.001)),同时子宫组织中PGF2α水平显著降低(P<0.001)。暖宫七味丸高、低剂量水提液对大鼠子宫收缩幅度和频率均有显著的抑制作用(P<0.001)。结论 暖宫七味丸可以通过下调PTGS2靶点进而调控子宫肌张力起到治疗痛经的效果。  相似文献   

14.
目的 利用网络药理学及分子对接的方法探究养血清脑丸治疗偏头痛的潜在作用机制并对其进行实验验证。方法 利用TCMSP和Swiss Target Prediction数据库筛选养血清脑丸的活性成分和作用靶点,从NCBI GENE、OMIM、CTD、DisGeNET数据库获取与偏头痛密切相关的靶点,将其与养血清脑丸靶点取交集后获得养血清脑丸治疗偏头痛的潜在作用靶点;利用STRING数据库进行蛋白互作网络(PPI)分析,结合Cytoscape 3.6.0软件筛选关键靶点;采用DAVID数据库对养血清脑丸治疗偏头痛的潜在作用靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并采用Cytoscape 3.6.0软件构建“养血清脑丸–组方中药–活性成分–偏头痛–靶点–通路”网络和筛选关键成分,使用AutoDock软件对关键成分与关键靶点进行分子对接。采用硝酸甘油诱导的偏头痛大鼠模型,对网络药理学研究结果中的部分关键靶点进行实验验证。结果 筛选获得养血清脑丸活性成分140个、作用靶点279个,其中与偏头痛治疗相关的靶点53个;通过网络分析,筛选获得白细胞介素-6(IL-6)、溶质载体家族6成员4(SLC6A4)、肿瘤坏死因子(TNF)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、内皮型一氧化氮合酶(NOS3)等靶点、异紫堇杷明碱、槲皮素、斯氏紫堇碱、球紫堇碱、山柰酚等成分可能是养血清脑丸治疗偏头痛的关键靶点和关键成分,分子对接结果表明关键成分和关键靶点间具有较好的结合活性;KEGG通路富集结果表明养血清脑丸可能通过神经活性配体受体相互作用、5-羟色胺能突触、钙信号通路、cAMP信号通路及肿瘤坏死因子信号通路等途径发挥治疗偏头痛的作用。动物实验结果表明,养血清脑丸能抑制偏头痛大鼠血清中一氧化氮(NO)、IL-6、TNF-α及脑组织中VEGF表达的升高,促进脑组织5-羟色胺(5-HT)水平的升高和5-羟色胺受体1B(5-HT1B)蛋白的表达,抑制SLC6A4和CGRP的表达,对硝酸甘油型大鼠偏头痛症状有明显的改善作用。结论 明确了养血清脑丸治疗偏头痛的潜在成分、靶点和通路,其作用机制可能与升高5-HT水平和5-HT1B蛋白表达、抑制SLC6A4和降钙素基因相关肽(CGRP)表达有关,为深入开展其作用机制的研究提供了科学依据和参考。  相似文献   

15.
16.
目的 运用网络药理学结合实验验证研究冯了性风湿跌打药酒治疗类风湿关节炎的作用机制。方法 借助前期研究中超高效液相色谱–四极杆–静电场轨道阱高分辨质谱联用技术分析冯了性风湿跌打药酒的活性成分,通过TCMSP数据库、Swiss Target Prediction数据库筛选活性成分靶点,Drugbank、OMIM、GeneCards、TTD、Disgenet数据库检索类风湿性关节炎的疾病靶点。利用STRING数据库绘制蛋白相互作用(PPI)网络图,分析冯了性风湿跌打药酒治疗类风湿关节炎的核心靶点。通过DAVID数据库进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其富集的信号通路并进行可视化展示。利用AutoDockTools 1.5.6软件进行分子对接。利用牛Ⅱ型胶原乳剂诱导建立类风湿关节炎大鼠模型,进行关节炎评分,组织病理学检查,PCR分析关键基因m RNA表达水平,ELISA法检测低氧诱导因子-1α(HIF-1α)和白细胞介素-6(IL-6)水平。结果 冯了性风湿跌打药酒中46个核心化学成分对应靶点661个,搜索收集获得疾病靶点2 604个,两者交集...  相似文献   

17.
目的 利用网络药理学技术和实验研究方法探究黄芩活性成分调控铁死亡逆转肿瘤耐药的药效物质基础、潜在靶标及作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),以生物利用度(OB)≥30%且类药性(DL)≥0.18的条件筛选黄芩活性成分,使用UniProt数据库获得黄芩活性成分的对应靶点基因。在GeneCards、OMIM数据库中搜集肿瘤耐药的相关靶点。利用Cytoscape 3.7.0软件将获得的黄芩活性成分与肿瘤耐药的交集靶点,绘制“活性成分–作用靶点”网络,并借助CytoHubba插件获得活性成分度(degree)值排名,并分析关键核心靶点。通过DAVID数据库在线分析功能进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。利用FerrDb数据库获取铁死亡过程中的调控基因,将其与黄芩活性成分参与逆转肿瘤耐药性的靶点基因取交集,获得黄芩通过调控铁死亡过程逆转肿瘤多药耐药性的靶点基因。利用Discovery Studio软件进行化合物和核心靶点的分子对接。取处于指数生长期的ZR-75-30和HeLa细胞,加入不同终浓度(12.5、25.0、50.0、...  相似文献   

18.
目的 探索清开灵干预病毒性感冒的潜在作用机制,为其临床用药提供理论指导。方法 通过TCMSP、TCMID和Pubchem数据库获得清开灵的活性成分及作用靶点;通过GeneCards数据库获取病毒性感冒的相关靶点,并采用交集法筛选出与清开灵活性成分作用的共同靶点,运用Cytoscape构建“活性成分-靶点”网络,并通过String数据库构建PPI网络;通过Bioconductor数据库进行KEGG通路和GO功能富集分析,运用R软件将结果进行可视化;采用Auto Dock Tools进行分子对接研究。结果 从清开灵中共筛选出潜在活性成分90个,对应靶点225个;PPI网络分析获得清开灵干预病毒性感冒的关键作用靶点34个;GO及KEGG富集分析得出:清开灵干预病毒性感冒的作用机制主要与抗炎、抗病毒有关;分子对接结果显示:清开灵中胆酸、猪去氧胆酸、黄芩苷与RELA和JUN具有一定的亲合力。结论 清开灵含有的活性成分可作用于JUN、RELA、MAPK1、IL-6、AKT1等靶点,调节多条信号通路,从而发挥对病毒性感冒的干预作用。  相似文献   

设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号