云南地区非小细胞肺癌10种驱动基因突变联合检测分析

目的 探讨云南地区非小细胞肺癌(NSCLC)患者EGFR、ALK、ROS1、KRAS、BRAF、NRAS、PIK3CA、HER2、RET和MET 10种基因突变特点及与临床病理特征的关系,探索10种基因突变联合检测的临床应用价值。方法 收集2016年7月至2021年7月昆明医科大学第一附属医院经病理诊断为NSCLC的云南地区227例患者的肿瘤组织和临床病理资料,采用扩增阻滞突变系统(ARMS)检测10基因突变状态。结果 227例NSCLC标本中,10种驱动基因的总突变率为78.85%,EGFR突变频率最高,KRAS突变位居第二,ALK融合位居第三,并且原发灶的突变率与转移灶比较,术后石蜡样本突变率与细胞学样本比较,差异无统计学意义(χ²=1.646,0.216,P>0.05)。EGFR基因突变率为44.93%,主要以19Del和21号外显子L858R为主型,占总突变率的78.43%。EGFR基因突变率在女性患者高于男性患者,腺癌患者高于非腺癌患者,不吸烟患者高于吸烟患者,差异有统计学意义(χ²=11.050、12.365、19.936,...     

非小细胞肺癌患者肿瘤组织中驱动基因的分子病理检测分析

目的:探讨非小细胞肺癌患者肿瘤组织中驱动基因EGFR、KRAS、ALK、ROSI、c-Met和Her-2基因各亚型改变情况。方法:应用Taqman-ARMS方法检测273例非小细胞肺癌石蜡组织中EGFR基因、KRAS基因、ALK基因、ROSI基因、c-Met基因和Her-2基因改变情况。结果:非小细胞肺癌肿瘤组织中EGFR基因总突变率为36.26%(99/273),外显子18、19、20和21的突变率分别为0(0/273)、16.12%(44/273)、4.49%(15/273)和17.95%(49/273);EGFR基因各外显子之间双重突变共12例(4.40%);KRAS基因总突变率为4.76%(13/273);ALK融合基因总阳性率为9.16%(25/273);ROSI融合基因总阳性率为2.20%(6/273);c-Met基因总扩增率为3.66%(10/273);Her-2基因总突变率为0.73%(2/273);各驱动基因双突变共存型11例(4.03%),其中EGFR基因突变与ALK融合基因阳性共存型2例(0.73%),EGFR基因突变与KRAS基因突变共存型3例(1.10%),EGFR基因突变与c-Met基因扩增共存型6例(2.20%)。结论:非小细胞肺癌患者中EGFR基因19和21外显子突变和ALK融合基因均存在较高的突变率,基因突变亚型分类能指导精准医学的个体化靶向治疗,KRAS、ROSI、c-Met、Her-2基因改变以及驱动基因双突变共存型基因突变率虽低但不容忽视。     

396例非小细胞肺癌EGFR,KRAS,ALK和BRAF基因突变状态及其临床病理特征

目的:探讨非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)基因、Kirsten鼠肉瘤基因(KR AS)、间变性淋巴瘤激酶(ALK)基因和鼠类肉瘤病毒癌基因同源物B1(BR AF)基因的表达及其临床病理特征。方法:收集郑州大学第一附属医院病理确诊NSCLC患者396例临床病理资料,采用高通量二代测序(next-generation sequencing,NGS)检测肿瘤组织中EGFR,KRAS,A L K和B R A F基因的突变状态,分析基因的突变率及其与临床病理特征的关系。结果:EG F R基因突变阳性率为49.24%(195/396例),女性、腺癌、非吸烟患者中突变率较高(P0.05);KRAS基因突变阳性率为8.59%(34/396例),男性、腺癌、大于60岁老年吸烟患者中突变率较高(P0.05);ALK基因突变阳性率为6.06%(24/396例),60岁以下年轻患者中突变率较高;BRAF基因突变阳性率为3.28%(13/396例)。其中EGFR合并ALK突变共存1例,EGFR合并BR AF突变共存2例,KRAS合并ALK突变共存1例,ALK合并BRAF突变共存1例,KRAS合并BRAF突变共存1例,EGFR,KRAS合并BRAF三基因突变共存1例。结论:NSCLC患者EGFR,KRAS,ALK和BRAF基因突变阳性率与国内外报道相仿,与患者临床病理特征存在相关性,存在2个及以上基因突变共存,共存突变患者的临床治疗方案仍有待进一步研究提供循证依据。     

非小细胞肺癌患者功能性驱动基因突变的临床意义

目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者功能性驱动基因表皮生长因子受体(EGFR)、间变淋巴瘤激酶(ALK)、Kirsten鼠肉瘤病毒癌基因(KRAS)和B-Raf原癌基因丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(BRAF)基因的突变状况。 方法选择2009年1月至2016年6月安徽省铜陵市人民医院及安徽省立医院呼吸科、胸外科、肿瘤科诊治的经病理诊断为NSCLC患者,共203例(其中铜陵市人民医院117例,安徽省立医院86例),收集患者的外科手术肿瘤组织标本和淋巴结活检、肺穿刺活检、气管镜活检和胸腔积液沉渣标本,应用突变扩增阻滞系统(ARMS)进行EGFR、KRAS和BRAF基因突变检测和免疫组化法进行ALK基因分析,采用χ²检验分析基因的突变率及其与临床特征的关系。 结果NSCLC患者EGFR、ALK、KRAS和BRAF基因的突变率分别为51.23%(104/203),4.88%(8/164),10.69%(17/159)和1.26%(2/159)。EGFR基因阳性突变率女性组66.67%(58/87)高于男性组36.21%(42/116),腺癌组48.80%(81/166)高于鳞癌组33.33%(7/21),非吸烟组63.38%(90/142)高于吸烟组16.39%(10/61),差异有统计学意义(χ²＝18.45,113.13,37.69;均P<0.05)。而EGFR基因突变状况与标本来源类型如手术、淋巴结活检、肺穿刺活检、气管镜活检和胸腔积液沉渣标本间差异无统计学意义(χ²＝3.91,P>0.05)。ALK基因突变状况与性别、病理类型、吸烟状态之间均差异无统计学意义(χ²＝0.00,0.86,0.55;均P>0.05)。KRAS基因突变状况与性别、病理类型、吸烟状态之间均差异无统计学意义(χ²＝3.63,2.13,2.36;均P>0.05)。此外BRAF基因突变均为男性、吸烟患者。检测中发现3例19,21外显子EGFR双突变;1例EGFR和ALK双突变。 结论NSCLC患者EGFR基因突变率最高,其次为KRAS、ALK、BRAF基因。EGFR基因突变以女性、不吸烟、腺癌为优势人群,EGFR与ALK双突变可共存。     

高通量测序在非小细胞肺癌基因突变研究中的应用

目的对非小细胞肺癌(NSCLC)精准化诊疗相关的28种肿瘤驱动基因进行高通量测序,分析多基因突变与疾病临床特征的关系。方法收集重庆大学附属肿瘤医院2017年1月至2018年10月396例NSCLC患者标本,对EGFR、ALK、ROS1、KRAS、NRAS、HRAS、PIK3CA、TP53、PTEN、BRAF、HER2、RET、MET等28种基因进行高通量测序分析。结果EGFR基因突变占基因突变总检出例数的35.35%,且基因突变频率最高的前5个基因占总突变的63.89%,表现出明显的肿瘤主基因突变聚集现象。EGFR基因亚型同样呈明显的主次分布规律,其中最常见的突变亚型是19del、L858R,分别占45.00%、41.43%。EGFR基因的19del、L858R和20ins 3个亚型多为单突变,而T790M、G719X、S768I、L861Q等亚型则常表现为共突变。T790M伴随L858R突变常常是原发性突变,T790M与19del共突变则常常是获得性突变。EGFR突变标本发生其他多基因突变的检出率显著低于无EGFR突变标本,可能是因为EGFR基因突变抑制了其他基因发生突变。结论高通量测序可高效检测NSCLC患者与靶向治疗相关驱动基因的突变情况,可为研究多基因突变的内在关系及突变负荷提供有效工具,为临床医生制订NSCLC患者的精准诊疗方案提供有力支撑。     

NSCLC患者肿瘤组织中EGFR和K-Ras基因各亚型的突变情况及意义

目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者肿瘤组织中EGFR和KRAS基因突变状况以及临床意义。方法选取2015年2月至2018年1月在我院治疗的NSCLC患者110例,采用荧光PCR检测EGFR和KRAS基因突变状况。结果 110例患者中共检测到EGFR基因突变为33.64%,其中外显子18、19和20突变分别占为27.03%、32.43%、16.22%,外显子18和20共同突变占13.51%,外显子19和20共同突变占10.81%;110例患者中共检测KRAS基因突变为2.73%;未检测到EGFR与KRAS基因双重突变;女性患者EGFR基因突变率为62.79%,明显高于男性患者(P0.05);腺癌患者EGFR基因突变率为42.17%,明显高于非腺癌患者(P0.05);KRAS基因突变与患者年龄、性别、吸烟史、病灶大体类型、肿瘤直径、TNM分期、分化程度以及淋巴结转移无关(P0.05)。结论 NSCLC患者肿瘤组织中EGFR突变率较高,而KRAS基因突变率较低,其中EGFR突变与患者性别、病理类型有关。     

非小细胞肺癌838例EGFR、KRAS基因突变状态及临床意义

目的探讨非小细胞肺癌(NSCKC)中EGFR、KRAS基因突变与患者临床病理特征的相关性。方法采用ARMS法和Sanger测序法检测838例NSCLC样本中EGFR和KRAS基因的突变情况,同时收集患者的临床病理资料,并分析之间的相关性。结果 EGFR、KRAS突变率分别为42.24%、10.98%。EGFR突变以21外显子L858R和19外显子Del突变为主,占所有突变的87.85%; EGFR突变在女性患者中的突变率明显高于男性(P0.01),在腺癌中的突变率明显高于非腺癌(P0.01),在不吸烟患者中的突变率明显高于吸烟患者(P0.01)。KRAS突变以外显子2突变为主,占所有突变的92.39%,其中12密码子突变占86.96%; KRAS突变在男性患者中的突变率明显高于女性(P0.01),在腺癌中的突变率明显高于非腺癌(P0.01),在吸烟患者中的突变率明显高于不吸烟者(P0.01)。EGFR、KRAS突变与患者年龄、有无淋巴结转移无相关性(P0.05)。结论潍坊地区NSCLC患者中EGFR突变以21外显子L858R和19外显子Del突变为主; KRAS突变以外显子2第12密码子突变为主; EGFR和KRAS基因突变与患者性别、组织学类型及吸烟密切相关。     

非小细胞肺癌患者PIK3CA基因与其他致癌基因共突变

  目的  研究中国非小细胞肺癌患者PIK3CA基因与其他致癌基因共突变现象及特点。  方法  2009年9月至2012年4月全国25家医院病理证实为非小细胞肺癌并进行基因突变检测的患者纳入本研究。收集和分析9个基因位点数据, 包括PIK3CA E9、PIK3CA E20、KRAS E2、KRAS E3、BRAF, 以及EGFR E18、E19、E20、E21。  结果  在纳入研究的5125例患者中, 有161例(3.14%)存在多个突变, 其中77例存在PIK3CA突变, 包括50例E9突变和27例E20突变。与PIK3CA共存的其他致癌基因突变位点包括KRAS E2(11例)、KRAS E3(1例)、BRAF(2例)、EGFR E18(4例)、EGFR E20(5例)、EGFR E21(28例)和EGFR E19缺失突变(37例)。在存在PIK3CA共突变的病例中, E9与E20相比, 更容易产生共突变现象; 与EGFR E20相比, 更易与EGFR E21的L858R型突变共存。在PIK3CA E20突变中, H1047R型突变较H1047L型更为常见。与PIK3CA共突变的KRAS突变经常出现在E2的G12位点。BRAF V600E突变也存在与PIK3CA共突变的倾向。  结论  PIK3CA是中国非小细胞肺癌常见的共突变致癌基因, 其E9与E20突变相互排斥, 但均可与其他致癌基因同时存在。其在肺癌发生发展中的作用和对患者预后的意义有待进一步研究。     

MRI纹理分析在胶质瘤中的研究进展

非小细胞肺癌（NSCLC）的驱动基因包括EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA及ALK基因等。获得准确分子表型是指导靶向治疗的前提。由于NSCLC的不均质性,活检获得的小块组织难以准确反映肿瘤基因突变情况。CT作为NSCLC的常规检查方法可全面反映肿瘤的病理生理学及分子生物学特征。影像基因组学致力于揭示肿瘤的影像特征（影像表型）和分子标志物（分子表型）之间的关系,在NSCLC驱动基因突变预测方面具有广阔应用前景。本文对NSCLC的CT特征与驱动基因突变相关性的影像基因组学研究进展进行综述。     

华南地区非小细胞肺癌患者肿瘤组织EGFR,ALK和ROS1基因突变分析

目的探讨华南地区非小细胞肺癌(NSCLC)患者肿瘤组织表皮生长因子受体(EGFR),变性淋巴瘤激酶(ALK)和C-ros原癌基因1酪氨酸激酶(ROS1)基因突变特点及其与临床特征的关系。方法收集2016年11月～2017年6月间华南地区76例NSCLC患者肿瘤组织及相应临床资料,利用ARMS法三基因突变联合检测试剂盒检测各肿瘤组织的EGFR,ALK,ROS1基因突变状态,并做各基因突变率与临床特征的相关性分析。结果在华南地区76例NSCLC患者中,EGFR基因突变率为55.3%(42/76),19 del和L858R突变为其主要突变类型,检出1例19del联合L858R共突变;ALK基因融合阳性率为17.1%(13/76),检出4例ALK基因融合联合EGFR基因突变;ROS1基因融合的阳性率为1.3%(1/76),未见ROS1基因联合EGFR基因或ALK基因共突变。与ROS1基因相比,EGFR和ALK基因突变率更高,差异具有统计学意义(χ~2=54.515,P=0.000;χ~2=11.329,P=0.001)。非吸烟NSCLC患者EGFR基因突变率高于吸烟患者,差异具有统计学意义(χ~2=4.578,P=0.032),而ALK与ROS1基因突变率的差异则不具有统计学意义(χ~2=0.000,均P值0.05);不同年龄、性别和组织学分型的NSCLC患者其EGFR,ALK与ROS1基因突变率的差异不具有统计学意义(χ~2=0.000～2.219,均P值0.05)。结论 EGFR,ALK和ROS1基因突变均可见于华南地区NSCLC患者,其中以EGFR和ALK基因突变率更高。     

华南地区172例非小细胞肺癌表皮生长因子受体和KRAS突变分析

目的:完善华南地区非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)和KRAS基因突变谱,探讨其与临床表型的关系。方法:直接测序法对172例NSCLC患者肿瘤组织DNA的EGFR 18-21外显子和KRAS 2号外显子进行突变鉴定并分析。结果:EGFR和KRAS在本群体中突变率分别为32%(55/172)和8.1%(14/172),其中热点突变为EGFR 19号外显子缺失,21号外显子L858R和KRAS 12位密码子点突变。女性、无吸烟史患者与男性、吸烟者相比,EGFR突变率显著增高,而KRAS突变率显著降低。腺癌患者EGFR突变率显著高于非腺癌患者,KRAS突变则无显著差别。结论:华南地区人群EGFR具有丰富的突变谱。完善该地区的突变数据库,确证各种突变对TKI的治疗敏感性的影响,对靶向治疗在NSCLC患者中更深入、广泛开展具有重要的指导作用。     

结直肠癌组织基因突变与临床病理及MMR蛋白表达的相关性分析

目的分析结直肠癌组织KRAS、NRAS、BRAF和PIK3CA基因突变与临床病理因素及MMR蛋白表达的相关性。方法采用扩增阻碍突变系统(ARMS)和免疫组化法对122例结直肠癌石蜡组织进行回顾性分析。结果 122例结直肠癌组织中KRAS、NRAS、BRAF和PIK3CA基因突变率分别为48.4%(59/122)、4.1%(5/122)、5.7%(7/122)和5.7%(7/122)。检出KRAS与PIK3CA双突变病例3例,BRAF与PIK3CA双突变1例,未发现BRAF与KRAS或NRAS基因同时突变病例。女性患者KRAS突变率高于男性患者(P0.05),低分化腺癌KRAS突变率高于高、中分化腺癌(P0.001)。女性患者、有淋巴结转移者和MLH1蛋白表达缺失者与男性患者、无淋巴结转移和MLH1表达者比(P0.05),PMS2蛋白表达缺失者比表达者的BRAF突变率更高。黏液腺癌PIK3CA突变率较其他肿瘤组织学类型高(P0.05)。结论该4种基因在结直肠癌的突变率依次为KRAS、 BRAF、PIK3CA、NRAS,不存在4种基因全突变及3种基因突变。BRAF与KRAS、NRAS基因突变存在相互排斥现象。KRAS、BRAF、PIK3CA基因突变与结直肠癌临床病理特征存在相关性。     

新疆维吾尔族非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体及KRAS基因突变与临床病理特征的关系

目的探讨新疆维吾尔族非小细胞肺癌（NSCLC）患者组织中表皮生长因子受体（EGFR）及KRAS基因突变与临床病理特征的关系。方法应用探针扩增阻滞突变系统（ARMS）检测50例NSCLC组织中EGFR基因第18、19、20和21外显子及KRAS基因12、13密码子上7种热点体细胞的突变情况,分析EGFR及KRAS基因突变与维吾尔族NSCLC患者临床病理特征之间的相关性。结果50例标本中,EGFR总检出率为12．0％,其中4例为19外显子缺失突变,2例为21外显子L858R点突变;KRAS总检出率为10％,均位于12密码子Glyl2Ala突变;无1例发生EGFR与KRAS同时突变。腺癌、鳞癌、大细胞癌EGFR及KRAS基因突变检出率分别为27．8％、3．5％、0％和22．2％、3．5％、0％。腺癌患者EGFR基因突变率（27．8％）明显高于非腺癌者（3．1％）,差异有统计学意义。腺癌与非腺癌患者KRAS基因突变比较,差异有统计学意义。维吾尔族患者EGFR及KRAS基因突变与年龄、性别、吸烟状况、TNM分期及ECOG评分均无关。结论与汉族人群相比,新疆维吾尔族NSCLC患者EGFR突变率较低,KRAS突变率较高,类似于欧美高加索人群的突变特点。     

结直肠癌患者血清外泌体与组织中KRAS，BRAF，NRAS 和PIK3CA 基因突变检测及临床意义的比较

目的 检测结直肠癌(colorectal cancer, CRC) 患者血清外泌体KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 相关基因位点的突变,分析其与癌组织基因突变的一致性及其可能的影响因素。方法 2019 年2 月～ 2021 年1 月中国人民解放军联勤保障部队第九二〇医院100 例结直肠癌患者作为研究对象。提取患者血清外泌体,并用蛋白免疫印迹（Westernblot,WB）法检测外泌体标志物CD63 和TSG101 的蛋白表达;聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）检测血清外泌体及手术切除的癌组织中KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 基因突变情况,Kappa 一致性检验分析血清外泌体突变与组织突变的一致性,Logistic 单因素回归分析影响一致性的因素。结果 癌症基因组图谱（the cancer genomeatlas,TCGA）数据显示,KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 的结直肠癌突变率分别为35% ～ 96%,5% ～ 15%,5% ～ 30%和18% ～ 36%,且KRAS 和BRAF 的突变与结直肠癌患者的低存活率有关。血清外泌体中KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 的突变率分别为94.00%,11.00%,17.00% 和35.00%;结直肠癌组织KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 的突变率分别为34.00%,5.00%,6.00% 和16.00%;血清外泌体中KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 的突变率均高于组织,差异有统计学意义（χ2=101.027 ～ 256.250,均P ＜ 0.05）。血清外泌体与组织中KRAS 突变的一致率为40.00%（Kappa值=0.064,P>0.05）,BRAF 突变的一致率为99.00%（Kappa 值=0.599,P<0.05）,NRAS 突变的一致率为89.00%（Kappa 值=0.475,P<0.05）,KRAS 突变的一致率为81.00%（Kappa 值=0.523,P<0.05）。ECOG 评分、转移、临床分期是影响外泌体和组织KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 的突变检测一致性的因素。结论 结直肠癌患者血清外泌体KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 的突变率高于组织,二者BRAF,NRAS 和PIK3CA 的一致性中等,为外泌体的基因检测指导临床靶向治疗提供参考。     

结直肠癌患者应用ARMS法检测KRAS、NRAS、PIK3CA、BRAF基因突变分析

目的探讨结直肠癌(CRC)患者应用扩增阻碍突变系统(Amplification Refractory Mutation System,ARMS)法检测KRAS、NRAS、PIK3CA及BRAF基因突变情况并分析其与临床病理特征的关系。方法收集中国医科大学附属盛京医院60例结直肠癌患者手术切除组织,采用ARMS法检测KRAS、NRAS、PIK3CA及BRAF基因突变情况。结果 KRAS基因突变23例,突变率为38.3%;NRAS基因突变1例,突变率为1.7%;PIK3CA基因突变4例,突变率为6.7%;BRAF基因突变3例,突变率为5%。检出双突变2例,分别为PIK3CA与KRAS突变,PIK3CA与BRAF突变。有淋巴结转移患者KRAS基因突变率显著高于无淋巴结转移患者(P=0.031)。KRAS、NRAS、PIK3CA、BRAF基因突变之间无明显相关性。结论在结直肠癌患者中,KRAS基因突变率最高,且多发生于有淋巴结转移患者,NRAS、PIK3CA、BRAF基因突变率较低。对结直肠癌患者进行KRAS、NRAS、PIK3CA、BRAF基因联合检测,为临床个体化靶向治疗提供更准确的理论依据。     

非小细胞肺癌患者EGFR\ALK\ROS1基因突变状态及其临床意义

目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)中表皮生长因子受体(EGFR)\间变性淋巴瘤激酶(ALK)\ROS1基因突变状态及其临床意义。方法采用蝎型探针扩增阻滞突变-荧光定量聚合酶链反应(ARMS-QPCR)检测NSCLC石蜡组织标本中EGFR\ALK\ROS1基因突变状态,同时分析EGFR、ALK、ROS1基因突变与患者的性别、年龄、吸烟史、组织学类型、样本类型等临床特征的相关性。结果 196例NSCLC中EGFR、ALK、ROS1突变率分别为54. 08%(106/196)、3. 57%(7/196)、3. 06%(6/196); EGFR突变状态与患者的性别、吸烟史和组织学类型有关,多见于女性(59/82,71. 95%)、无吸烟史(84/137,61. 31%)、腺癌患者(99/168,58. 93%)(P0. 01); ALK基因融合状态与患者的年龄、吸烟史、组织学类型和标本类型均无关(P0. 05); ROS1基因融合状态与患者的年龄有关(P0. 01),多见于年龄≤60岁患者10. 71%(6/56),而与性别、吸烟史、组织学类型和标本类型无关(P 0. 05)。结论EGFR、ALK、ROS1基因同步检测,有助于筛选靶向治疗对象,指导临床用药,实现精准治疗。     

139例肺癌小活检标本EGFR,ALK,ROS1基因状态分析

目的:探讨肺癌小活检标本EGFR,ALK,ROS1基因突变状态。方法:回顾性分析2014年1月至2017年1月南京中医药大学附属医院经活检初诊为原发性肺癌的139例患者,分析其临床病理特征及EGFR,ALK,ROS1基因突变状态。结果:入组的139例患者中,EGFR敏感突变阳性率为38.85%(54/139),其中腺癌突变率为49.52%(52/105),鳞状细胞癌突变率为4.17%(1/24),非小细胞癌(非特指型)突变率为1 2.5 0%(1/8),腺癌患者突变率明显高于其他类型癌患者(P=0.0 0 0 1)。男性患者突变率为3 0.3 9%(3 1/1 0 2),女性患者突变率为6 2.1 6%(2 3/3 7),女性患者突变率显著高于男性(P=0.0014)。不吸烟患者突变率为53.13%(34/64),吸烟患者突变率为2 6.6 7%(2 0/7 5),不吸烟者突变率显著高于吸烟者(P=0.0 0 1 7)。临床I,I I,I I I期患者突变率分别为33.33%(1/3),0.00%(0/3),8.70%(2/23),IV期患者突变率为47.19%(42/89),分期未知者突变率为42.86%(9/21),IV期患者突变率显著高于I,II,III期患者(P=0.0038)。EGFR的突变类型包括:E19-del占44.44%(24/54),L858R占51.85%(28/54),L861Q占1.85%(1/54),S768I占1.85%(1/54)。A LK融合基因检出率为3.28%(2/61),均为不吸烟的腺癌患者。ROS1融合基因检出率1.72%(1/58),为不吸烟的男性鳞状细胞癌患者。结论:EGFR突变更常见于女性、非吸烟及腺癌患者。ALK融合见于不吸烟的腺癌患者。ROS1融合见于鳞状细胞癌患者。     

江西地区非小细胞肺癌EGFR基因突变分析

目的探讨江西地区非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)基因突变类型、突变率及其与临床特征的关系。方法收集2014年3月至2015年6月南昌大学第一附属医院非小细胞肺癌患者石蜡包埋组织78例,采用等位基因特异性扩增-聚合酶链反应(ARMS-PCR)方法,对非小细胞肺癌患者肿瘤组织EGFR基因18~21外显子突变进行检测,并分析其突变类型、突变发生率及其与临床特征之间的关系。结果在78例非小细胞肺癌患者中,共有27例发生EGFR基因突变,总突变率为34.6%。其中,第18、19、20、21号外显子突变率分别2.6%(2/78),12.8%(10/78),3.9%(3/78),14.1%(11/78)。一例既有21号外显子突变,又有20号外显子突变,其中,19号外显子的突变均为第746~750密码子的碱基缺失,21号外显子突变类型以L858R为主,且19号外显子的突变率与21号外显子的突变率无统计学差异(P0.05),女性EGFR基因的突变率显著高于男性,不吸烟者显著高于吸烟者,腺癌患者显著高于鳞癌患者(P0.05),而EGFR基因的突变率与非小细胞肺癌患者的年龄、临床分期无相关性(P0.05)。结论江西地区的非小细胞肺癌EGFR基因突变以19、21号外显子为主,常见于女性、不吸烟、腺癌的非小细胞肺癌患者。     

非小细胞肺癌组织EGFR/ALK/ROS1基因联合检测的临床意义

目的 探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR),间变性淋巴瘤激酶(ALK)和肉瘤致癌因子-受体酪氨酸激酶(ROS1)三种基因突变联合检测的临床意义。方法 收集2017年1月～2018年7月患者NSCLC组织标本146例,采用过柱法提取DNA和RNA,突变检测采用RT-PCR法和扩增阻滞突变系统(ARMS)法。结果 EGFR/ALK/ROS1三联检的突变频率为41.8%(61/146),明显高于单基因检测突变率:EGFR(33.6%,49/146),ALK(6.8%,10/146)和ROS1(2.7%,4/146)。EGFR的不同突变类型的检出率如下:19Del 52.9%(27/51),L858R 41.2%(21/51),G719X,L861Q 5.9%(3/51); 其中还检出四例双突变标本:19Del+ L858R(1例),19Del+G719X,L861Q(1例),ALK+19Del(1例),ROS1+L858R(1例)。EGFR/ALK/ROS1阳性标本中女性(56.7%,30/53)明显高于男性(33.3%,31/93),两者比较差异有统计学意义(χ²=7.516,P=0.006),肺腺癌(47.9%,58/121)明显高于鳞癌(4.8%,1/21),差异具有统计学意义(χ²=13.733,P=0.000)。不同来源组织突变检出率为:手术切除肿瘤组织标本41.0%(32/78),细针穿刺活检及支气管镜刷检细胞学等标本43.4%(23/53),胸腔积液标本40.0%(6/15),三者比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论 在NSCLC基因突变中:EGFR/ALK/ROS1三联检的突变频率明显高于EGFR,ALK和ROS1单基因检测。EGFR常见突变基因为19Ex Del和21Ex L858R。女性突变率明显高于男性。EGFR/ALK/ROS1的联合检测可一次获得更多基因突变信息,为靶向用药提供更多选择,尤其是对于临床稀有标本意义更大。     

胸腔积液不同类型标本用于非小细胞肺癌驱动基因检测的临床价值研究

目的 分析非小细胞肺癌(NSCLC)患者胸腔积液上清、细胞沉淀、细胞蜡块用于驱动基因检测的准确性。方法 回顾性纳入2021-01—2022-03首都医科大学附属北京胸科医院确诊并发胸腔积液且具有同期配对组织基因检测结果的NSCLC患者45例，采用蝎形探针扩增阻滞突变系统荧光定量PCR (ARMS-PCR)对患者胸腔积液上清、细胞沉淀和细胞蜡块进行肺癌靶基因变异检测。结果 胸腔积液三种类型标本中共检出EGFR、KRAS、BRAF、MET、HER2、PIK3CA、ALK共7个基因变异。以组织基因检测结果为参考，胸腔积液上清总体变异检测敏感度为80.0%(24/30),特异度为93.3%(14/15),高于细胞沉淀和细胞蜡块。在DNA层面，胸腔积液上清核苷酸变异敏感度最高，为84.6%(22/26);对于RNA融合变异，上清与细胞蜡块敏感度一致，均为50.0%(2/4),高于细胞沉淀的25.0%(1/4)。胸腔积液细胞学结果对上清、细胞沉淀和细胞蜡块驱动基因总体变异、核苷酸变异检出有影响，但差异无统计学意义(P>0.05)。结论 晚期并发胸腔积液NSCLC患者在无法获取组织标本情况下，...