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1.
目的 探讨TBX5 基因3'' 非翻译区靶序列SNPs 与先天性心脏病(CHD)遗传易感性的关系, 为CHD 的分子机制研究提供线索。方法 利用HaploView 软件筛选TBX5 基因3'' 非翻译区功能性单核苷酸 多态性(SNP),并应用高分辨率熔解曲线检测TBX5 基因3'' 非翻译区SNP。采用病例对照研究分析SNP 位 点与CHD 的关联。结果 HaploView 软件筛选出TBX5 基因3'' 非翻译区有意义的标签SNP rs883079,高分 辨率熔解曲线法成功检测该SNP位点(rs883079)的G/G、G/A及A/A 3种基因型。TBX5 基因rs883079( G>A) 位点等位基因或基因型分布频率比较,差异有统计学意义(P <0.05);与CHD 易感性关联,A 是CHD 的危 险等位基因,A/A 为CHD 的危险基因型(P <0.05)。结论 TBX5 基因rs883079 位点SNP 与CHD 有关系, rs883079(G>A)携带突变纯合子基因型A/A 个体患CHD 的危险性升高。  相似文献   

2.
目的检测结肠癌中ABCG2基因SNP多态性,探讨其与伊立替康疗效的相关性。方法收集该院2011年1月~2013年2月应用伊立替康治疗的结肠癌患者92例,34 G>A、376 C>T、421 C>A位点SNPs多态性测定使用Real-Time PCR Taqman分析。结果 34 G>A等位基因的频率为70.6%和29.4%,376 C>T等位基因的频率为92.9%和7.1%,421 C>A等位基因的频率为70.1%和29.9%。34 G>A位点G/G、G/A、A/A基因型的临床获益患者分别占了68.2%、76.2%和66.7%,各基因型之间差异无显著性(P>0.05)。376 C>T位点C/C、C/T和T/T基因型的临床获益患者分别占了72.8%、66.7%和50.0%,各基因型之间差异无显著性(P>0.05)。421 C>A位点C/C、C/A、A/A基因型的临床获益患者分别占了88.6%、61.0%和42.9%,各基因型之间差异具有显著性(P<0.05)。结论检测ABCG2基因421 C>A位点SNP的多态性有利于伊立替康临床疗效的早期评估。  相似文献   

3.
Calpain10基因多态性与超重肥胖、胰岛素抵抗的相关性研究   总被引:1,自引:1,他引:1  
目的:探讨昆明地区2型糖尿病(T2DM)钙蛋白酶10基因(Calpain10基因)的多态性(SNP)与超重肥胖、胰岛素抵抗(IR)的关系.方法;选取昆明市城市社区居民非超重肥胖者111名及超重肥胖者151名.检测空腹血糖(FPG)、空腹胰岛素(FINS)、C肽(C-P)水平。计算胰岛素抵抗指数(HOMAA).应用聚合酶链式反应双引物等位基因特异性扩增法(PCR-ASA)检测Calpain10基因SNP43位点(G/A)及SNP44位点(T/C)基因型.结果:(1)GG基因型频率随着BMI值的增大呈逐渐增加的趋势,但各组基因型频率间无显著性差异(P〉0.05);(2)BMI〉28.00组的TC基因型频率显著高于其余各组(P〈0.05);(3)GG基因型组中,WHR≥0.90者的FPG、FINS、C-P水平及HOMA-IR均显著高于WHR〈0.90者(P〈0.05);(4)TT基因型组中,WHR≥0.90者的FPG、FINS、C-P水平及HOMA-IR均显著高于WHR〈0.90者(P〈0.05).结论;昆明地区人群中Calpain10基因SNP44的多态性与肥胖有关,同为TT基因型者中具有中心性肥胖者存在明显的胰岛素抵抗现象.SNP43的多态性与肥胖无关。但同为SNP43GG基因型者中具有中心性肥胖者存在明显的胰岛素抵抗现象。  相似文献   

4.
目的:分析两对引物‐聚合酶链式反应(PCR‐CTPP)在碱基切除修复(BER)途径基因单核苷酸多态性(SNP)分型中的应用,为发现新的SNP检测方法提供实验依据。方法采用PCR‐CTPP扩增BER途径关键蛋白OGG1、XRCC1及APE14个常见SNP位点OGG1 Ser326Cys、XRCC1 Arg399Gln、APE1 Asp148Glu及‐141T/G(位于启动子区域)的DNA片段,凝胶电泳显像后判读基因型,同时与DNA测序的方式比对各基因位点的准确性。结果 PCR‐CTPP方法基因分型结果与DNA测序得到的基因分型结果完全一致。结论 PCR‐CTPP技术可靠、快速,其广泛应用能够有助于基因SNP的分型研究。  相似文献   

5.
目的:探讨calpainl0基因单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)与西南地区汉族人群2型糖尿病(Type 2 diabetes mellitus,T2DM)遗传易感性的关系。方法:采用病例一对照研究设计,对144例T2DM患者和98例正常对照者采用双向等位特异性PCR技术(Bi—PASA),检测calpain10基因SNP43MG位点、SNPddC/T位点和SNP56A/G位点的基因型,并进行关联分析。结果:与对照组相比,病例组SNP43的G/G等位基因型频率、SNP44的C/T等位基因型频率和SNP56的A/A等位基因型频率显著升高(分别为86.11%,73.5%;36.8%,19.36%;38.0%,9.8%)。SNP43的G等位基因频率、SNP44的C等位基因频率和SNP56的A等位基因频率在西南地区T2DM人群中显著升高(分别为93.06%,86.22;19.1%,9.69%;60.07%,44.96%);单体型ATG、GCA、GTG频率在病例组与对照组的分布具有显著差异。结论:calpain10基因可能为西南地区汉族人群T2DM的易感基因。  相似文献   

6.
翁思颖  王志锋  周建扬 《浙江医学》2015,37(24):1973-1977
目的探讨2型糖尿病(T2DM)合并非酒精性脂肪肝(NAFLD)患者的脂联素基因(apM1)多态性与CT肝/脾比值的关系。方法运用PCR直接测序法检测184例无亲缘关系宁波地区汉族人(T2DM合并NAFLD者95例,健康体检者89例)的脂联素基因+45T/G与+276G/T的多态性,并用逻辑回归法分析基因多态性分布与CT肝/脾比值及胰岛素抵抗指数(IR)程度、血糖之间的关系。结果T2DM合并NAFLD患者中,脂联素基因+45和+276位点有T/G单核苷酸多态性(SNP)存在。+45位点的T/G等位基因分布与健康体检者差异有统计学意义(P<0.05),基因型T/G与G/G的突变型人群T2DM合并NAFLD易感性增加(OR=1.947,95%CI=1.082~3.503),+45位点基因突变与患病人群CT肝/脾比值呈负相关(P<0.05),与BMI、稳态胰岛素评价指数(HOMA-IR)、糖化血红蛋白(HbA1c)均无关(均P>0.05)。apM1+276位点亦存在SNP,但与健康人群相比无统计学差异(P>0.05)。结论脂联素基因+45位点T/G、G/G基因突变型人群T2DM合并NAFLD易感性增加,且随着患者的CT肝/脾比值下降,该人群中突变基因型分布增多。  相似文献   

7.
目的:初步分析急性ST段抬高心肌梗死( STEMI)患者低密度脂蛋白受体( LDLR)基因启动子区9个基因位点的单核苷酸多态性( SNP)。方法选择经急诊确诊的急性STEMI患者24例(病例组)和健康体检者13例(对照组),抽取静脉血检测血脂和用于DNA提取,以高分辨溶解曲线方法分析技术检测SNP。比较两组三酰甘油( TG)、总胆固醇( TC)、高密度脂蛋白( HDL)和低密度脂蛋白( LDL)的水平,以及LDLR基因启动子区9个SNP位点基因型和等位基因频率。结果病例组血清LDL高于对照组( P<0.05),而 HDL低于对照组( P<0.05),两组血清TG、TC比较差异无统计学意义(P>0.05)。 LDLR启动子区9个SNP位点的基因型和等位基因频率差异无统计学意义( P>0.05),9个SNP位点的HRM曲线变异未出现群组效应,且出现变异的样品号高度一致。结论急性STEMI患者存在血脂的异常,但其LDLR基因启动子区基因位点未发生变异修饰。  相似文献   

8.
He Y  Ding YQ  Huang ZX  Yao KT 《中华医学杂志》2007,87(22):1553-1555
目的检查腭、肺及鼻咽上皮克隆(PLUNC)基因编码区单核苷酸多态(SNP)位点G14595T与广东地区鼻咽癌易感性有无明显关联。方法用直接测序的方法检测基因编码区、调控区和侧翼区及部分内含子区,确定SNP位置和类型。用聚合酶链式反应一限制性酶切片段长度多态性(PER-RFLP)结合测序方法对编码区多态性位点G14595T在广东地区239例鼻咽癌患者和286例对照人群中进行相关性分析。结果通过测序共获取9个SNP;其中8个SNP位点之间均呈高度连锁不平衡;3个SNP位点可以作为htSNP;编码区多态位点G14595T在239例鼻咽癌患者和286例对照人群中等位基因型频率差别很小。结论PLUNC基因编码区多态位点G14595T在鼻咽癌患者和对照人群中等位基因型频率差别很小,这说明该位点与中国广东地区鼻咽癌易感性无明显关联。  相似文献   

9.
目的:探讨胰岛素诱导基因1(INSIG1)单核苷酸多态性(SNP)rs9769506位点的多态性与2型糖尿病(T2DM)的相关性,以期为 T2DM 的防治提供潜在的分子靶点。方法选择河南省南阳市中心医院2013年1月至2014年3月收治的 T2DM患者98例,另选取体检中心的健康体检者90例作为对照组,INSIG1基因 SNP rs9769506位点多态性检测使用实时荧光定量PCR(RT‐PCR)Taqman 分析。结果 T2DM 组 rs9769506位点 A 等位基因频率为54.1%,G 等位基因频率为45.9%,对照组 A等位基因频率为47.8%,G 等位基因频率为52.2%,两组之间差异无统计学意义(P >0.05)。 T2DM 组患者 rs9769506位点 A/A 、A /G 和 G/G 基因型频率分别为41.8%、24.5%和33.7%,对照组 rs9769506位点 A/A 、A/G 和 G/G 基因型频率分别为32.2%、31.1%和36.7%,A/A 基因型频率在对照组和 T2DM 组之间差异有统计学意义(P<0.05),而 A/G 和 G/G 基因型频率在对照组和 T2DM 组之间差异则无统计学意义(P>0.05)。 T2DM 患者中三酰甘油(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL‐C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL‐C)表达水平在 A /A 、A/G 、G/G 基因型患者之间差异有统计学意义(P <0.05),而 A/G 、G/G 基因型患者之间差异无统计学意义(P>0.05)。结论 INSIG1基因 SNP rs9769506位点 A/A 基因型在 T2DM 患者中检出率高,对 T2DM 早期筛查及基因治疗具有临床指导意义。  相似文献   

10.
目的 建立CYP1A2基因-3860G >A、-3113G >A、-2467delT、-739T >G、-163C >A、2321G >C、5347C >T等7个SNP位点的检测方法,探讨7个SNP位点在华北地区人群中的分布。方法 选取健康受试者,提取全血样本DNA,以Primer Premier 5软件自设计引物及探针,采用扩增阻滞突变系统(ARMS)结合TaqMan探针技术(ARMS-TaqMan法)建立CYP1A2基因7个SNP位点基因分型方法。结果 -3860G >A、-3113G >A、-2467delT、-739T >G、-163C >A、2321G >C、5347C >T7个SNP位点的突变等位基因频率分别为0.292、0.078、0.524、0.078、0.657、0.148、0.127。结论 成功建立7个SNP位点的ARMS-TaqMan基因分型方法,该方法具有准确、操作简单、高通量等优势。  相似文献   

11.
目的探讨高分辨率熔解曲线法(HRM)检测中国5种常见B.地中海贫血突变的可行性。方法应用HRM法检测中国5种常见B.地中海贫血突变,检测结果为纯合子的标本进行基因测序验证。结果HRM法能准确区分-28(c.-78A〉G)、Codon17(c.52A〉T)、Codons41/42(c.126—129delCTTT)、Codons71/72(c.216—217insA)及IVS—II-654(c.316—197C〉T)的纯合、杂合突变以及野生型标本,测序结果与HRM法检测结果一致。结论HRM法检测中国5种常见何天文-地中海贫血突变具有简便、快速、灵敏度高等优点,有望成为临床尤其是产前诊断领域B.地中海贫血突变筛查的优选方法。  相似文献   

12.
目的了解海南省黎族自治县地区葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(glucose-6-phosphate dehydrogenase, G6PD)缺乏症发病情况和基因突变特点。方法收集该地区2017年1—12月出生的新生儿干血片,采用荧光分析法进行G6PD酶活性筛查,对初筛阳性的干血片样本采用多色探针荧光PCR熔解曲线法(MMCA)进行基因突变分析。结果共收集14 130例新生儿干血片,G6PD酶活性筛查共筛出1 059例阳性,初筛阳性率为7.49%,其中男性682例,女性377例,男性新生儿G6PD初筛阳性率9.13%,女性5.66%,男女初筛阳性率差异有统计学意义(P<0.01)。黎族新生儿初筛阳性率8.33%,汉族6.25%,不同民族比较差异有统计学意义(P<0.01)。通过MMCA法对1 059例初筛阳性干血片进行基因检测分析,共检出864例样本发生突变,突变率81.59%;男性突变率86.07%,女性73.47%,男女间差异有统计学意义(P<0.01);黎族突变率83.26%,汉族77.71%,突变率差异有统计学意义(P=0.033)。本次共检出11种G6PD基因单一突变型(c.1376 G>T、c.1388 G>A、c.95 A>G、c.871 G>A、c.519 C>T、c.1024 G>T、c.392G>T、c.1360C>T、c.517T>C、c.592C>T和c.86C>T)和5种复合突变型,其中c.1376 G>T复合c.871 G>A突变、c.1376 G>T复合c.517 T>C突变和c.392 G>T复合c.871G>A突变在海南省尚属首次报道。结论海南省黎族自治县地区是G6PD缺乏症高发区,黎族为高发人群,基因突变类型复杂多样,突变以c.1376G>T、c.1388G>A、c.95 A>G和c.871 G>A四种最为普遍。在G6PD缺乏症高发地区开展G6PD的活性筛查和基因检测,有利于G6PD缺乏症的确诊和防治,提高出生人口素质。  相似文献   

13.
目的研究贵州土家族葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)基因致病突变型,检测G6PD缺乏症发生率及基因频率。方法通过硝基四氮唑蓝纸片法对2 789例土家族男性进行G6PD缺乏症定性筛查,用变性高效液相色谱技术和DNA测序对78例个体进行基因突变型鉴定。结果在2 789例纯系土家族男性中,发现2例酶活性异常。在印江县采集的78例(2例酶活性异常和76例正常)纯系土家族男性血样中,共检出G6PD c.1388G>A突变2例、c.1376G>T突变1例和c.1311C>T/IVS 11+93T>C突变2例,基因突变型分别占2.6%、1.3%和2.6%。结论在贵州土家族人群中发现c.1388G>A、c.1376G>T和c.1311C>T/IVS11+93T>C 3种突变型,是共同存在于中国人群的G6PD基因突变型,中华民族可能源于共同的祖先;贵州省印江县土家族男性G6PD缺乏症的基因频率为6.5%,可为上述地区G6PD缺乏症的防治提供依据。  相似文献   

14.
目的利用CRISPR/Cas9技术构建敲除G6PD基因常见突变位点——c.392G>T(p.131G>V)突变位点的HEK293T细胞, 为后期研究其基因修复提供可靠的细胞模型。方法针对G6PD基因c.392G>T(p.131G>V)突变位点靶向设计4对向导RNA (sgRNA),构建表达Cas9-sgRNA的外源PX458质粒,将其转染至HEK293T细胞内,通过流式细胞术分选表达GFP荧光蛋白的 细胞进行培养,利用T7核酸内切酶1(T7E1)酶切验证CRISPR/Cas9的剪切效率,有限稀释法筛选单克隆细胞,测序鉴定并检测 G6PD mRNA、蛋白表达和细胞功能的改变。结果成功构建基于G6PD基因c.392G>T(p.131G>V)突变位点的Cas9-sgRNA外 源PX458 质粒,T7E1 酶切检测四对sgRNA 的编辑效率分别为6.74%、12.36%、12.54%、2.94%。测序鉴定敲除G6PD 基因 c.392G>T(p.131G>V)突变位点的细胞株构建成功,细胞G6PDmRNA、蛋白表达和G6PD酶活性降低,细胞增殖能力下降,维生 素K3诱导细胞死亡增加。结论本研究成功构建敲除G6PD基因c.392G>T(p.131G>V)突变位点的HEK293T稳定细胞模型, 为后期研究基因的修复奠定了基础。  相似文献   

15.
荧光PCR熔解曲线法检测广东韶关地区G6PD缺乏症基因突变   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:采用荧光PCR熔解曲线法检测广东韶关地区G6PD缺乏基因突变,获得基因突变谱并进行方法学应用评价.方法:采用荧光PCR熔解曲线法试剂盒对613例G6PD缺乏症表型筛查阳性样本,分两管检测中国人群常见的12种G6PD基因突变(95A>G、383T>C、392G>T、487G>A、517T>C、592C>T、871G>A、1004C>A、1024C>T、1360C>T、1376G>T、1388G>A).结果:613例标本中检出基因突变536例(男性365例,女171例,占87.44%),其中:1388G>A突变210例(占37.30%),1376G>T突变213例(占37.83%),95A>G突变55例(占9.77%),871G>A突变49例(占8.70%),1024C>T突变18例(占3.20%),1004C>A突变2例(占0.35%),1360C>T突变4例(占0.71%),383T>C突变1例(占0.18%),392G>T突变10例(占1.78%),517T>C突变1例(占0.18%),没有发现487G>A、592C>T突变类型.另外,女性双重杂合或纯合突变分布情况为:1388G>A纯合突变7例,1376G>T纯合突变4例,871G>A纯合突变1例,1388G>A/1376G>T杂合突变4例,1388G>A/871G>A杂合突变2例,1388G>A/95A>G杂合突变1例,1376G>T/1024C>T杂合突变1例,1376G>T/95A>G杂合突变1例,1376G>T/392G>T杂合突变2例.结论:1388G>A,1376G>T,95A>G,871G>A,1024C>T,1004C>A,1360C>T,383T>C,392G>T,517T>C是韶关地区最常见的基因突变类型,与已报道的中国南方人群突变谱相近;荧光PCR熔解曲线法G6PD缺乏症基因结果准确,可广泛应用于临床基因检测.  相似文献   

16.
高分辨熔解曲线分析慢性骨髓增殖性疾病JAK2V617F基因突变   总被引:2,自引:2,他引:0  
目的研究慢性骨髓增殖性疾病(CMPDs)获得性JAK2V617F突变检测方法。方法应用高分辨熔解曲线分析技术(HRM),对前期经等位基因特异性PCR法(AS—PCR)分析过的36例CMPDs样本进行JAK2V617F基因突变检测,并与AS—PCR检测情况进行比较分析,结果经测序验证。结果36例CMPDs样本均得到可供分析的JAK2V617F基因突变HRM检测结果,与AS—PCR法相比较,二者的符合率为97%(35,36);只有一份样本结果不相符,经测序验证,结果与HRM检测相一致;HRM检测的敏感性和特异性均达100%。结论应用HRIM技术检测JAK2V617F突变快速简便、而且敏感,是一项适合临床开展的新方法,可用于临床辅助CMPDs的诊断。  相似文献   

17.
目的 考察葡萄糖转运蛋白1(GLUT1)的基因SLC2A1 XbaI G>T和-2841 A>T基因多态性与 非小细胞肺癌的关系。方法 应用PCR和基因测序技术检测112例河南汉族人群非小细胞肺癌患者SLC2A1基因XbaI G>T和-2841 A>T多态性,统计其基因型及等位基因频率,并比较腺癌与鳞癌的基因型和等位基因频率,以及各期的非小细胞肺癌的基因型和等位基因频率。结果 SLC2A1基因XbaI G>T多态性位点GG、GT、AA基因型频率分别为53.6%、43.8%和2.6%,G、T等位基因频率分别为75.4%和24.6%;-2841 A>T多态性位点AA、AT、TT基因型频率分别为50.0%、41.0%和9.0%,A、T等位基因频率分别是71.0%和29.0%。腺癌与鳞癌的XbaI G>T和-2841 A>T基因型及等位基因频率比较,差异无统计学意义(P?>0.05)。各期非小细胞肺癌患者的XbaI G>T和-2841 A>T基因型及等位基因频率比较,差异无统计学意义(P?>0.05)。结论 河南汉族人群非小细胞肺癌的发生、发展与XbaI G>T及-2841 A>T多态性没有关系。  相似文献   

18.
Zhao J  Peng QX  Yang BH  Lu DR 《中华医学杂志》2011,91(10):674-678
目的 探讨高分辨熔解曲线(HRM)法检测肺癌患者血浆循环DNA中表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的可行性.方法 采用HRM法对含不同比例EGFR基因突变型质粒的系列混合样本进行检测,以评价其灵敏度.应用HRM法检测2009年9月至2010年5月收治的96例肺癌患者血浆循环DNA中EGFR基因19、21外显子突变状况,并与基因测序法的结果比较分析.结果 HRM法可检出系列混合样本中突变型质粒比例为5%的突变,其检测灵敏度达5%.经HRM法,在96例肺癌患者中检测出17例发生了EGFR突变,突变率为17.7%,其中外显子19和21突变分别占88.2%(15/17)和11.8%(2/17);经基因测序法验证,结果完全一致.结论 HRM法检测EGFR简单易行,快速,敏感性较高,可作为临床EGFR突变筛查的优选方法.
Abstract:
Objective To discuss the practicability of detecting epidermal growth factor receptor (EGFR) mutations in plasma circulating DNA of lung cancer patients by high-resolution melting (HRM).Methods The sensitivity of HRM was analyzed by the detection of samples containing different proportions of EGFR-mutated plasmids.The mutations in exons 19 and 21 of EGFR were detected by HRM in 96 lung cancer patients from September 2009 to May 2010.And the results of HRM were compared with those of sequencing.Results The HRM detection could identify the EGFR mutations in a proportion of 5% of mutated plasmid DNA.And the EGFR mutations were detected in 17 (17.7%,17/96) cases.Among which,the number of exons 19 and 21 mutations was 15 (88.2%,15/17) and 2 (11.8%,2/17)respectively.The results of sequencing were consistent.Conclusion The HRM analysis may be an optimal method for clinical screening of EGFR mutation due to its simplicity and promptness with a high sensitivity.  相似文献   

19.
对SCN1A 基因突变阴性的热性惊厥(FS)患者进行3 基因突变筛查,并分析其突变特点。方法应用聚合酶链反应扩增和Sanger 测序方法对38 例入组患者筛查SCN3A 基因突变,采用生物软件分析突变特点。结果2 例错义突变(c.956T>C/p.I319T,c.5179G>A/p.D1727N);同源性比对分析提示2 例突变均高度保守,在千人基因组计划数据库和100 例正常人中未发现相应的位点改变。结论在SCN1A 基因突变阴性的FS 患者中,发现2 例SCN3A基因突变错义突变,该突变可能具有致病性。  相似文献   

20.
遗传性对称性色素异常症的基因突变分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的检测遗传性对称性色素异常症(DSH)ADAR基因的突变,分析基因型与表型之间的相关性。方法调查中国安徽省汉族人的5个DSH家系、3个散发病例,用直接测序的方法对其进行ADAR基因的突变检测。结果发现了8个杂合突变,其中5个是新发现的(c.982C〉T,c.1491insA,c.2568_2571delTAAC,c.2969C〉G,c.3040G〉T),3个是曾经报道过的(c.3203—2A〉G,c.3247C〉T,c.3286C〉T)。结论到目前为止,共发现48个DSH的A-DAR基因突变,推测ADAR基因的突变热点可能位于ADEAMc区域。ADEAMc区域是ADAR蛋白发挥腺苷脱氨酶作用的重要区域,但目前尚未发现基因型和表型之间的明确相关性。  相似文献   

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