乙型肝炎病毒基因的型特异引物结合型特异核苷酸分析

目的 研究HBV感染者HBV基因型分布状况,并建立一套适合HBV病毒株分型的简便可靠的分析方法.方法 通过对GenBank中全部S区基因序列(1000余条)进行比对,筛选A～H 8个基因型的型特异核苷酸.采用型特异引物PCR法分型,对238例慢性乙型肝炎患者所感染病毒中未能分型的病毒株再进行S区基因巢式PCR扩增、测序筛选出其特异性核苷酸从而判定其基因型.结果 238株HBV均得到分型.其中B型HBV感染者159例(男120例、女39例);C型69例(男52例、女17例);B+C混合型6例(男4例、女2例),B+D混合型4例(男3例、女1例).B型、C型、B+C和B+D昆合型检出率分别为66.8%、28.9%、2.5%和1.6%.未检出A、E、F、G、H基因型.结论 HBV感染以B、C基因型为主,B基因型高于C基因型.少数患者为B+C或B+D混合型感染.B、C基因型分布与性别无关(χ2=0.794,P＞0.05).     

核酸杂交检测HBV DNA及基因分型

检测血清中HBVDNA并进行基因分型。采用聚合酶链反应（PCR）扩增HBV DNA后，采用不同的探针，利用微板杂交法将其分为六个亚型。50例广东地区HBVDNA阳性病人中C型占68％（34例），B型占10％（5例），D型占6％（3例），F型占2％（1例），另有8％为混合型（3例BC，1例BCD），没有发现A型和E型，3例分型结果阴性，为未定型。广东地区HBV基因亚型以C型为主，B型次之，其它较少。可能存在其他亚型。     

乙型肝炎病毒基因分型方法的建立及应用

目的建立一种乙型肝炎病毒基因分型方法并应用于临床。方法用基因型特异性引物PCR法检测我院门诊和住院乙型肝炎患者基因分型。结果180例乙型肝炎患者基因分型中B型31例（17．2％），C型139例（77．2％），BC混合型10例（5．6％）。结论我地区乙型肝炎患者基因分型以B型和C型为主，主要是C型，其次是B型，其他分型未出现，还有待于进一步研究。     

乙型肝炎病毒基因型(A-F)多引物PCR分型法的初步建立

目的：建立一种简便易行的乙型肝炎病毒基因分型方法（只需PCR）。方法:对GenBank中查获的114例HBV全序列进行比较分析，找出每种基因型相对于其他5种基因型的独特序列，并根据这些独特序列设计出6对分别针对A－F基因型的特异引物。用这6对引物分别对标本进行PCR，根据阳性结果判断出标本的基因型。进一步简化该方法，用多引物对PCR法（PCR with several primer sets in a single tube,Multiplex PCR)将B，C，D3种基因型的特异引物混合进行PCR，根据扩增片断的大小判断基因型。用此方法对已鉴定的B，C，D型标本进行比较和验证。结果：单引物对PCR与多引物对PCR的分型结果一致，且与以前用PCR－RFLP法的分型结果一致。结论：用多引物对PCR分型法准确易行，灵敏性高，便于推广应用。     

广东省东莞地区慢性乙型肝炎患者HBV基因型分析

目的探讨东莞地区乙型肝炎患者HBV基因型的分布特点。方法采用PCR-微板核酸杂交-ELISA法检测HBVA—F基因型，采用荧光定量-聚合酶链反应法检测血清HBVDNA定量。结果在295例乙型肝炎患者中检出HBV基因型247例（83．7％），其中HBV基因C型占62．3％（154／247）、B型15．4％（38／247）、D型6．9％（17／247）、B／C混合型4．9％（12／247）、C／D混合型5．3％（13／247）、B／D混合型5．3％（13／247），48例未检出基因型；基因C型感染者之间无性别差异（x^2=0．043，P〉0．05）；各基因型患者血清HBVDNA水平无显著性相差，但与48例未检出基因型者比，后者HBVDNA水平明显降低（P〈0．01）。结论PCR-微板核酸杂交-ELISA法检测HBV基因型具有特异、敏感、简单和实用的特点，东莞地区乙型肝炎患者HBV基因型以C型为主，混合型比例相对较高，HBV复制强弱与病毒基因型无关。     

乙型肝炎病毒逆向点杂交基因分型法建立及应用

目的 利用逆向点杂交技术建立乙型肝炎病毒(HBV)基因分型新方法，通过对HBV DNA阳性血清抽样标本进行基因分型，了解佛山地区HBV基因型分布状态。方法 以HBV基因组的X区序列为主设计分型引物与探针，将活性氨基标记的探针依次固定在尼龙膜上，制成检测膜条。用标记生物素的引物进行HBV DNA扩增，将扩增产物与检测膜条杂交，以POD与TMB显色，判断基因分型结果，通过与基因测序结果比较确定新方法的有效性。从佛山地区HBVDNA阳性患者血清中随机抽取300份，用新建方法进行HBV基因分型检测。结果 新建HBV逆向点杂交基因分型方法可对拷贝数在10^3～10^9／ml之间的300份HBV DNA阳性抽检血清进行基因分型，发现B型147例，占49.0％；C型136例，占45．3％；D型1例，占0．3％；B、C混合型12例，占4．0％；C、D混合型4例，占1．3％；未发现A、E和F型。新方法基因分型结果与测序结果一致。结论 利用逆向点杂交技术可以准确有效和简便经济的进行HBV基因分型，适用于临床检测与流行病学研究；在佛山地区，人群中感染的HBV以B、C型为主。     

间日疟原虫环子孢子蛋白基因型的鉴别研究

[目的 ]建立间日疟原虫环子孢子蛋白 (CSP)基因分型法用于地理株的鉴定。[方法 ]Chelex 10 0离子交换法提取滤纸血样中的微量DNA ;套式PCR和等位特异PCR技术、琼脂糖电泳分析法、斑点印迹和Southern印迹 探针杂交技术分别用于判别性片段的扩增、分析和鉴定。[结果 ]用本文描述的套式 等位 特异PCR分型法 ,从一小片滤纸血样提取的微量DNA中 ,扩增出不同长度范围的 3种判别性片段 :6 5 0～ 770bp(间日疟种特异 ) ,15 0～2 30bp(温带族特异 ) ,5 88～ 6 15bp(PV 2型特异 )。用本法检测参考虫株出现的带型和长度与设计的靶序列完全吻合。检测 5 9份国内感染血样 ,42份鉴定为温带族虫株 ,15份为热带族虫株 ,2份为PV 2型虫株。 4份境外感染血样中 ,2个巴基斯坦分离株均为温带族 ,缅甸和老挝各 1株均为热带族虫株。 [结论 ]①本法能同时区分PV 1型 ,PV 2型以及温带族与热带族虫株 ,且较现有 (PCR 探针杂交 )法更为简便、快捷 ;②现场血样初步检测结果显示 :我国存在PV 1型 (温带族与热带族 )虫株和PV 2型虫株 ,也可能存在温带族东南亚组虫株。     

HBV基因型与HBeAg的表达关系及其临床意义

目的观察慢性乙型肝炎病毒（HBV）感染者HBV基因型与HBeAg表达和病情轻重的关系。方法利用型特异性引物多重PCR方法检测HBV基因型,时间分辨荧光法检测HBV DNA。结果在120例慢性乙型肝炎病毒感染者中HBV基因型C型84例（70%）、B型31例（25.8%）,BC混合型5例（4.2%）,未发现A、D、E、F基因型;C型在慢性重型肝炎组最高（P〈0.05）;在C基因型中HBeAg（＋）患者较HBeAg（-）患者多见（P〈0.05）,在B基因型中,HBeAg（＋）和HBeAg（-）患者分布无明显差别。结论徐州地区HBV基因型以C型和B型多见,e抗原的表达率在C型中较高;基因型B型与C型相比,C型引起肝脏损伤重。     

云南大理白族人群乙型肝炎病毒基因型和亚型的分布

目的调查云南大理地区白族人群乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）基因型和亚型分布情况。方法在大理地区选择100例白族慢性HBV感染者，采用基因型特异性引物分型法和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）方法测定HBV感染者血清HBV基因型和亚型，并用ELISA法测定HBV血清标志物。结果100例HBV感染者中，B型41例（41％），全部为Ba亚型，未发现Bj亚型；C型25例（25％），其中Cs亚型21例（84％），Ce亚型3例（12％），未分型1例（4％）；B＋C混合型34例（34％）。B型感染者与C型感染者比较血清HBeAg阳性率差异有统计学意义（P=0．024）。结论云南大理白族人群HBV感染的基因型主要为B型、B＋C混合型和c型，以Ba和cs亚型为主要流行株，B＋C混合型感染占很大比例。     

大肠杆菌O110 O-抗原基因簇序列的破译及特异基因鉴定

目的 定大肠杆菌O110标准株的O-抗原基因簇序列，对其基因结构进行遗传学分析，鉴定可用于快速分型的特异DNA序列。方法 用长距离PCR扩增O-抗原基因簇序列，建立鸟枪法文库进行随机测序，用生物信息学的方法进行序列拼接与分析，根据测定的序列设计引物，用PCR的方法确定针对大肠杆菌O110的特异基因。结果与结论 确定了大肠杆菌O110标准株的O-抗原基因簇序列以及该基因簇中7个开放阅读框架(open reading frame，orf)的功能，分别为：糖基转移酶基因(orf1，orf2，orf7)，小分子修饰酶基因(orf3，orf5)，O-抗原转运酶基因(wxx)和O-抗原聚合酶基因(wzy)。鉴定出了可以用于PCR方法对大肠杆菌O110快速检测的特异基因。     

HBV基因型分布与临床特征的相关性

采用多重聚合酶链反应-连接酶检测反应分型法对102例HBV-DNA阳性的慢性乙型肝炎病毒（HBV）感染患者进行HBV基因型检测。结果HBV基因B型43例，C型52例．BC混合型3例。未分型4例；B型以慢性乙型肝炎感染率最高，C型以肝炎肝硬化感染率最高；C型HBV感染患者血清总胆红素、抗HBe阳性率显著高于B型者。提示扬州地区存在HBV基因B、C及BC混合型，C型引起的肝脏损伤程度较重，B型较轻。     

基因芯片技术检测西藏拉萨地区的乙型肝炎病毒基因型

目的:研究西藏拉萨地区乙型肝炎病毒基因型的分布与特点.方法:采集92份西藏拉萨地区乙型肝炎患者的血清,参照GenBank中HBV DNA序列设计寡核苷酸探针并制备HBV基因分型芯片,利用套式PCR扩增HBV S基因部分片段,结合基因芯片、DNA测序和BioEdit软件进行基因分型检测,并对其与乙肝标志物、DNA含量、性别和民族之间的关系进行分析.结果:在92例血清标本中,套式PCR检测73例HBV DNA阳性可进行基因分型检测.其中B型13例(17.8%),C型18例(24.7%),D型39例(53.4%)和B/D混合基因型3例(4.1%).统计学分析3种基因型分布在不同乙肝标志物阳性、不同DNA含量和不同性别之间无差异,但与民族存在统计学差异(x~2=7.179,P<0.05).B型以汉族为主(9/13),而C、D型以藏族为主(12/18、28/39).将基因芯片分型的B、C、D型和B/D混合型进行DNA序列分析,表明两种分型方法的结果完全一致.结论:PCR结合基因芯片技术可用于HBV基因分型.西藏拉萨地区HBV基因型包括B、C、D和B/D混合型,其中以D型为主.     

幽门螺杆菌16SrDNA指纹图和PCR-RFLP基因分型研究

目的　探讨我国幽门螺杆菌 (Helicobacterpylori,Hp)的基因多态性及其与相关疾病之间的关系。 方法　应用PCR掺入法制备 16SrRNA基因探针 ,建立 16SrDNA指纹图技术和尿素酶C(ureC)基因的PCR -RFLP法 ,并结合统计学软件进行聚类分析 ,对临床分离的 14株Hp进行基因分型。结果　 14株Hp的 16SrDNA指纹图谱显示 10个HaeⅢ杂交带型和 12个HindⅢ杂交带型 ;ureC基因的变异度较小 ,14株Hp中有 12株PCR -RFLP图谱完全一致。通过杂交结果示意图和SPSS10 0软件进行聚类分析 ,HaeⅢ、HindⅢ及两种酶杂交结果的综合 ,均将 14株Hp分为两型。两种方法结果综合进行聚类分析 ,14株Hp在基因水平上分为三型。结论　差异显著的DNA指纹图谱说明了不同Hp菌株间基因组结构的高度变异性。 16SrDNA指纹图谱较ureC基因的PCR -RFLP谱型更敏感地表达Hp各菌株的变异 ,可准确有效地对Hp作出基因分型。未发现Hp菌株间有特异的疾病图谱存在     

135例乙型肝炎病毒感染者基因分型及其临床分布

目的研究乙型肝炎病毒（HBV）感染者中HBV基因分型及其临床分布情况。方法应用基因型和亚型特异性引物聚合酶链反应（PCR）法，对鲁西地区135例HBV感染者血清进行HBV基因型及亚型分型。结果未分型11例，已分型124例。其中C型111例（C2基因亚型87例、非C1／C2亚型24例）；B型11例，其中Ba型8例、Bj型3例；B／C混合型2例均为BaC2亚型混和感染。在肝硬化和重度慢性乙型肝炎中C型所占比例较高，分别为100％、88％；无症状携带者中B型所占比例较高为8．51％；HBV基因型分型与性别无关。结论鲁西地区HBV感染者以C基因型为主，其中C2亚型占优势。     

膜芯片检测人B组、C组轮状病毒的初步研究

目的建立检测人B组、C组轮状病毒（RV）的膜芯片。方法采用化学合成法合成B组、C组RV高度保守的核酸扩增区域,以地高辛标记上游引物,经半巢式PCR扩增B组、C组RV的保守检测区域,采用本实验室自行研制的膜芯片进行杂交检测。结果B组、C组RV的扩增产物同膜芯片上特异探针呈高度特异杂交。结论自制的膜芯片检测技术能够实现B组、C组RV的检测．并具有特异性好、高通量、平行性和简便快速的特点。     

黄石地区慢性无症状乙型肝炎病毒携带者的基因型分布

目的：了解湖北黄石地区慢性无症状乙型肝炎病毒（HBV）携带者HBV基因型的分布，及其与病毒复制水平、HBeAg表达的相关性。方法：选择黄石地区168例慢性无症状HBV携带者作为研究对象，HBV基因型采用PCR微板核酸杂交．ELISA方法检测；血清HBVDNA复制水平采用荧光定量PCR检测；HBV—M采用ELISA法检测。结果：168例慢性无症状HBV携带者中HBVDNA阳性者为114例（阳性率为67．9％），其基因型分布为B、C、D型以及这3种基因型组成的混合型，而未发现A、E、F基因型。其中以B型、C型为主，所占比例为62．6％和36．8％，D型及混合型比例均为5．3％。C基因型患者中，HBV DNA呈现高水平复制（10^7～10^8 Copies／ml）的患者比例为26．2％（11／42），B基因型为13．3％（8／60）（P〈0．05）。C基因型患者血清抗-HBe阳性率（40．5％）显著高于B基因型（15．0％）（P〈0．01）。结论：黄石地区存在HBV的B、C、D基因型，以及由它们组成的混合基因型；B基因型为优势基因型；C基因型与HBV高复制水平，以及基因变异相关。     

深圳地区乙型肝炎病毒DNA基因分型与临床的关系

目的检测血清中乙型肝炎病毒(HBV)DNA并进行基因分型。方法采用聚合酶链反应(PCR)扩增HBV DNA后，用不同的探针，利用微板杂交法将其分为6个亚型。结果150例HBV DNA阳性病人中，B型50例、C型36例．D型13例、F型3例和A型1例，没有发现E型。另有47例为混合型，其中以B、D型(18例)、C、D型(20例)为主，分别占混合型的38．30％与42．6％。受检病人中，B型感染者丙氨酸氨基转移酶水平明显增高；B型感染者比C型感染者抗HBe阳性率高，分别为64．0％和30．5％，而C型感染者比B型感染者乙型肝炎e抗原阳性率高，分别为47．2％和22．0％；年龄、性别与基因型关系不明显。结论深圳地区HBV基因亚型以B型为主，C型次之，其他较少。基因型与肝炎程度有一定关系。     

兰州地区乙肝病毒基因亚型的感染情况

目的：调查兰州地区乙肝病毒基因分型情况及其和性别，血清标志物的关系，方法：用PCR－微板核酸杂交－ELISA法对88例兰州地区慢性无症状携带者（AsC)及慢性乙型肝炎（CHB），肝炎后肝硬化（HLC）的HBV DNA进行基因分型，并用酶免疫法（EIA）测其血清标志物（HBV－M），结果：兰州地区基因型C型67．0％，B型12．5％，B，C混合型18．2％，其他型2．3％，男、女性感染HBV DNA构成比存在差异，HBeAg阳性率C型较B型高，结论：兰州地区的基因型以C型为主，乙肝病毒基因亚型易感性可能存在性别差异，不同基因亚型感染可形成不同的血清标志物。     

用PCR—RFLP和16SrDNA指纹图法分析幽门螺杆菌基因型

本文建立了PCR－RFLP和16srDNA指纹图法．对19株幽门螺杆菌（HP）进行基因型分析：HP尿素酶C基因的PCR扩增产物．分别用HindⅢ、HaeⅢ、AluⅠ酶切，结果显示：每个酶均将19株HP分为3种RFLP图谱．综合HindⅢ，HaeⅢ和AluⅠ酶切结果，19株HP分为10个酶切带型；PCR扩增HP标准株16SrRNA基因，地高辛标记制备550bp探针，19株HPDNA分别经HaeⅢ和EcoRⅠ酶切、电泳后，通过Southern杂交获16SrDNA指纹图，结果显示：HaeⅢ酶切分为14个杂交带型，EcoRⅠ酶切19株HP杂交带型均不同。本实验表明：上述两种方法重复性好，分群力高，可准确有效地对HP作出鉴定并将其分型。19株HP株间存在基因型差异。     

恶性疟原虫有性期特异抗原Pfs48/45基因的克隆与部分序列分析

目的：构建恶性疟原虫海南FCC1／HN分离株有性期特异抗原Pfs48／45，为研制恶性疟原虫传播阻断疫苗提供抗原。方法：根据Pfs48／45基因编码区序列设计引物，用PCR扩增DNA，并进行序列分析，双酶切后，定向克隆入pcDNA3载体，转化大肠杆菌TG1，随机取出氨苄青霉素抗性菌落进行PCR扩增，用碱裂解法抽提阳性的重组子DNA，双酶切鉴定。结果：特异扩增了编码Pfs48／45全基因序列（1363bp）；用5端寡核苷酸引物测定了450个碱基，结果表明FCC1／HN分离株Pfs48／455端基因序列与NF54株相应基因基本一致，仅在第307（T→C）和372（T→C）位碱基存在置换；第372位碱基置换产生新的酶切位点TaqI，进一步用TaqI消化PCR扩增产物，产生两个大小分别为984bp和379bp的酶切片段，测序和酶切结果均证实扩增的目的基因确为fs48/45 基因; 将纯化的目的基因片段正向插入pcDNA 3 质粒的BamHI 和EcoRI 位点。结论: 我国海南FCC1/ HN 分离株Pfs48/45 抗原基因序列与NF54 株相应基因高度同源; 成功构建重组质粒pcDNA 3-Pfs48/45