miRNA-224-3p对人结肠癌细胞株SW480的增殖及侵袭的作用

目的探讨低表达miRNA-224-3p对结肠癌细胞株SW480增殖及侵袭的作用机制。方法采用siRNA技术沉默miRNA-224-3p在结肠癌细胞株SW480中的表达,实验分为si RNA组和NC组;采用CCK8法检测细胞增殖率;采用流式细胞术检测细胞周期分布;采用Western blot检测细胞中miRNA-224-3p、Cyclin D1以及CDK4蛋白的表达;采用Transwell小室检测细胞侵袭力。结果转染si RNA后,siRNA组中miRNA-224-3p蛋白表达明显低于NC组(P0.05);CCK8结果表明在结肠癌细胞株在转染24 h、48 h和72 h时的细胞增殖率分别明显低于NC组(P0.05);流式检测结果表明在siRNA组中,处于G0～G1期的SW480的细胞数量显著高于NC组(P0.05),处于S期的SW480细胞数量显著低于NC组(P0.05);Western blot结果表明siRNA组中的Cyclin D1和CDK4蛋白表达明显高于NC组(均P0.05);Transwell小室检测表明siRNA组细胞的侵袭力明显低于NC组(P0.05)。结论低表达miRNA-224-3p可显著抑制结肠癌细胞株SW480增殖和侵袭,其机制可能与阻滞细胞周期进程有关。     

miRNA-218-5p通过HMGB1信号通路抑制RAW264.7细胞源性泡沫细胞炎症反应

目的：探讨微小RNA-218-5p(miRNA-218-5p)通过调节高迁移率族盒蛋白1(HMGB1)信号通路对RAW264.7细胞源性泡沫细胞炎症反应的影响。方法：将RAW264.7细胞分为对照组、模型组、miRNA mimics组及miRNA NC组。对照组细胞正常培养;模型组细胞采用80 mg/L氧化低密度脂蛋白（ox-LDL）诱导24 h建立泡沫细胞模型;miRNA mimics组及miRNA NC组分别转染miRNA-218-5p mimics及miRNA mimics control 24 h后再用80mg/L ox-LDL诱导24 h建立泡沫细胞模型。应用油红O染色检测各组细胞内脂质变化;试剂盒检测各组细胞中白细胞介素1β(IL-1β)、IL-6和肿瘤坏死因子α(TNF-α)表达量;qPCR检测各组细胞中miRNA-218-5p表达量;Western Blot检测各组细胞中HMGB1、Toll样受体4(TLR4)、核因子κB(NF-κB)p65及p-NF-κB p65蛋白水平;通过双萤光素酶报告基因实验检测miRNA-218-5p对HMGB1的靶向作用。结果：与对照组比较...     

结肠癌化疗耐药相关miRNA表达谱的初步研究

目的:应用基因芯片技术筛选结肠癌耐药相关微小RNAs (miRNAs),探究miRNAs对化疗耐药的调控机制。方法:采用基因芯片技术分析结肠癌细胞系HCT8及其耐长春新碱细胞系HCT8/v中miRNAs的表达差异,对部分差异表达的miRNAs应用RT-qPCR进行验证,对表达差异显著的miRNAs进行靶基因预测,利用Gene Ontology (GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对预测到的靶基因进行生物信息学分析。结果:筛选出342个差异表达miRNAs,其中190个表达上调,152个表达下调。RT-qPCR验证结果示miR-125-5p、miR-181c-5p和miR-153-3的表达情况和芯片检测结果一致;miR-130a-3p和miR-149-3p的表达与芯片检测结果不一致。GO分析结果显示,耐药相关基因主要富集的旁路是RNA聚合酶II调控区序列特异性DNA结合旁路,主要通过正向调节发挥作用,位置主要是在细胞内有界细胞器上。KEGG分析结果显示,耐药相关基因最为富集的是轴突导向通路、胰岛素信号通路及磷脂酶D信号通路。结论:miRNAs与结肠癌化疗耐药密切相关。对这...     

miR-203靶向PIK3CA对结肠癌SW480细胞增殖的影响

目的探讨miR-203对结肠癌SW480细胞增殖的影响及可能机制。方法采用脂质体介导的miR-203模拟物转染结肠癌SW480细胞,通过实时定量PCR进行验证,Western blot检测miR-203过表达后SW480细胞中p110α蛋白的表达。采用CCK-8法检测miR-203过表达后,SW480细胞增殖能力的变化,采用生物信息学网站预测PIK3CA是否为miR-203的靶基因,进一步应用双荧光素酶报告基因实验进行验证。结果 miR-203模拟物转染SW480细胞组,miR-203的表达水平显著升高,p110α蛋白表达下调,miR-203过表达能抑制SW480细胞体外增殖,生物信息学分析结果显示PIK3CA是miR-203的靶基因之一,双荧光素酶实验证实PIK3CA为miR-203的下游靶基因。结论 miR-203通过靶向调控PIK3CA抑制结肠癌SW480细胞增殖。     

血浆循环miRNA-126、miRNA-28-3p的表达与糖尿病的关系研究

目的探讨血浆中miRNA-126和miRNA-28-3p的表达与糖尿病(DM)的关系,并进行相关机制探讨。方法随机选取恩施土家族苗族自治州中心医院DM患者80例作为DM组,选取同期治疗的非DM患者80例作为对照组,采用qRT-PCR检测其血浆中循环miRNA-126和miRNA-28-3p的表达水平,并对其靶基因、基本生物学功能和相关lncRNA和circRNA进行生物信息学预测。结果 DM患者血浆中miRNA-126的表达水平(0.115 0±0.014 4)较对照组患者(0.001 9±0.000 6)明显升高,差异具有极显著性统计学意义(P0.01);DM患者血浆中miRNA-28-3p的表达水平(0.138 6±0.017 24)较对照组患者(0.000 6±0.000 05)明显升高,差异具有极显著性统计学意义(P0.01);miRNA-126与miRNA-28-3p的Pearson相关系数为0.433 5(P0.01);2组患者miRNA-126、miRNA-28-3p ROC曲线下面积差异均有极显著性统计学意义(P0.01);生物信息学分析发现miRNA-126、miRNA-28-3p可能参与调控了胰岛素信号通路、胰岛素受体信号通路、胰岛素/胰岛素生长因子信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路和血管生成等信号通路,并可能与多种lncRNA和circRNA都有关。结论血浆中循环miRNA-126与miRNA-28-3p可能通过调控胰岛素和胰岛素生长因子相关信号通路导致DM的发生,可以作为DM新型临床诊断生物标志物,并可能与多种lncRNA和circRNA有关。     

miR-625-3p在结肠癌组织和细胞中的表达

目的:探讨微小RNA(mi R)-625-3p在结肠癌组织和细胞中的表达,了解其作用机制。方法:利用q RT-PCR分析结肠癌细胞株、癌组织和癌旁组织中mi R-625-3p的表达水平,探讨mi R-625-3p表达水平与结肠癌临床病理参数之间的关系;利用碘化丙啶染色和流式细胞术检测细胞凋亡和细胞周期变化;Western blot法检测mi R-625-3p对结肠癌细胞株凋亡相关蛋白的影响,初步了解其发挥影响的可能机制。结果:结肠癌组织mi R-625-3p的表达量比癌旁组织高(P0.05),mi R-625-3p的表达量与结肠癌浸润深度、TNM分期及有无远处转移关系密切(P0.05)。mi R-625-3p在结肠癌SW620细胞中的表达水平高于在SW480细胞中的表达。抑制mi R-625-3p的表达能显著抑制结肠癌细胞的周期(P0.05)和促进凋亡;转染mi R-625-3p后,Bcl-2的表达量增加(P0.05),Bax表达量没有显著变化。结论:mi R-625-3p能促进结肠癌细胞增殖,抑制结肠癌细胞凋亡,可能是结肠癌新的抗癌靶点。     

miR-194-5p在微流控芯片筛选的肺癌间质表型亚系的作用

目的分析肺癌间质表型亚系A3细胞中上皮间质转化(EMT)相关的miR-194-5p鉴定、分析及其靶基因功能富集的生物学过程和信号通路。方法使用微流控芯片筛选母系肺癌A549细胞获得间质表型亚系A3细胞,利用miRCURYTM芯片筛选差异性表达的miRNA。利用MTT、Transwell实验检测miR-194-5p对亚系细胞增殖、迁移、侵袭能力的影响。应用Miranda、MiRBase、TargetScan数据库和DAVID在线软件对miR-194-5p进行靶基因预测及相关信号通路、生物学功能富集分析。结果成功筛选获得具有间质表型亚系A3细胞,与母系A549细胞相比,在A3亚系中miR-194-5p的表达水平显著下调,转染miR-194-5p mimics后细胞迁移和侵袭能力发生显著降低但增殖未受影响;转染miR-194-5p inhibitor后细胞的迁移和侵袭能力增强。miR-194-5p的48个靶基因主要在蛋白质结合等生物学过程中起作用,信号通路显著富集于TGF-β等EMT相关信号转导通路。结论从微流控芯片获得的间质表型细胞亚系成功筛选EMT相关miRNA,其中miR-194-5p抑制肺癌EMT进程,是潜在的治疗靶点。     

miRNA-205调控靶基因的研究进展与趋势

传统的miRNA-靶基因-生物学功能研究思路忽略了靶基因之间、靶基因所在信号通路之间的联系,使得miRNA调控作用的整体性与关联性无法得到全面的阐释。运用整体、系统且联系的思维方式,通过对荧光素酶报告实验验证的miR-205靶基因及其信号通路的整理和分析,将明确miR-205的研究方向,并为突破现有miRNA研究的整体格局,探索新颖的miRNA调控机制提供帮助。     

永久性房颤的转录组分析及miRNA调控网络的建立

目的探索永久性房颤(p AF)发病相关的关键miRNAs及其调控的靶基因。方法联合应用表达谱芯片和miRNA芯片分析p AF患者(n=7)和健康成人(n=4)的左房组织,筛选p AF相关差异表达的miRNAs,进行靶基因预测后,与表达谱芯片的筛选结果进行负相关分析后的基因集合进行显著性功能分析(GO-analysis);利用miRNA与靶基因之间的靶向调控关系,构建差异miRNA与交集靶基因的调控网络(miRNA-gene-network),得到网络中起核心调控作用的miRNA和被调控的关键靶基因;采用RT-q PCR方法检验另一组p AF患者(n=5)和健康成人(n=4)的左房组织标本。结果表达谱基因芯片发现610个mRNA有显著性改变(fold change2,P0.05),miRNA-靶基因调节网络发现与p AF显著相关的20个miRNAs和107个靶基因,相关度最高的是miR-144、miR-1284、miR-1827、miR-1、miR-3613-3p和miR-101;其调控的重要靶基因包括CACNB2、EFNB1、PTEN、TAOK1、RUNX1和TPM3等;RT-q PCR验证结果显示这些miRNAs和靶基因密切相关。结论通过表达谱基因芯片与miRNAs芯片联合分析p AF左房组织标本,构建miRNA调控网络,发现p AF重要的miRNA-靶基因调控及功能,结果更加准确。     

上调miR-187*表达对人结肠癌细胞株增殖活性的影响

 目的：研究微小RNA-187*(miR-187*)在人结肠癌细胞株及正常结肠组织中的表达,同时分析miRNA-187*上调对人结肠癌细胞增殖和细胞周期的影响。方法：选取3例结直肠癌组织及配对正常黏膜组织进行miRNA芯片检测,筛选出大肠癌组织中异常表达的miRNA;提取8株结肠癌细胞株和10例正常结肠组织中总RNA,采用Taqman 实时定量PCR方法检测miR-187*的表达;预测miR-187*的靶基因,采用实时定量PCR方法检测靶基因的表达;采用脂质体介导的转染方法将miR-187*模拟物转染人结肠癌细胞株HCT116;检测转染后miR-187*和靶基因的表达;通过MTS试剂盒检测细胞增殖能力,流式细胞术检测miR-187*对细胞周期的影响。结果：miRNA芯片检测结直肠癌组织中miR-187*的表达较正常黏膜明显降低;miR-187*在结肠癌细胞株中的表达较正常结直肠黏膜组织明显下调;而B细胞特异性莫洛尼小鼠白血病病毒整合位点1（BMI-1） mRNA在结肠癌细胞株中表达较正常黏膜组织中明显增高;转染miR-187*模拟物后,miR-187*表达明显增加;同时miR-187*的高表达可以显著抑制BMI-1 mRNA的水平;miR-187*模拟物转染组和阴性对照组相比,细胞增殖活力明显受抑制（P＜0.05）,同时增殖细胞核抗原表达亦明显降低;细胞周期检测结果显示,miR-187*模拟物转染组G2/M期细胞增多,和阴性对照组间差异有统计学意义。结论：miR-187*在人结肠癌细胞株中表达下调;上调miR-187*表达可抑制结肠癌细胞增殖活性,影响结肠癌细胞周期;miR-187*可能通过抑制BMI-1 在结肠癌中发挥抑癌作用。     

肠道病毒71型感染人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)的miRNA表达谱

目的 研究肠道病毒71型(EV71)感染神经细胞的miRNA表达谱,探讨miRNA在病毒感染神经细胞中的可能作用.方法 建立EV71感染人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)模型,收集感染后48 h细胞.以Taqman低密度芯片检测miRNA表达谱,使用实时RT-PCR对芯片结果进行验证并在TargetScan和miRanda网站预测靶基因,采用GO和KEGG分析靶基因功能.结果 成功建立EV71感染SH-SY5Y细胞模型,通过低密度芯片筛选出215种显著升高的miRNA和25种显著下调的miRNA.经过RT-PCR验证,3种miRNA(MiR-10a*、miR-15b*和miR-195)显著下调,7种miRNA(miR-10a、miR-342-5p、miR-483-5p、Let-7b、miR-99a、miR-140-5p和miR-21)显著上调,与芯片结果相符.GO分析显示发展进程和信号调节条目最富集靶基因.KEGG路径分析显示靶基因在肿瘤路径、蛋白水解、Wnt信号传导、黑素形成、粘附连接、MAPK信号通道最富集.结论 EV71感染神经细胞48 h后miRNA表达谱发生改变,10种变化的miRNA靶基因预测在发展进程、信号传导及凋亡中起着重要的作用,可为后期机制研究提供参考.     

miRNA-326调控胃癌细胞活力和凋亡的机制及其在胃癌组织中的表达及临床意义

目的:探讨微小RNA-326(miRNA-326)调控胃癌细胞活力和凋亡的机制及其在胃癌组织中的表达及临床意义。方法:采用RT-qPCR检测miRNA-326在55例胃癌组织中的表达情况,并分析其与临床病理特征的关系。以胃癌细胞BGC-823为研究对象,RT-qPCR检测miRNA-326在细胞中的表达;将BGC-823细胞随机分为正常对照组(未转染)、mimic-NC组(转染mimic阴性对照)和miRNA-326 mimic组(转染miRNA-326 mimic),以脂质体转染法上调miRNA-326表达后,CCK-8法检测细胞活力,流式细胞术检测细胞凋亡,Western blot检测基质金属蛋白酶9(MMP-9)、p21、细胞周期蛋白D1(cyclin D1)、Bcl-2和cleaved caspase-3的蛋白水平,RT-qPCR检测cyclin D1的mRNA表达,双萤光素酶报告基因检测法验证CCND1 (cyclin D1的基因)是否是miRNA-326的靶基因。结果:miRNA-326在胃癌组织中的表达明显低于癌旁组织(P 0. 05),其表达与肿瘤大小、淋巴结转移、分化程度及临床分期均有显著相关性(P 0. 05),而与患者的年龄和性别无关;此外,还与患者生存率密切相关(P 0. 05)。miRNA-326在BGC-823细胞中的表达明显低于正常胃黏膜GES-1细胞(P 0. 05)。与正常对照组相比,mimic-NC组细胞中miRNA-326的表达无明显变化,而miRNA-326 mimic组细胞中miRNA-326的表达明显升高(P 0. 05)。与正常对照组相比,miRNA-326 mimic组细胞活力明显减弱,而细胞凋亡增强(P 0. 05);此外,与正常对照组相比,miRNA-326 mimic组细胞中MMP-9、cyclin D1、Bcl-2蛋白及cyclin D1 mRNA表达下降,而p21和cleaved caspase-3的蛋白水平上升(P 0. 05)。然而,mimic-NC组与正常对照组相比,各检测指标的差异均无统计学显著性。与mimic-NC+miR-326 mimics组相比,转染pmiR-CCND1-WT质粒细胞的萤光素酶活性降低(P 0. 05),而转染pmiRCCND1-Mut质粒的萤光素酶活性无改变。结论:miRNA-326在胃癌组织中低表达,可能通过靶向调控CCND1表达而促进细胞活力并抑制细胞凋亡。     

miRNA-181a在人肺腺癌细胞中的表达及对细胞功能的影响

目的:研究微小RNA-181a(mi RNA-181a)在不同人肺腺癌细胞中的表达及其转染人肺腺癌耐药细胞A549/DDP后对其细胞功能的影响及机制。方法:利用实时荧光定量PCR方法检测mi RNA-181a在人正常肺上皮细胞系BEAS-2B、人肺腺癌细胞系A549、人肺腺癌耐药细胞系A549/DDP中的表达;利用p Genesil-mi RNA-181a真核表达质粒转染A549/DDP细胞,同时设置未转染组和空载组;分别采用实时荧光定量PCR、MTT法、流式细胞术、Transwell实验以及Western blot法检测mi RNA-181a转染前后的表达情况、对A549/DDP细胞活力、细胞周期、细胞侵袭能力和顺铂(DDP)作用下的细胞生长抑制率、细胞凋亡率的影响以及对A549/DDP细胞中mi RNA-181a的靶基因bcl-2和p53蛋白表达的影响。结果:mi RNA-181a在A549和A549/DDP中的表达量显著低于BEAS-2B(P0.05),且在A549/DDP中表达量最低;mi RNA-181a转染A549/DDP细胞后其表达显著升高(P0.05)且能够抑制A549/DDP细胞活力、细胞周期和细胞侵袭能力(P0.05),同时升高DDP作用下A549/DDP细胞的生长抑制率和细胞凋亡率(P0.05);mi RNA-181a转染A549/DDP细胞后抑制Bcl-2蛋白的表达而促进P53蛋白的表达(P0.05)。结论:mi RNA-181a可能参与了肺腺癌的发生发展,mi RNA-181a可作为人肺腺癌治疗的新靶点。     

Oncolytic adenovirus co-expressing miRNA-34a and IL-24 induces superior antitumor activity in experimental tumor model

It has been demonstrated that numerous microRNAs (miRNAs) have potent tumor-suppressing effects on a variety of cancers, implicating a possible application of miRNA in tumor therapy. Oncolytic adenovirus is a suitable vector to deliver tumor suppressor genes for treatment of cancers. However, it remains unknown whether co-expression of tumor suppressor genes and miRNAs can contribute to a more potent antitumor capacity within an oncolytic adenovirus delivery system. In this study, we found that expression of miRNA-34a was reduced in hepatocellular carcinoma (HCC), and the reduced expression of miRNA-34a was associated with worse outcome of HCC patients. Thus, we developed an oncolytic adenoviral vector, AdCN205, to co-express miRNA-34a and IL-24 driven by an adenovirus endogenous E3 promoter in HCC cells. High levels of miRNA-34a and IL-24 expression were detected in AdCN205-IL-24-miR-34a-infected HCC cells. AdCN205-IL-24-miR-34a significantly induced dramatic antitumor activity, as compared with that induced by AdCN205-IL-24 or AdCN205-miR-34a alone. Transfer of miRNA-34a into HCC cells inhibited the expression of its target genes, Bcl-2 and SIRT1. Treatment of established xenograft HCC tumors with AdCN205-IL-24-miR-34a in a mouse model resulted in complete tumor regression without recurrence. Taken together, our data provide a promising and reasonable delivery strategy of double-aimed cancer therapy, in which miRNAs and tumor-suppressing genes are used simultaneously.     

Small RNA sequencing of sessile serrated polyps identifies microRNA profile associated with colon cancer

Sessile serrated adenoma/polyps (SSA/Ps) of the colon account for 20–30% of all colon cancers. Small non‐coding RNAs, including microRNAs (miRNAs), may function as oncogenes or tumor suppressor genes involved in cancer development. Small RNA sequencing (RNA‐seq) was used to characterize miRNA profiles in SSA/Ps, hyperplastic polyps (HPs), adenomatous polyps and paired uninvolved colon. Our 108 small RNA‐seq samples' results were compared to small RNA‐seq data from 212 colon cancers from the Cancer Genome Atlas. Twenty‐three and six miRNAs were differentially expressed in SSA/Ps compared to paired uninvolved colon and HPs, respectively. Differential expression of MIR31‐5p, MIR135B‐5p and MIR378A‐5p was confirmed by RT‐qPCR. SSA/P‐specific miRNAs are similarly expressed in colon cancers containing genomic aberrations described in serrated cancers. Correlation of miRNA expression with consensus molecular subtypes suggests more than one subtype is associated with the serrated neoplasia pathway. Canonical pathway analysis suggests many of these miRNAs target growth factor signaling pathways.     

miRNA-146a与肺部疾病的研究进展

MicroRNA（miRNA）是近二十年来分子生物学和遗传学领域的研究热点,随着人们对miRNA的不断研究和认识,发现miRNAs与吸入性肺损伤的发生发展密切相关。miRNA-146a是第一个被发现在免疫系统中具有调节作用的miRNA,是近年来研究较前沿、较广泛的miRNA之一,其下游基因介导参与了炎症、免疫、肿瘤的发生和发展。近年来,对miRNA-146a这种急性时相反应的负调节剂的研究越来越多,被认为是固有免疫及适应性免疫细胞分化及功能的重要调控者。本文首先从miRNA-146a在固有免疫、适应性免疫参与炎症负反馈机制出发,归纳了在Nuclear factorκB（NF-κB）信号通路中路径图,再通过回顾miRNA-146a在肺部疾病中的表达水平,对参与吸入性肺损伤及肺癌病程中分子机制及预后中作用的最新研究进展作一综述。