中国人脆性X—E位点多态性研究

采用毛细管多聚酶链反应（ＰＣＲ）结合序列胶银染色的方法，对２０５条Ｘ染色体的脆性Ｘ－Ｅ位点进行了研究，确认正常人ＧＣＣ三核苷酸重复序列〔Ｐ（ＧＣＣ）ｎ〕多态分布范围在９￣２５个拷贝，最多见的等位基因是１６个拷贝的ＧＣＣ重复、正常女性等位基因杂合子频率为７５％。     

转化生长因子β受体I多聚丙氨酸重复多态性不会增加卵巢癌发病风险

目的:本研究旨在验证I型转化生长因子β受体(TGFβR1)6A等位基因多聚丙氨酸重复序列的多态性是否会增加多种肿瘤(包括卵巢癌)的易感性。方法:对北卡罗莱纳州588例卵巢癌患者及614例正常人TGFβR1多聚丙氨酸重复序列多态性进行基因型测定,进行人群病例对照研究。结果:6A等位基因多态性发生率具有种族差异,高加索人(10.7%)和非裔美国人对照(2.4%)间有统计学差异(P<0.001)。对照组中18%携带1或2个拷贝的转化生长因子β受体I(TGFβR1)6A等位基因多聚丙氨酸重复多态性,而在卵巢癌组中为19%,并且与卵巢癌的发病风险无关(OR1.07,95%CI0.80…     

多拷贝基因座DYF399S1在河南汉族群体中的遗传多态性分析

目的:研究Y染色体上1个新的多拷贝短串联重复序列基因座DYF399S1在河南汉族群体中的遗传多态性。方法:采集248名河南汉族无关男性个体的血标本,提取基因组DNA,PCR法扩增,用中性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR产物并测序,采用ABI 3130基因自动分析仪和Gene Mapper ID v3.5软件分析结果。结果:DYF399S1基因座为3拷贝,在河南汉族群体继续表现为(GAAA)3N7(GAAA)12-22其模块结构包括1个重复数目变异的核心序列和1个固定的重复序列结构。按其变异模块命名等位基因,共发现11个等位基因。在248名河南汉族无关男性个体中,3个拷贝组成的单体型有94种,其中出现最多的单体型是18/18/18,频率是0.080 6,仅出现1次的单体型有49种,频率是0.004 0;单体型辨别能力(DC)是0.372 5,单体型多样性(HD)和个体识别力(DP)分别为0.865 5和0.862 1。结论:DYF399S1基因座具有高度的多态性,适用于法医学实践和人类进化的研究。     

DRD4多态性与海洛因依赖的相关研究

目的探讨多巴胺D4受体第3外显子48bp可变重复序列多态性(DRD4exon48bpVNTR)与海洛因依赖的关系。方法采用PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染检测结果,检测了西北地区187例20~45岁之间海洛因依赖人员的DRD4基因多态性。结果在DRD4exon48bp的重复片段中,海洛因依赖组存在5个等位基因,分别为2,3,4,5,6个重复片段,其基因频率以48bp的2个和4个重复等位基因出现的频率较高。把等位基因划分为长重复序列(大于等于4次)和短重复序列(小于4次)后,海洛因依赖组长重复等位基因多于对照组(χ2=3.82,P<0.05)。结论DRD4外显子48bpVNTR长重复等位基因与海洛因依赖有关。     

广西地区正常人群SCA3／MJD基因多态性研究

目的探讨广西地区汉族正常人群SCA3／MJD基因（CAG）n重复拷贝数的正常变异范围。方法应用荧光PCR及毛细管电泳片段长度分析对广西75名正常人SCA3／MJD基因（CAG）n重复拷贝数进行分析。结果广西地区SCA3／MJD基因（CAG）n在正常人群中的变异范围为13～34个拷贝,集中于13个拷贝,其等位基因频率为52．00％,杂合频率为69．33％,共17种等位基因。结论SCA3／MJD基因（CAG）n重复序列在广西正常人群中呈现多态性,SCA3／MJD基因（CAG）n重复拷贝数正常变异范围存在地区差异。     

注意缺陷多动障碍与多巴胺D4受体和多巴胺载体蛋白基因多态性的关系

目的：探讨中国汉族人群中，注意缺陷多动障碍(ADHD)与多巴胺D4受体基因(DR／M)第3外显子48bp和多巴胺载体蛋白基因(DAT1)非编码区40bp可变数目顺向重复(VNTR)多态性的关系。方法：对340个ADHD患儿，202个ADHD核心家系和226个对照分别就DRD4 48bp VNTR和DAT1 40bp VNTR多态性进行检测，并进行ETDT、HHRR和病例对照的关联分析。结果：所测人群中的DRD4 48 bp的重复次数是2—6次，最常见的等位基因是4次重复(77％)和2次重复序列(19．4％)；未发现7次重复序列或更长的片段。DAT1 40 bp的重复次数是6—7和9-11次，其中10次重复序列最常见(90．7％)。在ADHD患儿中，长重复等位基因(DRD4的4—6次和DAT1的11—12次重复序列)比对照组多。未发现ADHD和DRD4的7次重复等位基因或DAT1的10次重复等位基因之间存在关联。结论：DRD4(按照性别分层后)和DAT1的长重复等位基因可以增加中国汉族儿童罹患ADHD的危险性。     

1个多发性椎间盘退行性变疾病家系的Aggrecan基因串联重复多态性的分析

  目的 分析1个多发性椎间盘退行性变疾病（DDD)家系的聚合蛋白聚糖（Aggrecan）基因串联重复多态性(VNTR)。方法 应用PCR技术检测家系成员血液中Aggrecan VNTR的分布情况。结果 被检测的家系成员中未发现超过25次重复的等位基因者,家系患DDD成员基因Aggrecan VNTR分布：均为杂合子,且有1个等位基因≤20个重复序列。结论 本家系中遗传因素是DDD的主要诱发因素,且可能与相对较小重复序列Aggrecan VNTR有关。     

CTLA-4基因微卫星多态性与子宫内膜异位症的相关性研究

目的:研究CTLA-4基因微卫星多态性与子宫内膜异位症(EM)的相关性.方法:采用聚合酶链反应技术-扩增片段长度多态性技术,分析56例EM患者和35例对照者CTLA-4基因外显子4的3,非翻译区,包含(AT)n重复序列的特异性等位基因.结果:EM患者CTLA-4基因外显子4的3'非翻译区(AT)n重复序列有12种等位基因.与对照组比较,120 bp等位基因频率在EM组中显著增高,差异有统计学意义(P＜0.01,OR=3.344,95%CI 1.498～7.464);CTLA-4(AT)n 120 bp等位基因频率在EM临床各期分布无明显差异(P＞0.05).结论:CTLA-4基因外显子4的3'非翻译区(AT)n重复序列多态性与EM相关;CTLA-4(AT)n重复序列120 bp等位基因可能是EM的易感基因.     

浙南汉族人群短串联重复序列LPL位点的多态性调查

目的:获得STR位点脂蛋白脂肪酶基因(LPL)在浙南汉族群体中的等位基因频率.方法:用Chelex法提取外周血DNA,PCR扩增短串联重复(STR)位点LPL后,用聚丙烯酰胺电泳系统进行分型.结果:在236个无关个体中共发现了四个等位基因,扩增片段为117～129bp,等位基因频率最高为0.6758(117bp),有十个核心重复序列,最低为0.0191(129bp),有十三个核心重复序列.杂合率、个体识别率、非父排除率和多态性信息容量分别为0.4949、0.6996、0.1840、0.4497.家系分析表明按孟德尔规律遗传.结论:结果表明STR位点LPL是一个具有法医应用价值的位点,浙南汉族群体中的等位基因频率与武汉地区相比,差异无显著性.     

广东汉族人基因组D17S5位点遗传多态性

本介绍用二步法PCR检测广东汉族人基因组D17S5 VNTR(数量可变的串联重复序列)遗传多态性的结果。共发现有12个等位基因。这些等位基因片段的大小在100bp至870bp之间(每一重复单位为70bp)，等位基因的频率分布在0．00．5至0．19之间。统计学分析证明D17S5各等位基因频率在本组人群的分布符合哈-温氏平衡     

基于二代测序平台的法医STR分型

目的探究二代测序(NGS)技术平台在法医短串联重复(STR)分型中的应用。方法采集402个广东汉族无关个体样本,基于Ion PGM测序平台,对15个STR基因座(D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、CSF1PO、FGA、TH01、TPOX、v WA、D2S1338和D19S433)进行序列测定和基因分型。分析基于STR重复序列多态性检出的STR等位基因,计算其等位基因频率,评估法医学应用效能。结果在15个STR基因座中共检测到202种不同重复序列的等位基因。在D3S1358、D5S818、D13S317、D21S11、FGA、v WA、TH01等7个基因座中检测到54种长度相同而重复序列不同的等位基因亚型,基于重复序列多态性分析的STR分型技术的杂合度、个体识别力、多态信息含量、非父排除率等法医学参数均大于基于片段长度检测的STR分型技术,随机匹配概率小于基于片段长度检测的STR分型技术。结论基于NGS技术平台的STR分型技术提高了STR基因座的多态性和检测效能,具有很好的法医学应用价值。     

极低密度脂蛋白受体基因多态性与动脉粥样硬化性脑梗死的相关性研究

目的　探讨人极低密度脂蛋白受体 (VLDL R)基因CGG三核苷酸串联重复序列与动脉粥样硬化性脑梗死(ABI)的相关性。方法　检测 6 5例ABI患者和 16 0例正常汉族人 (对照组 )的该重复序列 ,同时分析各项血脂水平。结果　共检出CGG重复次数为 5、8、9、11的 4种等位基因及 5 / 5、5 / 8、8/ 8、8/ 9、9/ 9、5 / 9、8/ 11及 5 / 11等 8种基因型。ABI组和对照组比较 ,VLDL R等位基因频率、基因型频率分布均无显著差异 (P >0 .0 5 )。ABI组患者血脂水平与对照组相比明显异常 ,但以VLDL R基因CGG重复序列基因型分 5个亚组后比较分析显示 ,各亚组间差异无显著性 (P >0 .0 5 )。结论　VLDL R基因CGG重复序列多态性与ABI、血清中脂质水平没有关联。     

正常人群及3个智力低下家系FMR1基因CGG重复序列检测与分析

目的:检测、分析脆性X综合征致病基因FMR1第1外显子的三核苷酸CGG重复序列在正常人群及智力低下家系中的分布情况。方法:采用PCR扩增技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术方法,对随机抽取的154名中国汉族正常人(男73人、女81人)和3个智力低下家系有关成员FMR1基因CGG重复序列进行分析。结果:共检测到19种等位基因,CGG重复变异范围n=12～40,最大频率等位基因n=29,频率为16.2%。3个智力低下家系中未检测到CGG重复序列异常扩增。结论:在中国正常人群体中FMR1基因CGG重复序列变异分布与高加索人群体有差异;所检测的3个家系智力低下症状不是由于FMR1基因CGG重复异常扩增所致。     

湖北汉族人载脂蛋白B基因(TTTA)n微卫星DNA序列分析

目的:探讨湖北汉族人载脂蛋白B基因(TTTA)n微卫星DNA碱基序列特征。方法:采用聚合酶链反应扩增载脂蛋白B基因(TTTA)n微卫星DNA,扩增产物经纯化、测序反应、上机测序等步骤进行序列分析。结果:①对ApoB(TTTA)n扩增片段为147bp的基因序列分析发现,湖北汉族人群ApoB(TTTA)n等位基因为12.8,即该基因位点有12次(TTTA)串联重复,在(TTTA)n串联重复序列间夹有2次(TTTG)串联重复;②湖北汉族人群ApoB基因(TTTA)n微卫星DNA序列第一个(TTTA)前为“C”碱基,最后一个(TTTA)后有连续6个“T”碱基。结论:湖北地区汉族人群ApoB基因(TTTA)n微卫星DNA序列具有自身的碱基序列特征。     

广东汉族人基因组D17S5位点遗传多态性

本文介绍用二步法PCR检测广东汉族人基因组D17s5 VNTR(数量可变的串联重复序列)遗传多态性的结果。共发现有12个等位基因。这些等位基因片段的大小在100bP至870bP之间(每一重复单位为70bP),等位基因的频率分布在0.005至0.19之间。统计学分析证明D17S5各等位基因频率在本组人群的分布符合哈-温氏平衡(X~2=74.63,df=6.6,P>0.05),并遵循盂德尔遗传规律。这一遗传多态性系统的杂合     

t-PA基因Alu重复序列I/D多态性在云南彝族人群中的分布

目的研究云南省彝族人群t-PA基因Alu重复序列插入/缺失(I/D)多态性分布情况,为探讨t-PA基因相关性疾病的发病机制奠定基础。方法采用PCR-RFLP技术对云南省晋宁县275例彝族健康个体的t-PA基因Alu重复序列插入/缺失(I/D)多态性进行分析,计算II、ID、DD基因型频率和I、D等位基因频率,与其他人群进行比较。结果云南省晋宁县彝族人群t-PA基因的II、ID、DD基因型频率分别为24.36%、48.36%、27.27%,I和D等位基因频率分别为48.55%、51.45%。与报道的巴基斯坦人、印度人、韩国人、日本人和美国白种人的人群相比较,基因型分布和等位基因频率均无统计学差异(P>0.05)。与英国白种人人群相比较,无论基因型分布还是等位基因频率均差异有统计学意义(P<0.05)。结论 t-PA基因Alu重复序列I/D多态性的分布在不同种族之间存在差异。     

延边地区朝鲜族和汉族快速突变型Y-STR基因座DYS449和DYF404S1序列及遗传多态性分析

[目的]分析延边地区朝鲜族和汉族快速突变型Y-STR基因座DYS449和DYF404S1序列及遗传多态性.[方法]采用PCR技术对目的基因进行扩增,行聚丙烯酰胺凝胶电泳分型和银染显色,根据分型结果对DYS449和DYF404S1基因座的不同等位基因进行序列分析.[结果]DYS449为单拷贝基因座,在朝鲜族及汉族男性群体中分别检测出12,11个等位基因;DYF404S1为多拷贝基因座,在朝鲜族和汉族男性群体中均检测出8个等位基因.2个基因座联合在朝鲜族男性群体中构成88种单倍型,单倍型多态性(HD)、个人识别能力(DP)和单倍型辨别能力(DC)分别为0.988 1,0.983 2和0.220 0,在汉族男性群体中构成93种单倍型,HD,DP和DC分别为0.988 0,0.983 1和0.245 0.[结论]快速突变型Y-STR基因座DYS449和DYF404S1在延边地区朝鲜族和汉族男性群体中具有较高的遗传多态性.     

醛糖还原酶基因(AC)n二核苷酸串联重复序列不同等位基因的筛选

研究了醛糖还原酶基因转录起始点上游 - 2 1kb处的微卫星DNA标记--- (AC)n二核苷酸串联重复序列 7种等位基因 (Z + 6,Z + 4,Z + 2 ,Z ,Z 2 ,Z 4和Z 6)的筛选方法。首先自人外周血提取基因组DNA后设计一对引物进行PCR扩增 ,获得长度为 13 2～ 14 4bp的DNA片段。选取等位基因为纯合子的个体DNA标本的PCR扩增产物 ,经纯化后直接测序以确定等位基因的种类 ;并以确定的等位基因为标准 ,用尿素 /甲酰胺聚丙烯酰胺凝胶电泳银染显色法对各种等位基因进行筛选。该法操作简便、快速、准确度高 ,利于大量标本的筛选 ,也适用于其它二核苷酸重复序列等位基因的筛选。     

ERα基因 TA 重复序列多态性与月经过少中医证候相关性研究

目的探讨雌激素受体α(ERa)基因TA(胸腺嘧啶thymine,腺嘌吟adenine)重复序列多态性在不明原因月经过少人群中的分布情况及其与中医证候的相关性。方法采用测序方法检测TA重复序列的重复次数,比较月经过少组及正常人群的TA重复序列多态性的分布差异及其在不同中医证候间的分布差异。结果 1TA重复序列与原因不明月经过少存在相关性,实验组TA 19等位基因频率(22.73%)高于对照组(4.55%),差异有显著性(P=0.007);2TA 19等位基因型针对月经过少不同证候的构成比:肾虚型血瘀型血虚型,经卡方检验无统计学差异(χ2=5.137,P=0.077),肾虚型与血虚型经卡方检验有统计学意义(χ2=4.574,P=0.032,OR值=0.283)。结论ERa基因多态性TA重复序列与不明原因月经过少存在相关性,TA 19等位基因可能是其易感因素,但其与中医证候的相关性无统计学意义。     

两种烟曲霉基因分型方法的比较研究

目的筛选一种操作简单、分辨率高的烟曲霉基因分型方法。方法选取分离自14例慢性肺曲霉病(CPA)患者的31株烟曲霉,同时用两种基于串联重复序列[改良烟曲霉短串联重复序列(改良STRAf)和表面蛋白编码基因外显子的串联重复序列(TRESP)]的方法进行基因分型,用NCSS 11软件绘制树状图,比较两种方法的分型效果。结果改良STRAf方法共鉴定出23种基因型,其中MC3是分辨率最高的基因,共鉴定出14个等位基因;TRESP方法共鉴定出18种基因型,MP2、CSP、CFEM最常见的基因型分别为m1.1、t03、c08A,其中MP2是分辨率最高的基因,共鉴定出8个等位基因;菌株11、13的改良STRAf分型结果一致,但CSP基因存在一个短串联重复序列(STR)差别;菌株23与M患者分离菌株的TRESP分型一致,但其改良STRAf方法多个基因的STR数存在差别。结论 TRESP的分辨率略低于改良STRAf方法,但其不依赖于仪器,适合在临床实验室推广使用。