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1.
目的对广州地区无症状携带者HBV基因型分布及变异情况进行初步分析,为其科学防制提供数据支持。方法测定65例广州地区无症状携带者HBV基因组全序列,应用DNAman软件构建系统发育树,确定基因型,并应用blastn进行各基因型同源性分析。结果 65例HBV无症状携带者中检测出B基因型50例(76.9%),C基因型14例(21.5%),D基因型1例(1.6%),广州地区以B基因型流行占优势。同源性分析结果表明,相同基因型间同源性高、稳定性好。结论广州地区HBV流行以B基因型为主,相同基因型的序列间同源性高、基因稳定性好。 相似文献
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目的:建立重庆地区基因型C/血清型adrq HBV流行株PreS/S、EnhII/CP/PreC基因标准参照序列,为HBV变异的研究奠定基础。方法:测定18例无症状携带者HBV的PreS/S、EnhII/CP/PreC序列,应用同源性分析和对齐比较等方法确定HBV亚型,并拟定基因型C/血清型adrq HBV的PreS/S、EnhII/CP/PreCC标准参照序列。结果:9株基因型B/血清型adw2、6株基因型C/血清型adrq ,3株基因型B/血清型aywl;建立的重庆地区HBV基因型C/血清型adrq HBV流行株PreS/S、EnhII/CP/PreC标准参照序列与东北华南地区同亚型的标准序列比较分别用13个、2个核苷酸差异,可引起4个、1个氨基酸差异。结论:初步建立了重庆地区基因型C/血清型adrq HBV流行株PreS/S、EnhII/CP/PreC基因标准照参照序列。 相似文献
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首例中国株乙型肝炎病毒D基因型全序列测定及分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:测定并分析1例中国慢性无症状携带者感染的乙型肝炎病毒(HBV)D基因型的全基因序列。方法:用聚合酶链式反应(PCR)扩增HBV全基因,将PCR产物克隆后对其进行核酸序列分析并与已发表的HBV毒株全列进行同源性比较;对GenBank中已发表的30株HBVD基因型毒株的全序列进行系统进行树分析。结果:该病毒全基因长3182bp,为ayw3亚型,D基因型,此毒株全基因GenBanK Accession No为AF280817,与GenBank中已发表的HBV D基因型全序列同源性为98.3%-94.5%,与已发表的A,B,C,E,F和G基因全序列同源性均小于89.5%,结论:首例中国株HBVD基因型全序列与源于瑞典的四株HBV D基因型全基因的进化距离最近。 相似文献
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目的 测定并分析1例中国慢性无症状携带者感染的乙型肝炎病毒(HBV)D基因型的全基因序列。方法 用聚合 酶链式反应(PCR)扩增HBV全基因,将PCR产物克隆后对其进行核酸序列分析并与已发表的HBV毒株全序列进行 同源性比较;对 GenBank中已发表的30株HBV D基因型毒株的全序列进行系统进化树分析。结果 该病毒全基因长 3182bp,为ayw亚型,D基因型;此毒株全基因GenBank AccessionNo为AF280817;与GenBank中已发表的HBVD 基因型全序列同源性为98.3%~94.5%,与已发表的 A、B、C、E、F和G基因型全序列同源性均小于89.5%。结论 首例中 国株 HBV D 基因型全序列与源于瑞典的四株 HBV D 基因型全基因的进化距离最近。 相似文献
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目的 从本地樱桃谷鸭血清中克隆鸭乙型肝炎病毒(DHBV)DNA,并进行序列分析。方法 用PCR扩增HBV全基因.连接至T载体上,挑选克隆进行测序分析,与GenBank中16株:DHBV全基因组进行同源性比较,并进行分子进化树分析。结果 24-18与16株DHBV基因组比较,核苷酸同源性介于89.4%-99.3%之间,各开放阅读框氨基酸同源性比较显示差异显地方位于P区。结论 24-18属于DHBV西方基因型中的一个亚型。 相似文献
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根据HBV S基因组核苷酸序列的同源性,可将HBV分为A、B、C、D、E、F等6种基因型,HBV基因型在全球有一定的区域性分布,在我国南北地区分布也有差异[1,2].本文用套式PCR法调查了台州三门地区HBV感染者基因型分布并探讨了其临床意义,结果报告如下. 相似文献
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根据HBV S基因组核苷酸序列的同源性,可将HBV分为A、B、C、D、E、F等6种基因型,HBV基因型在全球有一定的区域性分布,在我国南北地区分布也有差异[1,2].本文用套式PCR法调查了台州三门地区HBV感染者基因型分布并探讨了其临床意义,结果报告如下. 相似文献
8.
中国株乙型肝炎病毒全基因组克隆的制备与鉴定 总被引:1,自引:1,他引:1
目的:扩增全长HBV DNA基因组,建立中国株HBV感染性克隆,阐述HBV基因组变异对其不同基因生物学特性影响。方法:TD-PCR和XL-PCR技术一次扩增HBV全长基因组,克隆,PCR、酶切和测序鉴定,结果:通过PCR、酶切,测序鉴定和真核细胞转染分析,获得全长HBV基因组克隆。结论:获得了HBV全基因组克隆,在真核细胞中可以表达HBsAg,为建立HBV感染性克隆奠定物质基础。 相似文献
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型特异引物PCR法分析238株乙肝病毒基因型 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:研究乙肝病毒(HBV)感染者HBV基因型分布状况,并建立一套HBV病毒株分型的简便可靠的分析法.方法:设计型特异引物,采用基因型特异引物聚合酶链反应(PCR)法分型.结果:238株HBV中218株得到分型.其中B型149例(男115例、女34例);C型63例(男47例、女16例);B C混合型6例(男4例、女2例).B型、C型和B C混合型检出率分别为68.3%(男69.3%、女65.3%)、28.9%(男28.3%、女30.8%)和2.8%(男2.4%、女3.8%).未检出A、D、E、F、G、H基因型.结论:HBV感染者以B基因型为主.基因型B检出率显著高于其它基因型,其差异具有统计学意义(P<0.0).HBV各基因型分布与性别无关(P>0.01). 相似文献
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目的:从慢性乙型肝炎恩替卡韦临床耐药的患者血清中,应用高保真聚合酶长距离扩增、克隆乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)全基因组序列,建立HBV恩替卡韦耐药株的全长基因克隆。方法:从3例恩替卡韦临床耐药的慢性乙型肝炎患者血清中提取HBV DNA,应用高保真聚合酶对3 200 bp的HBV DNA进行全序列扩增,通过克隆技术构建PGEM-HBV重组质粒,DNA测序后进行序列分析。结果:获得1株恩替卡韦基因耐药的HBV DNA全长序列克隆,序列长度为3 216 bp,序列分析发现在逆转录区有L180M、M204V、T184G位点变异。结论:构建了恩替卡韦基因耐药的HBV DNA全长序列克隆,为进一步研究HBV耐药株提供工具。 相似文献
11.
湖南省乙肝病毒基因型分布及临床意义 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 :研究湖南省乙肝病毒 (HBV)基因型分布及临床意义。方法 :选择湖南省HBVDNA阳性慢性乙肝病人共 185例 ,其中病毒携带者 (ASC) 4 2例 ,慢性轻、中度肝炎 (CH) 38例 ,重型肝炎 (FHF) 80例 (伴有肝硬化者 4 9例 ) ,肝细胞癌 (HCC) 2 5例 ,采用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性 (PCR RFLP)方法检测HBV基因型。结果 :基因型B136例 (73.5 % ) ,基因型C 4 9例 (2 6 .5 % )。基因型B在FHF中占绝对优势 (83.7% ) ,其次为HCC(76 % ) ,与ASC(5 7.1% )比较 ,差异有显著性 (P <0 .0 1)。与基因型B相比 ,基因型C在垂直传播感染者中多见 (38.8%与 13.2 % ,P <0 .0 0 1) ;HBeAg阳性率明显增高 (5 7.1%与 30 .9% ,P <0 .0 0 1) ;抗HBe阳性率明显下降 (36 .9%与 6 6 .2 % ,P <0 .0 0 1)。与基因型C相比 ,基因型B感染者ALT水平明显增高 (2 6 4 .5± 2 5 6 .5与 10 0± 12 0 .6 ,P <0 .0 0 1)。结论 :湖南省存在乙肝病毒基因型B和基因型C ;基因型B为优势基因型并与肝脏疾病活动性相关 ,基因型C与母婴垂直传播感染有关 相似文献
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南京地区99例乙肝病毒基因型及慢性感染临床表型 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:调查南京地区乙肝病毒的基因型分布,并分析基因型与临床表现之间的相关性.方法:分别用特异引物PCR法和基因型特异探针分析(试剂盒)法两种方法测定慢性乙肝病毒感染者病毒基因型.统计分析基因型与临床表型的相关性.结果:分型结果相同的95株乙肝病毒中,32株为B型,59株为C型,1株为D型,3株为BC混合型.基因型B和C在ASC中分别为7例(50%)和6例(42.86%),在CHB患者中分别为17(42.5%)和21(50%),在LC患者中分别为5(35.71%)和9(64.29%),在HCC患者中分别为3例(11.11%)和24例(88.89%).在HCC患者中,基因型B组患者的平均年龄比C型的小.结论:南京地区乙肝病毒有B、C、D、BC混合四种基因型,其中以C型和B型为主.与基因型B比较,基因型C乙肝病毒感染所致的肝病更严重. 相似文献
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目的:了解柯萨奇病毒B5( CoxB5)河南分离株全基因特征及与其他肠道病毒基因的关系.方法:采用RT-PCR扩增全基因,采用DNAStar中的SeqMan拼接所测序列,BioEdit进行同源性比较,Simplot进行相似度分析.结果:CoxB5/Henan/2010基因组全长7 401 bp.与原型株Faulkner... 相似文献
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目的:建立重庆地区HBV流行株PreS/S、EnhⅡ/CP/PreC基因标准参照序列,为HBV变异的研究莫定基础:方法:测定15例无症状携带HBV的PreS/S、EnhⅡ/CP/PreC序列,应用同源性分析和对齐比较等方法确定基因型/血清型,并拟定标准参照序列。结果:9株基因型B/血清型adw2、3株基因型B/血清型aywl、3株基因型C/血清型adrq ;建立的重庆地区HBV流行株(基因型B/血清型adw2)PreS/S、EnhⅡ/CP/PreC标准参照序列与华东华南地区同亚型的标准参照序列比较分别有6个、1个核苷酸差异。结论:初步建立了重庆地区HBV流行株PreS/S、EnhⅡCP/PreC基因标准参照序列。 相似文献
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乙肝病毒基因型及病毒变异对慢性肝病进展的影响 总被引:5,自引:1,他引:5
目的 进一步研究HBV基因型及病毒变异与慢性肝病进展的关系.方法 用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)以及部分PCR产物测序的方法对401例慢性HBV感染者.包括112例HCC患者(HCC组),129例无症状携带者(ASC组),70例肝硬化患者(LC组)和90例慢性肝炎患者(CH组)进行HBV基因分型以及BCP和PC变异检测.结果 401例慢性HBV感染者中181例发生B基因型感染,220例发生C型感染.HCC组中C型分布高于其他3个疾病组;C基因型感染者BCP变异多于B基因型;B基因型感染者PC变异多于C基因型;同时BCP变异发生率随着病程进展而递增:在ASC组、CH组、LC组和HCC组里的BCP变异阳性率分别为22.4%、35.0%、50.0%、74.1%.C1与C2亚型相比,C1有较高BCP变异阳性率,而C2有较高PC变异发生率.结论 BCP变异与肝病进程存在依从关系,因此BCP变异的检测对慢性HBV感染的疾病进展和临床结局的评估有重要意义. 相似文献
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目的:了解重庆地区乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)基因型的分布情况并进行精确定量分析。方法:采用荧光分型定量聚合酶链反应法(Real-time genotyping and quantitative PCR,GQ-PCR)对收集的血清标本进行HBV基因分型并定量。结果:152株血清标本成功分型148株(97.37%),其中B基因型109例(男88例、女21例)[定量值范围4~12 log10copies/ml、均值和标准差(7.94±1.44)log10copies/ml]、C基因型10例(男6例、女4例)[定量值范围5~10 log10copies/ml、均值和标准差(8.12±1.64)log10copies/ml]、基因B+C混合型29例(男24例、女5例)[定量值范围4~10 log10copies/ml、均值和标准差(7.45±1.59)log10copies/ml]。检出率分别为73.65%(男74.58%、女70.00%)、6.76%(男5.08%、女13.30%)、19.59%(男20.34%、女16.70%)。结论:重庆地区HBV优势基因型以B型和B+C混合型为主,... 相似文献
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乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染至今仍是世界性的医学难题,它是嗜肝HBV引起的一种高发病率、高病死率的传染病.据统计,目前全世界大约有20亿人感染过HBV,其中约有3.5亿人是HBV携带者[1].在我国约有1.2亿HBV携带者,每年有30~50万人死于HBV引起的肝硬化或肝癌.因此,抗HBV药物研究一直是防治乙型病毒性肝炎(乙肝)的重点[2].中国传统医药博大精深,一些单味中药和中药复方治疗HBV感染疗效肯定,且毒副作用轻,是亟待开发的理想药物.笔者就近年来中医药抗HBV的研究进展作一综述. 相似文献
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目的了解莱芜地区乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)基因型分布情况,探讨HBV基因型与临床的相关性。方法随机选择莱芜地区HBV感染患者231例,其中无症状HBV携带者45例,慢性乙型肝炎68例,乙型肝炎肝硬化65例,原发性肝癌53例。应用双波长实时荧光定量PCR技术,进行血清HBV基因分型测定。结果 231例标本中,216例(91.14%)可检出基因型,在阳性结果中B基因型39例(18.06%),C基因型179例(82.87%),B+C混合基因型5例(2.31%),未检出非B非C基因型。结论莱芜地区HBV感染者中,HBV基因主要存在C型,不同基因型与慢性乙型肝炎、肝硬化、原发性肝癌有相关性,C基因型HBV感染者较B基因型更易发展成肝硬化、原发性肝癌。 相似文献