2004年云南省部分地区流感暴发的病因研究

目的分析2004年云南省流感暴发的病因,探讨流感流行优势株抗原性和基因特性变异特征。方法从暴发疫情中采集标本,用MDCK细胞分离流感病毒,对所分离的毒株用血清学方法进行抗原分析,并对其编码HA1区进行序列测定和分析。结果从146份标本中分离到54株流感病毒,其中A3亚型27株,B型27株。62%的A3亚型毒株与A/福建/411/2002(H3N2)的血凝抑制效价有4倍或以上差别;5.8%的Yamagata系毒株与B/上海/361/2002的血凝抑制效价有4倍或以上差别;10.8%的Victoria系毒株与B/浙江/2/2001的血凝抑制效价有4倍或以上差别。无论是A3亚型还是B型毒株HA1区的某些位点均发生了氨基酸的替换。结论2004年云南省流感暴发点分离的A3和B型毒株其抗原性和基因特性与疫苗株相比发生了变异。     

四川省2006年B型流感病毒抗原性及基因特性研究

[目的]阐明2006年四川省流行的B型流感病毒血凝素抗原性及其基因变异情况。[方法]对2006年分离的B型毒株进行单向血凝抑制实验,再将病毒株进行血凝素基因HA1区核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后进行基因进化特性分析。[结果]2006年四川省人群中同时流行着B型Victoria系和Yamagata系毒株。Victoria系毒株与B/Hongkong/330/2001比较,病毒单向血凝抑制效价均有4倍以上差异,并且在HA1区发生8个氨基酸替换,在197位增加一个糖基化位点。Yamagata系毒株与B/Shanghai/361/2002比较,病毒单向血凝抑制效价均有4倍以上差异,并且在血凝素基因HA1区有7个氨基酸位点发生改变,在196位增加一个糖基化位点。[结论]四川省2006年B型流感病毒的抗原性与B/Hongkong/330/2001、B/Shanghai/361/2002相比已经发生了变化。     

2004～2006年江西省乙型流感病毒HA1基因特性分析

目的：了解江西省2004～2006年分离的B型流感病毒株HA1基因变异特征。方法：采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的B型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar5.0、BioEdit（Version5.0）、Mage生物软件对测序结果进行分析处理,推导出氨基酸序列,进行基因特性分析。结果：2004年和2005年分离到的B型流感病毒均为B型的Yamagata系;2006年以Victoria系为优势株,但有Yamagata系的活动。9株Yamagata系B型流感病毒HA1区域核苷酸序列长度均为1014 bp,未发现核苷酸的丢失和插入,与疫苗推荐株B/Shanghai/361/2002 HA1区相比较,不同毒株氨基酸同源性为96.4%～97.3%,替换数在10～11个,所有毒株均在9个相同的氨基酸位点发生了相同的替换,在196位增加了一个糖基化位点。12株Victoria系B型流感病毒HA1区域核苷酸序列长度均为1017 bp,未发现核苷酸的丢失和插入,与疫苗推荐株B/Malaysia/2506/2004的HA1区相比较,不同毒株氨基酸同源性为98.4%～99.5%,替换数在2～4个,所有毒株均在2个相同的氨基酸位点发生了相同的替换,在197位增加了一个糖基化位点。结论：江西省2004～2006年Yamagata系B型流感病毒HA1基因特性已发生改变,从基因水平说明Yamagata系B型流感病毒抗原性发生了改变。2006年Victoria系B型流感病毒HA1基因特性有所改变,疫苗仍有预防效果。     

四川省2006～2007年度甲3亚型流行性感冒病毒抗原性和基因特性分析

目的 了解四川省甲3亚型流行性感冒(流感)病毒血凝素(Hemagglutinin,HA)的抗原性和基因变异情况,比较四川省2006～2007年度甲3亚型流感病毒流行株与世界卫生组织(WHO)推荐的2006～2007年度北半球甲3亚型流感疫苗株甲/威斯康星/67/2005(H3N2)HA1区的基因差异,为评价流感疫苗免疫效果提供依据.方法 采集四川省流感监测哨点医院和疑似流感疫情的流感样病例咽拭子,用狗肾传代细胞进行病毒分离.选取来自不同时间、地点,且经血凝抑制(Hemagglutination Inhibition,HI)试验鉴定为甲3亚型的流感病毒分离株进行单向HI试验;提取病毒核酸,进行逆转录-聚合酶链反应扩增HA基因的HA1区,对扩增产物进行序列测定并推导出氨基酸序列;将分离株的序列与甲/威斯康星/67/2005(H3N2)的HA1区序列进行比较,并进行基因进化特征分析.结果 单向HI试验表明,2006～2007年度四川省甲3亚型流感毒的抗原性与中国甲3型流感标准株(甲/云南/1145/2005和甲/江西东湖/312/2006)相比,HI效价均无≥4倍的差异.核苷酸和氨基酸序列分析结果表明,核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为99.59%和99.47%,仅有4～6个氨基酸位点发生了替换,涉及2个抗原决定簇.结论 四川省2006～2007年度甲3亚型流感病毒的抗原性和基因特性未发生明显变异.     

韶关市2008年B型流感病毒流行及基因变异分析

目的:了解2008年韶关市B型流感病毒的流行及基因变异情况。方法:收集2008年韶关市流感监测及疫情资料,选取流感疫情中分离的B型毒株,提取病毒RNA,RT-PCR扩增病毒HA1基因,纯化产物进行核苷酸序列测定,使用DNA Start MegAlign等生物软件包进行序列分析。结果:2008年流感监测与疫情中一共分离到39株B型流感毒株,分离率为7.39%(39/528),与B型流感病毒相关的疫情达到当年疫情数量的一半(7/14),有4起完全由B型流感病毒引起,有3起同时检出B型流感病毒与A型流感病毒,爆发时间多集中在3月;B/SG/y010/2008与B/Shanghai/361/2002相比,3个氨基酸替换发生在抗原决定簇,与韶关以往毒株B/SG/173/1999比较4个氨基酸替换发生在抗原决定簇,均在196增加了一个糖基化位点。结论:B型流感病毒是韶关市2008年流感流行优势毒株,B/SG/y010/2008与B/Shanghai/361/2002相比发生了一定的变异,而与韶关以往毒株B/SG/173/1999相比则发生了抗原性漂移。     

2007～2008年流感监测季北京地区H3N2亚型流感病毒抗原性与HA1基因特性分析

目的:了解2007~2008年流感监测季北京地区分离的H3N2亚型流感病毒抗原性及血凝素基因变异情况。方法:选取2007~2008年流感监测季中分离的首株H3N2亚型毒株及其后不同时间、不同地点共9株毒株,通过单向血凝抑制试验进行抗原性分析;测定血凝素基因的HA1区核苷酸序列并推导出其氨基酸序列,进行基因进化特性分析。结果:与我国代表株A/江西/东湖/312/2006本身的血凝抑制效价相比,9株病毒中3株有4倍及以上差异。HA1区核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,有部分毒株的氨基酸发生下述替换:3 L→F、53 D→N、57 Q→H、157 L→S、158 K→R、171 N→K、173 K→N、182 V→I、194P→L、261 R→Q、272 A→V、291 N→D、299 K→R;其中53、157、158、171、173、194位氨基酸位于抗原决定簇。结论:北京地区2007~2008年流感监测季分离的H3N2亚型流感病毒有部分毒株已发生抗原性及基因特性的改变。     

2000-2007年佛山市甲1亚型(H1N1)流感病毒监测情况及其HA1基因的变异

目的分析2000-2007年佛山市甲1亚型(H1N1)毒株流行情况及其HA1基因变异情况。方法用MDCK细胞分离流感病毒,采用血球凝集抑制试验进行型别鉴定,选取每年2~4株甲1亚型毒株的细胞培养物提取病毒核酸,进行HA1基因的逆转录,对其核苷酸和氨基酸序列及亲缘关系进行分析。结果病毒分离结果显示2000-2007年间甲1亚型流感病毒在佛山市人群中的流行是间断性的,只在2000、2001、2005、2006年4个年份分离到甲1亚型流感毒株。毒株的HA1区氨基酸序列与流感疫苗推荐株A/New Caledonia/20/99和A/Solomon Islands/3/2006相比,同源性分别为97.2%~99.7%和97.2%~98.5%。氨基酸残基平均替换数随年份的推移而增加,只有2006年的毒株在抗原决定簇发生了替换。结论与疫苗株比较,佛山市的甲1亚型流感毒株抗原性已逐渐发生了改变,应密切注意疫苗对毒株的免疫效果。     

2007年江西省乙型流感病毒流行的分子基础

目的 了解江西省2007年乙型流感病毒流行情况的分子基础.方法 采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的B型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar5.0、BioEdit(Version5.0)、Mega生物软件对测序结果进行分析处理,推导出氨基酸序列,进行基因特性分析.结果 2007年分离到B型流感病毒91株,其中68株Yamagata系和23株Victoria系;6株Yamagata系和4株Victoria系B型流感病毒分别与WHO推荐的疫苗株B/Shanghai/361/2002(Yamagata系)和B/Malaysia/2506/2004(Victoria系)的HA1序列比对,结果为:Yamagata系B型流感病毒HA1区域核苷酸平均替换数为23.3个,平均点突变率为2.30%,氨基酸替换数在7～9个,同源性为95.2%～96.3%,所有毒株均在6个相同的氨基酸位点发生了相同的替换;Victoria系B型流感病毒HA1区域核苷酸平均替换数为8.5个,平均点突变率为0.84%,氨基酸替换数在3～4个,同源性为98.95%～99.48%,所有毒株均在3个相同的氨基酸位点发生了相同的替换.结论 2007年Victoria系B型流感病毒HA1基因特性有所改变,疫苗仍有预防效果,但是B型流感流行趋势发生了改变,Yamagata系比Victoria系更活跃,B/Malaysia/2506/2004(Victoria系)疫苗推荐株对江西省B型流感保护效果不佳.     

2004～2006年江西省甲3亚型流感疫苗预防效果的基因分析

[目的]了解江西省2004～2006年分离的甲3亚型流感病毒株HA1基因变异特征,分析WHO甲3亚型疫苗推荐株对江西省甲3亚型流感的预防效果. [方法]采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的H3型流感病毒进行核酸提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar5.0、BioEdit(Version5.0)、Mage生物软件对测序结果进行分析处理,推导出氨基酸序列,进行基因特性分析. [结果]21株甲3亚型流感病毒HA1区域核苷酸序列长度均为960 bp,未发现核苷酸的丢失和插入,平均点突变率为1.09%.2004年甲3亚型流感病毒分离株与当年WHO疫苗推荐株HA1区相比较,不同毒株氨基酸的同源性是97.8%～98.8%,抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为3.17个,但有毒株已出现在2个抗原决定簇区4个氢基酸替换.2005年甲3亚型流感病毒分离株与当年疫苗推荐株HA1区相比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.4%～99.1%,抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为20个.2006年甲3亚型流感病毒分离株与当年疫苗推荐株的HA1区相比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.1%～98.4%,在2个抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为5.71个. [结论]2004年、2005年和2006年分别根据WHO推荐疫苗株生产的疫苗,对我省2004年度的甲3亚型流感总体上有较好的预防效果,但毒株的变异在增强:对2005年度的甲3亚型流感上有良好的预防效果;对2006年度的甲3亚型流感预防效果不 够理想. 比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.4%～99.1%,抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为20个.2006年甲3亚型流感病毒分离株与当年疫苗推荐株的HA1区 比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.1%～98.4%,在2个抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为5.71个. [结论]2004年、2005年和2006年分别根据WHO推荐疫苗株生产的疫苗,对我省2004年度的甲3亚型流感总体上有较好的预防效果,但毒株的变异在增强:对2005年度的甲3亚型流感上有良好的预防效果;对2006年度的甲3亚型流感预防效果不 够理想. 比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.4%～99.1%,抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为20个.2006年甲3亚型流感病毒分离株与当年疫苗推荐株的HA1区 比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.1%～98.4%,在2个抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为5.71个. [结论]2004年、2005年和2006年分别根据WHO推荐疫苗株生产的疫苗,对我省2004年度的甲3亚型流感总体上有较好的预防效果,但毒株的变异在增强:对2005年度的     

广东省2003年甲3型流行性感冒病毒血凝素重链区基因的特征

目的了解广东省2003年甲型流行性感冒(流感)病毒的抗原变异情况和血凝素重链区(HA1)基因的特征.方法对广东省流感分子流行病学资料进行分析.结果全年分离到481株甲型流感病毒,全部是H3N2亚型,其抗原性与疫苗株甲/马拿马/2007/99(H3N2)有所不同,类似于疫苗变异株甲/福建/411/02(H3N2).在HA1区氨基酸序列上,与疫苗株甲/巴拿马/2007/99(H3N2)存在25～30个氨基酸的差异,同源性为92.1%.抗原决定族A、B、D、E区以及受体结合部的左侧臂和前臂均发生氨基酸替换,并在144位增加了1个糖基化位点.结论广东省2003年甲3型流感活动比2002年进一步加强,与疫苗株相比,病毒基因发生突变,抗原性发生了漂移.     

广东省1991-2004年乙型流感监测结果分析

[目的]分析1991—2004年广东省乙型流感病毒抗原变异和流行情况。[方法]用9~11日龄鸡胚和(或)MDCK细胞分离流感病毒,病毒鉴定用常量红细胞凝集抑制法(HI);人血清流感抗体检测用微量半加敏红细胞凝集抑制法。[结果]广东省一直有乙型流感流行,并从人群中分离到流感病毒2 916株,乙型流感病毒占23.3%。乙型流感病毒两大谱系交替为优势株,除1994、1997及2002年以Victoria系为主外,其余各年以Yamagata系为主。乙型流感病毒抗原性不断发生漂移,历年一般人群血清乙型流感抗体检测阳性率在28.3%~73.9%。[结论]1991—2004年广东省乙型流感病毒存在差异较大的两个谱系,病毒谱系的轮换和抗原漂移导致乙型流感不断流行。     

浙江省1999--2010年乙型流感病毒血凝素 和神经氨酸酶基因变化特征分析

目的 分析1999-2010年浙江省乙型流感病毒主要抗原基因血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的分子变异特征.方法 采集浙江省流感暴发疫情和哨点监测医院的流感样患者呼吸道标本,荧光定量RT-PCR快速检测和病毒分离,选取乙型流感病毒分离代表株进行HA和NA基因测序,采用生物信息学软件分析变异和进化.结果 共分析浙江省乙型流感病毒分离株34株,其中Victoria系20株,Yamagata系14株;1999-2010年间Victoria系毒株的HA1基因变异率4.5%,Yamagata系毒株为3.4%;2004年后分离的Victoria系毒株均为基因重配株,HA属于Victoria 系,而NA属于Yamagata系;2010年新型甲型HINI流感流行高峰过后,浙江省仍以乙型流感病毒流行为主,分离株与2009-2010年流感疫苗株B/Brisbane/60/2008接近,与往年乙型流感毒株相比HA和NA发生多个氨基酸位点变异.结论 1999-2010年浙江省乙型流感病毒流行株发生明显变异,基因重配和抗原漂移是病毒发生变异的主要机制.

Abstract：

Objective To Characterize the genetic diversity of hemagglutinin(HA)and neuraminidase(NA)of influenza B viruses isolated in Zhejiang province during 1999-2010.Methods Respiratory specimens were collected from patients with flu-like syndrome during the influenza outbreaks or from the hospitals which carrying out influenza surveillance project in Zhejiang province.Samples were detected by real-time RT-PCR and isolated for influenza virus.HA1 and NA genes of influenza B virus isolates were amplified and sequenced.Phylogenetic comparison and genetic diversity analysis were performed using the bioinformation software.Results A total of 34 influenza B viruses were evolved in this study including Victoria-like and Yamagata-like strains according to the results of the HI test.The mutation rate of Victoria-like HA1 gene was 4.5% and Yamagata-like HA1 gene was 3.4%,respectively.The Victoria-like influenza B isolates had appeared to be all re-assortants having a Victoria lincage HA and Yamagata lineage NA since 2004.The predominant type of influenza virus isolates in 2010 was also influenza B virus after the H1N1 flu pandemic in Zhejiang province.The isolated strains were antigenicaily and genetically similar to B/Brisbane/60/2008--the vaccine strain proposed for 2009-2010.Many difierences of HA1 and NA amino acids existed in the current isolates when compared to previous influenza B strains.Conclusion Significant diversity was generated among influcnza B virus isolated from 1999 to 2010 in Zhejiang province.Genetic re-assortment and antigenic drift seemed the main evolutionary mechanism on influenza B virus.     

2005-2006年河北省流感病毒监测与毒株变异分析

目的分析2005～2006年河北省流感病毒的流行与毒株变异情况。方法将采集的咽拭子标本用MDCK（Madin—Darby Canine Kidney）细胞培养分离流感病毒，血凝抑制试验鉴定病毒型别；在分离得到的3种型别流感病毒中分别以不同时间点选取分离株，进行血凝素重链（HA1）区核苷酸序列测定，并进行基因进化特性分析。结果2005～2006年分离到流感病毒92株，甲1亚型57株，甲3亚型6株，乙型29株。HA1区核苷酸和氨基酸序列分析表明，甲1亚型流感病毒与A／New Caledonia／20／99比较，1株有5个位点（173V〉A、259W〉R、260Y〉F、281 E〉K、322V〉A）发生氨基酸替换，2株有7个位点（90T〉K、102Y〉H、153R〉K、173V〉A、216R〉K、259W〉R、274T〉N）发生替换。3株甲3亚型与A圯alfornia／7／2004比较3个位点（188N〉D、193S〉F、225D〉N）氨基酸发生同样的替换。3株乙型流感病毒与B／HongKong／330／2001比较有7个位点（48K〉E、80K〉R、116R〉H、121N〉T、129K〉N、164E〉D、197S〉N）发生了相同的氨基酸替换。结论2005～2006年河北省流行甲1、甲3亚型和乙型流感病毒。流行株的基因特性发生了一定程度的变异，但乙型毒株变异更明显。     

Systematic evaluation of suspension MDCK cells,adherent MDCK cells,and LLC-MK2 cells for preparing influenza vaccine seed virus

Suspension Madin–Darby canine kidney (MDCK) cells (MDCK-N), adherent MDCK cells (MDCK-C), and adherent rhesus monkey kidney LLC-MK2 cells (LLC-MK2D) were systematically evaluated for the preparation of influenza vaccine seed viruses for humans on the basis of primary virus isolation efficiency, growth ability, genetic stability of the hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA) genes, and antigenic properties in hemagglutination inhibition (HI) test of each virus isolate upon further passages. All the subtypes/lineages of influenza viruses (A(H1N1), A(H1N1)pdm09, A(H3N2), B-Victoria, and B-Yamagata) were successfully isolated from clinical specimens by using MDCK-N and MDCK-C, whereas LLC-MK2D did not support virus replication well. Serial passages of A(H1N1) viruses in MDCK-N and MDCK-C induced genetic mutations of HA that resulted in moderate antigenic changes in the HI test. All A(H1N1)pdm09 isolates from MDCK-C acquired amino acid substitutions at the site from K153 to N156 of the HA protein, which resulted in striking antigenic alteration. In contrast, only 30% of MDCK-N isolates showed amino acid changes at this site. The frequency of MDCK-N isolates with less than two-fold reduction in the HI titer was as high as 70%. A(H3N2) and B-Yamagata isolates showed high antigenic stability and no specific amino acid substitution during passages in MDCK-N and MDCK-C. B-Victoria isolates from MDCK-N and MDCK-C acquired genetic changes at HA glycosylation sites that greatly affected their antigenicity. When these cell isolates were applied to passages in hen eggs, A(H1N1), B-Victoria, and B-Yamagata viruses grew well in eggs, while none of the cell isolates of A(H3N2) viruses did. Thus, we demonstrate that MDCK-N might be useful for the preparation of influenza vaccine seed viruses.     

2000—2007年佛山市甲1亚型（H1N1）流感病毒监测情况及其HA1基因的变异

目的分析2000—2007年佛山市甲1亚型（H1N1）毒株流行情况及其HA1基因变异情况。方法用MDCK细胞分离流感病毒，采用血球凝集抑制试验进行型别鉴定，选取每年2～4株甲1亚型毒株的细胞培养物提取病毒核酸，进行HA1基因的逆转录，对其核苷酸和氨基酸序列及亲缘关系进行分析。结果病毒分离结果显示2000—2007年间甲1亚型流感病毒在佛山市人群中的流行是间断性的，只在2000、2001、2005、2006年4个年份分离到甲1亚型流感毒株。毒株的HAl区氨基酸序列与流感疫苗推荐株A／NewCMedonia／20／99和A／Solomon Islands／3／2006相比，同源性分别为97．2％～99．7％和97．2％-98．5％。氨基酸残基平均替换数随年份的推移而增加，只有2006年的毒株在抗原决定簇发生了替换。结论与疫苗株比较，佛山市的甲1亚型流感毒株抗原性已逐渐发生了改变，应密切注意疫苗对毒株的免疫效果。     

湖北省甲3型流行性感冒病毒株HA1基因特性分析

目的探讨湖北省流感病毒分离株的变异、进化发展过程,比较这些毒株之间的遗传进化亲缘关系,探讨湖北省流感病毒血凝素基因变异规律,为湖北省流感防治提供理论基础。方法对省内1983-2002年分离到的8株H3N2亚型流感病毒HA1区基因进行序列测定,并用生物信息学研究方法,分析比较各年代病毒分离株的进化关系。结果随着时间的变化,湖北省内流感病毒HA1基因间核甘酸替换数增加,随之抗原决定簇A和B的氨基酸有改变。结论分析1983-2002年8株流感病毒株,根据其HA1基因序列,按年代特征划分为两个谱系。其中一个谱系是1985年及其以前分离的毒株。上个世纪90年代后分离的毒株为一个谱系,90年代及2002年的毒株在进化树上和80年代处于不同分支。     

深圳市2005-2007年H1N1亚型流感病毒HA1基因分子流行病学研究

目的 探讨2005-2007年深圳市H1N1流感病毒HA1基因变异特征.方法 选取深圳市2005-2007年分离的H1N1流感毒株,提取病毒RNA,用RT-PCR扩增HA1区基因片段,产物纯化后测序并进行基因序列分析.结果 2005-2007年流感病毒分离率平均为7.16%,H1N1流感病毒在2005年和2006年的分离数占总分离数的比例分别为56.14%和66.03%,而2007年仅占3.61%.核苷酸同源性和基因进化树结果一致,2005年4月份之前分离株与A/New Caledonia/20/1999为同一分支,2005年5月份之后的分离株与A/Solomon Island/3/2006为一支,而2006-2007年分离株又与国家代表株A/GDLH/219/2006在一个分支.氨基酸序列分析显示,绝大多数的毒株均在第130位点缺失一个赖氨酸;2005年5月以后的大部分毒株出现以下氨基酸变异:T82K、Y94H、R146K、R209K、T267N,2006年5月份之后的毒株在抗原决定簇B区发生了A190T、H193Y、E195D氨基酸变异,同时也发生A区R146K的置换.但所有毒株的潜在糖基化和受体结合位点均比较保守.发现1株病毒A/SZ/68/2007具特殊性,经与参照毒株比较,其326个氨基酸中有50个发生变化,其中有11个位于抗原决定簇位点、6个位于受体结合位点,且有4个氨基酸变化导致糖基化位点丢失.结论 2005-2007年深圳市人群中至少有3个类型HA1基因不同的H1N1流感病毒株;由于氨基酸变异引起病毒发生抗原漂移,其代表株为A/GDLH/219/2006;发现的A/SZ/68/2007病毒毒株具有特殊性,其抗原特性和流行病学意义还有待探讨.     

Concurrent antigenic analysis of recent epidemic influenza A and B viruses and quantitation of antibodies in population serosurveys in Italy

Laboratory investigations of virus isolation and serum antibodies in a Mediterranean country (Italy) demonstrated that influenza A and B viruses, and often both, circulated every winter in Italy.The winter 1987/88 was characterized by a low level of influenza activity, as shown by the limited number (47) of influenza virus isolates, the majority of which (61%) belonged to the influenza B type. In contrast, the 1988/89 influenza season was exclusively associated with the circulation of influenza type A viruses. The A(HlH1) subtype was largely predominant (97%), as compared to the low incidence of the A(H3N2) subtype (3%). During the 1989/90 winter a cocirculation of A and B influenza viruses was observed, A(H3N2) strains being responsible for 96% of the virologically confirmed cases.Antigenic analysis of the virus isolates showed some antigenic variation in influenza A viruses of both HlN1 and H3N2 subtypes, whilst antigenic stability was found among the influenza B virus isolates.Overall, the above virological findings correlate with the data concerning the pattern of influenza virus circulation in Northern Europe and the UK during the three years surveyed.The results of serum antibody surveys conducted in each post-epidemic period are also reported.     

深圳市2005—2007年H1N1亚型流感病毒HAl基因分子流行病学研究

目的 探讨2005-2007年深圳市H1N1流感病毒HA1基因变异特征。方法 选取深圳市2005-2007年分离的H1N1流感毒株，提取病毒RNA，用RT-PCR扩增HA1区基因片段，产物纯化后测序并进行基因序列分析。结果 2005-2007年流感病毒分离率平均为7.16%，H1N1流感病毒在2005年和2006年的分离数占总分离数的比例分别为56.14%和66.03%，而2007年仅占3.61%。核苷酸同源性和基因进化树结果一致，2005年4月份之前分离株与A/New Caledonia/20/1999为同一分支，2005年5月份之后的分离株与A/Solomon Island/3/2006为一支，而2006-2007年分离株又与国家代表株A/GDLH/219/2006在一个分支。氨基酸序列分析显示，绝大多数的毒株均在第130位点缺失一个赖氨酸；2005年5月以后的大部分毒株出现以下氨基酸变异：T82K、Y94H、R146K、R209K、T267N，2006年5月份之后的毒株在抗原决定簇B区发生了A190T、H193Y、E195D氨基酸变异，同时也发生A区R146K的置换。但所有毒株的潜在糖基化和受体结合位点均比较保守。发现1株病毒A/SZ/68/2007具特殊性，经与参照毒株比较，其326个氨基酸中有50个发生变化，其中有11个位于抗原决定簇位点、6个位于受体结合位点，且有4个氨基酸变化导致糖基化位点丢失。结论 2005-2007年深圳市人群中至少有3个类型HA1基因不同的H1N1流感病毒株；由于氨基酸变异引起病毒发生抗原漂移，其代表株为A/GDLH/219/2006；发现的A/SZ/68/2007病毒毒株具有特殊性，其抗原特性和流行病学意义还有待探讨。