靶细胞捕集联用网络药理学、分子对接及实验验证分析桃红四物汤活性成分及调控缺血性脑卒中潜在作用机制研究

通过靶细胞捕集联用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)筛选鉴定桃红四物汤(Taohong Siwu Decoction, THSWD)潜在的抗脑卒中活性成分，并采用网络药理学、分子对接及实验验证探究THSWD活性成分对缺血性脑卒中(ischemic stroke, IS)治疗的潜在作用机制。利用UPLC-Q-TOF-MS技术联合UNIFI数据分析平台分析THSWD与靶细胞共孵育后的细胞破碎液成分，通过网络药理学对其潜在活性成分与IS疾病进行靶点搜集，将两者交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)、基因本体论(Gene Ontology, GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)信号通路富集分析，构建靶细胞捕集成分-核心靶点-信号通路可视化网络，将活性成分与PPI网络排名靠前的靶点进行分子对接，并通过体外药效学进行验证。靶细胞破碎液中共鉴定出15个潜在的活性成分，包括双环单萜类、氰苷类、黄酮醇类、醌式查耳酮类、苯...     

基于网络药理学的麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘作用机制

目的利用网络药理学技术,探索麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘的作用机制。方法基于中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取麻黄、甘草的化学成分及其作用靶点,UniProt数据库提取作用靶点的基因名称,通过OMIM数据库获取哮喘相关靶点,将疾病靶点与药物靶点进行交集,筛选得到疾病-药物成分共同靶蛋白。利用Cytoscape软件构建化合物-靶点网络,利用DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析,通过Cytoscape软件构建"中药活性化合物-关键靶标-主要通路"多维网络关系图。结果筛选出115个活性成分,12个作用于小儿哮喘的蛋白靶点;GO富集(P0.01)提示有24个生物过程条目、3个分子功能条目、3个细胞组分条目,KEGG富集29条通路(P0.01),关键靶点包括TNFRSF1A、TNF、IKBKG、TP53、NFKBIA、IKBKB等,关键通路包括细胞凋亡、NF-κB信号通路、TNF信号通路、小细胞肺癌、脂肪细胞因子信号通路、RIG-I样受体信号通路、T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路等。结论该研究通过网络药理学初步揭示了麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘的多维调控网络,从多角度探索了麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘的潜在分子机制及药理作用,为其的临床应用提供了理论依据。     

基于网络药理学探讨穿心莲治疗新型冠状病毒肺炎机制研究

目的:通过网络药理学方法探索穿心连治疗新型冠状病毒肺炎的作用靶点及分子机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选穿心莲的活性成分及相关的药物靶点,同时在GeneCards数据库筛选出新型冠状病毒肺炎的相关疾病靶点,交集基因即为穿心莲治疗新冠肺炎的核心靶点。随后利用Cytoscape3.7.2软件和String数据库构建药物活性成分-靶点网络和蛋白质相互作用关系的网络图。最后通过DAVID数据库对交集靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,并构建成分-靶点-通路图。结果:筛选出穿心莲的活性成分24个及作用靶点53个,新型冠状病毒肺炎的靶点259个,交集靶点14个。KEGG富集分析涉及通路17条,主要包括癌症、细胞凋亡、肌萎缩性侧索硬化症(ALS)、MAPK信号通路、神经营养蛋白信号通路等。结论:穿心莲中的多种活性成分可以通过介导多靶点、多通路发挥治疗新型冠状病毒肺炎的作用。     

黄芪-党参药对治疗胃癌的网络药理学研究

目的运用网络药理学探讨黄芪-党参药对治疗胃癌的作用机制。方法通过DisGeNET数据库检索胃癌的相关靶点。使用中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索黄芪、党参的潜在活性成分和作用靶点,借助PubChem数据库,预测黄芪-党参药对活性成分的所有潜在靶点,并将活性成分预测的靶点与疾病靶点取交集,获取黄芪-党参药对治疗胃癌的靶点集。使用Auto Dockt Vina对筛选所得的主要活性成分及主要相关靶点进行分子对接验证。通过DAVID进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用Cytoscape 3.7.1构建"药物-化合物-靶点-通路-疾病"网络及蛋白相互作用(PPI)网络,研究其作用机制。结果"药物-化合物-靶点-通路-疾病"网络包括52个活性化合物、62个作用靶点以及34条通路,关键化合物为3-β-Hydroxymethyllenetanshiquinone、黄芪皂苷Ⅰ、咖啡酸、异阿魏酸等,关键靶点涉及MAPK、PI3Ks、EGFR、NF-κB1等;PPI网络关键靶点主要为STAT3、PIK3CA、MAPK1、HRAS等。GO富集分析共涉及264个生物过程(BP),38个细胞组分(CC)以及57个分子功能(MF);KEGG通路富集分析筛选得到34条与胃癌相关的通路,主要为癌症通路、PI3K-Akt信号通路等。结论黄芪-党参药对可能是通过介导PI3K-Akt等信号通路调控肿瘤细胞的增殖、凋亡、迁移、失巢凋亡及血管生成等生物过程进而达到治疗胃癌的目的。     

基于网络药理学和实验验证探究黑果小檗花色苷防治AD的作用机制

基于网络药理学、分子对接技术和体外实验验证探究黑果小檗花色苷防治阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease, AD)的潜在作用机制。借助数据库和在线平台筛选黑果小檗花色苷活性成分的潜在靶点和AD相关作用靶点，运用STRING数据库和Cytoscape软件对两者共同靶点进行蛋白相互作用网络构建和拓扑学分析，利用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，对活性成分和NF-κB/TLR4通路相关靶点进行分子对接，然后利用脂多糖诱导BV2细胞构建AD神经炎症模型进行体外实验验证。该研究共筛选出黑果小檗活性成分潜在作用靶点426个，药物-疾病共同靶点329个，蛋白-蛋白网络互作筛选出14个关键靶点，富集分析得到623个GO功能富集条目和112个KEGG通路富集条目；分子对接结果显示活性成分和NF-κB、IκB、TLR4和MyD88有较好的结合能力，其中结合能力最强的是锦葵素-3-O-葡萄糖苷；同时，与模型组比较，不同剂量锦葵素-3-O-葡萄糖苷在不影响BV2细胞存活率的情况下，一氧化氮浓度均显著下降；同时锦葵素-3-O-葡萄糖苷可下...     

基于网络药理学推测和分子生物学验证探讨半枝莲抗胰腺癌的活性成分及其作用机制

目的运用网络药理学预测和分子生物学验证探讨半枝莲抗胰腺癌的活性成分及其作用机制。方法通过中医药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选半枝莲的活性成分和相关潜在靶点;应用毒性与基因比较数据库(CTD)、治疗靶点数据库(TTD)、药物基因组学知识库(PharmGKB)建立胰腺肿瘤靶点数据库;基于半枝莲潜在靶点与胰腺肿瘤靶点的匹配结果,构建PPI网络,拓扑分析筛选核心靶点;基于核心靶点的GO功能富集分析和KEGG通路富集分析建立半枝莲抗胰腺癌的信号通路图;采用Westernblotting验证半枝莲中核心成分木犀草素对胰腺癌细胞PANC-1中P53、Bax和Bcl-2关键靶点的调控作用。结果共筛选出28种活性成分,包括槲皮素、木犀草素、汉黄芩素等;91个半枝莲作用靶点,经拓扑筛选获得24个核心靶点,涉及TP53、AKT1、JUN、VEGF等。GO功能富集分析显示,半枝莲作用靶点共涉及到73条生物学过程,KEGG通路富集筛选出18条信号通路参与胰腺癌的治疗,主要是通过NF-κB、p53、PI3K-Akt和VEGF信号通路来调节肿瘤炎性微环境、细胞周期阻滞、促细胞凋亡以及抗血管生成。分子生物学实验发现半枝莲中木犀草素可调节p53信号通路中关键靶点促进胰腺癌细胞的凋亡,证明了本研究中网络药理学分析结果的可靠性。结论初步证实了半枝莲具有多成分-多靶点-多途径协同作用的特点以及治疗胰腺肿瘤的潜在分子机制,为进一步探索其作用机制及临床应用奠定基础。     

基于网络药理学技术研究桃红四物汤延缓成纤维细胞生长的分子靶标

桃红四物汤(Taohong Siwu Decoction, THSWD)作为活血化瘀方,对于延缓肾脏纤维化的进程有一定作用,但作为包含诸多单体成分的中药复方,应对复杂的病理过程,其研究方法的探讨和作用靶点的找寻一直是该方向的研究热点。活血化瘀法在阻滞IgA肾病(IgA nephropathy, IgAN)纤维化进程方面有一定的临床疗效,但作用机制尚不明确。该研究先借助网络药理学方法,研究THSWD干预IgAN纤维化进程的有效活性成分,作用靶点及分子作用机制,在此基础上,通过离体实验,验证THSWD作用于3T3细胞对ERK因子表达的影响。通过中药系统药理学技术平台收集THSWD中的活性成分及作用靶点,筛选得到木犀草素、槲皮素等61个有效活性成分及240个作用靶点,与CTD数据库查找的IgAN相关靶点相交得到185个靶点。利用Cytoscape软件与STRING数据库构建"桃红四物汤-活性成分-靶点"网络和蛋白互作网络,筛选69个核心靶点;通过DAVID对核心靶点的GO富集分析和KEGG通路分析及进行细胞实验,结果表明,ERK因子是THSWD干预IgAN重要的因子,THSWD可以显著降低细胞活性、ERK1/2 mRNA表达、p-ERK1/2蛋白表达。该研究提示,THSWD可能通过影响ERK因子及其磷酸化水平,来延缓成纤维细胞生长。     

基于网络药理学探讨瓜蒌桂枝汤治疗脑卒中后炎性反应的活性成分和作用机制

目的:探讨瓜蒌桂枝汤治疗脑卒中后炎性反应的活性成分和作用机制。方法:利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)筛选瓜蒌桂枝汤活性成分和靶点,并借助Cytoscape 3.9.0软件构建“成分-靶点”网络图,运用人类基因数据库(GeneCards)、药物靶标数据库(TTD)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)筛选作用于脑卒中、炎性反应的靶点,利用STRING平台构建靶蛋白相互作用网络,通过DAVID 6.8平台对关键靶点进行KEGG和GO功能分析,预测其作用机制。结果:成分-靶点网络包含101个化合物和相应靶点210个。GO功能富集分析得到GO条目279个,其中生物过程(BP)199个,细胞组成(CC)31个,分子功能(MF)49个。KEGG通路富集涉及HIF-1、肿瘤坏死因子(TNF)、疟疾、核转录因子κB(NF-κB)信号通路等。结论:本研究利用网络药理学方法初步探讨瓜蒌桂枝汤治疗脑卒中后炎性反应的活性成分和作用机制,为进一步研究提供方向。     

基于网络药理学探究香砂枳术丸治疗功能性消化不良的作用机制与实验验证

目的:借助网络药理学的研究思路,探寻香砂枳术丸（XSZZW）治疗功能性消化不良（FD）的作用机制,并使用动物实验进行验证。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中药分子机制生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)筛选活性成分和靶点,借助Perl语言与UniProt将靶点进行标准化;通过TTD、DrugBank、OMIM以及GeneCards数据库筛选FD相关靶点;利用Cytoscape构建“中药复方-活性成分-作用靶点”网络;使用STRING数据库分别构建活性成分和疾病相关靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络并导入Cytoscape软件,以度值、接近中心性和介度中心性为条件筛选核心靶点;将核心靶点映射到DAVID数据库,进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后,使用分子对接和动物实验进行结果验证。结果:获得活性成分75个以及靶点292个,FD相关的疾病靶点666个,经筛选最终获得核心靶点90个;GO富集分析主要在同源蛋白结合、酶结合、蛋白结合等生物学调控方面;KEGG富集分析得到信号通路103条,主要涉及癌症、细胞凋亡、炎症通路等方面。结论:香砂枳术丸可通过调控PI3K-AKT、FoxO、核因子κB、神经营养因子信号通路来预防或治疗FD。     

大黄抗肾脏纤维化的网络药理学及其活性成分的作用机制

目的:通过网络药理学方法,预测中药大黄抗肾脏纤维化的活性成分、潜在靶点及通路,选取活性成分,对筛选出的靶基因进行体外实验验证。方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)与中药分子机制分析综合数据库(TCMID)获取并筛选大黄主要活性成分,利用相似度系综算法数据库(SEA),瑞士生物信息学研究所(SIB),Gene Cards数据库预测和筛选大黄抗肾脏纤维化的潜在作用靶点。采用String Version 10.5数据库构建靶点蛋白相互作用(PPI)网络;运用David 6.8软件对关键靶点进行基因本体论(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。采用Cytoscape Version 3.6.0软件对关键蛋白相互作用网络、活性成分-关键靶点网络、活性成分-靶点-信号通路网络进行可视化分析。结合Malarcards数据库筛选出与肾脏纤维化高关联性信号通路。进一步采用细胞实验验证:选取HK-2细胞,利用转化生长因子-β1(TGF-β1)诱导细胞纤维化模型,予大黄酸干预细胞48 h,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测缺氧诱导因子1α(HIF-1α),血管内皮生长因子(VEGF),血小板衍生生长因子受体-α(PDGFR-α),免疫荧光检测E-钙黏蛋白(E-cadherin),α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)蛋白表达,流式细胞术检测细胞凋亡。结果:筛选得到大黄活性成分17个,大黄抗肾脏纤维化潜在靶点424个,关键靶点5个,依次为蛋白激酶B(Akt)1,丝裂原激活的蛋白激酶(MAPK)3,EGFR,白细胞介素-6(IL-6),VEGFA;GO富集生物学过程主要涉及信号转导、细胞增殖、凋亡等生物过程;KEGG通路富集结果发现磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt,HIF-1α,VEGF,叉头转录因子(FoxO)等通路与大黄抗肾脏纤维化作用机制相关。体外实验验证表明,大黄酸抑制E-cadherin,α-SMA,HIF-1α,VEGF,PDGFR-α的表达水平,同时抑制肾小管上皮细胞凋亡,验证了网络药理学部分预测结果。结论:本研究体现了大黄多成分、多靶点、多途径的作用特点,其抗肾脏纤维化的作用机制可能与其抑制HIF-1α/VEGF/PDGFR-α信号转导途径,抑制细胞凋亡及肾小管上皮细胞上皮间质转化(EMT)有关。     

基于网络药理学探讨川椒方治疗过敏性结膜炎的作用机制

目的通过网络药理学探讨川椒方治疗过敏性结膜炎(AC)的作用机制。方法在中药系统药理学数据库(TCMSP)和中医药百科全书数据库(ETCM)中获取川椒方的活性成分和作用靶点,并按照药代动力学参数进行筛选。基于GeneCards数据库和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取AC的相关靶点;并获取川椒方治疗AC的关键靶点,构建关键靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,并对关键靶点进行GO富集分析、KEGG通路富集分析、模块分析。结果共得到川椒方活性成分85个,预测靶点508个,其中川椒方治疗AC的关键靶点183个。PPI网络中度值最高的靶点包括:白细胞介素6 (IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF-α)、蛋白激酶B(Akt1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等。GO富集分析分别得到生物过程(BP)条目1,981个,细胞成分(CC)条目71个,分子功能(MF)条目160个。KEGG富集分析共筛选得到160条信号通路。模块分析共得到7类模块。结论川椒方中主要含有的成分是槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等,可能通过作用于IL-6、TNF-α、VEGFA、AKT1等关键靶点,调控AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、NF-κB信号通路来调节炎症免疫等过程,从而发挥治疗AC的作用。     

何首乌-石菖蒲药对治疗阿尔茨海默病网络药理学研究及实验验证

目的应用网络药理学方法预测何首乌-石菖蒲药对治疗阿尔茨海默病的作用靶点及相关信号通路,探讨其作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索并筛选何首乌、石菖蒲的潜在活性成分,并查询活性成分作用靶点,采用DrugBank数据库和Pharmmapper服务器预测有效化学成分的作用靶点,采用Cytoscape3.7.1软件构建活性成分-靶点网络;通过DrugBank、DisGeNET、HPO数据库检索阿尔茨海默病相关基因;将活性成分作用靶点和阿尔茨海默病相关基因进行比对,得到交集靶点,利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络;使用Cytoscape3.7.1软件根据度值、介数和紧密度筛选关键靶点,应用Metascape数据库分析关键靶点的KEGG信号通路和GO分子功能;通过MTT、ELISA和qPCR实验验证何首乌-石菖蒲对PC12细胞的保护作用。结果共筛选出何首乌-石菖蒲药对有效成分15个,对应靶点280个,与阿尔茨海默病交集靶点共123个,12个关键靶点的前10条KEGG通路和前20个GO分子功能涉及炎症反应和凋亡等。细胞实验表明,何首乌-石菖蒲药对能有效提高PC12细胞存活率,抑制细胞炎症反应,并抑制p38MAPK/NF-κB信号通路激活。结论何首乌-石菖蒲药对的多种有效成分以协同方式与多个靶点、多种途径相互作用,主要通过抑制炎症反应、抗凋亡等对阿尔茨海默病发挥重要治疗作用。     

基于网络药理学探讨水蛭防治股骨头坏死的作用机制

目的基于网络药理学探讨水蛭防治股骨头坏死(ONFH)的潜在作用机制。方法应用中药综合数据库(TCMID)及BATMAN-TCM分析工具筛选出单味中药水蛭的活性成分及作用靶点,检索与疾病靶点有关的数据库GeneCadrs、TTD、OMIM筛选ONFH的作用靶点,进而筛选水蛭与ONFH的交集核心靶点,并运用Cytoscape 3.7.1软件构建化合物-靶点-疾病网络,基于DAVID数据库对靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果基于BATMAN-TCM分析工具预测得出水蛭防治ONFH的活性成分13个和交集靶点28个;GO功能富集分析得到条目153个,其中生物过程条目117个、细胞组成条目10个、分子功能条目26个;KEGG通路富集分析得出条目35个,主要包括PPAR信号通路、TNF信号通路、AMPK信号通路、NF-κB信号通路、TLR信号通路等。结论基于网络药理学初步探讨并验证了水蛭防治ONFH多成分-多靶点-多通路的整体调节作用特点,预测了水蛭防治ONFH的潜在作用机制,以期为其活性成分研究与实验研究提供科学依据。     

基于网络药理学的党参治疗慢性萎缩性胃炎的机制研究

目的运用网络药理学的方法探讨党参治疗慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)的分子作用机制。方法通过TCMSP数据库和文献挖掘获取党参的主要活性成分,利用人类基因数据库GeneCards预测和筛选党参活性成分的作用靶点。采用String数据库和Cytoscape3.7.1软件绘制蛋白相互作用网络(PPI),借助DAVID6.8数据库进行潜在基因的基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果筛选得到党参21个活性成分,涉及27个作用靶点。GO分析结果显示,党参治疗慢性萎缩性胃炎潜在基因的生物功能主要涉及影响染色体结合,蛋白质异二聚化活性,核受体活性,转录因子活性,类固醇激素受体,类固醇结合,NF-κB结合,雌激素受体,RNA聚合酶II,半胱氨酸型内肽酶等;KEGG通路富集分析结果显示,党参治疗慢性萎缩性胃炎潜在基因的通路主要涉及前列腺癌,细胞凋亡,TNF信号通路,结直肠癌,乙型肝炎,AGE-RAGE信号通路,PI3K-Akt等信号通路。结论党参治疗慢性萎缩性胃炎是多成分、多靶点、多通路的复杂过程,主要通过参与抑制炎性分子、NF-κB结合、细胞凋亡等发挥治疗CAG的作用。     

基于网络药理学探讨苦参治疗结直肠癌活性成分、作用靶点及潜在作用机制

目的 使用网络药理学方法分析抗肿瘤中药苦参活性成分及其治疗结直肠癌的潜在靶点与作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选中药苦参活性成分,并使用PubChem数据库验证所收集活性成分化合物结构,运用SwissTargetPrediction数据库反向分子对接预测苦参活性成分可能作用靶点。采用GeneCards、DisGeNET、TTD、MalaCards数据库预测结直肠癌疾病靶点,通过Cytoscape 3.8软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”关系网络图,利用STRING数据库分析苦参-结直肠癌共同靶蛋白PPI蛋白间相互作用网络,采用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体论(GO)富集分析以及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 共筛选获得中药苦参活性成分45个,通过调控结直肠癌相关作用靶点54个,参与体内信号传导、蛋白质磷酸化、凋亡等生物学过程,并通过调控癌症相关信号通路、PI3K-Akt信号通路、癌症蛋白聚糖信号通路等途径发挥治疗作用。结论 中药苦参能够通过多途径、多靶点协同发挥抗结直肠癌作用。     

基于网络药理学探究红花注射液治疗原发性痛经的作用机制

目的 基于网络药理学探究红花注射液治疗原发性痛经的作用机制.方法 利用网络药理学技术筛选红花注射液治疗原发性痛经的潜在活性成分及靶点,构建"活性成分-潜在靶点"网络和潜在蛋白互作网络.筛选核心靶标,并对潜在靶点进行GO分析、KEGG通路富集及与临近基因的富集分析.建立原发性痛经大鼠模型,考察红花注射液干预后相关通路蛋白...     

乌梅治疗变应性鼻炎的网络药理学机制探究

目的：运用网络药理学方法筛选乌梅对变应性鼻炎（Allergic Rhinitis,AR）的作用靶点,明确其作用机制。方法：经中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索乌梅的化学成分并筛选其作用靶点;通过GeneCards、OMIM等数据库查询AR的疾病靶点;利用Venny映射得到乌梅与AR的共同靶点,进而构建靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络图;基于Metascape数据库对靶点进行基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：共筛选出乌梅的8个主要活性成分和194个相应靶点蛋白,与1 092个AR靶点相交的核心靶点有87个。KEGG通路富集分析得到癌症通路、流体动力与动脉粥样硬化通路、肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor,TNF）信号通路、弓形虫通路、核因子-κB(Nuclear Factor-κB,NF-κB)信号通路等21条通路;GO通路富集分析得到53条结果,其中生物过程包括脂多糖反应通路等18条,细胞组成包括膜筏通路等15条,分子功能包括细胞因子受体结合通路等20条。结论：乌梅的主要活性成分通过调控白细胞介素-...     

基于网络药理学分析人参-黄芪治疗肺癌潜在靶点和机制

目的:基于网络药理学分析人参-黄芪治疗肺癌潜在靶点和机制。方法:通过传统中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选人参、黄芪活性成分和靶基因。使用人类基因数据库(Gene Cards)获得肺癌相关基因。使用Cytoscape构建"药物-成分-靶点-疾病"网络。使用STRING下载蛋白与蛋白相互作用(PPI)数据,利用插件Centi Scape筛选PPI核心基因。使用R软件进行关键靶基因基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:共筛选17个人参,16个黄芪活性成分,50个人参,95个黄芪治疗肺癌的靶基因,构建"药物-成分-靶点-疾病"网络。筛选出38个PPI核心基因。GO功能富集显示人参-黄芪生物学过程和功能集中在核受体功能、转录相关功能、泛素化、细胞凋亡等。KEGG通路富集显示,人参-黄芪治疗肺癌主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt),细胞凋亡、肿瘤坏死因子(TNF)等信号通路。结论:通过构建"药物-成分-靶点-疾病"网络,从多成分、多靶点、多通路阐释人参-黄芪作为对药治疗肺癌的作用机制,为后续深入研究提供一定参考。     

基于网络药理学研究桃仁-红花的药效活性成分及其治疗葡萄胎的分子机制研究

目的:基于网络药理学预测桃仁-红花治疗葡萄胎(HM)的分子作用机制。方法:以网络药理学方法为基础,依托中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选桃仁-红花的活性成分及作用靶点;借助Gene Cards、OMIM、Drug Bank、Pharm GKB等数据库筛选葡萄胎的疾病靶标,绘制Venn图,构建药对-疾病"活性成分-作用靶点"网络图,绘制蛋白互作网络(PPI),完成GO和KEGG富集分析,进一步用分子对接来验证和筛选靶点。结果:研究共筛选得到槲皮素、木犀草素等8个活性成分,分别作用于AKT1、TP53、EGFR等39个相关靶点; GO富集分析显示桃仁-红花的活性成分主要涉及凝血、改善血流动力学、调控细胞凋亡和细胞增殖、抗炎等生物学过程。KEGG富集通路HM有显著作用的有MAPK信号通路、血流剪切应力与动脉粥样硬化信号通路等;分子对接进一步验证了槲皮素与AKT1的相关性。结论:桃仁-红花药对包括槲皮素、木犀草素等8个活性成分,其治疗葡萄胎主要通过多靶点多通路起作用,为后续临床治疗葡萄胎提供了新的思路。     

基于网络药理学和分子对接研究三仁汤治疗肺癌的分子机制

目的：采用网络药理学方法筛选三仁汤君药药对（SRJMP）的活性成分及核心靶点,探讨三仁汤君药药对治疗肺癌的作用机制。方法：依托中药系统药理学分析平台（TCMSP）,检索三仁汤 3 味中药相关的所有化学成分及预测作用靶点,采用STRING 数据库与 Cytoscape 软件构建“药物-活性成分-靶点”网络和蛋白互作网络,通过 ClusterProfiler、ClueGO、DAVID 数据库对核心靶点进行基因本体（GO）分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集。把候选作用靶点映射在 KEGG 通路图上分析结果,最后应用 AutoDock 软件进行分子对接。结果：共筛选出 40 个活性成分和 222 个相应蛋白靶点。首要分析核心靶点47 个,GO 分析共包含 117 条富集结果,KEGG 通路富集筛选出 30 条通路。结论：通过网络药理学验证了 SRJMP 多成分、多靶点、多通路的特点,其可能是通过调控免疫细胞分化,肿瘤相关信号通路以及干预细胞代谢过程,达到抗肿瘤作用。