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1.
王乐琪  李冰冰  王倩  支运霞  肖雪  关永霞  张贵民  郭姣 《中草药》2020,51(19):4861-4872
目的基于网络药理学方法研究参芪降糖颗粒治疗糖尿病微循环障碍的潜在分子机制。方法通过GeneCards数据库查询糖尿病肾脏病、糖尿病视网膜病变、糖尿病神经病变、糖尿病足病和糖尿病合并脑小血管病的疾病靶点,整合为糖尿病微循环障碍疾病靶点。借助PubChemSearch和Swisstargetprediction在线工具得到参芪降糖颗粒药效成分治疗糖尿病微循环障碍的作用靶标,利用Cytoscape 3.3.0软件构建参芪降糖颗粒化学成分-糖尿病微循环障碍作用靶标网络,通过STRING数据库构建靶蛋白相互作用(PPI)网络,利用Clue GO插件进行GO分析和KEGG通路富集分析。结果从参芪降糖颗粒中共筛选出85个化学成分,以及10个与糖尿病微循环障碍相关的作用靶点,分别为ACE、VEGFA、TNF、IL6、STAT3、ALB、PON1、PTPN22、PPARG、NOS3。经GO和KEGG通路富集分析,发现参芪降糖颗粒治疗糖尿病微循环障碍可能参与HIF-1信号通路、胰岛素抵抗、AGE-RAGE信号通路、炎症性肠病、类风湿性关节炎、肥厚性心肌病信号通路等多条信号通路。结论参芪降糖颗粒治疗糖尿病微...  相似文献   

2.
目的:运用网络药理学的方法,探索芪术颗粒治疗糖尿病肾病的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP),中医百科全书数据库(ETCM),以口服生物利用度和类药性为限定条件筛选出芪术颗粒中各药的化学成分及其蛋白靶点,并通过UniProt数据库将蛋白靶点规范为相应的基因名称;通过在线《人类孟德尔遗传》数据库(OMIM),疾病-基因数据库(DisGeNET),治疗靶标数据库(TTD),ETCM数据库检索糖尿病肾病的相关基因;两者取交集之后,通过蛋白质相互作用数据库(STRING)构建蛋白互作网络,使用Cytoscape分析网络的核心靶点,使用KOBAS 3.0数据库对相关靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:从芪术颗粒中共得到化学成分93个,涉及到254个靶点,与糖尿病肾病相关的基因607个,取交集后确定了76个芪术颗粒治疗糖尿病肾病的靶标,包括蛋白激酶B1(Akt1),血管内皮生长因子α(VEGFA),白细胞介素(IL)-6,肿瘤坏死因子(TNF),丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1),基质金属蛋白酶(MMP)-9等核心靶点,经过GO分析和KEGG分析,芪术颗粒可以影响细胞对氮化合物的反应、调节活性氧代谢过程等生物过程,调控糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物(AGE)/晚期糖基化终产物受体(RAGE)信号通路,流体剪切应力和动脉粥样硬化,IL-17信号通路,缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路,TNF信号通路等通路。结论:芪术颗粒对糖尿病肾病的治疗作用可能是影响Akt1,VEGFA,IL-6,TNF,MAPK1,MMP-9等靶点,调控糖尿病并发症中的AGE/RAGE信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化,IL-17信号通路,HIF-1信号通路,TNF信号通路等通路发挥的,可以为进一步的基础实验研究提供理论参考。  相似文献   

3.
目的利用网络药理学方法及分子对接技术分析贞芪扶正胶囊辅助治疗艾滋病的分子机制。方法通过TCMSP获取贞芪扶正胶囊组方药物活性成分及作用靶点, 通过GeneCards、OMIM及DrugBank数据库获取艾滋病相关靶点;通过STRING 11.5数据库构建交集靶点PPI网络, 并采用Cytoscape 3.9.1软件进行网络拓扑分析;采用Metascape数据库对核心靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析;运用Cytoscape 3.9.1构建贞芪扶正胶囊成分-靶点-通路网络;利用Autodock Tools软件对核心靶点与活性成分进行分子对接。结果获得贞芪扶正胶囊31个活性成分及180个作用靶点, 确定TNF、IL6、AKT1、IL1B、TP53、VEGFA、RELA、EGFR、CASP3为核心靶点。GO功能富集分析获得生物过程1 436条、细胞组分53条、分子功能117条。KEGG通路富集分析获得167条通路, 与癌症、糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路等密切相关。分子对接结果显示, AKT1、TNF等核心靶点与槲皮素、山柰酚、木犀草素等成分有良好的结合活性。...  相似文献   

4.
目的:通过网络药理学方法探讨经方真武汤治疗糖尿病肾病(DKD)的核心作用靶标基因以及潜在通路机制,旨在指导临床用药同时为更深入的实验研究提供依据。方法:通过TCMSP数据库检索真武汤所含药物的有效成分、潜在作用靶点,在Genecards、OMIM、DisGeNET数据库筛选与糖尿病肾病有关的疾病靶点,借助Cytoscape3.7.2绘制并构建“药物-成分-靶点-疾病”可视化交互网络。利用STRING平台绘制关键靶点PPI网络,在David数据库里针对关键靶点蛋白开展GO基因功能、KEGG信号通路富集分析。结果:检索查筛出真武汤中有效活性成分59个、潜在靶点108个,其中涉及DKD的关键靶点47个,从蛋白互作网络中分析发现TNF、ATK1、JUN、RELA、IL6、MAPK8、CASP8、NOS2可能是真武汤治疗糖尿病肾病的核心靶点。GO富集分析得到180个条目,主要涉及细胞增殖、代谢、凋亡及脂肪细胞因子、葡萄糖稳态等。KEGG信号通路富集分析得到94条信号通路,主要涉及TNF信号通路、Toll样受体信号通路、HIF-1信号通路、FoxO信号通路等。结论:本研究初步验证真武汤治疗糖尿病肾病的作用机制涉及多成分、多靶点、多信号通路,给予真武汤的临床应用及更深层次对糖尿病肾病的研究以一定理论依据。  相似文献   

5.
徐荣佳  姜晨 《湖南中医杂志》2021,37(9):169-174,190
目的:基于网络药理学探讨水陆二仙丹治疗糖尿病肾病(DN)蛋白尿可能的作用机制及原理.方法:通过TCM-SP平台检索获取水陆二仙丹中2味药的有效化学成分以及各化合物潜在作用靶点,利用GeneCards数据库筛选DN功能相关的靶标,将药物、有效成分、共同靶标导入Cytoscape 3.6.1.运用Cytoscape软件绘制"药物-疾病-靶点"可视化网络,利用软件分析功能得到主要药效成分及靶点.将药物作用靶点与DN功能相关靶点交集结果导入STRING10.5平台,构建"药物-靶标"蛋白相互作用(PPI)网络,利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG富集分析.结果:挖掘出5种活性成分、116个相关靶点与本方治疗DN相互关联,其中PPI网络图显示核心靶标AKT1、IL6、MAPK8、VEGFA、MAPK1等;KEGG结果表明主要作用于AGE-RAGE信号等氧化应激相关通路.结论:网络药理学可科学预测水陆二仙丹治疗DN的主要作用机制,水陆二仙丹可能是通过对AGE-RAGE-NF-Kb/Ap-1调控轴为中心等多个靶点的抗氧化应激抑制作用控制DN蛋白尿.  相似文献   

6.
目的:基于网络药理学预测薏苡附子败酱散YFBP治疗溃疡性结肠炎(UC)的有效成分及作用机制。方法:通过数据库(TCMSP)搜集附子薏苡败酱散的有效成分及药物靶点,Geencard数据库搜集UC的疾病靶点,求出药物靶点与疾病靶点的交集及对应的有效成分;利用Cytoscape…3.7.1软件构建中药-化合物网络以及化合物-靶标网络;将靶点交集导入String中,对靶点的节点重要性进行分析;通过R语言对靶点的交集进行KEGG分析。结果:最终得到18个可治疗UC的潜在有效成分,以及可治疗UC的122个靶点、144条信号通路。结论:YFBP可能主要通过AKT1、IL-6、VEGFA、CASP3、JUN、PTGS2、EGFR等多个靶点,PI3K/Akt、AGE-RAGE等多条通路来发挥作用。  相似文献   

7.
目的对化聚消积方进行网络药理学研究,探讨其改善糖尿病肾病可能的作用机制。方法利用GeneCards和TCMSP数据库选取糖尿病肾病及化聚消积方的共同作用靶点,并找出其对应的化合物成分,使用R语言和Cytoscape软性找出并核心靶点并构建网络,利用STRING数据库构建靶点相互作用网络,再分别采用GO和KEGG数据库进行基因功能和信号通路分析。结果筛选得到有效化合物41个,涉及作用靶点105个。核心化合物有槲皮素、山奈酚和花生四烯酸等,核心靶点有IL6、AKT1、VEGFA等。GO分析BP模块显示存在2008条富集结果(P0.05),MF模块存在143条富集结果(P0.05)。KEGG显示共存在154条通路(P0.05),包括AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等。结论化聚消积方对糖尿病肾病的治疗作用是多靶点、多层次的,AGE-RAGE信号通路可能是该方发挥作用最重要的信号通路。  相似文献   

8.
目的 采用网络药理学和分子对接技术研究黄芩治疗糖尿病脑病的作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索黄芩主要活性成分和作用靶点,通过OMIM、GeneCards、TTD及DrugBank等数据库筛选糖尿病和阿尔茨海默病的主要靶点,构建活性成分-靶点网络;利用STRING 11.0进行蛋白质互作分析,构建PPI网络以筛选重要靶点;运用Metascape库对关键交集靶点进行GO和KEGG富集分析;利用Cytoscape 3.7.2将分析得到的重要靶点和通路构建药物成分-疾病靶点-通路网络;进一步对关键活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果 筛选出黄芩重要活性成分有汉黄芩素、黄芩素、金合欢素、降穿心莲黄酮等,PPI网络中关键交集靶点61个,核心靶点有AKT1、IL-6、MAPK14、TNF、PRKCA、VEGFA等。GO富集分析得到细胞组成101条,分子功能76条,生物过程1 413条;KEGG通路富集分析得到258条,主要涉及AGE-RAGE信号介导的糖尿病并发症通路、IL-17、MAPK、TNF、PI3K-Akt信号通路、胰岛素抵抗通路等。分子对接结果可知,汉黄芩素、金合欢素、黄芩素、红...  相似文献   

9.
目的基于网络药理学和分子对接技术预测当归补血汤抗心肌缺血再灌注损伤和缺血性卒中"异病同治"的作用机制。方法检索TCMSP和文献资料, 筛选当归补血汤活性成分和靶点;使用OMIM、GeneCards数据库检索心肌缺血再灌注损伤和缺血性卒中对应靶点;利用韦恩图获取当归补血汤与疾病的交集靶点, 通过Cytoscape 3.7.1软件和STRING数据库构建"中药-成分-疾病共同靶点"网络和PPI网络;借助DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析, 结合Bio GPS数据库获取关键靶点组织分布信息;运用分子对接技术进行验证。结果获取当归补血汤活性成分21个, 有效靶点181个, 与疾病交集靶点93个。其核心成分有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、芒柄花黄素、异鼠李素, 关键靶点为AKT1、TNF、IL6、IL-1β、VEGFA。富集结果显示, 主要作用通路为流体剪切力与动脉粥样硬化、脂质与动脉硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路, 核心靶点大多分布于髓细胞、树突状细胞、平滑肌、前列腺、甲状腺等组织。分子对接验证结果显示, 芒柄花黄素与IL-1β结合效果较好, 槲皮素分别与IL...  相似文献   

10.
目的 运用网络药理学方法探讨复方丹参滴丸治疗糖尿病心肌病(DCM)的潜在作用机制。方法 通过检索TCMSP数据库平台获取复方丹参滴丸活性成分,查询对应靶基因;运用OMIM和GeneCards数据库查找DCM的疾病靶点,构建药物有效成分与疾病靶点的交集Venn图。利用Cytoscape 3.7.2软件构建核心靶点网络图;在DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果 筛选获得药物有效成分73个,药-病交集靶点102个,其中IL-6、VEGFA、TNF、TP53等可能是治疗机制核心靶点。富集分析获得GO条目147条,主要包括NO生物合成过程的正调节、质膜、酶结合等生物过程。KEGG通路95条,主要涉及TNF信号途径、癌症信号通路、HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路等。结论 从分子层面分析得到复方丹参滴丸治疗DCM具有多成分、多靶点、多通路的特点,为临床应用提供了一定的理论依据。  相似文献   

11.
目的:基于网络药理学研究附子-细辛对高血压病的作用机制.方法:运用TCMSP数据库挖掘出附子-细辛的有效成分及药物预测靶点,采用5个生物信息数据库检索出高血压病的疾病预测靶标,构建药物靶点-疾病靶标交集,使用Cytoscape生物信息分析软件绘制"成分-靶点-疾病"中药调控网络,基于STRING数据库构建"药物-疾病"相关靶点的蛋白互作网络(PPI),并对其进行GO和KEGG的生物信息学分析.结果:通过生物利用度和类药性筛选得到附子-细辛的有效成分29个,对应药物靶点1807个,高血压病的疾病靶标8505个,构建的药物靶点-疾病靶标交集80个.与高血压病密切相关的GO富集条目91个,KEGG信号通路123条,主要涉及流体剪切应力与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、白细胞介素(IL)-17信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、PI3K-Akt信号通路等.结论:附子-细辛药对与高血压病密切相关,能够通过一条或多条通路协同发挥药效作用,考虑其可能是通过干预血液的流体剪切应力影响动脉粥样硬化与心血管重塑再生而实现的.  相似文献   

12.
目的:分析血府逐瘀汤治疗冠心病的作用机制。方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索血府逐瘀汤的化学成分和靶基因,利用GeneCards获得与冠心病相关的靶基因,采用Cytoscape 3.7.2绘制"中药成分-疾病靶基因"网络图,采用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,将PPI网络图导入Cytoscape 3.7.2,借助CytoNCA插件进行网络拓扑分析,采用R64 3.6.1软件对靶基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:筛选出血府逐瘀汤相关化合物224个,作用于冠心病的相关靶点3 564个,PPI网络显示Degree值排名前10位的靶基因依次为IL6、AKT1、ALB、VEGFA、CCL2、EGF、IL1B、MMP-9、CASP3、MAPK1,拓扑分析结果显示Degree值排名前10位的靶基因依次为PTGS2、MMP2、VEGFA、AKT1、ALB、CASP3、STAT3、IL6、MMP9、SERPINE1。GO富集分析预测出此方对冠心病的治疗机制可能与调控营养水平反应、对氧含量的反应、膜筏、膜微域、磷酸酶结合等通路相关。KEGG富集分析预测出此方治疗冠心病可能是通过糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化、HIF-1信号通路、TNF信号通路等几个关键的通路达到治疗效果。结论:本研究探讨了血府逐瘀汤治疗冠心病的活性成分及其作用机制,血府逐瘀汤可通过多靶点、多通路治疗冠心病,为进一步研究该方作用机制提供了理论依据。  相似文献   

13.
目的 基于网络药理学和分子对接探讨紫苏子治疗糖尿病心肌损伤(DMI)的机制。方法 检索TCMSP数据库,筛选出紫苏子的主要活性成分和相关靶点,从Gene Cards和OMIM数据库中筛选获得DMI的相关靶点。将紫苏子的作用靶点与疾病靶点取交集得到紫苏子治疗DMI的潜在靶点,使用STRING 11.0构建PPI网络,并通过网络拓扑分析筛选9个核心靶点。采用Metascape平台分析对交集靶点进行GO和KEGG富集分析。最后运用Auto Dock Vina 1.1. 2进行分子对接验证。结果 共筛选出105个紫苏子活性成分调控DMI的潜在靶点,通过网络拓扑分析中的degree值筛选出ALB、AKT1、IL6、VEGFA、TNF、TP53、CASP3、MAPK1、EGFR等9个核心靶点; GO富集分析筛选出细胞氮化合物反应、有毒物质反应、无机物反应、细胞成分运动的正调控、炎症反应等15个生物学过程; KEGG富集筛选出癌症通路、PI3K-Akt信号通路、前列腺癌、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、流体剪应力与动脉粥样硬化等;分子对接验证结果显示核心靶点与紫苏子核心成分之间有良好的结合...  相似文献   

14.
目的:通过网络药理学方法建立六味地黄丸"活性成分-靶点-通路"图,初步探讨六味地黄丸治疗糖尿病肾病的药理机制。方法:通过TCMSP获取六味地黄丸各单药的活性成分和潜在靶点,运用Genecard筛选得分≥20分的糖尿病肾病相关靶点,STRING构建蛋白相互作用网络,Cytoscape拓扑分析网络图,R语言进行GO和KEGG通路富集分析。结果:网络分析得出41个活性成分,共涉及21个靶点和63条通路。其中槲皮素和山奈酚是主要化合物,关键靶点AKT、VEGFA、NOS3、IL6、SERPINE1富集在重要通路AGE-RAGE信号中。结论:为进一步研究六味地黄丸治疗糖尿病肾病的潜在活性成分及其可能的作用机制提供了思路和理论基础。  相似文献   

15.
目的:运用网络药理学方法探讨枸杞子-菟丝子“异病同治”2型糖尿病性骨质疏松症(DOP)和肾病综合征(NS)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选枸杞子-菟丝子的主要活性成分和作用靶点,利用UniProt数据库及Perl语言进行规范以及转化为标准基因名称,利用Cytoscape3.9.1软件构建药物-活性成分-靶点网络。通过GeneCards、OMIM及PharmGkb数据库搜集DOP和NS相关疾病靶点,将疾病靶点与药物靶点取交集,通过STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用网络并筛选核心蛋白;对交集蛋白运用Rx4.1.3软件及R脚本进行GO功能富集和KEGG通路分析,运用Autodock 4.2软件进行分子对接。结果:筛选后得到枸杞子-菟丝子活性成分42个,作用靶点208个;DOP、NS疾病靶点分别为2834个、2114个,共有靶点915个,疾病和药物交集靶点86个。GO富集分析得到分子功能121条;KEGG通路富集分析获得126条信号通路,靠前的通路为糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、IL-17信号通路,...  相似文献   

16.
目的采用网络药理学及分子对接方法探究桂枝茯苓丸治疗足厥阴肝经疾病甲状腺结节、乳腺结节及子宫肌瘤的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和SwissTargetPrediction数据库检索桂枝茯苓丸组方药物的化学成分并获取靶点,通过GeneCards、OMIM数据库查询疾病相关靶点,获得二者交集靶点基因。采用Cytoscape3.7.2软件构建药物-成分-疾病-靶点网络和蛋白相互作用网络,利用R语言对靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,运用PyMOL软件进行分子对接。结果共筛选出桂枝茯苓丸活性成分116个,对应有效靶点1109个,与3种疾病的交集靶点79个。对交集靶点富集分析发现,桂枝茯苓丸治疗甲状腺结节、乳腺结节及子宫肌瘤的共同关键通路为AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路及PI3K-Akt信号通路。根据KEGG通路富集分析结果确定7个核心靶点(TP53、CCND1、EGFR、SRC、ESR1、VEGFA、GAPDH)。结论桂枝茯苓丸可能通过调控AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路及PI3K-Akt信号通路,作用于TP53、CCND1、EGFR、SRC、ESR1、VEGFA、GAPDH等靶点,发挥活血、化瘀、消癥功效,可为桂枝茯苓丸“异病同治”机制研究提供参考。  相似文献   

17.
目的 采用网络药理学方法探讨地黄饮子治疗血管性痴呆(VD)的分子机制。方法通过TCMSP、化学专业数据库、ETCM数据库及相关文献进行查询,筛选出地黄饮子的活性成分,再利用TCMSP预测出潜在作用靶标。从GeneCards、DrugBank、OMIM数据库筛选与VD相关的靶点,整合后得到交集靶点,继而运用Cytoscape 3.7.1软件构建出成分-靶点蛋白相互作用网络,最后再通过Metascape数据库进行GO、KEGG富集分析。结果 筛选出地黄饮子中有81个活性成分,药物靶点262个,疾病靶点1 140个,VD治疗关键靶点117个,槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、木犀草素等成分具有抗VD的作用,其可能是通过CASP3、TNF、IL6、VEGFA等靶点,通过PI3K/Akt信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、MAPK信号通路、IL-17信号通路等发挥治疗作用。结论 地黄饮子通过多成分、多靶点、多途径起到干预治疗VD的作用,为地黄饮子治疗VD的基础和临床研究提供了新方向。  相似文献   

18.
目的 通过网络药理分析及相关的动物实验探讨黄芪减少糖尿病肾病蛋白尿(Diabetic nephropathy proteinuria,DNP)的作用机制。方法 利用TCMSP数据平台筛选出黄芪中的有效成分和相关靶标,使用GeneCards、OMIM网站数据库在线搜索出DNP的疾病相关靶标,取疾病和药物相同靶标交集,再利用Cytoscape 3.8.2构建药物-效应成分-疾病-靶标相互作用网络,进行拓扑学分析;从Uniprot数据库中获取靶点蛋白的基因名称,利用STRING在线数据库进行靶点蛋白与蛋白互作(Protein-protein interaction,PPI)网络分析;再进行GO功能分析和KEGG通路功能富集分析,推断黄芪减少DNP的机制是否和Akt1/mTOR自噬通路相关,再利用黄芪干预糖尿病肾病动物模型探讨其作用机制是否和预测的一致。结果 黄芪中20种核心化合物有作用靶点174个,DNP相关靶标有1862个,交集靶标有98个,关键效应分子有10个。PPI图显示黄芪发挥效应的目标蛋白主要是AKT1、VEGFA、IL6、CASP3、MAPK1、JUN等。GO分析黄芪药效主要与细胞因子受体结合及其活性、核受体活性、转录因子活性等有关,KEGG分析表明黄芪药效基础主要作用与糖尿病并发症中AGE-RAGE、MAPK、PI3K-Akt等信号通路有关。动物实验显示黄芪能明显改善糖尿病肾病的大鼠的肾功能,尤其改善蛋白尿指标,通过上调足细胞Nephrin蛋白保护了肾小球滤过屏障,减少了蛋白尿的产生(P < 0.05),同时下调了Akt1、总mTOR及其mRNA表达(P < 0.05),从而增强了肾足细胞的自噬活性,也起到减少DNP的作用。结论 网络药理分析显示黄芪可能通过多靶点效应发挥减少DNP作用,潜在的分子机制和Akt1/mTOR自噬通路有关,再经过实验研究说明Akt1/mTOR自噬通路是黄芪减少糖尿病肾病蛋白尿作用机制之一。  相似文献   

19.
《四川中医》2021,39(7):32-38
目的:运用网络药理学方法研究清脉活血方治疗ASO的作用机制。方法:在中药数据库TCMSP中筛选出清脉活血方的化学成分及对应的靶点,通过Uniprot数据库将靶点名称标准化;通过OMIM、GeneCards数据库检索ASO相关靶点,取药物靶点与疾病靶点交集靶点制作韦恩图,交集靶点即为清脉活血方作用于ASO的预测靶点;使用Cytocsape3.7.2软件构建"中药活性成分-靶点-疾病"网络图,选出关键活性成分;然后在STRING数据库中构建关键蛋白相互作用网络(Protein-proteininteraction, PPI),选出关键靶点基因;利用Rstudio对交集靶基因进行GO和KEGG富集分析。结果:筛选出清脉活血方有14个有效成分和273个靶点,作用于ASO的相关靶点有152个。GO分析显示,清脉活血方治疗ASO的机制可能与G蛋白偶联胺受体活性、类固醇受体活性、肾上腺素能受体活性、蛋白酶结合、RNA聚合酶II特异性等相关;KEGG通路富集显示清脉活血方治疗ASO影响的通路主要有AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、TNF信号通路、白介素-17信号通路、内分泌抵抗、EB病毒感染通路、雌激素信号通路、乙肝病毒、钙信号通路等通路途径。结论:清脉活血方可能是通过JUN、TNF、TP53、IL6、VEGFA、CXCL8等多靶点,通过调节AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、TNF信号通路等多条信号通路的形式治疗ASO。  相似文献   

20.
目的:探讨知母-黄柏药对治疗糖尿病(DM)的作用机制。方法:通过TCMSP、化学专业数据库检索知母、黄柏化学成分和作用靶点,并在UniProt数据库中进行靶点与基因转换,通过OMIM、Drugbank数据库查询现有DM相关基因。进而运用Cytoscape 3.7.1构建成分-靶点网络、靶点相互作用(PPI)网络并进行网络拓扑分析,最后通过Omicshare进行基因GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,研究其作用机制。结果:成分-靶点网络共有127个化合物和107个靶点,其中关键化合物涉及槲皮素、豆甾醇、山柰酚等。PPI网络包含107个蛋白,其中关键靶蛋白涉及INS、AKT1、IL6、VEGFA、TNF等。GO功能富集分析得到2 612个条目(P<0.05),其中生物过程(BP)条目2 125个,分子功能(CC)条目138个,细胞组成(MF)条目349个。KEGG通路富集分析筛选到157个信号通路(P<0.05),涉及到MAPK信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化、AGE-RAGE信号通路、胰岛素抵抗等信号通路。结论:知母-黄柏中的主要治疗糖尿病活性成分是槲皮素、豆甾醇、山柰酚,靶点主要涉及INS、AKT1、IL6、VEGFA、TNF等,通过MAPK信号通路、AGE-RAGE信号通路、胰岛素抵抗等信号通路协同治疗DM。  相似文献   

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