白细胞介素-1家族基因多态性与子宫内膜异位症的相关性研究

目的：探讨白细胞介素1（interleukin-1，IL-1）家族基因多态性与子宫内膜异位症（endometriosis，EMs）的相关性。方法：用聚合酶链式反应技术（PCR）及限制性片断长度多态性（RFLP），对138例EMs患者及100例对照者的IL-1β基因-511和＋3953位点及IL-1RA基因进行分析。结果：EMs组IL-1β-511位点的基因型（C／C、C／T、T／T）频率和等位基因（C、T）频率，IL-1β＋3953位点基因型（C／C、C／T）及等位基因（C、T）频率与对照组比较，差异均无显著性（P〉0．05）。IL-1RA基因型A1／A1、A1／A2、A1／A4、A2／A2频率在EMs组和对照组分别为84．1％、12．3％、2．9％、0．7％和95％、4％、1％、0％，两组比较P=0．042；A1、A2、A4等位基因频率在两组间分别为91．7％、6．9％、1．4％和97．5％、2％、0．5％，两者比较均具有显著性差异（P=0．019）。A1／A2基因型个体患EMs的危险性是野生型A1／A1纯合子的3．48倍（95％CI：1．13～10．69），携带A2等位基因者患EMs的危险性是携带A1等位基因的3．66倍（95％CI：1．23～10．94）。结论：IL-1β-511及＋3953位点的基因多态性与中国浙江籍汉族EMs患者的遗传易感性无关联，而IL-1RA基因的A2型等位基因可能是EMs的易感因素之一。     

白介素8-251位点基因多态性与我国高低发区胃癌关系

【目的】研究白介素（interleukin，IL）-8基因-251A/T位点多态性在中国高、低发区普通人群和胃癌（gastric cancer，GC）患者中的分布，并探讨其基因多态性与我国胃癌的关系。【方法】用聚合酶链反应-反向杂交法（polymerase chain reaction and reverse dot blot，PCR-RDB）检测我国胃癌低发区（广东省）104例健康人和104例胃癌患者和胃癌高发区（陕西省）102例健康人和102例胃癌患者的IL-8基因-251A／T位点多态性。【结果】在胃癌低发区，胃癌患者IL-8-251A／A基因型的频率略高于正常对照组，但未达统计学意义（27．9％vs21．2％，χ^2=1．27，P〉0．05），胃癌患者携带IL-8-251A／A基因型不增加Hp感染后胃癌发生的危险性（χ^2=1．40，P〉0．05），而在胃癌高发区，胃癌患者携带IL-8-251A／A的频率明显高于普通人群（31．2％vs16．7％，χ^2=6．04，P〈0．05，OR=2．29，95％ CI=1．17-4．46），并增加Hp感染后胃癌发生的危险性（χ^2=6．38，P〈0．05，OR=4．71，95％CI=1．36-16．30）。【结论】IL-8-251A等位基因与我国汉族人群胃癌的发生相关，以高发区明显。     

D2S388、D2S2232微卫星长度多态性与汉族人慢性阻塞性肺疾病易感性关联研究

目的研究D2S388和D2S2232微卫星长度多态性及其与汉族人慢性阻塞性肺疾病（COPD）易感性的关系。方法提取80例吸烟COPD患者和81名健康吸烟者（全部为汉族人,来源于全国各地）外周血基因组DNA,用多聚酶链式反应-变性聚丙烯酰胺电泳-测序方法检测D2S388、D2S2232微卫星长度多态性。分析吸烟健康人群的基因型分布是否符合Hardy-Weinberg平衡,计算微卫星位点的多态信息含量,并对两组人群D2S388和D2S2232长度多态性进行比较。结果D2S388和D2S2232位点均分别检测出6种等位基因和12种不同基因型,等位基因分布比墨西哥人相对集中;吸烟健康人群D2S388和D2S2232位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡,D2S388位点杂合率为0．47,多态信息含量为0．54,D2S2232位点杂合率为0．45,多态信息含量为0．53。D2S388（AC）15等位基因在COPD患者中的分布频率高于健康吸烟组,其患COPD的机会比为3．0;两组人员D2S2232位点的等位基因频率差异无显著性意义。结论汉族人D2S388和D2S2232位点长度多态性与墨西哥人比较具有种族差异;D2S388长度多态性与中国汉族人COPD易感性有关,D2S2232长度多态性与中国汉族人COPD易感性无相关关系。     

胆固醇24S-羟化酶和三磷酸腺苷结合盒转运子A1基因多态性与阿尔茨海默病的相关性分析

目的探讨胆固醇24S-羟化酶（CW46）基因第二内含子A→G多态性位点和三磷酸腺苷结合盒转运子A1（ABCA1）基因第六外显子G→A（R219K）多态性位点与散发性阿尔茨海默病（SAD）易感性的关系。方法采用病例-对照研究方法,利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RVLV）技术对168例SAD患者和215名正常对照的CYP46和ABCA1基因多态性进行检测,比较不同基因型与阿尔茨海默病（AD）发病风险之间的关系。结果CYP46基因第二内含子A→G多态性等位基因频率和基因型分布在SAD组和正常对照组差异无统计学意义。ABCA1基因第六外显子G→A多态性的基因型分布在两组之间差异有统计学意义（x^2=8．230,P=0．016）,AD组携带A等位基因（G／A＋A／A基因型）的频率明显低于对照组（61．3％vs73．5％,x^2=6．444,P=0．011）。Logistic回归分析表明携带A等位基因者（G／A＋A／A基因型）比携带GG基因型者AD发病风险低43％（校正后OR=0．57,95％CI=0．36～0．91,P=0．019）,而从纯合子比携带GG基因型者AD发病风险低60％（校正后OR=O．40,95％CI=0．21～0．77,P=0．006）。结论CYP46第二内含子A→G多态性可能与AD发病无关;而ABCA1基因第六外显子G→A多态性与SAD相关,携带A等位基因或从基因型对SAD发病可能有一定的保护作用。     

头颈部鳞癌微卫生多态标记的分析

目的 探讨中国人头颈部鳞状细胞癌（SCCHN）多染色体上等位基因的杂合性丢失（LOH）和微卫星不稳定（MI）的频率。方法 采用聚合酶链反应结合二核苷酸酸的重复序列多态性方法,选取6对染色体（3p,4q,7q,9p,17p和18q）上18个微卫星位点对30例SCCHN手术配对组织进行分析。结果 30例SCCHN组织中有12例（40％）组织至少有一个微卫生位点发生LOH,多数位点LOH的频率谱普遍比已报道的文献低。有7个位点（D7S480、D7S522、D9S162、D9S168、D9S304、D9S171和D17S520）具有统计学意义（P＜0．05）,然而这些位点的LOH与肿瘤病理学类型、肿瘤大小及转移性无显著相关性。此外,MI仅在4例患者中发现,没有1例患者符合MI的判定标准,即需两个或两个以上的微卫星多态位点的异常。结论 主要发生在D7S480、D7S522、D9S162、D9S168、D9S304、D9S171和D17S520位点的LOH可能存在与部分SCCHN有关的潜在的肿瘤抑制基因,而微卫星不稳定性与SCCHN发生的关系不大。     

精神分裂症与多巴胺D4基因和5-羟色胺2A受体基因的关联分析

目的探讨湖南地区汉族人群多巴胺D4受体（DRD4）基因和5-羟色胺2A（5-HT2A）受体基因与精神分裂症遗传易感性的关系及其相互作用对精神分裂症的影响。方法81例精神分裂症患者单一用氯氮平治疗6—8周，利用阳性与阴性症状量表（PANSS）评定氯氮平的疗效，并根据量表的减分率将患者分为有效和无效两组。采用聚合酶链式反应（PCR）及限制性片段长度多态性（RFLP）技术检测患者组和对照组DRIM基因48bp可变串联重复（VNTR）多态性及5-HT2A受体基因T102C多态性的基因型及等位基因的频率。结果有效组患者DRIM＊3／5基因型（DRIM＊3／5）频率（40．3％）明显高于对照组（23．9％）。DRIM＊3等位基因携带者中，精神分裂症5-HT2A受体基因的A2等位基因频率（50．0％）显著高于对照组（30．0％）；非DRD4＊5／5携带者中，精神分裂症5-HT2A受体基因的A2／A2基因型（22．0％）及A2等位基因频率（48．8％）显著高于对照组（5．0％；32．5％）。结论DRD4基因48bpVNTR多态性可能与精神分裂症的某些亚型（对氯氮平有效者）遗传易感性相关。DRD4基因和5-HT2A受体基因可能存在交互作用，DRD4＊非5／5基因型及携带DRIM＊3等位基因者可能影响5-HT2A受体基因A2等位基因及A2／A2基因型与精神分裂症关系。     

乙醇依赖综合征与ADH2、CYP4502E1基因多态性的相关研究

目的对云南汉族酒依赖综合征与ADH2、CYP4502E1基因多态性进行相关性研究;方法采用PCR—RFLP方法,对来自云南地区的44例乙醇依赖综合征患者以及与其配比的30例对照个体的ADH2基因第3外显子处G143A单核苷酸多态位点等位基因频率和基因型频率、CYP2E1基因5’端非编码区的RsaL／PstI酶切位点多态性等位基因频率和基因型频率以及是否与乙醇依赖综合征相关进行分析。结果（1）在患者组ADH2基因3种基因型ADH2^＊1／^＊1、ADH2^＊1／^＊2、ADH2^＊2／^＊2分别为36％、43％、21％,患者组和对照组相比较无显著差异（P〉0．05）;等位基因ADH2^＊1和ADH2^＊2在患者组中的基因频率为0．58和0．42,患者组和对照组相比较分布有差异（P〈0．05）,患者组ADH2^＊2等位基因频率降低;（2）CYP2E1基因在患者组中A、B型基因分布为59％、41％,患者组和健康对照组两种基因型的分布有差异（P〈0．05）,B型基因在乙醇依赖组升高;等位基因C1和C2在患者组中的频率为0．80和0．20,患者组和对照组两种等位基因分布有差异（P〈0．05）,患者组C2等位基因频率升高。结论CYP2E1基因多态性与乙醇依赖综合征发生有关,ADH2^＊2等位基因对于乙醇依赖综合征发病有保护作用,而C2等位基因在乙醇依赖综合征的发生中起一定的作用。     

微卫星vWA和D5S818与精神分裂症的多态性分析

目的：探讨微卫星vWA和D5 S818的多态性与精神分裂症有关的易感基因区域。方法对57例精神分裂症患者（精神分裂症组）和123名随机人群（对照组）采用PE Profiler plus系统进行PCR复合扩增,然后用ABI公司的310型基因分析仪自动进行电泳分离和基因检测。结果精神分裂症组的vWA-14的检出率为21．9％,对照组检出率为33．3％,两者之间差异有显著性意义（P＜0．05）;D5S818位点的各等位基因频率的检出率两组之间差异无显著性意义（ P＞0．05）。经吻合度检验,2个微卫星各等位基因频率的分布,均符合Hardy-Weinberg平衡。结论 vWA-14位点与精神分裂症有明显关联,提示vWA-14可能与精神分裂症某种抵抗基因连锁,表明在第12号染色体上存在与精神分裂症相关的基因。     

贵阳地区224例哮喘儿童 IL-17 A-152 G/A 位点基因多态性及与哮喘易感性的研究

目的：探讨白细胞介素-17A（IL-17A）-152G/A位点单核苷酸多态性（SNP）在贵阳地区支气管哮喘儿童的分布特征。方法：选择224例支气管哮喘患儿作为哮喘组,对照组为同期150例健康体检儿童,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性（ PCR-RFLP）方法检测两组IL-17A-152G/A位点单核苷酸多态性,分析两组基因型、等位基因频率及其与哮喘易感性的关系,采用χ2检验分析基因型及等位基因频率。结果：IL-17A基因-152G/A位点 AA、AG、GG 3种基因型频率在哮喘组中分别为21.4％、53.6％、25.0％,对照组中分别为11.3％、54.7％、34.0％,该位点在哮喘组与对照组间基因型频率及等位基因频率分布差异均有统计学意义（χ2=7.832,P＜0.05;χ2=6.635,P＜0.05）,等位基因A与哮喘相关。结论：IL-17A基因-152G/A位点多态性可能是贵阳地区儿童支气管哮喘的候选基因,AA纯合子基因型可能与儿童支气管哮喘发病相关。     

二氢脂酰胺琥珀酰转移酶基因型与Alzheimer病遗传易感性的关系

目的 探讨二氢酰胺琥珀酰转移酶（DLST）基因13号内含子A19117G和14号外显子C191835T位点基因多态性与散发性Alhzeimer病（SAD）遗传易感性的关系。方法 应用聚合酶链反应－限制性片段长度多态性（PCR－RFLP）方法检测了105例SAD患者和109名正常老年人的DLST基因多态性分布特征。结果 SAD组AC等位基因频率、AC／AC、AT／AT单倍体基因型频率低于对照组。SAD组分别为13％、3％、10％,对照组分别为17％、9％、17％;SAD组GC等位基因频率、GC／GC单倍体基因型频率高于对照组。SAD组为48％、30％,对照组为43％、24％,但2组差异无显著意义（P＞0．05）。SAD组AT／AC单倍体基因型频率高于对照组：SAD组为21％,对照组为10％,2组差异有显著意义（P≤0．05）,相对危险性为2．36。结论 携带DDLST基因AT／AC单倍体基因型的个体较非携带者患SAD的风险增高2．36倍。     

广东人群MSX1编码区(G267C和P278S)突变与非综合征性唇腭裂相关性研究

目的 探讨MSX1基因编码区突变G267C和P278S与广东人群非综合征性唇腭裂(NSCL/P)发病的相关性.方法 收集广东籍NSCL/P患儿100名及健康对照者91名的外周血,提取基因组DNA,应用基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)对MSX1基因编码区G267C和P278S突变进行研究...     

精神分裂症患者染色体D6S296等微卫星标志的多态性分析

目的　探讨人类第 6号染色体上与精神分裂症有关的易感基因位点。方法　研究对象为上海地区 1 78例精神分裂症患者 (其中 82例为病程在 1 0年以上的慢性精神分裂症患者 ) ,以 88名健康人为正常对照。应用扩增片段长度多态性技术 (AFLP) ,观察D6S470、D6S2 74、D6S2 96和D9S1 75等 4个微卫星标志多态性的分布。结果　精神分裂症患者和健康人D6S470、D6S2 74、D6S2 96和D9S1 75微卫星标志上各等位基因频率的分布均符合Hardy Weinberg平衡。慢性精神分裂症组患者D6S2 96的 2 64bp等位基因频率为 0 .1 688,而健康人组为 0 .0 390 ,差异有非常显著意义 (χ2 =1 7.68,P<0 .0 0 1 ) ;其他微卫星标志的各等位基因频率分布在各组之间的差异无显著意义。D6S2 96的 2 64bp等位基因与慢性精神分裂症间存在强烈关联 (RR =8.30 ,χ2 =1 3 .91 ,υ=1 ,P <0 .0 0 1 )。结论　人类 6号染色体上D6S2 96微卫星标志区域可能存在精神分裂症的易感基因     

FGFR1,FGF10,FGF18单核苷酸多态性与非综合征性唇(腭)裂的相关性

Objective:To explore the relationship between the polymorphisms in gene FGFR1, FGF10, FGFI8 and the nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate (NS CLP) in Chinese population. Methods: Genomic DNA was isolated from peripheral lymphocytes of 75 patients with NS CLP and their parents and 75 unimpaired healthy children. The polymorphisms in FGFRI gene rs13317, p. E467K, p. M3691 and p. S393S, FGF10 gene rs1448037 and FGFI8 gene rs4043716 were detected by applying three-dimensional (3-D) polyacrylamide gel microarray technology. The data were performed using statis-tical analysis : the genotype frequenc+ y and allele frequency between patients with NSCL/P and control subjects were performed. Haplotype relative risk (HRR) , family based association test (FBAT) , and transmission disequilibrium test (TDT) in nuclear family were performed. Results: There were no poly-morphism in FGFR1 gene p. E467K, p. M369I and p. $393S site, the corresponding base was all G. The polymorphisms of rs13317 and rs1448037 were detected and their genotype frequency and allele frequen-cy showed no significant difference between 75 patients with NSCL/P and 75 normal children. TDT, HRR and FBAT were also no significant differences. The genotype frequency of gene FGF18 rs4043716 showed significant difference, but allele frequency were no significant difference. TDT, HRR and FBAT were also no significant difference. Conclusion: Our studies suggest an association between gene FGF18 rs4043716 and the NS CLP in Chinese population, and no association among gene FGFR1 rs13317, p. FA67K, p. M3691, p. S393S and gene FGF10 rs1448037.     

BHMT gene polymorphisms as risk factors for cleft lip and cleft palate in a Chinese population

Objective Convincing evidence suggests a link between increased risk of nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL/P) and low intake of folic acid by the mother during pregnancy. The present study was designed to explore if genetic variation in the betaine‐homocysteine methyltransferase (BHMT) gene contributes to NSCL/P. Methods DNA was obtained from 166 individuals with NSCL/P and 285 healthy subjects. Three known single nucleotide polymorphisms (SNPs) present in the BHMT gene (rs651852, rs3...     

甘肃省汉族、回族人非综合征唇腭裂与转化生长因子-α基因多态性的相关性对比

目的 研究甘肃省汉族和回族人非综合征唇腭裂与转化生长因子-α基因多态性的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性方法,对50例汉族非综合征唇腭裂患者与50例正常汉族人,50例回族非综合征唇腭裂患者与50例回族正常人进行TGF-α基因检测分析.结果 汉族、回族人非综合征唇腭裂患者的等位基因频率较正常对照组...     

载脂蛋白H基因多态性与脑卒中的相关性研究

目的　探讨载脂蛋白H(apoH)基因多态性与长沙地区汉族人脑卒中的关系。方法　采用PCR 单链构象多态技术和DNA序列测定法检测长沙地区汉族 2 6 0例脑卒中患者、2 0个脑卒中家系成员和 10 0例健康对照者的apoH基因 3号外显子的多态性。结果　长沙地区汉族人apoH基因 3号外显子存在G341A(Ser88Asn)多态 ,在脑出血 (CH)组 ,G341A (Ser88Asn)多态A等位基因频率(0 12 7)明显高于对照组 (0 0 5 5 ) (P <0 0 5 )。有高血压的CH组A等位基因频率 (0 15 1)明显高于对照组 (0 0 5 5 )及无高血压的CH组 (0 0 78) (P <0 0 5 ) ,而后两者比较无统计学意义 (P >0 0 5 )。有家族史的CH患者A等位基因频率 (0 15 0 )明显高于对照组 (0 0 5 5 ) (P <0 0 5 ) ,以CH为主的家系中患病组与未患病组A等位基因 (0 16 0 ,0 12 8)频率均明显高于对照组 (0 0 5 5 ) (P <0 0 5 )。apoH基因G341A(Ser88Asn)多态性与脑梗死无关。结论　G341A(Ser88Asn)多态A等位基因可能是长沙地区汉族人CH ,特别是高血压性CH及有家族史的CH患者的遗传危险因素。     

中国唇腭裂患者Sonic hedgehog信号通路相关单核苷酸多态性的分析

目的 探讨Sonic hedgehog(Shh)信号通路相关的单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism, SNP)与非综合征型唇腭裂(non-syndromic cleft lip and/or palate, NSCL/P) 之间的关联,并对唇腭裂疾病的致病风险因素进行探索。方法 收集197例个体的外周血(NSCL/P患者100例,健康对照97例),基于国际人类基因组单体型图计划中中国北京汉族人口数据,使用Haploview软件进行单倍体型分析和标签SNP选择。针对Shh 信号通路中的4个候选基因SHH、PTCH1、SMO和GLI2共选择了27个SNP。使用Sequenom质谱技术检测27个SNP在4个Shh信号通路中候选基因的基因型,并进行分析。结果 所选择的SNP基本涵盖了候选基因的潜在功能性SNP,其最小等位基因频率(minor allele frequency,MAF)>0.05:GLI2 73.5%, PTCH1 91.0%, SMO 100.0%, SHH 75.0%。发现位于SMO基因的SNP(rs12674259)和位于PTCH1基因的SNP(rs2066836)的基因型频率在NSCL/P病例组和对照组之间的差异有统计学意义。同时在4个候选基因所在的3条染色体(第2、7、9号染色体)中均发现了连锁不平衡,但在连锁不平衡单倍体型分析中,病例组和对照组之间的差异无统计学意义。结论 提示Shh信号通路参与NSCL/P的发生,其信号通路中关键基因的某些特殊SNP位点与唇腭裂相关,为NSCL/P的病因研究提供了新的探索方向,可能为NSCL/P的早期筛查与风险预测提供帮助。     

Association of Single Nucleotide Polymorphisms in IRF6 and TGFA Genes With Nonsyndromic Cleft Lip With Or Without Cleft Palate in Chinese Patients

Objective:Nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate(NSCL/P) is a common birth defect with unclear etiology. Both genetic and environmental factors may contribute to NSCL/P. Many genes have been identified as candidate genes associated with this disease. Interferon regulatory factor 6(IRF6) gene and transforming growth factor-a(TGFA) gene seem to be crucial in the predisposition of NSCL/P. Here we evaluated some single nucleotide polymorphisms(SNPs) loci of TGFA and IRF6 genes in Chinese nuclear fa...     

MTHFR基因-677C/T多态性与皖北地区人群NSCL/P的相关性研究

目的探讨MTHFR基因677C/T多态性与皖北地区人群非综合征性唇腭裂(NSCL/P)发生的关系。方法通过基因多态性的研究,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,以74例非NSCL/P患者为对照,配对研究74例NSCL/P患者的MTHFR基因677C/T多态性,分析记录基因型和等位基因频率,用病例-对照研究方法进行遗传统计学分析。结果①在MTHFR-677位点,病例组与对照组人群的基因型和等位基因分布差异有统计学意义(P<0.05)。杂合突变型(CT)和纯和突变型(TT)的NSCL/P发病风险分别是野生型(CC)的3.66倍和3.02倍,P<0.05,差异有统计学意义。②病例组NSCL/P不同类型与对照组的基因型和等位基因频数比较,结果在MTHFR-677位点,单纯唇裂组与对照组的基因型比较,P<0.05,差异有统计学意义;单纯唇裂组与对照组的等位基因频数比较,P<0.05,差异有统计学意义。其余各类型与对照组相比较差异均无统计学意义,P>0.05。③病例组NSCL/P中有家族史组与无家族史组基因型和等位基因频数的比较,结果在MTHFR-677C/T位点处,P>0.05,差异无统计学意义。结论皖北地区人群NSCL/P的发病与MTHFR-677C/T位点处的单核苷酸多态有关。     

新疆维吾尔族干扰素调节因子6基因单核苷酸多态性与非综合征性唇腭裂相关性研究

目的：探讨新疆地区维吾尔族人群干扰素调节因子6（IRF6）基因 rs 7545538、rs7545542、rs2235373位点单核苷酸多态性与非综合征性唇腭裂的相关性。方法选择新疆地区世居维吾尔族非综合征性唇腭裂（NSCL/P）患者100例,对照组为60例因上呼吸道感染而住院的新疆籍维吾尔族儿童,抽取其静脉血,用新一代测序方法对目标区域测序,进行遗传学分析。结果在新疆维吾尔族人群中,rs7545538位点 CC 基因型（P ＝0．037）和 C等位基因（P ＝0．007）、rs7545542位点 C 等位基因（P ＝0．044）和 rs2235373位点 G 等位基因（P ＝0．049）与NSCL/P 有关联;对以上3个 SNPs 进行连锁不平衡分析,未能证实存在连锁不平衡（r 2＜0．8）。结论新疆维吾尔族人群 IRF6基因 rs7545538、rs7545542、rs2235373位点 SNPs 可能与新疆维吾尔族人群唇腭裂发病可能存在相关性。