乙型肝炎病毒前C区/BCP区突变及其临床意义

目的探讨利用基因芯片技术检测乙型肝炎病毒(HBV)前C区/BCP区基因突变方法的临床价值及前C区/BCP区基因突变的临床意义。方法应用基因芯片技术检测95例慢性乙型肝炎患者的HBV前C区G1896A(nt1896G→A)、A1814C(nt1814A→C)及HBV C基因启动子(BCP)T1762A、G1764A(nt1762A→T、nt1764G→A)四位点突变,同时检测血清HBV DNA含量及ALT、AST水平。结果95份血清标本中,有91份分别检测到了HBV前C区/BCP区基因突变,阳性率95.8%,其中61896A突变33例(36.3%),A1762T G1764A联合突变64例(70.3%),G1896A A1762T G1764A联合突变22例(24.2%),未检测到A1814C突变毒株。抗-HBe阳性的慢性乙肝患者HBV前C区/BCP区突变率较HBeAg阳性的患者明显增高。G1896A突变后血清ALT水平与未变异组比较有显著性差异(P<0.05),而其他各组的肝功能无显著变化。G1896A A1762T G1764A联合突变后,血清HBV DNA水平较未变异组降低(P<0.05),其他各组间则无显著变化。结论应用基因芯片法测定HBV特定变异位点,可一次同时检测多个突变位点,具有一定的临床应用价值。HBV前C区/BCP区突变对血清HBVDNA水平和肝功能有一定的影响。     

慢性HBV感染患者bcp/pc区点突变模式、pres区缺失及其临床意义

目的阐明HBV(hepatitis B virus,HBV)感染患者不同临床阶段bcp/pc(basic core promoter,BCP/precore,PC)点突变模式及pres区缺失突变规律,并探讨其临床意义。方法慢性HBV感染患者180例,其中,无症状HBV携带者13例,慢性乙型肝炎者75例,HBV相关肝硬化及肝癌分别为62、30例。Qiagen法提取血清HBV-DNA,常规PCR扩增目的基因,纯化PCR产物ABI377DNA自动测序仪直接双向测序。直接测序失败者,回收目的 DNA与PMD-18T载体连接,克隆质粒双向测序。DNAStar软件包的SeqMan软件进行生物信息分析。结果 Bcp/pc区点突变包括nt1753、nt1762、nt1764、nt1776、nt1803、nt1846、nt1896。HBV携带者、慢性乙型肝炎、HBV相关肝硬化及肝癌患者nt 1762(nt 1764)点突变率分别为7.7%、68.0%、72.7%(68.0%)及90.9%(81.8%),肝癌患者G1896A突变频率占54.6%。A1762T+G1764A联合突变占36%;A1762T、G1764A、G1896A联合突变占11%;T1753A/C、A1762T、G1764A、G1896A发生率为7%。克隆测序显示,肝硬化及肝癌患者bcp区起始点A1727G点突变率分别为72%、63%。HBeAg阴性患者存在更多的基因变异(P=0.022),G1776A和G1896A突变是HBeAg阴性的独立预测因素(P<0.05)。Bcp区点突变与HBeAg阴性无明显关系。肝硬化和肝癌患者pres基因缺失突变频率最高,肝癌及肝硬化患者pres1、pres2及pres1+s2缺失频率分别为7.1%、71.4%、7.1%及41.2%、58.8%、29.4%(P<0.05)。结论 A1727G、A1762T、G1764A及A1762T/G1764A联合突变、pres缺失在HBV相关肝硬化及肝癌患者多见,可能是肝脏疾病进展的危险因素,G1776A和G1896A突变是HBeAg阴性的独立预测因素。Bcp/pc点突变及pres区缺失可能为肝癌发生的早期预测因素,值得进一步研究。     

鲁南地区乙肝病毒基因变异和基因型与肝癌的相关性

目的 研究鲁南地区肝细胞癌(HCC)患者乙型肝炎病毒(HBV)基因型与基本C区启动子(BCP)基因区A1762T/G1764A双位点变异之间的关系,探讨其相关性.方法 选择37例HCC患者作为研究组,37例慢性乙型肝炎(CHB)患者作为对照组,采用实时荧光定量PCR法及PCR微板核酸杂交ELLSA技术进行HBV基因定量、分型检测,采用HBV基因多态性芯片检测BCP区A1762T/G1764A双位点变异.结果 37例HCC患者中,HBeAg阳性的患者仅6例, HBeAg阴性者共31例;CHB患者中,HBeAg阳性的患者28例, HBeAg阴性者共9例. HCC中, HBV以C基因型为主,占70.2%,而CHB以B基因型为主,占67.6%.BCP双突变率在HCC为64.9%,在CHB中为27.0%.其中HCC中发生BCP双突变HBV多见于 C基因型占87.5%, 而CHB中发生BCP双突变HBV C基因型占40.0%.结论 鲁南地区肝细胞癌的发生与HBV DNA BCP区A1762T/G1764A双位点变异有关,并且HBV C基因型可能是HBV相关肝癌的主要基因型.     

HBV多基因位点变异与肝细胞癌相关性研究

目的探讨乙型肝炎病毒前C区和C基因启动子基因变异与肝细胞癌发生的关系。方法采用实时荧光PCR检测29例慢性乙型肝炎（CHB）,27例乙型肝炎肝硬化（LC）,26例HBV相关肝细胞癌（HCC）患者血清HBV前C区G1896A和BCP区A1762T／G1764A的变异情况。结果HCC组和LC组前c区G1896A和BCP区A1762T／G1764A变异率均显著高于CHB组（P≤0．005）,HCC组和LC组间无显著差异（P〉0．05）。结论乙型肝炎病毒C基因启动子和前c区基因变异与肝细胞癌、肝硬化的发生密切相关。     

不良结局家族聚集性乙型肝炎病毒感染者HBV基因型/亚型及前C/C启动子区变异特征分析

目的:分析不良结局家族聚集性乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染者HBV基因亚型和前C/C启动子(Corepromoter,CP)区变异特征。方法:选择101名不良结局家族聚集性HBV感染者为实验组,92名无明显家族聚集性的慢性HBV感染者作对照,用巢氏PCR及直接测序法检测基因亚型及前C/CP区变异位点,比较实验组和对照组的不同基因亚型构成比率及前C/CP区核苷酸变异频率,分析实验组HBV基因亚型及热点变异与临床疾病谱的关系。结果:在实验组和对照组中,Ba均为优势基因亚型,其次为C2、C1亚型,仅在实验组检测出1例Bj亚型。C基因型在实验组中构成比率显著高于对照组(P<0.01);实验组83.3%(5/6)感染C1基因亚型的患者发生肝硬化和(或)肝癌(Liver cirrhosis/hepatocellular carcinoma,LC/HCC),明显高于Ba(29.9%,P<0.01)和C2亚型(11.8%,P<0.01);各位点变异频率在2组中无明显差异(P>0.05);实验组17个位点发生变异,其中A1752、A1775、G1899位点变异在无症状HBV携带者(Asymptomatic carriers,ASC)、慢性乙型肝炎(Chronic hepatitisB,CHB)、慢性重型乙型肝炎(Chronic severe hepatitis B,CSHB)及LC/HCC组间分布差异均无统计学意义(P>0.05);随着病情加重,T1753、A1762、G1764、A1846、G1896位点变异率在ASC、CHB、CSHB和LC/HCC组中呈逐渐增加的趋势。LC/HCC组A1762T/G1764A双突变率及A1762T/G1764A/1896A三联变异率显著高于ASC组(P<0.01)。结论:本地区,不良结局家族聚集性HBV感染者C基因型患者构成比率增加,C1基因亚型及前C/CP区多个位点变异可能与慢性HBV感染者不良结局相关。     

乙型肝炎病毒X基因BCP双变异和CP聚集变异及其临床意义

目的 探讨广州市番禺区133例乙型肝炎患者血清中HBV X基因区BCP双变异(A1762T/G1764A)和CP聚集变异情况及其临床意义.方法 丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天门冬氨酸氨基转移酶(AST)采用速率法;ELISA和PCR法分别检测HBeAg和HBV DNA拷贝数;并以PCR方法扩增HBV X基因,再进行测序,最后将结果分成四组(BCP双变异、CP聚集变异、BCP双变异合并CP聚集变异,无BCP双变异和CP聚集变异)进行综合比较分析.结果 (1) HBeAg阳性在BCP双变异组中检出率最低(P<0.05);(2)四组HBV DNA拷贝数两两比较差异均无统计学意义(P>0.05);BCP双变异、CP聚集变异HBeAg阳性组的HBV DNA拷贝数均高于HBeAg阴性组(P<0.05);(3)四组ALT、AST异常例数检出率差异均无统计学意义(P>0.05).结论 乙型肝炎患者常规的相关指标检测对病情的评估尚不全面,在条件许可情况下,对HBV X基因区的BCP双变异(A1762T/G1764A)和CP聚集变异的常见突变位点进行检测,并结合其他临床资料进行综合分析可做出较正确的诊断.     

乙型肝炎病毒家族聚集性感染者基因型分布及基础核心启动子和C区变异的研究

目的 探讨家族聚集性乙肝感染者HBV基因型和基础核心启动子（BCP）、前C/C区变异的特征,及其临床意义。方法 选择家族聚集性慢性乙型肝炎（CHB）98例（来自38个家族）作研究组和非家族聚集性CHB 110例作对照组;应用型特异性引物巢式PCR法检测HBV感染者的HBV基因型,PCR测定BCP、前C/C区核苷酸序列,并且检测患者血清丙氨酸氨基转移酶（ALT）、总胆红素（TBIL）、白蛋白（ALB）、乙型肝炎两对半和HBV-DNA载量等临床指标。结果 家族性乙肝母亲和（或）父亲与子女感染组以C基因型为主（52.9%）,家族水平成员感染组和对照组以B基因型为主（分别为73.3%、67.3%）,仅检测到少数B/C和B/D混合型（共8.7%）,并且乙肝家族中母亲和（或）父亲与子女感染组C基因型所占百分比高于家族水平成员感染组及非乙肝家族（P＜0.05）。家族内HBV聚集感染的基因型基本相同,不一致者为混合型。HBV C基因型的家族CHB患者比非乙肝家族具有更高的HBV-DNA载量,更高的BCP区A1762T/G1764A双突变率（P＜0.05）。结论 家族聚集性CHB患者HBV基因型可能与传播途径有关,C基因型更易发生垂直传播。家族聚集性HBV C基因型感染的患者更易发生BCP区A1762T/G1764A双突变,HBV C基因型感染并且BCP区A1762T/G1764A双突变可能是家族聚集感染者病情进展的危险因素。     

BCP区和前C区突变检测在慢加急性肝衰竭中的临床价值

目的 探讨检测乙型肝炎病毒（hepatitis B virus,HBV）相关慢加急性肝衰竭（acute–on–chronic liver failure,ACLF）患者基本核心启动子区（basic core promoter,BCP）A1762T/G1764A和前C区G1896A突变的临床价值。方法 选取2010年9月至2020年10月中国科学院大学宁波华美医院收治的403例慢性HBV感染患者,根据患者是否发生ACLF将其分为慢性乙型肝炎（chronic hepititis B,CHB）组（369例）和ACLF组（34例）,并根据预后将ACLF组患者再分为缓解组和恶化组。采用多因素Logistic回归分析筛选发生ACLF的独立影响因素,并构建联合预测模型。绘制受试者操作特征曲线以评价该模型的诊断价值。结果 ACLF组患者的年龄、总胆红素（total bilirubin,TBiL）、谷草转氨酶、碱性磷酸酶、甲胎蛋白、凝血酶原时间均显著高于CHB组（P<0.05）,乙型肝炎e抗原阳性率、白蛋白（albumin,ALB）均显著低于CHB组（P<0.05）。ACLF组和CHB组患者A1762T/G1764A突变率比较差异无统计学意义（P>0.05）,ACLF组患者G1896A突变率显著高于CHB患者（P<0.05）。多因素Logistic回归分析结果显示,年龄、TBiL、ALB、G1896A突变均是发生ACLF的独立影响因素（P<0.05）。以上4项指标联合诊断ACLF的曲线下面积为0.950,敏感度和特异性分别为88.24%和93.22%;缓解组和恶化组患者的A1762T/G1764A、G1896A突变率比较差异均无统计学意义（P>0.05）。结论 HBV相关ACLF患者的前C区G1896A突变率显著增高是ACLF发病的独立危险因素,而BCP区A1762T/G1764A突变与ACLF发病的关系可能并不紧密。     

鲁南地区HBV基因型和HBV核心启动子双点突变与肝硬化、肝癌的关系

目的 研究鲁南地区肝细胞癌(HCC)、肝硬化(LC)患者与乙型肝炎病毒(HBV)基因型及基本C区启动子(BCP)基因区A1762T/G1764A双位点变异之间的关系,探讨其相关性.方法 按慢性HBV感染者111例的不同临床分型,对其中HCC、LC和慢性乙型肝炎(CHB)患者各37例,采用实时荧光定量PCR法及PCR微板核酸杂交ELLSA技术进行HBV基因定量、分型检测;采用HBV基因多态性芯片检测BCP区A1762T/G1764A双位点变异;对不同性别、年龄、病毒基因型分布、临床分型患者进行HBV基因分型、BCP区双突变,以及不同HBV基因型BCP双突变的比较.结果 在CHB、LC、HCC患者中,HBeAg阴性者分别为24.3％、75.7％和83.8％;HCC患者HBeAg阴性率较CHB患者明显升高(P＜0.05).男、女性别HBV均以C基因型占优势,分别为57.3％和54.5％,性别间无统计学差异(P＞0.05);年龄＜30岁组HBV以B基因型(40.3％)、C基因型(51.7％)占优势,≥30岁组以C基因型(67.2％)占优势,＜30岁组B基因型构成比高于≥30岁组(29.6％,P＜0.05);HCC、LC患者中HBV以C基因型为主,分别占73.0％和75.6％.BCP双突变率在HCC、LC分别为64.9％和56.8％;HBV C基因型多发生BCP双突变,占63.6％ (42/66).结论 鲁南地区HBV基因型以C型和B型为主,其中LC、HCC患者基因型以C型占优势,HCC患者BCP双突变率显著高于CHB患者,在慢性HBV感染者中HBV C基因型多发生BCP双突变.     

乙型肝炎病毒A1762T/G1764A变异的临床意义

目的 探讨乙肝病毒（HBV）A1762T／G1764A变异的临床意义。方法 应用基因芯片方法对115例慢性乙型肝炎患者进行HBV A1762T／G1764A变异检测,分析A1762T／G1764A变异与临床类型、HBV-DNA、HBeAg及肝纤维化血清学指标透明质酸（HA）、Ⅲ型前胶原（PⅢP）、Ⅳ型胶原（CL-Ⅳ）、层粘蛋白（LN）的关系。结果 慢性乙型肝炎轻度、中度、重度及肝炎肝硬化中A1762T／G1764A变异率分别为43％、55％、61％、89％（P〈0．05）;A1762T／G1764A变异组病人肝纤维化指标HA、PⅢP、CL-Ⅳ明显高于对照组（P〈0．05）。结论 HBV A1762T／G1764A变异与与疾病进展及肝纤维化具有相关性。     

Characterization of hepatitis B virus genotypes/subgenotypes in 1301 patients with chronic hepatitis B in North China

Background  There is still a paucity of data on hepatitis B virus (HBV) subgenotype prevalence in North China based on sequencing of large-size samples. In addition, whether HBV genotypes impact drug-resistance-associated and HBV e antigen (HBeAg)-loss-associated mutations in patients with chronic hepatitis B (CHB) is still under investigation. This study aimed to disclose clinical prevalence of HBV genotypes/subgenotypes in North China and the clinical implications of HBV genotype classification in respect to HBeAg loss and drug-resistant occurrence.

Methods  Sera were collected from 1301 nucleos(t)ide analog-experienced CHB patients. Viral DNA was extracted and used as template for HBV genome amplification by nested PCR. DNA sequencing was performed for the analysis of HBV genotypes/subgenotypes, drug-resistance-associated mutations in polymerase gene and HBeAg-loss-associated mutations in precore/basal core promoter (BCP) regions.

Results  HBV/B, HBV/C, and HBV/D were detected in 190 (14.6%), 1096 (84.2%), and 15 (1.2%) patients, respectively. HBV/B2 (182/190), HBV/C2 (1069/1096), and HBV/D1 (12/15) were predominant subgenotypes within individual genotypes. By contrast, C2 prevalence is relatively lower in Beijing area (77.2%) than in other north areas (84.9%–87.4%). HBV/C-infected patients had an older age and a lower serum albumin level but similar HBV DNA and alanine aminotransferase (ALT) levels compared to HBV/B-infected patients. HBV/C infection had a higher incidence of lamivudine-resistant mutations rtM204I/V (44.9% vs. 30.2%, P <0.01) and BCP mutations A1762T+G1764A (65.8% vs. 40.0%, P <0.01) compared with HBV/B infection.

Conclusions  C2 is the most prevalent HBV subgenotype followed by B2 in CHB patients in North China; and HBV genotype prevalence is influenced by immigrant population. HBV/C infection is likely to have longer disease duration and severer liver functional impairment and might be more susceptible to develop lamivudine resistance compared to HBV/B infection.

     

Distribution of hepatitis B virus genotype and cancer predicting precore and basal core promoter mutations

Background

Chronic hepatitis B (CHB) infection which is associated with an increased risk of developing liver disease including cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Viral factors that may increase the risk for HCC development include HBV DNA level, genotypes, and naturally occurring mutations such as hepatitis B virus precore (PC) (G1896A) and basal core promoter (BCP) A1762T/G1764A double mutations. HBV genotypes and subgenotypes can significantly influence HBeAg seroconversion rates, viremia levels, mutational patterns that could significantly influence the heterogeneity in clinical manifestations and even response to antiviral therapy.

Method

94 CHB infected individuals with detectable serum HBV DNA levels were studied. HBsAg, HBeAg, anti-HBc IgM antibody estimations were done by ELISA. HBV DNA estimation was done. The HBV genotypes were determined by TSP-PCR and 10 samples randomly selected for DNA sequencing. PC and BCP mutations were determined by DNA sequence analysis of core region.

Result

Of 94 study participant samples with detectable serum HBV DNA levels, 75 were successfully genotyped and sequenced for BCP/PC region. 30/75 (40%) harbored PC and BCP mutations. The total Double mutations of BCP at A1762T/G1764A nucleotide positions, and PC mutation at G1896A nucleotide position were seen in 29.3% and 21.3%, respectively. All 75 isolates were subtype D using TSP-PCR. However, by sequencing 2/10 were subtype A, while 8 were subtype D.

Conclusion

Our study reinforces that D is the predominant genotype in Indian population. It reveals that Indian CHB subjects have increased prevalence of BCP & PC mutations, which possibly may lead to development of HCC.     

乙型肝炎病毒基本核心启动子T1762A1764 联合突变的临床意义

目的:研究乙型肝炎患者乙型肝炎病毒(HBV)基本核心启动子(BCP)T^1762A^1764联合突变情况及其临床意义。方法:采用聚合酶链反应(PCR)与限制性长度片段多态性分析(RFLP)相结合，检测130例乙型肝炎患者BCP区核苷酸(nt)1762碱基A→T和1764碱基G→A联合突变。结果：HBeAg( )和HBeAb( )两组患者中BCP T^1762A^1764联合突变率的不同频率分别为慢性乙型肝炎患者(Chronic hepatitis B，CHB)40．0％和85．7％，无症状携带者(Asymptomatic carrier，ASC)22．2％和65．0％，献血员为5％。BCP T^1762A^1764双点联合突变组HBV-DNA≥10^5 cps／ml检出例数81例(96．4％)，非突变组HBV-DNA≥10^5 cps／ml检出例数25例(54．3％)。结论：BCP T^1762A^1764联合突变与乙型肝炎的发生、发展以及预后有关，可能是CHB与ASC患者HBeAg(-)的原因之一，可促进乙肝病毒繁殖。对慢性乙型肝炎患者检测HBV BCP T^1762A^1764联合突变有一定的临床意义。     

A comparative study on effect of lamivudine in wild and precore mutant variety of chronic hepatitis B virus infected patients

The aim of this study is to evaluate the effectiveness of lamivudine treatment in both precore mutant and wild type of chronic hepatitis B (CHB) patients. The study was done on sixty CHB patients of both sexes seeking treatment in the Outpatient Department and admitted patients of Mymensingh Medical College Hospital. The patients were divided into two groups. Group A included chronic hepatitis B patients with raised ALT (> 80 u/l ) with HBeAg positivity, and group B included precore mutant variety of CHB patients with raised ALT (> 80 u/l) with HBeAg negativity. In Group-A, after 1 year of completion of lamivudine therapy there was 86.67% normalization of ALT, 23.33% HBeAg loss, 16.67% anti-HBeAg development and 73.33% HBV DNA loss. In Group-B, there was 76.67% normalization of ALT and 73.33% HBV DNA loss after 1 year of completion of therapy. In the present study, it was observed that lamivudine is equally effective in both wild and precore mutant variety of CHB patients. This was reflected by normalization of ALT and loss of HBV DNA. This study also shows the reappearance of HBV DNA during the later half of Lamivudine therapy which is due to YMDD mutation.     

乙肝相关疾病中乙肝病毒核心启动子区变异频率及发病风险评估

目的 检测乙肝病毒核心启动子(basic core promoter,BCP)区变异位点在乙肝相关疾病中的变异频率,评估乙肝病毒变异在终末期肝病发生中的风险。方法 收集2 093例HBV无症状携带者(asymptomatic HBsAg carrier, ASC)、慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B, CHB)、肝硬化(liver cirrhosis, LC)和肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)患者,应用测序法检测HBV位点变异;运用病例对照研究方法,以ASC组为对照,研究乙肝病毒核心启动子区的变异与乙肝相关疾病发生间的关系。应用非条件Logistic回归法分析校正年龄和性别后HBV变异在CHB、LC和HCC发生中的风险。结果 HCC组中除T1768A变异外,其余变异位点的变异频率均大于30%,而在ASC组中无变异位点的变异频率超过30%;7个变异位点在4组人群中变异频率均逐渐增高(P_trend<0.001);除T1768A位点外,其余变异在CHB、LC和HCC组中的校正比值比(adjusted odds ratio, AOR)均逐渐增加,A1762T/G1764A双突变在HCC发生中的AOR为13.91(95%CI 9.66～20.03);HBV BCP区位点累积变异频率在乙肝相关疾病进展过程逐渐递增(P_trend<0.001)。结论 随着HBV BCP区变异在HBV相关肝病进展过程中逐渐累加,终末期肝病的发病风险增加;HBV BCP区变异可作为早期预测HBV相关终末期肝病发生的潜在分子标记物。     

HBV亚基因型B和C体外重组中间体的检测

目的:检测HBV亚基因型B和C的体外重组中间体.方法:将基因型B和C序列插入载体Plenti6/V5-D-topo-X后,共转染HepG2细胞,克隆,测定转染后HBV的核酸序列,而后用软件包RDP3Beta40进行序列比对.结果:发现存在3种重组中间体,重组中间体的重组位置为1740-1838至2443-2485.R1...     

基因芯片检测慢性乙肝患者HBV-DNA变异的临床研究

目的应用新型基因芯片研究乙肝病毒多点基因变异在慢性乙肝患者中的意义，为临床诊断和治疗提供依据。方法对132例慢性乙肝患者采用DNA芯片技术，检测HBV—DNA基因6个位点的变异。结果132例慢性乙型肝炎患者均存在HBV—DNA位点的变异，其中前C区1896G—A变异率为23．5％。e抗原阳性者占4．O％（4／74）。e抗体阳性者占48．3％（28／58），后者变异株显著高于前者，此突变有助于HBV逃避免疫攻击而形成慢性感染状态；前C区1814变异率为3．8％；C区启动子1762变异率为56．1％，1764变异率为53．8％，且两种变异常同时出现，与重型肝炎、肝硬化和肝癌的发生相关；P区528变异率为9．8％，552M—I变异率38．6％，552M—V变异率为10．6％，552变异与核苷类似物耐药相关。结论HBV—DNA位点变异对于判定疾病的稳定与进展有重要作用。