中国南方汉族散发性先天性肾病综合征NPHS1基因突变1例

目的 分析中国南方汉族1例散发性先天性肾病综合征(CNS)患儿NPHS1基因突变及其特点.方法 研究对象为1例中国南方汉族CNS患儿及其父母,对照人群为50例尿液检查正常的南方汉族成年人.取所有研究对象外周静脉血3 mL,提取基因组DNA,PCR扩增NPHS1全部29个外显子及其周围的部分内含子和启动子全长序列,对PCR产物直接进行DNA序列测定.结果 在CNS患儿检测出NPHS1基因3250insG(V1084fsX1095)纯合突变,其父母分别携带3250insG杂合突变.在CNS患儿及其父母还检测出3种已报道的NPHS1基因多态性--349G＞A、3315G＞A和IVS27+45C＞T.在50例对照人群中未发现NPHS1基因3250insG变异;但检测出349G＞A、3315G＞A和IVS27+45C＞T基因多态性.结论 首次在1例中国南方汉族CNS患儿发现了NPHS1基因纯合突变--3250insG(V1084fsX1095),表明中国南方汉族散发性CNS患儿存在NPHS1基因突变,提示对中国南方汉族散发性CNS患儿需进行NPHS1基因突变分析.     

生长激素受体基因突变与非生长激素缺乏性矮身材的相关研究

目的了解生长激素受体（GHR）基因突变与非生长激素缺乏性矮小的相关性,以及GHR基因突变患儿的临床特点。方法（1）选择47例（男33例,女14例,年龄2—16岁）非生长激素缺乏而又显著矮小的患儿作为研究对象;80例身高正常的儿童（男49例,女31例,年龄1—17岁）作为对照组。（2）应用PCR-SSCP和基因测序技术检测GHR突变。（3）通过家系成员和正常对照人群的基因分析以及氨基酸同源序列分析等,推测突变基因的性质。结果（1）在47例矮小患儿中有5例、4种不同的GHR基因突变：H56R、G148E、IVS6-30,-31CA〉TG和IVS8＋10G〉C。5例患儿均为杂合突变,杂合突变个体的检出频率为10．6％（5／47）。（2）对照组的基因分析显示这些突变非多态性改变,初步认为H56R和G148E突变可能对蛋白功能产生影响。（3）确定了1种多态性突变：G168G（GGA〉GGG）。该位点基因频率的分布在矮小儿童组和正常对照组之间的差异无统计学意义,但与西方白种人之间的差异有统计学意义。提示该突变可能是单核苷酸多态性改变,与身高没有相关关系。但该位点的等位基因存在人种的差异。结论非生长激素缺乏性矮身材患儿存在GHR基因杂合突变。     

汉族慢性肾衰竭儿童6例NPHS2和WT1基因遗传学变异

目的 分析汉族慢性肾衰竭(CRF)儿童NPHS2和WT1基因遗传学变异及其特点.方法 研究对象为6例汉族CRF儿童和50例尿检正常的汉族成年人.分别取其外周静脉血3 mL,提取基因组DNA.应用PCR方法 扩增NPHS2和WT1基因的全部8个外显子及其周围的部分内含子.通过DNA直接测序法和限制性片段长度多态性/PCR分析法对NPHS2和WT1基因进行遗传学变异分析.结果 未发现NPHS2和WT1基因致病突变,但检测到2个NPHS2基因多态性(102G>A和954T>C)和4个WT1基因变异(5′-UTR-7G>T、126C>T、IVS5-9T>C和903A>G).NPHS2基因多态性(102G>A)在6例CRF儿童与对照人群中的基因型频率和等位基因频率比较均无显著性差异(Pa>0.05).3个WT1基因变异(5′-UTR-7G>T、126C>T和903A>G)在100条正常染色体中也有检出,其在6例CRF儿童与对照人群中的基因型频率和等位基因频率比较均无显著性差异(Pa>0.05).1个WT1基因变异(IVS5-9T>C)在1例患儿及其父亲(尿检正常)中检出,为杂合变异,而在100条正常染色体中未检出.结论 IVS5-9T>C为新发现的WT1基因变异, NPHS2和WT1基因突变不是本研究6例汉族CRF儿童的主要致病原因.     

中国人先天性肾病综合征NPHS1基因突变

目的分析并确定一个中国先天性肾病综合征（CNS）家系NPHSl基因突变及特征。方法对先证者及其家系成员采用聚合酶链反应（PCR）和DNA直接测序方法进行NPHSl基因突变检测,确定基因突变的位点。同时应用限制性内切酶酶切分析的方法,分析先证者及其家系成员和对照人群的基因组DNA,确定突变特征。结果在本家系的先证者发现同时存在NPHS1的G928A（D310N）、1893～1900del8（CGAAACCG）和G2869C（V957L）的3个杂合突变。具有相同表型的姐姐（Ⅲ：11）与先证者的测序结果完全一致,而在表型正常的先证者的同父异母的大姐及对照样本均未发现这些突变。患儿母亲尿检正常,基因检测显示仅有第8外显子G928A突变;患儿父亲尿检也正常,基因检测显示仅存在第14外显子的1893～1900del 8和第21外显子的G2869C突变,没有第8外显子G928A突变。同时还在先证者发现了4种碱基变异：E117K（rs3814995）、S1105S（rs2071327）、IVS27＋45c〉t和IVS8＋68a〉g,经比对前3种均为单核苷酸多态性,位于内含子内的变异（IVS8＋68a〉g）意义有待进一步研究。结论首次发现中国人CNS存在NPHS1基因突变,并证实致病突变为国际首次报道的3个杂合突变。     

中国南方汉族人3个家族性激素耐药型肾病综合征家系CD2AP和NPHS1基因突变分析

目的 分析中国南方汉族人家族性激素耐药型肾病综合征(SRNS)家系CD2AP和NPHS1基因突变及其特点.方法 研究对象为A、B、C 3个南方汉族SRNS家系先证者及其父母,A、B 2个家系先证者的姐姐和50例尿检正常的南方汉族成年人.取所有研究对象外周静脉血,提取基因组DNA,PCR方法扩增CD2AP基因全部18个外显子和NPHS1基因全部29个外显子及其周围的部分内含子,对PCR产物直接进行DNA序列测定.结果 在3个SRNS家系先证者未检测出CD2AP基因致病突变.在B家系的先证者检测出NPHS1基因2398C＞T(R800C)杂合突变,先证者父亲亦携带此杂合突变,但先证者母亲及姐姐未发现该突变.在50例对照人群中未发现2398C＞T突变.此外,在3个先证者及50例对照人群还检测出9种已报道的CD2AP基因多态性--IVS4-25G＞A、IVS8-95G＞A、IVS10+36C＞A、IVS10-153A＞T、IVS10-110A＞G、IVS11+82T＞C、1204C＞T、IVS16+24G＞A、IVS17-66T＞C和4种已报道的NPHS1基因多态性--349G＞A、IVS24+36C＞T、3315G＞A和IVS27+45C＞T.结论 在1个中国南方汉族SRNS家系先证者检测出NPHS1基因突变--2398C＞T,证实中国南方汉族人家族性SRNS儿童存在NPHS1基因突变,提示对其需进行NPHS1基因突变分析.     

RT-PCR-DGGE检测急性白血病儿童胸苷酸合成酶基因多态性研究

目的：胸苷酸合成酶(TS)是DNA合成的关键酶,在DNA合成与修复中起重要作用,是叶酸代谢循环中起中心作用的酶类之一,也是以5-氟尿嘧啶（5-FU）为基础化疗的靶酶,TS的遗传多态性在抗白血病等肿瘤疾病5-FU类药物的体内代谢中起着重要作用。该文研究胸苷酸合成酶基因编码区单核苷酸多态性（cSNP）及基因突变在急性白血病（AL）患儿和正常儿童中的分布情况,以探讨TS基因变异与AL患儿5-FU类药物化疗效应之间可能的相关性。方法：应用RT-PCR-变性梯度凝胶电泳（RT-PCR-DGGE）结合DNA直接测序技术,对53例AL患儿和115例正常儿童的cDNAs进行了TS 基因cSNP及基因突变的筛查与鉴定,分析各基因型在两组之间的分布差异。结果：首次鉴定了儿童TS 381 A＞G (E127E) cSNP位点,其在AL患儿及正常儿童中的等位基因频率分别为12.3%,13.5%,与国际SNP文库中12.3%基本一致。该cSNP在两组人群的等位基因频率差异无显著性意义,与白血病的易感性无相关性。研究未发现T349C, G470T及C500T变异。结论：采用RT PCR-DGGE结合DNA测序法首次确定了儿童TS基因存在381 A＞G cSNP位点,其等位基因频率为13.1%,基因型分布频率在AL患儿及正常儿童两组人群中差异无显著性。［中国当代儿科杂志,2009,11（4）：251-254］     

中国汉族家族性激素耐药型肾病综合征家系MYO1E基因突变分析

目的 MYO1E基因突变可导致常染色体隐性遗传型激素耐药型肾病综合征（SRNS）,该研究旨在分析中国汉族家族性SRNS家系MYO1E基因突变及其特点。方法 2005~2010年期间共收集到4个中国汉族家族性SRNS家系,共9例肾脏病患者,选取其中4例先证者为研究对象,对照人群为59例尿检正常的健康志愿者。取所有研究对象外周静脉血3 mL,提取基因组DNA;PCR扩增MYO1E基因全部28个外显子及其周围的部分内含子序列;应用DNA直接测序法进行MYO1E基因突变分析。结果 在4个中国汉族家族性SRNS家系的先证者中共检出25个MYO1E基因变异;根据对美国国立生物技术信息中心（NCBI）的单核苷酸多态性（SNP）数据库的检索,其中1个MYO1E基因杂合变异（IVS21-85G>A）首次在该研究的1个先证者中被检出,且该变异在59例正常对照人群中未检出,表明它是MYO1E基因突变;另24个变异在NCBI的SNP数据库中已公布,均为MYO1E基因多态性。生物信息学分析提示IVS21-85G>A突变不导致MYO1E基因剪切位点改变,为非致病性突变。结论 MYO1E基因突变不是该研究中国汉族SRNS家系的主要致病原因。     

中国汉族儿童散发性激素耐药型肾病综合征CD2AP基因突变分析

目的分析中国汉族散发性激素耐药型肾病综合征(SRNS)患儿CD2AP基因突变及其特点。方法40例中国汉族散发性SRNS患儿,以及50例尿检正常的汉族成年人,取外周静脉血3 ml,提取基因组DNA,应用聚合酶链反应(PCR)方法扩增CD2AP基因全部18个外显子及其周围的部分内含子,进行直接DNA序列测定。应用神经网络程序对CD2AP基因内含子突变进行隐蔽性剪接位点预测。结果在40例散发性SRNS患儿中检测出11种CD2AP基因多态性,并在3例散发性SRNS患儿中检测出3种在正常对照人群中未发现的CD2AP基因变异,IVS7-135G>A、1083T>C和IVS13-137G>A。神经网络程序分析结果结合临床表型提示,IVS7-135G>A突变为非致病突变、1083T>C和IVS13-137G>A突变的致病性不明确。结论中国汉族散发性SRNS患儿存在CD2AP基因突变,今后尚需对CD2AP基因突变与SRNS患儿临床表型的关联性进行详尽研究。     

中国南方汉族人家族性激素耐药型肾病综合征家系NPHS2基因突变

目的 分析中国南方汉族人家族性激素耐药型肾病综合征(SRNS)家系NPHS2基因突变及其特点.方法 研究对象为A、B、C 3个南方汉族人SRNS家系先证者及其姐和父母,50例尿检正常的南方汉族成年人作为对照人群.取所有研究对象外周静脉血3 ml,提取基因组DNA,PCR扩增NPHS2全部8个外显子及其周围的部分内含子和启动子全长序列,对PCR产物直接进行DNA序列测定.结果 对3个南方汉族人SRNS家系先证者NPHS2全部8个外显子及其周围的部分内含子进行突变分析,未发现NPHS2突变,仅在外显子8上检测到1个NPHS2基因多态性(954T＞C).在3个家系的先证者及其姐和父母的NPHS2启动子上检测到6个变异:-1715A＞G、-1709G＞A、-1000A＞T、-670C＞T、-116C＞T和-51G＞T.其中5个变异(-1709G＞A、-1000A＞T、-670C＞T、-116C＞T和-51G＞T)在100条正常染色体中也有检出,它们在SRNS患者中的等位基因频率分别与在对照人群中的等位基因频率比较差异均无统计学意义(P＞0.05);另1个变异(-1715A＞G)在家系C的先证者及其母亲(尿检正常)中检出,为杂合变异,而在100条正常染色体中未发现.-1000A＞T为新发现的NPHS2基因多态性,-1715A＞G为新发现的NPHS2变异.结论 NPHS2基因突变不是本研究3个南方汉族人家族性SRNS家系的主要致病原因.     

COL9A1基因在单纯性马蹄内翻足中的表达及其多态性分析

目的：COL9A1 基因是位于单纯性马蹄内翻足（ICTEV）易感区域(6q12-13)的已知基因。本研究探讨 COL9A1 基因在 ICTEV 患者中的表达及其单核苷酸多态 (SNP) 位点在ICTEV 和正常人中的分布情况。方法：应用免疫组化方法检测 25 例 ICTEV 患儿及 5 例正常对照组肌肉及肌腱组织中 COL9A1 的表达;应用限制性片段长度多态性技术结合测序法,分析 118 例 ICTEV 患者及 100 名正常人 COL9A1 基因的 2 个 SNP位点基因型。结果：88%（22/25）的 ICTEV 患者 COL9A1蛋白表达阳性,明显高于正常对照组。位于 COL9A1 基因编码区的 SNP 位点 rs1135056 的基因型频率和等位基因频率在两组人群中的分布差异有统计学意义（P<0.05）：ICTEV 组 G 等位基因频率高于对照组;与对照组相比,AA 基因型频率降低,AG、GG 基因型频率增高。结论：COL9A1 基因在 ICTEV 中高表达,rs1135056多态位点G等位基因和ICTEV的发生相关。     

PCR-SSCP银染色法检测尿道下裂患儿雄激素受体基因突变

研究尿道下裂的发生与雄激素受体基因突变间的关系。方法运用盐析法从２７例不同类型尿道下裂患儿外周血中提取基因组ＤＮＡ,然后通过聚合酶反应－单链构象多态性分析银染色法检测雄激素受体基因第２和第８外显子基因突变情况。结论激素受体基因突变可能与尿道下裂的发生有关,并可能与严重尿道下裂的发生关系更为密切。     

丙酸血症11例基因突变分析

目的 研究丙酸血症患儿丙酰辅酶A羧化酶PCCA和PCCB基因突变情况.方法 应用PCR扩增和直接测序对11例丙酸血症患儿PCCA和PCCB基因的各个外显子及其两侧侧翼序列进行突变检测,并对部分患儿父母进行相应突变基因检测.结果 6例为PCCA突变,5例为PCCB突变.共发现13种突变,其中10种突变未见文献报道,突变类型包括错义突变、缺失突变、剪切位点突变和复杂型插入缺失突变,错义突变为最常见类型.167-179dell3insl复杂型插入缺失突变在2例中为纯合突变.结论 在11例内酸血症患儿中检测到13种突变,其中10种为新突变类型,为今后有关丙酸血症的发病机制研究提供理论依据.     

两个A型尼曼-匹克病家系基因型和临床表型分析

目的 研究2个无关的A型尼曼-匹克病家系酸性神经鞘磷脂酶(ASM)基因SMPD1突变及遗传特征,分析基因型与表型关系.方法 收集2位先证者及其家庭成员的临床资料,采用基因组小剂量抽提试剂盒从2个家系共6名成员及100例健康对照者外周血中提取基因组DNA,根据人类基因组数据库中获得的基因序列(NM000543)设计4对引物,采用聚合酶链反应(PCR)进行扩增,并应用PCR产物回收试剂盒进行产物回收,采用DNA直接测序法进行基因突变检测,测序结果应用DNAman软件进行序列对比分析,确定基因突变位点,对测序异常的片段重新进行PCR扩增与测序,以验证结果的可靠性.结果 PCR扩增所得片段与预计扩增片段大小一致,无非特异扩增带,可以进行纯化与测序.将测序结果与正常序列进行对比分析后,在先证者1和2的SMPD1基因的第1号外显子均发现一个纯合突变T107C,遗传密码子由GTG变为GCG,从而导致36位缬氨酸被丙氨酸替代(p.V36A),最终致使ASM(E.C.3.1.4.12)活性缺陷,产生临床症状.先证者之父母为携带者,100例健康对照中未发现上述突变.结论 证实SMPD1基因是本研究中2个无关的A型尼曼-匹克病家系的致病基因.2个家系患儿均为SMPD1基因纯合突变致病,其父母为表型正常的基因突变携带者.     

儿童神经母细胞瘤中ALK基因突变的研究

目的：探讨中国儿童神经母细胞瘤（NB）中间变性淋巴瘤激酶（ALK）基因的突变情况。方法：从22例石蜡包埋的NB肿瘤组织中提取基因组DNA,通过PCR-DNA直接测序技术分析儿童NB肿瘤组织中ALK突变热点区域第20~26号外显子的突变情况。结果：22 例儿童NB中,有10例（46%）在ALK第21号外显子上存在已知同义突变C3375A（Gly1125Gly）,等位基因频率为27%;1例（5%）在ALK第23号外显子上发现一个新的同义突变C3586T（Leu1196Leu）。ALK突变C3375A的发生频率在NB患儿的年龄、性别、肿瘤分化程度和是否转移方面差异无统计学意义（P＞0.05）。在其他5个ALK外显子中未发现突变。结论：采用PCR-DNA测序技术发现了ALK一个新的同义突变C3586T,并证实了儿童ALK存在已知突变C3375A,其发生率不受NB患儿临床特征的影响。     

神经管畸形患者锌指蛋白ZIC2基因编码区罕见突变的分子遗传分析

目的 筛选ZIC2外显子区域基因突变,分析突变对神经管畸形（NTDs）的影响。方法 采用病例对照研究方法,收集来自山西省和江苏省苏州市经孕期B超或病理学解剖证实为NTDs的胎儿为NTDs组,以常规体检排除出生缺陷和重大疾病的胎儿和健康成年人为对照组。采用酚-氯仿法抽提基因组DNA,通过PCR扩增ZIC2的3个外显子及邻近的部分内含子序列,扩增产物采用ABI Prism Bigdye system进行测序,对于测序发现的基因突变进行反向测序验证。结果 NTDs组163例,对照组576例。在NTDs组中发现一个同义突变c.1140G>A,未发现错义突变或重复缺失。同义突变c.1140G>A位于第2外显子,为1例妊娠期37周诊断为枕部脑膜脑膨出的女性胎儿。KEGG数据库分析ZIC2结构发现该同义突变位于ZIC2的一个C2H2锌指结构中。在对照组中未检测到相同突变。结论 ZIC2是一个高度保守基因,其编码区不含有与NTDs相关的SNP和罕见突变。     

A Chinese girl with cleidocranial dysplasia (CCD) caused by the recurrent R190W mutation in RUNX 2

OBJECTIVE: Cleidocranial dysplasia (CCD) is a rare skeletal disease with autosomal dominant inheritance associated with mutation in RUNX 2. The authors report a Chinese girl with CCD in whom the mutation in RUNX 2 was identified. METHODS: Clinical diagnosis was based on physical examination, radiological findings, and biochemical tests. For mutation detection, genomic DNA was extracted from peripheral blood using standard method. All 7 coding exons of RUNX 2 and their flanking intronic sequences were amplified by polymerase chain reaction (PCR), and the PCR products were then subjected to automatic DNA sequencing. RESULTS: The affected girl showed typical clinical manifestations of CCD, including patent fontanelles, absent clavicles, short stature and dental anomalies. Direct sequencing of PCR-amplified fragments revealed a recurrent missense mutation, R190W (568 C > T), in RUNX 2. The mutation was further confirmed by Hae III restriction analysis. CONCLUSION: A Chinese case of CCD was confirmed and the disease-causing mutation was linked to a recurrent point mutation in RUNX 2.     

一例颅锁骨发育不良患儿的RUNX 2基因突变研究

目的　报告 1中国人常染色体显性遗传颅锁骨发育不良的临床病例并对其致病基因RUNX 2进行突变鉴定。方法　根据患儿的症状、体征、骨骼系统放射线检查和相关血液生化检查进行临床诊断。提取患儿外周血DNA ,PCR扩增RUNX 2编码氨基酸的 7个外显子片段 ,测序检测突变。结果　患儿 ,女 ,5岁 ,具有前囟大、双锁骨缺失、身材矮小、牙齿异常等典型颅锁骨发育不良临床表现。PCR扩增片段直接测序显示患儿RUNX 2外显子 2内发生R190W (5 6 8C >T)错义突变。该突变通过PCR产物的HaeIII限制酶切分析得到进一步确认。结论　报告一例颅锁骨发育不良病例并发现RUNX 2一复发点突变为其致病的遗传基础。     

A heterozygous frameshift mutation in the Fanconi anemia C gene in familial T-ALL and secondary malignancy

BACKGROUND: Patients with Fanconi Anemia (FANC) have a well documented increased risk to develop malignancies, especially Acute Myeloid Leukemia (AML) and Myelodysplastic Syndrome (MDS). The risk for heterozygous individuals is not clear, epidemiological data are inconsistent. If the risk for heterozygous individuals to develop malignancies was increased, they should be found in groups of patients with AML or MDS at higher proportion than in the normal population. We are currently screening a pediatric population with hematologic malignancies for mutations in the FANCA, FANCC and FANCG gene, and report here on siblings carrying a heterozygous frameshift mutation in the FANCC Gene. PATIENTS AND METHODS: Using PCR based single strand conformational analysis we screened the DNA from pediatric patients suffering from 1 degree or 2 degrees MDS, CMML/JMML or AML for mutations in the FANCA (43 exons), FANCC (14 exons) and FANCG (14 exons) gene, and included one patient with refractory T-ALL, being the brother of a patient with T-ALL and MDS transforming into AML. Aberrant PCR products were directly sequenced. Flowcytometric measurement of mitogen-sensitivity and G2-phase arrest is used to evaluate cultured stimulated lymphocytes from individuals carrying FANC-mutations. RESULTS: A novel heterozygous frame-shift mutation, 377-378delGA in the FANCC gene was found in 2 siblings, both suffering from T-ALL with subsequent MDS transforming to AML in one of them. No other mutation was found by direct sequencing of the complete FANCC gene. Both patients died under therapy. The parents (first degree cousins) and one healthy brother are also carriers. Their lymphocytes show a higher mutagen sensitivity than normal, but do not get blocked in G2 phase as being typical for Fanconi Anemia. CONCLUSION: As the mutation causes a premature Stopcodon within exon 4 of the FANCC gene it has to be regarded as a causal FANCC gene defect. The findings within this family support the hypothesis of an increased risk to develop malignancies in heterozygous carriers of FANC-mutations. A systematic screening of further patients is needed, and we are currently examining a larger cohort to get a better estimate of the true risk of heterozygosity.     

家族性高胆固醇血症低密度脂蛋白受体基因突变的研究

目的 分析中国儿童家族性高胆固醇血症低密度脂蛋白受体基因突变,并建立筛查该基因突变的方法。方法 以一家两患儿及其父母的基因组DNA为模板,用聚合酶链反应（PCR）及增该基因的启动子和全部18个外显子。用温度梯度凝胶电泳（TGGE）分析检测PCR产物,对电泳结果异常者进行DNA测序。结果 平行TGGE发现,两患儿第13外显子存在一纯合突变,其父母此外显存在杂合突变。DNA测充证实两患儿第13外显子发生Ala^606→Thr纯合错义突变,其父母均为此Ala^606→Thr杂合突变。结论 此家系家族性高胆固醇血症患者的LDL受体 基因存在Ala^606→Thr突变。TGGE结合DNA测序法的建立可用本症的基因诊断。