MNNG诱导小鼠胸腺细胞DNA损伤修复模型的建立

目的本实验研究了诱导小鼠胸腺细胞DNA损伤的适宜MNNG浓度以及损伤后DNA修复的时间范围。方法用终浓度为5、10、50、100、500、1 000μmol/L的亚硝基胍(N-methyl-N-’nitro-N-nitrosoguanidine,MNNG)分别处理小鼠胸腺细胞0.5 h,然后用RPMI-1640培养基培养,分别于0 h0、.5 h2、h、4 h8、h检测细胞存活情况和细胞DNA损伤修复情况。结果随着MNNG浓度的增大,细胞死亡率、DNA拖尾率以及彗星尾长都显著升高,其中100、5001、000μmol/L MNNG处理细胞后,细胞数量少,拖尾非常严重,无法测量。不同MNNG浓度之间的DNA损伤和修复程度差异显著(P<0.01),呈现明显的剂量反应关系。DNA拖尾率在0.5 h或2 h达到高峰,彗星尾长在2 h最大,在2~8 h内,拖尾率和彗星尾长都显著降低(P<0.01),接近对照。结论采用5μmol/L或10μmol/LMNNG处理小鼠胸腺细胞0.5 h可以诱导细胞DNA损伤,损伤后的DNA可以在2~8 h内基本修复。     

同型半胱氨酸致内皮细胞、平滑肌细胞和泡沫细胞低密度脂蛋白受体DNA甲基化的比较研究

目的 观察同型半胱氨酸(Hcy)对内皮细胞、平滑肌细胞以及泡沫细胞中低密度脂蛋白受体(LDLR)DNA甲基化的影响.方法 原代培养内皮细胞、人脐静脉血管平滑肌细胞(VSMCs)和单核细胞源性泡沫细胞,用0、50、100、200和500μM Hcy干预后培养72 h,提取基因组DNA,巢式降落式PCR(nMS-PCR)法分别检测3种细胞中LDLR DNA甲基化修饰状态的变化,以观察Hcy对不同细胞LDLR的作用和影响.结果 内皮细胞、VSMCs与不同浓度Hcy培养72 h后,LDLR基因启动子区DNA呈高甲基化改变,泡沫细胞LDLR启动子区DNA呈低甲基化改变,与对照组比较差异有统计学意义(P ＜0.05,P＜0.01),且以50或100μM Hcy组最明显.结论 Hcy对不同细胞LDLR启动子区DNA甲基化的影响有差异性,提示可能存在更深层次的机制.     

白血病细胞系中WT1基因启动子区域DNA甲基化的研究

目的应用基于聚合酶链反应(PCR)的实验方法,研究白血病细胞系中WT1基因启动子区域的DNA甲基化水平及其与WT1基因表达的关系.方法采用RT-PCR技术及甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)技术,检测HL-60、Jurkat及KG-1等白血病细胞系中WT1基因mRNA表达水平及其启动子区域的DNA甲基化状态;以5-杂氮脱氧胞嘧啶(5-aza-CdR)对启动子区域DNA高甲基化的U937细胞系进行去甲基化处理后,观察WT1基因表达水平的改变.结果 HL-60、K562、KG-1、NB4及SHI-1细胞系中WT1水平高表达,而Jurkat和U937细胞表达水平极低,同时检测到这两个细胞系存在WT1基因启动子区域DNA高甲基化;经去甲基化处理后,U937细胞系的WT1基因表达水平较未处理者升高.结论 WT1基因启动子区域DNA高甲基化是抑制其表达的机制之一.     

丹参提取物对肝癌HepG2细胞DNA去甲基化作用研究

目的 探讨丹参提取物丹参酮ⅡA对肝癌HepG2细胞DNA甲基转移酶1基因(DNMTI)表达的抑制作用.方法 采用MTT法检测丹参酮ⅡA、5-脱氧杂氮胞苷(5-Aza-cdR)对HepG2细胞的增殖抑制作用,根据回归方程求出半数抑制浓度(IC50).以IC50含药量的丹参酮ⅡA处理肝癌HepG2细胞.并以5-Aza-cdR处理作阳性对照,处理72 h后用RT-PCR技术检潮肝癌HepG2细胞DNMT1 mBNA表达水平.结果 经丹参酮ⅡA处理后肝癌HepG2细胞DNMT1 mRNA表达水平明显下降,与空白对照组比较差异有统计学意义(P<0.01).但5-Aza-cdR组下降更显著,丹参酮ⅡA组与5-Aza-cdR组比较盖异有统计学意义(P<0.05).结论 丹参酮ⅡA能抑制肝癌HepG2细胞DNTM1 mRNA表达,作用弱于5-Asa-cdR,DNA去甲基化作用可能是丹参酮抗肿瘤作用机制之一.     

DNA甲基化与肿瘤研究进展

细胞癌变是一个多阶段复杂过程 ,它包括原癌基因的激活和抑癌基因的失活 ,并涉及基因和基因外的多种改变。近来 ,人们发现肿瘤细胞的总体甲基化水平低于正常细胞 ,而在某些CpG岛甲基化程度增高。DNA甲基化在X染色体、基因表达及基因组印迹中[1 ] 起着重要作用。同时 ,近年来研究发现DNA甲基化的异常影响肿瘤的发生发展。1　DNA甲基化与基因表达1.1　DNA甲基化与去甲基化　DNA甲基化是指生物体在DNA甲基转移酶 (DNAmethyltransferase ,DMT)的催化下 ,以s 腺苷甲硫氨酸 (SAM)为甲基供体 ,将甲基转移到特定的碱基上的过程。DNA甲…     

DNA甲基化与宫颈癌的研究进展

DNA甲基化是最早发现的人类细胞表观遗传学修饰,是继基因突变和基因缺失之外,致抑癌基因失活的第3种机制。现已证实,DNA甲基化是癌变过程的早期事件,存在于多种肿瘤中。近年来研究表明,DNA甲基化与宫颈癌的发生、发展密切相关,并可作为宫颈癌早期诊断的分子标志物。现重点阐述DNA甲基化与宫颈癌的关系及DNA甲基化在宫颈癌诊断中的临床应用前景。     

DNA甲基化与组蛋白修饰对克隆胚发育的影响

在正常的受精、发育过程中,基因组DNA不对称的去甲基化、重新甲基化以及组蛋白修饰作用发生在整个受精和胚胎发育过程中.本文将从DNA甲基化、DNA不对称的去甲基化和组蛋白修饰作用就其原理,相互之间的关系及其对胚胎发育情况的影响作以综述,并对近年来,DNA甲基化与组蛋白修饰作用在胚胎发育过程中的研究作以总结.     

胆固醇对血管内皮细胞基因组DNA甲基化的影响

目的:研究胆固醇对人血管内皮细胞基因组DNA甲基化水平的影响.方法:体外培养人脐静脉血管内皮细胞ECV304,以50.00 mg/L的胆固醇作用于ECV304 48 h,提取细胞基因组DNA,用高效液相色谱法(HPLC)检测基因组DNA甲基化水平.结果:与无胆固醇的对照组比较,50.00 mg/L胆固醇使ECV304细胞中DNA甲基化水平显著下降(P＜0.01).结论:一定浓度的胆固醇能降低血管内皮细胞中DNA甲基化水平.     

氨甲蝶呤获得性耐药和DNA甲基化的相关性研究

目的 研究氨甲蝶呤(MTX)获得性耐药与DNA甲基化的相关性.方法 采用浓度递增结合低剂量持续诱导的方法 诱导细胞发生MTX耐药.通过高效毛细管法检测非小细胞肺癌A549细胞和非小细胞肺癌A549/MTX细胞内整体DNA甲基化水平.结果 MTT法分析显示A549细胞对MTX发生耐药.A549细胞发生MTX耐药时,其甲基化水平明显降低,且随着MTX耐药浓度增加,耐药细胞株DNA甲基化程度依次降低.A549/MTX细胞和A549细胞整体DNA甲基化水平差异有统计学意义.结论 MTX获得性耐药引起细胞内整体DNA甲基化水平降低,MTX获得性耐药机制可能与DNA甲基化相关.     

DNA甲基化数据分析方法和软件应用

目的分析DNA甲基化芯片实验过程质量控制方法、数据统计分析要点及实验结果的验证和数据的可视化处理。方法利用文献、DNA甲基化实验数据探讨DNA甲基化研究中的方法学。结果 DNA甲基化芯片初筛异常过程应多在步骤质量控制工作中,包括DNA片段化、免疫共沉淀阳性对照的选择、去除原始扫描噪音信号和数据均一化处理。DNA甲基化芯片的结果可采用常用的甲基化特异性PCR(MSP)和甲基化测序PCR(BSP),引物设计软件包括Methprimer和Methyl Primer Ex-press。DNA甲基化芯片分析数据的可视软件为Signal map;BSP结果的可视化可采用Windows系统下的执行软件QUMA和BISMA。结论 DNA甲基化研究,应从多角度控制实验的设计和数据的产生及结果的分析。     

大鼠衰老过程中脑细胞DNA与Yas原癌基因的甲基化

衰老过程中DNA甲基化水平常有明显改变。我们用MSPⅠ/HpaⅡ酶解电泳和高效液相色谱(HPLC)两种方法进行比较,研究了不同年龄大鼠的肝脑细胞基因组DNA甲基化的程度。酶解电泳图谱未观察到青年鼠和老年鼠之间基因组甲基化的差别,但用HP-LC测量DNA中5-甲基胞嘧啶的含量时发现,老年     

人宫颈癌发生中FANCF表达缺陷与其外显子甲基化的关系

目的:研究FANCF基因表达缺陷在官颈癌发生发展中的作用,分析这种差异表达与甲基化的关系,并探索去甲基化对宫颈癌细胞生长的抑制作用.方法:逆转录聚合酶链技术(RT-PCR)检测宫颈癌SiHa和Hela细胞、30例宫颈癌组织标本、48例宫颈上皮内瘤样病变(Cervical intraepithelial neoplasia,CIN)组织(CIN Ⅰ 12例、CIN Ⅱ 16例、CINⅢ20例)中FANCF基因的表达.Western Blot分析FANCF蛋白水平的表达.甲基化特异性的PCR技术(MSP)对FANCF DNA进行甲基化分析.以每例标本相应正常宫颈组织作为对照.采用脱甲基化试剂5-脱氧杂氮胞苷处理FANCF甲基化的细胞,四甲基偶氮唑蓝(MTT)法检测细胞增殖.结果:SiHa、Hela细胞系以及50%(15/30)宫颈癌组织中FANCF mRNA和蛋白表达均缺失.SiHa伴有FANCF DNA甲基化,宫颈癌组织中有9例FANCF DNA高度甲基化,60%(9/15)的FANCF下降可能与甲基化有关.脱甲基化处理SiHa细胞系后,FANCF基因重表达,细胞的增殖速度下降.结论:FANCF基因甲基化导致其表达缺陷可能是宫颈癌发生的一种原因,脱甲基化处理在抑制宫颈癌的发生发展中有一定的作用.     

低浓度MNNG诱发非DNA损伤依赖的细胞信号通路

目的：研究基因组DNA损伤与细胞信号通路激活的关系以及低浓度N-甲基-N'-硝基-N-亚硝基胍(MNNG)对细胞膜表面受体的影响。方珐：采用EUSA法来检测蛋白激酶A(PKA)的活性，不连续梯度密度离心法完成细胞脱核，以及免疫荧光法和激光共聚焦显微镜观察细胞表面受体聚集情况。结果：0．2μmol／L MNNG能在脱核细胞中引起PKA活性升高2．3倍，并可在5min内引起vero细胞表面生长因子受体和肿瘤坏死因子α受体的聚集；在脱核细胞中，表面受体聚集现象与在完整细胞中一样。结论：低浓度MNNG对PKA的激活和诱导细胞表面受体聚集均不依赖于基因组DNA的损伤，表明细胞信号转导通路的起源可能位于细胞膜或者细胞质中。     

DNA甲基化检测技术进展及经验总结

DNA甲基化作为一种表观遗传学元件,参与正常细胞的发育分化、基因组印记、X染色体失活和染色质重构等生命过程,在肿瘤演进中亦发挥重要作用。为满足不断深入的研究需求,DNA甲基化检测技术得到了较快的发展,检测的灵敏度和特异度不断提高,并逐步从个别位点向高通量检测发展。该文综述了目前常用的DNA甲基化分析方法,并简要总结了其在应用中的关键点和经验。     

DNA甲基化和动脉粥样硬化研究进展

DNA甲基化是基因组一个主要遗传外修饰方式,它能够调控基因表达.最近的研究表明在动脉粥样硬化发生过程中有DNA甲基化的异常发生.在动脉粥样硬化中DNA甲基化模式的紊乱表现为基因组广泛低甲基化和某些CpG岛的异常高甲基化共存.DNA甲基化的改变及其所引起的基因表达异常可能在高同型半胱氨酸血症和衰老致动脉粥样硬化发生过程中起了重要作用.进一步研究DNA甲基化在动脉粥样硬化中的改变,可能为动脉粥样硬化的诊断和治疗提供新途径.     

DNA甲基化在肾癌诊治的应用

肾癌的发生与形成是多基因改变的复杂过程,而参与其中的机制主要有2类:①遗传学机制,即通过DNA核苷酸序列改变而形成突变,引起肿瘤形成;②表观遗传学机制,即在DNA核苷酸序列不变的情况下,通过碱基修饰而引起基因水平的变化。作为表观遗传学家族中的重要成员,DNA甲基化程度的异常变化可影响肾癌相关基因的转录,从而影响肾癌的发生。现对DNA甲基化在肾细胞癌中的早期诊断、治疗靶点、预后监测和病理分期等临床应用作一综述。     

DNA甲基化与肿瘤

DNA甲基化是一种重要的基因调控方式，DNA甲基化水平的改变在肿瘤的发生、发展中有重要的作用，DNA甲基化改变引起细胞中C→T突变、癌基因的低甲基化、抑癌基因的高甲基化、错配修复基因异常以及诱导染色体不稳定从而导致肿瘤的发生，利用肿瘤发生中DNA甲基化特征可对其进行有效的治疗。     

基于寡核苷酸芯片的β-地中海贫血DNA甲基化的研究

目的 通过寡核苷酸芯片寻找和分析β-地中海贫血DNA甲基化相关的基因位点,进一步探讨产前筛查及诊断β-地中海贫血的新方法.方法 利用含有人30 178个DNA甲基化探针的寡核苷酸芯片,对2例β地中海贫血患儿脐血与2例正常脐血分别配对检测差异基因DNA甲基化情况,并用甲基化特异PCR(methylation-specific PCR,MSP)和荧光定量PCR(RT-PCR)验证芯片结果.采用非监督聚类(hierarchical clustering)等方法发现统计学意义上差异表达的基因.结果 两组芯片结果显示,差异基因共209条(ratio≥2.0,ratio≤0.5);其中上调基因共113条,下调基因共96条.验证结果显示,DNA甲基化相关基因成红细胞增多型白血病致病因子(erythroblastie leukemia viral,v-erb-a)与正常血样比较呈高甲基化状态.结论 利用DNA甲基化芯片及甲基化特异PCR技术检测并验证出成红细胞增多型白血病致病因子(v-erb-a)在地中海贫血中呈高甲基化.     

HL-60细胞降钙素基因高甲基化的发生机制

目的 :探讨HL 6 0细胞降钙素基因高甲基化的发生机制。方法 :采用HL 6 0细胞 ,以正常骨髓单个核细胞为对照 ,应用甲基化敏感的限制性内切酶消化 ,结合设有内外参照的PCR技术 ,检测CT基因甲基化状态 ;应用同位素微量分析法检测DNA 胞嘧啶 甲基转移酶 (DNA cytosin methyltransferase,MTase)活性 ;应用RT PCR技术检测MTase基因表达水平。结果 :HL 6 0细胞经甲基化敏感的内切酶HpaⅡ消化后仍可扩增出清晰的CT基因特异条带 ,提示CT基因 5′端呈高甲基化状态 ;HL 6 0细胞MTase活性平均测定值为 5 39.9Bq ,是正常骨髓单个核细胞 (平均 2 1 8Bq)的 2 9.8倍 ;MTase基因的mRNA表达水平以MTase与β actin内参照RT PCR产物的比值表示 ,HL 6 0细胞 (0 .72 )为正常对照 (0 .0 2 )的 36倍。结论 :HL 6 0细胞CT基因呈高甲基化状态 ,MTase活性增高可能是其发生机制之一     

DNA甲基化介导Id4在宫颈癌中的表观遗传沉默

目的:探讨宫颈癌中DNA结合抑制因子4(Id4)表达的启动子甲基化调控。方法:采用焦磷酸测序技术对17例散发性宫颈鳞状细胞癌及15例正常的宫颈组织标本进行Id4基因甲基化水平检测。实时荧光定量PCR检测组织和细胞中Id4表达水平。单独使用DNA甲基转移酶抑制剂(5Aza-dC)去甲基化处理宫颈癌细胞SiHa以及联合使用5Aza-dC和组蛋白去乙酰化酶抑制剂曲古抑菌素A(TSA)去甲基化处理SiHa后,检测Id4表达。结果:Id4甲基化水平在宫颈癌组织中显著高于正常宫颈组织[(65.0±24.7)%比(21.8±10.2)%,P<0.01]。在宫颈鳞状细胞癌组织和正常宫颈组织中,Id4的mRNA表达水平与其启动子甲基化水平呈负相关(Pearson test,r=-0.011,P<0.01)。单独使用5Aza-dC能使SiHa细胞中Id4的甲基化水平由98.23%降至50%左右,同时伴随Id4mRNA水平的显著提高(25倍),而单用TSA组甲基化水平及mRNA表达改变不明显。联合使用5Aza-dC和TSA时Id4甲基化水平的进一步下降(降至29.54%),及其mRNA表达水平的进一步升高(约35倍)。结论:Id4基因在宫颈癌中呈高甲基化状态,并介导Id4的表达沉默。组蛋白去乙酰化与DNA甲基化在Id4表观遗传沉默机制中起协同作用。Id4或可作为表观遗传治疗的作用靶点。