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目的 采用网络药理学方法探讨定喘汤治疗支气管哮喘的作用机制.方法 利用TCMSP筛选定喘汤药物的有效活性成分,并通过GeneCards等数据库进行检索获得支气管哮喘相关的疾病靶点.采用DAVID v.6.8数据库进行GO富集分析及KEGG通路富集分析.结果 经数据库分析,定喘汤与支气管哮喘的共同靶基因为286个.GO-... 相似文献
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目的:通过网络药理学研究,总结桔梗对于支气管扩张治疗的作用机制.方法:借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索桔梗的有效化学成分及作用靶点,再借助GeneCard、OMIM等数据库检索支气管扩张的相关基因,同时根据UniProt数据库分析靶点所对应的基因,应用Cytoscape构建化合物靶点关系网络,应用STRING数据库构建靶点蛋白相互作用的关系网络.将得到的所有与治疗相关的靶点导人Bioconductor数据库中,对其进行GO生物学过程富集分析和KEGG代谢通路富集分析.结果:桔梗治疗支气管扩张的主要活性成分为毛地黄黄酮,刺槐黄素,相关靶点包括PRSS1、CHEK1、VEGFA、IL6、MDM2、PCNA、ICAM1,对支气管扩张具有治疗效果.结论:本研究初步展示了桔梗对于支气管扩张的多成分、多靶点、多通路作用机制,为桔梗用于治疗支气管扩张提供了现代理论依据. 相似文献
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目的 利用网络药理学分析小承气汤治疗溃疡性结肠炎的潜在作用机制。方法 2022年1月17日-20日使用中药系统药理学数据库和分析平台筛选并收集小承气汤(大黄、厚朴、枳实)三味药的活性成分及靶点信息。在GeneCards数据库中检索“Ulcerative Colitis”,获取溃疡性结肠炎相关的疾病靶点。然后使用Cytoscape 3.7.2软件进行进一步的拓扑分析,构建“活性成分-靶点-疾病”网络。利用STRING数据库构建小承气汤治疗溃疡性结肠炎靶点的蛋白质相互作用网络。与此同时,将小承气汤治疗溃疡性结肠炎的靶点进行基因本体论和京都基因和基因组百科全书分析。结果 筛选后共获得小承气汤26种主要活性成分,对应122个药物靶点,4 837个溃疡性结肠炎疾病靶点,86个药物疾病共同靶点。根据蛋白质相互作用网络拓扑分析参数筛选出10个关键治疗靶点,即蛋白激酶B1、细胞肿瘤抗原p53、肿瘤坏死因子-α、白细胞介素-6、胱天蛋白酶3、前列腺素内过氧化物酶2、转录因子AP-1、血管内皮生长因子A、myc原癌基因蛋白和白细胞介素-1β。基因本体论和京都基因和基因组百科全书分析结果显示小承气汤治疗溃疡... 相似文献
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目的 基于网络药理学及分子对接探究五苓散治疗脓毒症相关急性肾损伤的作用机制。方法 使用TCMSP、SwissTargetPrediction、GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库筛选五苓散治疗脓毒症相关急性肾损伤的有效成分及关键靶点;使用Cytoscape 3.7.1软件构建“药物-成分-靶点”网络;使用STRING数据库构建关键靶点蛋白互作(PPI)网络;通过利用R语言对治疗靶点进行GO和KEGG富集分析,利用PubChem、蛋白质数据库(PDB)、AUTO Dock Vina等对主要活性成分及核心靶点进行分子对接。结果 通过网络药理学分析共获得40个五苓散的有效成分及其对应的432个基因,1 460个脓毒症相关急性肾损伤基因,166个药物和疾病的共同靶点。PI3K/Akt通路是一条关键的调节通路,选择小分子polyporusterone E和Akt1,以及Alisol B和PIK3CA进行分子对接。结论 五苓散是借助多个靶点和多个途径治疗脓毒症相关急性肾损伤的。 相似文献
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目的:运用网络药理学的研究方法分析心痛方,探讨心痛方治疗冠心病的潜在靶点及作用机制,为后续研究提供理论指导.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)查询柴胡、桃仁、郁金、川芎、白芥子、石菖蒲、瓜蒌、蒲黄、甘草、九香虫10味药物的有效成分及靶点信息,采用Swiss Target Prediction服务器进行补充,在Uniprot平台上对靶点进行标准化命名.通过OMIM、GeneCards、DrugBank数据库检索冠心病靶点基因.对心痛方靶基因和冠心病靶基因进行映射后,获得药物与疾病的共同基因.运用Cytoscape3.7.2绘制药物-成分-疾病-靶点网络,筛选关键成分;在String平台构建PPI网络,获得核心靶基因;运用Metascape平台对核心基因进行GO分析和KEGG通路分析.结果:通过TCMSP数据库检索及其他方法补充,获得心痛方有效成分417个,发现心痛方治疗冠心病的91个可能的重要靶点,经GO富集分析得到657个细胞生物学过程、33个细胞组分、68个分子功能;经KEGG富集分析得到245个相关通路.结论:心痛方对冠心病的治疗作用是多成分、多靶点、多通路的.并可以推测心痛方是通过花生四烯酸、槲皮素、山奈酚等成分介导IL6、AKT1、TNF、VEGFA、CCL2等靶点调节细胞黏附、细胞迁移、氧化应激反应、炎症反应等基因功能和丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、液体剪切应力与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等通路发挥治疗冠心病的作用. 相似文献
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目的 采用网络药理学和分子对接技术探讨桃红四物汤对血小板活化的作用机制,为后续实验研究及临床应用提供参考。方法 首先通过TCMSP数据库获得桃红四物汤中的主要活性成分及其对应作用靶点信息;通过Gene Card、OMIM、TTD等数据库获得与血小板活化相关的靶点;其次利用Venny图将桃红四物汤中有效成分对应靶点基因与血小板活化靶点基因相映射,筛选两者之间的共有靶点,借助STRING平台及Cytoscape3.7.1软件,绘制交集基因蛋白互作(PPI)网络图;然后利用基因注释、可视化和综合发现数据库(David)对核心靶点进行基因本体(GO)生物功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,通过微生信云平台对富集结果可视化;最后借助AutoDockTools软件对核心成分及关键靶点基因进行分子对接,筛选出桃红四物汤中的重要成分及其作用于血小板活化过程中的重要靶点,为后续对核心成分抑制血小板活化作用进行实验验证提供重要依据。结果 按照一定条件共筛选出69个桃红四物汤有效成分及2 175个血小板活化的靶点,去除重复后获得44个桃红四物汤作用于血小板活化的有效成分和154个... 相似文献
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目的:基于网络药理学和分子对接分析丹栀逍遥散治疗失眠障碍的相关成分、靶点及通路,探讨其作用机制.方法:检索TCMSP数据库,获取丹栀逍遥散中各药物的活性成分及其靶点,在UniProt数据库中规范靶点名;在GeneCards、OMIM、TTD3个数据库中检索失眠障碍相关基因,筛选复方与疾病的交集靶点,将其导入String数据库,导出蛋白互作关系,并使用CytoscapeV3.8.0构建疾病-药物-成分-靶点网络和核心蛋白互作网络;利用Metascape平台分别对交集靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析;将核心成分与核心靶点进行分子对接验证.结果:共获得丹栀逍遥散活性成分102种,对应靶点147个,与失眠障碍交集靶点52个,其中核心成分12种,核心靶点7个;GO富集分析共得762条结果,其中主要涉及神经递质水平调节、肾上腺素受体活性以及突触膜的组成部分等;KEGG通路富集分析共获得61条通路,主要涉及:神经活性配体-受体相互作用通路;分子对接结果显示核心靶点与核心成分均能形成稳定结合.结论:初步获得丹栀逍遥散治疗失眠障碍的关键成分、关键靶点和关键通路,为临床使用和进一步研究提供参考. 相似文献
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酚妥拉明在治疗支气管哮喘中的作用 总被引:3,自引:0,他引:3
酚妥拉明(phentolamine)又名立其丁(Re-gitine)、甲磺酸卡胺唑啉,其化学结构是咪唑啉衍生物属于抗肾上腺药物范畴,为一特殊的α-肾上腺能阻断剂,并有轻微的β-肾上腺能刺激作用.自1948年Ahlguis氏首先提出α-β肾上腺能受体学说后,近年来对受体的研究工作越来越多.籍于 相似文献
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免疫细胞在支气管哮喘发病机制中的作用 总被引:1,自引:0,他引:1
支气管哮喘是多种免疫细胞及其因子参与的慢性呼吸道炎症.免疫细胞及其分泌的细胞因子与支气管哮喘发生、发展与病情转归等关系密切,通过对近年来免疫细胞及其分泌的细胞因子的认识可以促进人们在细胞与分子水平对支气管哮喘发病机制的理解,为支气管哮喘的及早诊断及进一步防治提供理论基础,并为支气管哮喘的新药开发开辟新的途径. 相似文献
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白介素(IL)-33属于IL-1细胞因子家族,它通过ST2膜受体诱导辅助型T细胞(Th)2免疫反应,在调节免疫系统中起重要作用。IL-33主要由上皮细胞分泌,也可由其他细胞如骨髓细胞、树突状细胞、巨噬细胞和肥大细胞产生。IL-33受体ST2在多种细胞广泛表达。Th2细胞、肥大细胞、嗜碱性粒细胞和嗜酸性粒细胞等多种Th2阳性细胞均参与支气管哮喘的发展过程。IL-33被认为是Th2型免疫反应始发因素,通过激活固有免疫及适应性免疫,诱导哮喘等过敏性疾病的发生发展。进一步了解IL-33的生物学特性有助于阐明其在哮喘治疗中干预作用。 相似文献
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目的运用网络药理学的方法探讨青风藤治疗类风湿关节炎的分子机制。方法通过TCMSP平台筛选青风藤活性成分及作用靶点;在GeneCards和OMIM数据库中获取类风湿关节炎靶基因。通过R语言对基因进行匹配运算并绘制韦恩图;在String平台生成成分-蛋白互作网络图;Cytoscape 3.6.1软件构建成分-靶点网络;通过R3.5.1软件进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果共筛选出6个活性成分和23个潜在作用靶点;GO功能富集显示,青风藤可以影响炎症因子的细胞信号转导等生物学过程。KEGG通路富集分析显示,青风藤可以通过调控P53等凋亡相关通路发挥抗类风湿关节炎的作用。结论青风藤可能通过作用于CASP3、JUN、OPRD1等关键靶点调控P53等信号通路,从而调控炎症细胞凋亡进而发挥治疗类风湿关节炎的作用。 相似文献
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目的 通过网络药理学-分子对接的方法探究益气活血祛风方治疗糖尿病肾病(DKD)氧化应激的作用机制并进行实验验证。方法网络药理学-分子对接利用多个数据库和软件进行,实验采用8周龄雄性db/db小鼠分为模型组、益气活血祛风方低剂量组和高剂量组,并使用同龄雄性db/m小鼠作为对照组,研究周期为8周。PAS染色法用于观察小鼠肾组织的病理变化;PCR和WES检测小鼠肾组织中NRF2的mRNA和蛋白表达。结果 (1)网络药理学分析得到益气活血祛风方的37个有效成分和391个作用靶点,与DKD的1,816个疾病靶点相交得到145个交集靶点。分子对接分析发现甾醇、华良姜素、决明内酯、槲皮素等关键成分和TP53、NEFE2L2、VEGFA、ESR1、PIK3R1、HSP900AA1等靶点有较好的结合活性。(2)益气活血祛风方能上调NRF2信号通路的表达,改善肾脏病理学变化。结论 益气活血祛风方对DKD具有多成分、多靶点、多通路的特点,其调节氧化应激的机制可能与上调NRF2蛋白的表达有关。 相似文献
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目的 基于网络药理学和分子对接探讨黑骨藤追风活络胶囊(HZC)治疗类风湿关节炎(RA)的作用机制。方法 通过ETCM数据库和文献查阅获得复方活性成分,运用Swiss Target Prediction平台进行靶点预测。用GeneCards、DisGeNET、OMIM数据库筛选RA相关靶点,绘制韦恩图获取药物和疾病交集靶点。采用STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape3.9.1软件中centiscape2.2插件筛选潜在关键靶点。用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析,用Cytoscape3.9.1软件绘制药物-活性成分-靶点-通路网络图。最后选取核心成分与核心靶点进行分子对接。结果 共筛选出32个有效成分,药物与疾病交集靶点91个,主要活性成分为槲皮素、盐酸青藤碱和杠柳苷元,核心靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、表皮生长因子受体(EGFR)。作用机制可能与HIF-1信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、JAK-STAT信号通路等有关。分子对接显示主要活性成分与关键靶点具有很... 相似文献
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目的 基于网络药理学探讨止痛消炎膏治疗慢性湿疹的分子作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)、PubChem数据库筛选止痛消炎膏的潜在活性成分[口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18]。采取SwissTargetPrediction数据库预测其作用靶点,与DisGeNET数据库、GeneCards数据库、治疗靶点数据库(TTD)获得慢性湿疹疾病靶点相映射,得到止痛消炎膏治疗慢性湿疹的潜在靶点。利用Cytoscape3.7.2软件构建止痛消炎膏-活性成分-靶点网络图,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,并在R软件中使用Bioconductor生物信息软件包对止痛消炎膏的作用靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析。结果 止痛消炎膏中有186个潜在活性成分,将止痛消炎膏与湿疹作用靶点相匹配,两者取交集后获得药物-疾病共同靶点115个;番泻叶甙、白当归醚、白当归脑、大黄酸、大黄苷、迷迭香酸等可能是止痛消炎膏治疗慢性湿疹的主要活性成分,其作用于TNF、IL-6、AKT1、CXCL8、IL-2、STAT3等靶点,... 相似文献
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目的 通过网络药理学和分子对接方法预测黄连温胆汤治疗缺血性脑梗死的潜在机制。方法 利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)等数据库资料,并查阅文献获取黄连温胆汤的成分与靶点,导入Cytoscape 3.7.2软件创建中药-活性成分-靶点-疾病网络。借助在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、人类基因综合数据库(GeneCards)、治疗目标数据库(TTD)、DisGeNET和药物靶标数据库(DrugBank)等数据在线平台获取疾病相对应的靶点,基于STRING线上平台构建黄连温胆汤与缺血性脑梗死重合的蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络图。运用DAVID数据库对共同靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后,利用PyMOL及Auto Dock等软件进行分子对接。结果 获得黄连温胆汤活性成分167种,包括豆甾醇和β-谷甾醇等,相对应的作用靶标322个;缺血性脑梗死疾病靶点2 529个,如肿瘤坏死因子(TNF)及细胞肿瘤抗原p53(TP53)等;药物与疾病交集靶点167个;GO富集分析共得到407条基因功能信息,KEGG富集分析发现133条通路,包括TNF信号通... 相似文献