广州地区无偿献血者HPA-1—6,15基因分型及频率调查

目的研究人类血小板基因多态性,为人类群体遗传学研究及临床输血实践提供重要数据和依据。方法通过PCR-SSP方法对广州地区706名无偿献血者的HPA1—6,15系统进行基因分型,并统计其频率。结果706份样本中HPA-3和-15基因型的杂合程度最高,其a/a、a/b、b/b的频率分别为HPA-3:0.2918、0.4830、0.2252;HPA-15:0.2691、0.5170、0.2139,不配合率较高,均达到35%以上。HPA-1、-2、-4、-5系统均以a/a纯合子为主,a基因的频率范围为0.9583—0.9993,且均未发现b/b纯合子。1b、4b的基因频率很低,分别为0.0028和0.0007。本地区的HPA-1a与中国北方、英国白人、美国黑人有统计学差异(P<0.05)。HPA-2与中国南方、北方、美国黑人和日本人有统计学差异(P<0.05);HPA-5与英国白人和美国黑人存在统计学差异(P<0.05)。HPA-6频率分别为0.9575,0.0397,0.0028。结论本研究对广州地区HPA献血员的筛查可为建立HPA供者库和对探讨由HPA引起的免疫性疾病的预防和治疗提供相关数据和研究手段。     

人类血小板抗原1～4系统基因分型

目的 :建立人类血小板抗原 1～ 4系统序列特异性引物 (PCR SSP)分型方法。方法 :合成 14条引物 ,采用PCR SSP方法对 2 5名健康献血者的HPA 1～ 4系统进行基因分型 ;分型结果与采用等位基因特异性寡核苷酸点杂交 (PCR ASO)获得的结果进行比较。结果 :以PCR SSP方法对HPA 4个系统进行分型均取得了明确、满意的结果 ,且与PCR ASO方法获得的结果完全一致。结论 :人类血小板抗原PCR SSP基因分型方法具有简便、快速、准确等优点 ,具有广泛的应用前景。     

PCR-SSP在人类血小板抗原1—6、15系统基因分型中的应用

目的探索PCR-SSP技术在人类血小板抗原(HPA)-1、2、3、4、5、6、15系统的基因分型中的应用。方法合成23条序列特异性引物,通过调节引物浓度、Mg2+离子浓度和探索最佳PCR扩增条件,建立HPA-1—6、15系统同步扩增基因分型方法。用该法盲检100名献血者HPA-1—6、15系统的基因分型结果,与用美国G&T公司的HPA-1—6、15系统的基因分型试剂所测试的这100名献血者的基因分型结果进行比较。结果该分型方法和美国G&T公司试剂同时检测100名随机献血者,其HPA-1—6、15分型结果完全一致,符合率达100%,基因频率分别是:HPA-1a和1b为1和0,HPA-2a和2b为0.98和0.02,HPA-3a和3b为0.63和0.37,HPA-4a和4b为0.997和0.003,HPA-5a和5b为0.997和0.003,HPA-6a和6b为1和0,HPA-15a和15b为0.548和0.450。结论该分型方法具有简便、快速、准确的特点,适合常规HPA基因分型。     

PCR-高分辨熔解曲线法在Kidd血型基因分型中的应用

目的:探讨PCR-高分辨熔解曲线(HRM)法在Kidd血型基因分型中的应用。方法:采用简单随机抽样法,选择2019年10月至11月,于深圳市血液中心参加无偿献血的256例献血者为研究对象。本组献血者年龄为18～60岁;男性献血者为142例,女性为114例。采用血型血清学试验方法对本组献血者全血标本的红细胞抗原表型进行检...     

广州地区汉族人群人类血小板同种抗原及HLA-Ⅰ抗原基因分型库的建立

目的建立广州地区汉族人群人类血小板抗原(HPA)1—6、9及15系统和HLA-Ⅰ抗原基因分型库,探讨其基因多态性的分布,为有效避免血小板输注同种免疫的发生提供实验基础。方法随机抽取广州地区无血缘关系的健康机采血小板无偿献血者(均为汉族)的血样805份,采用PCR-SSP方法做HPA-1—6、9及15系统基因分型,利用Luminex-SSO方法做HLA-A、B、Cw抗原分型。结果HPA的基因频率分别为HPA-1a0.998、1b0.002,2a0.952、2b0.048,3a0.553、3b0.447,4a0.999、4b0.001,5a0.976、5b0.024,6a0.982、6b0.018,9a1.000、9b0.000,15a0.518、15b0.481;HPA-3、15a/b对偶抗原有aa、ab和bb 3种表型,HPA-1、2和4—6未发现bb表型,HPA-9未发现ab、bb表型;HPA-3a、3b,15a、15b的不配合率最高。经χ2检验,实验结果符合Hardy-Weinberg遗传定律。HLA-Ⅰ抗原基因频率较高的表达有A*02 0.286A*240.162A*11 0.323B*46 0.147B*75 0.100C*01 0.177C*03 0.289C*07 0.179。结论广州地区汉族HPA-1—6、9及15系统基因频率分布和HLA-Ⅰ类抗原分布存在明显的多态性,与其它资料相比显示出种族和地域性差异;建立HPA-1—6、9及15系统和HLA-Ⅰ抗原基因分型库对于临床输血有重要意义。     

大连地区汉族人群HPA-15基因多态性分析

目的分析大连地区汉族人群血小板特异性抗原HPA-15基因多态性,探讨其在血小板输注中的临床意义。方法采用PCR-SSP法对大连地区100名汉族无血缘关系血小板捐献者的HPA-15系统进行基因分型。结果大连地区汉族人群HPA-15aa、HPA-15ab、HPA-15bb基因型频率分别为0.3600、0.4400、0.2000。HPA-15a、HPA-15b的基因频率分别为0.5800、0.4200。与我国其他地区汉族人群比较,分布差异无统计学意义。在随机输血中,HPA-15抗原不配合概率为0.3685。结论在随机输血中,HPA-15抗原不配合概率高,在血小板输注中应加以重视。     

上海地区汉族人群人类血小板抗原基因的多态性研究

目的研究上海地区汉族人群人类血小板抗原HPA-1～16系统基因多态性分布,为快速寻找更合适的血小板输注提供实验依据。方法采用PCR-SSP方法对137名上海地区汉族健康成年人进行HPA-1～16系统基因分型。结果HPA-1～6和HPA-15的基因频率分别为HPA-1a 0．9854,HPA-1b 0．0146,HPA-2a 0.9453,HPA-2b 0．0547,HPA-3a 0．5511．HPA-3b 0．4489,HPA-4a 0．9964,HPA-4b 0．0036,HPA-5a 0．9891,HPA-5 b0．0109,HPA-6a 0．9781,HPA-6b 0．0219,HPA-15a 0．5292,HPA-15b 0．4708;其余HPA系统只检测到a等位基因,其基因频率均为1．0000。经χ^2检验,符合Hardy-Weinberg遗传定律。结论HPA基因多态性分布存在明显的种族和地域性差异。HPA-1～6和HPA-15系统基因频率分布具有多态性,其中HPA-3和HPA-15系统杂合度最高,抗原分布不配合比例相对高,在临床配合性血小板输注中必须加以重视。HPA-3基因多态性分布更具有上海地区特点。     

寡核苷酸芯片用于HLA-A基因分型的研究

目的 应用寡核苷酸芯片分型方法，对HLA-A基因进行分型研究。方法 采用不对称PCR方法，扩增HLA-A基因的第2，3外显子，荧光标记扩增产物，作为杂交模板。设计分型检测寡核苷酸探针，制备HLA-A基因分型检测芯片。采取差异选择法，筛选强杂交信号和高特异性的分型探针。探索了探针长度、探针位置等对杂交信号的影响。杂交结果经荧光扫描，并用分型软件分析判断阳性探针和HLA-A基因型。结果 30例临床样本芯片分型结果与PCR-SSP及DNA测序分型结果相符。结论 采用寡核苷酸芯片技术对HL-A基因分型是种好的方法，具有测速快、成本低、高通量的优点。     

潍坊地区汉族献血者血小板特异性抗原HPA-1-16系统基因多态性研究

目的研究汉族人群血小板特异性抗原HPA-1-16系统基因多态性区域分布特点,建立HPA基因型资料库。方法采用PCR-SSP技术对102名潍坊地区汉族无血缘关系的志愿捐献血小板者作HPA-1-16系统基因分型,计算基因型频率、基因频率。结果从HPA-1、5、6系统分别检出1例a/b基因型,HPA-4系统检出2例a/b基因型,检出HPA-2a/2b 11例(基因频率占0.1078);HPA-3、15系统表现出较高的杂合度,其中3a/3a、3a/3b、3b/3b基因型频率分别为0.3039、0.5392、0.1569,15a/15a、15a/15b、15b/15b基因型频率分别为0.3529、0.4608、0.1863;HPA- 7-14、16系统只检出a基因,呈单特异性。结论潍坊地区汉族人HPA-2、3、15系统具有多态性,是HPA配合性输注关注重点。在随机输血中供受者HPA-2系统不配合的机会为9.68%、HPA-3系统不配合的机会为36.95%、HPA-15系统不配合的机会为36.8%。     

南京地区血小板捐献者HPA-1-29bw基因分型检测

目的 了解南京地区汉族血小板捐献人群血小板抗原1 ～ 29(HPA-1-29bw)等位基因频率,为患者相容性血小板输注提供依据.方法 采用一代测序法(Sanger测序法)对2019年2月～2019年9月在本中心捐献血小板的900名南京汉族固定捐献者做HPA基因分型,并采用直接计数法计算等位基因频率和基因型频率等.结果 ...     

Genotyping of RHD c.1227G>A allele by melting curve analysis

BackgroundDEL is the weakest known D-positive phenotype and is detectable only by adsorption and elution tests. RHD c.1227G>A is an important marker for DEL phenotype in East Asians. The aim of this study was to develop a method for RHD c.1227G>A genotyping by single-tube PCR with melting curve analysis.MethodsTwo GC-rich tails of different lengths were attached to the 5′-end of allele-specific primers for RHD 1227G and 1227A alleles, such that RHD c.1227G>A could be distinguished by the melting temperature. A total of 145 D-negative Chinese Han blood donors were genotyped for RHD c.1227G>A by melting curve analysis, conventional polymerase chain reaction with sequence-specific primers (PCR-SSP), and sequencing.ResultsIn 143 subjects (143/145, 98.6%), PCR-SSP and melting curve analysis produced consistent results with RHD exon 9 sequencings. Two samples were genotyped as RHD 1227G/A by PCR-SSP, but as RHD 1227A/A or A/- by melting curve analysis. These two samples were confirmed to be RHD 1227A/A or A/-. Based on RHD exon 9 sequencing, the accuracy, sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative predictive value of the melting curve analysis for detecting both RHD 1227A and 1227G were all 100%. In contrast, the accuracy, specificity and positive predictive value of PCR-SSP for RHD 1227G detection were 98.62%, 98.21% and 94.29%, respectively, which were lower than those observed with the melting curve analysis.ConclusionMelting curve analysis for RHD c.1227G>A genotyping is a simple, rapid, and reliable method, superior to conventional PCR-SSP.     

应用PCR—SSP方法进行人类血小板抗原1～6系统的基因分型

目的研究采用PCR—SSP技术，建立人类血小板抗原1．6系统（HPA—1，2，3，4，5，6）的基因分型方法。方法合成18条序列特异性引物，通过调节引物浓度、Mg^2＋离子浓度和探索最佳PCR扩增条件．建立HPA—1．6系统同步基因分型技术。对第10届及第11届国际输血协会（ISBT）血小板基因定型协作组送检的考核样本进行盲检来验证。并应用该技术对198名深圳地区健康的血小板志愿捐献者进行基因分型。结果应用本研究的方法，对第10届及第11届ISBT送检的考核样本进行基因分型，结果与ISBT公布的结果完全一致，符合率达100％。对198名随机的血小板志愿捐献者观察到的基因频率分别是：HPA—1a和1b为0．9924和0．0076，HPA-2a和2b为0．9545和0．0455，HPA-3a和3b为0．5556和0．4444，HPA-4a和4b为0．9975和0．0025，HPA-5a和5b为0．9848和0．0152，HPA-6a和6b为0．9798和0．0202。结论本研究建立的HPA基因分型技术具有简便、快速、准确的特点，适合于常规HPA基因分型，具有广泛的应用前景。     

人类血小板抗原HPA-15系统PCR-SSP基因分型技术的建立

本研究目的是采用PCR-SSP技术建立人类血小板抗原HPA-15系统的基因分型方法,并应用于血小板供者库的HPA基因定型。采用第11届国际输血协会（ISBT）血小板血清学与基因分型协作组推荐的序列特异性引物,调节引物浓度、Mg2＋离子浓度和探索最佳PCR扩增条件,建立HPA-15系统基因分型技术。该分型技术的准确性和可靠性,采用第11届ISBT血小板协作组提供的质控样本进行验证,同时采用本研究合成的引物及商品化试剂盒,对50名随机的汉族血小板捐献者进行HPA-15系统基因分型,作为平行对照。应用本研究的方法,对第11届ISBT送检的10份考核样本进行基因分型。结果表明：基因分型结果与ISBT公布的结果完全一致。50名随机的血小板志愿捐献者,经本研究的方法及美国G＆T公司的试剂检测,基因分型的结果相符合;观察到的基因频率：HPA-15a和-15b分别为0.5100和0.4900。结论：本研究建立的HPA基因分型技术具有简便、快速、准确的特点,适合于常规HPA基因分型,具有广泛的应用前景。     

多重聚合酶链反应用于人血小板抗原-2、-4、-5系统基因分型的研究

目的建立用于检测人血小板抗原(HPA)-2、-4、-5系统基因型的多重聚合酶链反应(PCR)。方法在一个反应体系中同时扩增HPA-2、-4、-5系统特异性目的基因片段。用琼脂糖凝胶电泳确定HPA-2、-4、-5系统基因型;再用多重PCR对75名健康的单采血小板者进行HPA-2、-4-、5系统基因分型,分型结果与PCR-序列特异性引物(PCR-SSP)获得的结果进行比较。结果HPA-2、-4、-5系统分型的结果为:70名为2 a/2 a型,5名为2 a/2b型;73名为4 a/4 a型,2名为4 a/4b型;66名为5 a/5 a型,9名为5 a/5b型。未发现2b/2b、4b/4b及5b/5b纯合子个体。多重PCR结果与PCR-SSP方法获得的结果一致。结论多重PCR具有操作简便、快速、准确等特点,可以用于血小板血型抗原基因分型。     

血小板抗原基因分型及配型的研究与初步应用

目的 对患者进行血小板抗原基因分型及配型的研究，以探讨临床血小板输注的安全、有效性。方法 应用聚合酶链序列特异性引物技术（PCR－SSP），对南京地区55例患者HPA1－5系统等位基因进行分型，并为其进行血小板基因配型输注。结果 经血小板基因配型的吻合组血小板输注效果明显优于未经配型的对照组。结论 对患者进行血小板抗原基因分型及配型可提高血小板输注的安全、有效性。     

中国汉族人群人类血小板抗原HPA-15(Gov)多态性调查

目的研究中国汉族人群人类血小板抗原HPA15(Gov)系统多态性,评估其在血小板配型输注中的作用。方法采用PCRSSP技术对1000名来自不同省份汉族无关献血者进行HPA15系统基因分型。结果HPA15在所调查的7个省份汉族人群中的分布差异无显著性意义,在1000名汉族中HPA15a和15b基因频率分别为0.5320和0.4680,与HardyWeinberg平衡吻合;与其它种族的HPA15分布相比较,也无显著性差异。在随机输血中HPA15a和15b抗原不配合的机会分别为0.1711和0.2029。结论本调查数据表明,随机输血中供受者HPA15抗原不配合比例在中国汉族人群中高达37%,这对研究同种免疫血小板减少症和开展血小板同型输注具有指导意义。     

应用PCR—SSP法分析中国人血小板抗原基因型频率

本研究建立了在同一PCR反应条件下同时检测人血小板抗原（human platelet antigen,HPA）系统HPA-1到HPA-5的PCR-SSP检测法。应用该方法分析了110例健康献血员的HPA-1到HPA-5的基因型,并以此为依据推算了中国人HPA-1到HPA-5各亚型的基因频率。结果表明HPA-1a和HPA-1b的基因频率分别为0.91和0.09,HPA-2a和HPA-2的基因频率分别为0.86和0.14,HPA-3a和HPA-3b的基因频率分别为0.60和0.40,HPA-4a和HPA-4b的基因频率分别为0.92和0.08,HPA-5a和HPA-5b的基因频率分别为0.85和0.15。结论：基因组DNA的血小板抗原PCR-SSP分型法切实可行,可广泛应用于临床血小板抗原的分型。     

Asymmetric real-time PCR detection of BRCA1 5382insC mutation by melting curve analysis in the LightCycler

BACKGROUND: 5382insC BRCA1 frameshift mutation is a common founder mutation for many populations worldwide and a high-risk allele for the development of hereditary breast and/or ovarian cancer. Our goal was to develop a novel, reliable and rapid method for its detection. METHODS: We developed an asymmetric real-time PCR method with hybridization probes in the LightCycler. Genotyping was performed by melting curve analysis. RESULTS AND CONCLUSIONS: The developed method was in concordance with reference methods when tested in 85 peripheral blood and 107 tumor DNA samples from Greek breast and/or ovarian cancer patients. The described method proved to be simple, cost-effective, easy to perform and rapid enough for routine use as a screening method in high-risk families and especially in the Greek, Slavic and Jewish populations where 5382insC mutation is the most common BRCA1 mutation.     

广州地区汉族人群血小板抗原基因多态性及频率分布

目的 探讨广州地区汉族人群人类血小板抗原(HPA)-7Hita及HPA-12,-18,-19,-20,-21等位基因多态性及其频率分布情况.方法 选取2010年9月至2011年9月于广州血液中心参与志愿无偿献血,且符合《献血者健康要求(GB18467-2001)》的广州地区汉族献血者中,采用系统随机抽样方法随机选择95例献血者作为研究对象.采集并留取献血者血液标本;分别采用序列特异性引物-聚合酶链反应(PCR-SSP)及序列特异性引物-多重聚合酶链反应(multi-PCR-SSP)对研究对象血液标本进行HPA-7Hita及HPA-12,-18,-19,-20,-21等位基因分型检测,并对广州地区汉族人群HPA-7Hita及HPA-12bw、-18bw、-19bw、-20bw、-21bw等位基因频率与不同国家、地区人群进行比较.结果 ①95例广州汉族志愿无偿献血者均为HPA-7a、-12a、-18a、-19a、-20a、-21a,等位基因频率均为100％,均未发现HPA-7Hita及HPA-12bw、-18bw、-19bw、-20bw、-21bw等位基因;②进一步分析调查结果显示,广州地区汉族人群中HPA-7Hita等位基因频率低于日本人群,且差异有统计学意义(P＜0.05),HPA-12bw等位基因频率亦低于德国人群,且差异有统计学意义(P＜0.05);HPA-18bw、-19bw、-20bw、-21bw等位基因频率则分别与法国、巴西、中国、日本的报道相符.结论 本研究初步获得广州地区汉族人群HPA-7Hita及HPA-12,-18,-19,-20,-21等位基因频率分布情况,为临床相关疾病的诊治及预测提供一定实验数据基础及检测方法.