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1.
目的 研究河南益母草野生居群遗传多样性。方法 利用SCoT分子标记对位于河南伏牛、太行、大别和桐柏4大山脉的8个益母草居群66个样品进行遗传多样性分析。结果 10对引物共扩增出240条带,其中多态性条带为238条,多态性百分率(PPB)为99.17%。Nei’s遗传多样性指数(H)平均值为0.264 2,Shannon’s多态性信息指数(I)平均值为0.39,遗传分化系数(Gst)为0.294 6,种群间基因流为1.197。Mantel Test分析表明,河南益母草居群间的亲缘关系与它们之间的地理距离有着明显的相关性(r=0.366 3,P<0.05)。结论 河南野生益母草种群具有较高的遗传多样性,其遗传距离与地理距离存在明显的相关性。 相似文献
2.
中国不同地理居群鱼腥草遗传多样性分析 总被引:2,自引:0,他引:2
目的 研究中国不同地理居群鱼腥草药材的遗传多样性。方法 选取分布于我国13个省市的15个不同居群288份鱼腥草样本,进行AFLP分析,POPGENE及MEGA软件分析处理数据。结果 通过筛选得到10对AFLP引物,扩增得到110条带,其中70.51%条为多态性条带;有效等位基因数为1.210,Nei′s多样性指数 H为0.119,Shannon多样性指数I为0.186;15个居群遗传距离系数0.008 9~0.181 8;用MEGA软件进行UPMGA聚类分析,15个居群的鱼腥草材料被分为3个大分支。其中峨眉蕺菜最先与其他居群分开,表明它与其他居群之
间的亲缘关系较远。其他2个大的分支按地域聚在一起。结论 我国鱼腥草居群间存在较高多态性,遗传多样性较为丰富。 相似文献
3.
目的 研究3种类型黄连的遗传多样性和遗传结构。方法 对3种类型黄连的90个单株进行ISSR分析,运用POPGENE 1.31软件计算相关参数。结果 22个引物共检测到164个位点,其中108个为多态位点;黄连3种类型具有较丰富的遗传多样性,在物种水平上,多态位点百分率(PPB)为65.85%,有效等位基因数(Ne)为1.229 8,Nei’s基因多样度指数(H)为0.144 0,物种水平Shannon’s多样性信息指数(Hsp)为0.230 2;在类型水平上,PPB为55.08%,Ne为1.218 9,H为0.136 0,类型水平Shannon’s多样性信息指数(Hpop)为0.215 1。Nei’s基因多样性指数计算的类型间遗传分化系数与Shannon’s类型分化系数分别为0.056 1和0.065 2,均说明大部分遗传变异存在于类型内;ISSR标记检测到类型间存在着广泛的基因流(Nm=8.405 4),遗传分化程度较低;两两类型间的Nei’s遗传一致度(I)的范围为0.983 1~0.989 7;根据Nei’s遗传距离进行各类型间的UPGMA聚类,基于ISSR分子标记的聚类结果与形态分类基本一致。结论 3种类型的黄连遗传多样性较高,为新品种的培育提供了丰富的遗传基础。 相似文献
4.
目的 从DNA水平上对仙茅种质资源进行遗传多样性分析。方法 对我国25个主要分布区的仙茅进行ISSR-PCR扩增与检测。扩增结果转化为“0”、“1”矩阵后,利用Treeconw软件计算遗传距离,并采用UPGMA聚类法构建亲缘关系树状图。结果 14条引物共得到176条清晰可辨的扩增条带,其中有151条呈现多态性,占85.8%。遗传距离变化范围在0.177 2~0.403 0。25份样品分为两大类,聚类较为复杂,大多种质不具明显地理相关性,仅在小分支中呈现出一定的地域性分布规律。结论 我国仙茅植物的遗传多样性十分丰富,为筛选优质种质资源提供了丰富的遗传基础。 相似文献
5.
目的 对野生金荞麦进行遗传多样性研究。方法 通过ISSR技术对8个野生金荞麦居群的共92个个体进行遗传多样性分析。结果 用12个随机引物共扩增出103条清晰条带,其中90条具多态性,平均多态性位点比率为87.38%,Nei′s基因多样性指数H=0.374 7,Shannon多样性指数I=0.572 8,遗传分化指数Gst=0.171 8。遗传距离和遗传一致度分别为:0.043 1~0.384 9和0.684 3~0.954 5。结论 金荞麦种内具有较高的遗传多样性,遗传变异主要存在于居群内部,遗传多样性与地理关系表现出明显的相关性。ISSR可以作为研究遗传多样性及遗传分化的有效标记。 相似文献
6.
目的考察羌活Notopterygium incisum的遗传特征,探讨不同产地且有形态变异的羌活种质资源的遗传多样性、遗传分化及与环境因子的相关性。方法用RAPD方法选择15个随机引物对四川西部4个居群33株个体叶片DNA进行扩增,从个体间遗传关系及居群间遗传分化方面对羌活的遗传结构进行分析。结果RAPD共检测到185条谱带,其中128个位点为多态位点,多态性百分率为69.19%,Nei's基因多样性为0.2237,Shannon's信息指数为0.3375;壤塘和九龙居群聚为一类,理县和泸定居群聚为一类;茎秆颜色花纹性状与遗传差异间未表现明显相关性,不同性状的羌活个体仍主要按居群,即产地来源聚类;羌活居群内和居群间的变异分别占总变异的74.67%和25.33%;羌活居群间的遗传距离与地理距离间没有明显相关性(r=-0.1105,P=0.5855);羌活4个居群遗传多样性大小与年均温负相关,未达到显著水平(r=-0.771,P=0.229);与年均降雨量正相关,但相关不显著(r=0.291,P=0.709)。结论本研究表明羌活遗传多样性水平较高;羌活的遗传变异主要分布在居群内,但居群间已形成一定的遗传分化;壤塘和九龙羌活个体间的遗传距离较小,各自遗传背景较为相似。产地差异对遗传变异的影响大于因其茎秆颜色花纹不同所造成的影响。 相似文献
7.
目的:检测河南汉族群体14个Y-STR位点单倍型的遗传多样性,探讨其在法医物证学中的应用价值。方法:应用PCR、聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染显带技术,分析DYS713、DYS720、DYS635、DYS456、DYS389Ⅰ、DYS390、DYS389Ⅱ、H4、DYS460(A7.1)、DYS391、DYS448、DYS393、DYS439及DYS392等14个Y-STR位点单倍型在203名河南汉族无关个体中的分布,并用于2例法医物证检案的判定。结果:203例样本中共检出203种单倍型,单倍型多样性高达1,个体识别率为0.999976。应用于2例法医物证检案,得到准确判断。结论:构建的Y-STR复合体系具有较高单倍型遗传多态性和个体识别力。 相似文献
8.
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目的 了解铁皮石斛人工栽培居群的遗传多样性,为种质资源的保护与新品种的选育提供基础。方法 利用RAPD分子标记对浙江义乌、天台、建德、武义,云南麻栗坡、勐海的14个居群的铁皮石斛和1个居群的紫皮石斛进行遗传多样性分析。结果 从225个RAPD引物中筛选出15个引物,对105个铁皮石斛和3个紫皮石斛样本进行PCR扩增,共扩增出138条带,其中133条为多态性条带,多态性条带比率(PPB)为96.38%;14个铁皮石斛居群的多态位点(PPL)在10.79%~76.26%,平均为45.32%。结论 全国主产区人工栽培的铁皮石斛遗传多样性丰富,铁皮石斛种质的亲缘关系远近与其地理种源具有显著的相关性,与栽培地点无关。 相似文献
10.
江苏不同产地半夏遗传多样性的ISSR分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的对江苏不同产地半夏进行遗传多样性分析。方法采用ISSR-PCR技术研究江苏4个产地共20份半夏单株的遗传差异。结果从85个ISSR引物中筛选出6个条带清晰、扩增稳定、多态性高的引物,共扩增出54条带,其中43条具有多态性,多态性百分比为79.63%,通过SPSS11.5分析软件的聚类分析将江苏4个产地半夏划分为3类。结论ISSR分子标记研究结果与半夏的地理位置存在显著的相关性,可为半夏的种质划分和资源开发利用提供科学依据。 相似文献
11.
目的 进行药用植物桃儿七Sinopodophyllum hexandrum的遗传多样性研究,为桃儿七资源的保护和开发利用提供分子遗传理论基础。方法 对6个桃儿七居群进行DALP分析,利用PopGene 1.31软件分析遗传多样性相关数据,UPGMA方法聚类,结合Treeview软件生成树状图。结果 筛选5对引物组合,扩增共产生150条DNA片段,其中104条谱带具有遗传多态性,占69.33%,平均每组引物扩增所得多态条带为20.8,6个居群平均多态百分率为14.22%。6居群总的观察等位基因数Na为1.693 3,平均1.142 2;总的有效等位基因数Ne为1.417 1,平均1.083 8;基因多样性指数H为0.244 3,平均0.048 8;总的Shannon多样性指数I为0.364 3,平均0.073 0;居群总的基因多样性Ht为0.244 3,居群内基因多样性Hs为0.048 7。基因分化系数Gst为0.800 5,即遗传变异有80.05%发生在居群间,19.95%发生在居群内,居群每代迁移数Nm为0.124 6。结论 桃儿七居群间存在较大的遗传分化,基因流受到阻碍,这与桃儿七的繁育系统和生存环境紧密相关。 相似文献
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目的 采用GC-MS代谢组学技术研究狭叶柴胡的解热作用,并初步探讨其作用机制。方法 SD大鼠随机分为对照组,模型组,狭叶柴胡提取物高、中、低剂量(生药40、20、10 g/kg)组、阿司匹林(100 mg/kg)阳性对照组,干酵母诱导SD大鼠发热后分2次给药。造模后5~10 h每隔1 h观察大鼠的体温变化;采集造模后10 h大鼠血浆,进行GC-MS代谢组学分析,并寻找发热的潜在生物标志物。结果 阿司匹林具有很好的解热效果,在给药2 h后体温即与对照组无显著差异(P>0.05)。不同剂量的狭叶柴胡提取物使发热大鼠的体温有不同程度的降低,解热作用与剂量相关;高剂量组起效较快,在第1次给药后1 h即与模型组有显著差异(P<0.01);中剂量组在第2次给药后1 h效果最好,体温与对照组相比无显著差异(P>0.05);低剂量组大鼠体温在各个时间点与模型组相比均无显著差异,体温曲线波动较大,表明药物在该剂量虽可干预体温的升高,但未产生明显效果。通过代谢组学技术指认了与发热相关的17个潜在生物标志物,且不同剂量狭叶柴胡提取物均能调节这些标志物的改变。结论 狭叶柴胡具有良好的解热作用且与剂量相关,其可能从酶抑制、神经递质、糖脂代谢、氨基酸及能量代谢等多层面协同发挥作用,具有多靶点性。 相似文献
14.
目的 研究灰毡毛忍冬自然群体的遗传多样性。方法 以15个不同来源地的野生灰毡毛忍冬及2个花蕾型栽培品种为试材,通过SRAP分析,利用Popgene及Treeconw软件分析处理数据,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图。结果 通过筛选得到24对SRAP引物,扩增出239条条带,其中210条为多态性条带,多态性条带比率为87.8%;Nei′s多样性指数He为0.239 9,Shannon多样性指数I为0.372 4;从DNA分子水平揭示出灰毡毛忍冬存在着丰富的遗传多样性。遗传相似系数在0.442 3~0.940 2。用UPGMA法得到所有样本的聚类图,可分为两大类群。结论 灰毡毛忍冬有着丰富的遗传多样性,SRAP技术可有效运用于灰毡毛忍冬的遗传分析。 相似文献
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目的 研究石蒜属13种(含2变种)植物的种间亲缘关系和同种不同采集地材料的遗传多样性,为种质资源的开发利用提供分子佐证。方法 采用扩增长度多态性(AFLP)标记对石蒜属植物20份材料的基因组DNA进行种间亲缘关系研究。结果 从33对选择性扩增引物组合中筛选出6对,共扩增得到330条清晰可统计的条带,其中多态性条带为320条,占总带数的96.8%;AFLP分子标记检测到石蒜属20份材料种间遗传相似系数为0.38~0.89;AFLP分子标记聚类结果显示同一采集地的材料亲缘关系更近;石蒜属植物存在较丰富的遗传多样性。结论 AFLP分子标记能有效区分石蒜属植物种间的亲缘关系。 相似文献
16.
目的 对分布于我国30个居群的叶下珠进行遗传多样性分析。方法 采用ISSR分子标记技术,研究来自我国重庆、陕西、河南、云南、广西、广东、浙江、贵州、福建、海南省区共30个叶下珠居群的遗传多样性。结果 从60个ISSR引物中筛选出24个用于扩增,共扩增得到264条条带,其中共有条带19条,多样性条带245条,多态位点百分率(PPB)为92.80%,遗传相似性系数(GS)值在0.579 5~0.916 7,多态性较高。UPGMA聚类结果显示我国叶下珠居群大致可以分为3支,即内陆分支、沿海分支及位于云南省区的过渡分支;个别居群呈现明显的居群特异性。结论 叶下珠种质资源遗传多样性较高。 相似文献
17.
目的 对分布于我国及缅甸、老挝30个居群的珠子草进行遗传多样性分析,为珠子草遗传连锁图谱构建、种质资源保存及遗传育种等研究提供一定的理论依据。方法 采用ISSR分子标记技术,对采自我国云南、广西、广东、福建、海南及缅甸、老挝共30个珠子草居群进行多态性和聚类分析。结果 从60个ISSR引物中筛选出23条进行扩增,共扩增得到条带158条,其中共有条带43条,多样性条带115条,多态位点百分率(PPB)为72.78%,Nei’s基因多样性(H)为0.483 2,Shannon’s多态性信息指数(I)为0.676 0,多态性较高。结论 我国珠子草居群大致分为沿海及内陆两大类,个别居群呈现明显的居群特异性,种质资源遗传多样性较高。 相似文献
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目的 探索广西草珊瑚Sarcandra glabra种质资源的遗传多样性,为草珊瑚及其他中药种质资源保护、亲缘关系研究、品种选育和引种栽培提供分子生物学依据。方法 利用AFLP标记对来自广西不同产地的18份草珊瑚开展遗传多样性分析,采用NTSYS软件进行聚类和主坐标分析。结果 从64对AFLP引物组合中筛选出8对用于扩增,共获得319条清晰可辨条带,其中多态性条带251条,多态性位点百分率为78.68%。聚类和主坐标分析表明广西草珊瑚种质资源的遗传基础存在一定的多样性,但遗传相似性系数(0.630 3~0.836 6)较大,遗传距离较近。结论 广西草珊瑚种质资源的遗传多样性偏低,应该尽快采取相应措施,对草珊瑚资源进行合理保护。 相似文献