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《中国防痨杂志》2020,(6)
目的利用全基因组序列分析方法研究深圳市耐多药结核分枝杆菌(MDR-MTB)的耐药基因突变类型特点,为耐药结核病的快速分子检测提供依据。方法对2013—2017年深圳市慢性病防治中心及各区慢性病防治院门诊收集的所有449株MDR-MTB临床分离株进行全基因组测序,经与结核分枝杆菌标准菌株(H37Rv)基因组模板序列比对后获得447株满足分析要求的全基因组测序菌株。每株菌株经单核苷酸多态性(SNP)鉴定后与H37Rv各基因型和亚型的特异性突变和对11种抗结核药品已知的耐药基因突变进行比对,获得各菌株独属的基因型或亚型和耐药基因突变,并分析不同药品耐药基因中的主要耐药突变类型不同基因型或亚型间的相关性。结果 447株MDR-MTB中全基因组测序结果显示,432株(96.6%)发生基因突变,MTB对11种药品主要的耐药突变类型分别为katG-315-S/T[INH,81.7%(353/432)]、rpoB-450-S/L[RFP,59.7%(258/432)]、rpsL-43-K/R[Sm,66.0%(198/300)]、embB-306-M/V[EMB,35.5%(94/265)]、pncA启动子-11-T/C[PZA,8.9%(11/123)]、gyrA-90-A/V[Ofx,31.5%(39/124)]、rrs-1401-A/G[Am,48.1%(25/52)]、rrs-1401-A/G[Cm,100.0%(27/27)]、rrs-1401-A/G [Km,84.4%(27/32)]、inhA-15-C/T[Eto,84.2%(48/57)]、thyA-75-H/N[PAS,31.3%(10/32)],且发现存在2种及2种以上联合突变者有对INH、RFP、EMB和Sm耐药的菌株。深圳市MDR-MTB菌株的3个基因型为L1[0.4%(2/447)]、L2[84.6%(378/447)]和L4[15.0%(67/447)]型,其中L2型又分为3个亚型[L2.1型:1.9%(7/378)、L2.2型:37.0%(140/378)、L2.3型:61.1%(231/378)]。突变类型为katG-315-S/T、rpsL-43-K/R和embB-306-M/V在L2型菌株中的突变率[分别为79.6%(301/378)、50.5%(191/378)、23.0%(87/378)]明显高于L4型菌株[分别为61.2%(41/67)、10.4%(7/67)、10.4%(7/67)](χ~2值分别为10.874、37.021、5.396,P值分别为0.001、0.000、0.020),且PAS耐药突变类型folC43-I/T和thyA-75-H/N仅出现在L2型菌株中;其中katG-315-S/T在L2.2型菌株中突变频率[88.6%(124/140)]高于L2.3型[74.5%(172/231)](χ~2=10.764,P=0.000),而inhA-15-C/T(INH)、rpoB-450-S/L、rpsL-43-K/R和inhA-15-C/T(Eto)在L2.3型菌株中的突变频率[分别为8.2%(19/231)、61.9%(143/231)、59.3%(137/231)、15.6%(36/231)]明显高于L2.2型[分别为2.9%(4/140)、49.3%(69/140)、37.9%(53/140)、3.6%(5/140);χ~2值分别为4.319、5.668、16.053、12.797,P值分别为0.038、0.017、0.000、0.000)]。结论深圳市MDR-MTB菌株中11种药品耐药基因主要突变类型分别为katG-315-S/T、rpoB-450-S/L、rpsL-43-K/R、embB-306-M/V、pncA启动子-11-T/C、gyrA-90-A/V、rrs-1401-A/G、inhA-15-C/T、thyA-75-H/N;基因型为L1、L2和L4型,以L2.2型、L2.3型和L4型为主。 相似文献
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目的 利用全基因组序列分析方法研究深圳市耐多药结核分枝杆菌(MDR-MTB)的耐药基因突变类型特点,为耐药结核病的快速分子检测提供依据。方法 对2013—2017年深圳市慢性病防治中心及各区慢性病防治院门诊收集的所有449株MDR-MTB临床分离株进行全基因组测序,经与结核分枝杆菌标准菌株(H37Rv)基因组模板序列比对后获得447株满足分析要求的全基因组测序菌株。每株菌株经单核苷酸多态性(SNP)鉴定后与H37Rv各基因型和亚型的特异性突变和对11种抗结核药品已知的耐药基因突变进行比对,获得各菌株独属的基因型或亚型和耐药基因突变,并分析不同药品耐药基因中的主要耐药突变类型不同基因型或亚型间的相关性。结果 447株MDR-MTB中全基因组测序结果显示,432株(96.6%)发生基因突变,MTB对11种药品主要的耐药突变类型分别为katG-315-S/T[INH, 81.7%(353/432)]、rpoB-450-S/L[RFP, 59.7%(258/432)]、rpsL-43-K/R[Sm, 66.0% (198/300)]、embB-306-M/V[EMB, 35.5% (94/265)]、pncA启动子-11-T/C[PZA, 8.9% (11/123)]、gyrA-90-A/V [Ofx, 31.5% (39/124)]、rrs-1401-A/G[Am,48.1% (25/52)]、rrs-1401-A/G [Cm, 100.0% (27/27)]、rrs-1401-A/G [Km, 84.4% (27/32)]、inhA-15-C/T[Eto, 84.2% (48/57)]、thyA-75-H/N[PAS, 31.3% (10/32)],且发现存在2种及2种以上联合突变者有对INH、RFP、EMB和Sm耐药的菌株。深圳市MDR-MTB菌株的3个基因型为L1[0.4%(2/447)]、L2[84.6% (378/447)]和L4[15.0%(67/447)]型,其中L2型又分为3个亚型[L2.1型:1.9%(7/378)、L2.2型: 37.0%(140/378)、L2.3型: 61.1%(231/378)]。突变类型为katG-315-S/T、rpsL-43-K/R和embB-306-M/V在L2型菌株中的突变率[分别为79.6%(301/378)、50.5%(191/378)、23.0%(87/378)]明显高于L4型菌株[分别为61.2%(41/67)、10.4% (7/67)、10.4% (7/67)](χ 2值分别为10.874、37.021、5.396,P值分别为0.001、0.000、0.020),且PAS耐药突变类型folC-43-I/T和thyA-75-H/N仅出现在L2型菌株中;其中katG-315-S/T在L2.2型菌株中突变频率[88.6%(124/140)]高于L2.3型[74.5%(172/231)](χ 2=10.764,P=0.000),而inhA-15-C/T(INH)、rpoB-450-S/L、rpsL-43-K/R和inhA-15-C/T(Eto) 在L2.3型菌株中的突变频率[分别为8.2% (19/231)、61.9%(143/231)、 59.3% (137/231)、15.6% (36/231)]明显高于L2.2型[分别为2.9% (4/140)、49.3% (69/140)、37.9% (53/140)、3.6% (5/140);χ 2值分别为4.319、5.668、16.053、12.797,P值分别为0.038、0.017、0.000、0.000)]。结论 深圳市MDR-MTB菌株中11种药品耐药基因主要突变类型分别为katG-315-S/T、rpoB-450-S/L、rpsL-43-K/R、embB-306-M/V、pncA启动子-11-T/C、gyrA-90-A/V、rrs-1401-A/G、inhA-15-C/T、thyA-75-H/N;基因型为L1、L2和L4型,以L2.2型、L2.3型和L4型为主。 相似文献
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目的 探讨液体培养在我国HIV感染者与AIDS患者结核病早期诊断中应用的可行性,为Mtb与HIV双重感染的防治提供参考。 方法 实验组选取安徽、河南、新疆、广西、云南5个省、自治区中开展中国全球基金结核病项目Mtb与HIV双重感染防治工作的10个地市(实际纳入8个地市),在新发现和既往可随访的15 199例HIV感染者与AIDS患者中选取符合条件的2162例进行液体培养,记录相关结果信息,并与同期收集的同地区全部15 199例和全国67 186例HIV感染者与AIDS患者(对照组)通过常规结核病检查方法获得的结核病诊断率进行比较。 结果 实验组样本阳性率14.2%(306/2162),明显高于同地区同期总体结核病诊断率5.2%(793/15 199),差异有统计学意义(χ2=254.9,P<0.0001);实验组阳性率(14.2%)与同地区总体结核病诊断率(5.2%,793/15 199)也都分别高于全国同期HIV感染者与AIDS患者的结核病诊断率(2.3%,1525/67 186),差异均有统计学意义(χ2=1150.7、393.8,P值均<0.0001)。 结论 液体培养与结核病症状筛查、痰涂片和X线胸片检查等常规结核病检查方法相比,可以显著提高HIV感染者与AIDS患者的结核病检出率,对于HIV感染者与AIDS患者的结核病早期诊断有着重要意义,适合在我国进行推广。 相似文献
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结核分枝杆菌耐药机制 总被引:2,自引:0,他引:2
耐多药结核病和广泛耐药结核病在人类免疫缺陷病毒感染时代的不断增长是有效结核病控制的主要威胁。来自染色体自发突变的结核分枝杆菌耐药概率很低。疾病治疗过程中由于不稳定的药品供应、不合理的治疗方案以及差的患者依从性等人为选择因素导致临床耐药结核病大量发生。已经阐明主要的一线和二线药物包括利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、乙胺丁醇、氨基糖甙类和氟喹诺酮类的耐药分子机制。结核分枝杆菌菌株耐药性与毒性/传染性之间的关系需要进一步研究。理解结核分枝杆菌耐药机制将有助于快速分子诊断工具的发展并且可能进一步指导结核病治疗的新药的研制。 相似文献
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目的 了解县镇地区肺结核流行现状及其易感因素、结核分枝杆菌耐药谱和优势耐药组合模式方法 采用罗氏培养基和PNB/TCH生长试验,对杭州市周边7个县镇临床诊断为肺结核的2 840例初治和712例复治患者抗酸染色阳性痰标本进行分枝杆菌分离培养和菌种鉴定。采用浓度比例法,检测3 152株结核分枝杆菌对链霉素(SM)、异烟肼(INH)、利福平(RIF)、乙胺丁醇(EMB)、氧氟沙星(OFX)和卡那霉素(KM)的敏感性。采用统计学方法分析结核分枝杆菌优势耐药模式以及肺结核易感因素结果 3 552株分枝杆菌中,88.7%(3 152/3 552)为结核分枝杆菌,11.3%(400/3 552)为非结核分枝杆菌,复治患者非结核分枝杆菌感染率(23.7%)显著高于初治患者(8.1%)(χ2=138.67,P<0.05)。3 152株结核分枝杆菌对6种抗结核药物总耐药率为25.1%,对一线抗结核药物耐药、耐多药和广泛耐药率分别为15.9%、4.6%和0.2%,其中SM(χ2=50.40, P<0.05)和INH耐药率较高(χ2=47.81, P<0.05)。结核分枝杆菌有35种耐药谱,优势耐药组合模式分别为INH+SM(χ2=19.19,P<0.05)、INH+RFP+SM(χ2=24.85,P<0.05)和IHN+RFP+SM+EMB(χ2=20.11,P<0.05)。来自复治患者的结核分枝杆菌总耐药、一线抗结核药物耐药、耐多药和广泛耐药率(38.3%、36.1%、14.0%和0.9%)均显著高于初治患者(22.3%、19.3%、2.7%和0.04%)(P<0.05)。本地户籍60岁以上男性农民肺结核发病率显著较高(χ2=1 435.29,P<0.05)结论 本县镇地区肺结核疫情防控形势依然严峻,老年男性农民是肺结核易感人群,复治肺结核患者非结核分枝杆菌感染率以及结核分枝杆菌耐药性显著高于初治肺结核患者,提示县镇地区肺结核患者抗结核药物规范化治疗有待加强。 相似文献
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目的 了解深圳市耐多药结核分枝杆菌(multidrug-resistantMycobacterium tuberculosis ,MDR-TB)的分子流行病学特征。 方法 参照WHO/IUATLD标准,使用L-J药敏培养基,采用1%比例法药敏试验筛选出敏感株和异烟肼(isoniazid,INH)、利福平(rifampicin, RFP)双耐药临床分离株,通过DNA测序检测深圳地区153株敏感株与132株MDR-TB的INH耐药基因 kat G、inh A、oxy R- ahp C基因间区域及RFP耐药基因 rpo B碱基排列顺序,运用DNASTAR和blastn进行序列分析。 结果 153株敏感株突变率为27.5%(42/153)。132株MDR-TB突变率为98.5%(130/132),其中kat G基因突变率为73.5%(97/132),68.9%(91/132)为 kat G315位突变; inh A基因突变率为18.2%(24/132),11.4%(15/132)为启动子区域突变,未发现 inh A94特异突变株; ahp C基因突变率为16.7%(22/132),10.6%(14/132)为启动子区域突变; rpo B基因81-bp核心区域突变率为93.2%(123/132)。 结论 kat G315、inh A启动子区域、ahp C启动子区域以及 rpo B 81-bp核心区域突变为深圳地区耐多药结核分枝杆菌主要突变类型,与其他国家和地区差异无统计学意义;但深圳地区未见 inh A94突变株。 相似文献
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艾滋病的迅速传播已成为世界性关注的热点问题。我国援外医疗队在东非某国工作的2年时间里,共治疗6例HIV感染者合并结核的病人,现报告如下。1 资料与方法1.1 临床资料 1997年 3月~1999年 1月间,共收治6例抗HIV抗体阳性合并有结核的患者。其中男性4例,女性2例,平均年龄34岁。询问病史:3例有性乱史,1例为同性恋,另2例女性患者的丈夫已分别于1995年和1996年死于艾滋病。6例患者中,结核性脓肾2例,结核性附睾脓肿2例,结核性腹膜炎2例。入院时均有低热、盗汗症状。6例患者均有疟疾病史,且伴有不同程度的贫血和脾肿大。全组病 相似文献
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目的分析老年肺结核病人的耐药状况,为监控结核菌耐药性变化趋势和制定诊治对策提供参考依据。方法回顾性收集2013年3月至2017年12月我科收治2291例分支杆菌培养为结核分枝杆菌的病人的药敏试验资料,按年龄分为老年组(≥60岁)和中青年组(15-59岁),对比分析两组病人的耐药率和耐药类型分布。结果老年组463例中耐药104例,耐药率为22. 4%;获得性耐药率为48. 1%,显著高于初始耐药率的14. 9%(P 0. 001)。老年组的总耐药率和初始耐药率与中青年组差异不明显(P 0. 05),而获得性耐药率更低(P 0. 05)。老年组MR-TB的耐药率为9%、PR-TB为3. 2%、MDR-TB为9. 7%、XDR-TB为0. 4%,与中青年组比较差异无统计学意义; RR-TB的耐药率为12. 3%,低于中青年组的16%(P 0. 05)。获得性耐药中,老年组的MDR-TB和RR-TB耐药率低于中青年组(P 0. 05)。异烟肼(INH)和利福平(RFP)是耐药率最高的抗结核药物,在老年组中分别为19. 4%和12. 3%。老年组利福平的耐药率在获得性耐药中较中青年组低(P 0. 05),链霉素(S)的耐药率则在初始耐药与获得性耐药中均低于中青年组(P 0. 05),其余药物的耐药性差异不明显(P 0. 05)。结论老年结核病人结核分枝杆菌对利福平和链霉素的耐药率低于中青年;获得性耐药中MDR-TB和RR-TB的发生率较中青年低。 相似文献
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为了解广东省茂名市结核分枝杆菌初始耐药水平和今后动态观察耐药的趋势,并与全国各地进行对比分析,掌握疫情,为研究防治策略提供可靠的依据。[第一段] 相似文献
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结核病是由结核分枝杆菌引起的一种人兽共患慢性传染病,随着结核分枝杆菌自身演变和抗结核病药物的使用,导致结核分枝杆菌产生耐药性。目前根据结核病患者是否接受过抗结核病药物的治疗,将结核分枝杆菌的耐药性分为两种,一种是原发性耐药,另一种是获得性耐药。为了探索结核分枝杆菌的耐药机制,本文对原发性与获得性耐药机制进行阐述,为后续新型抗结核病药物的研发奠定理论基础。 相似文献
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目的了解长沙地区结核分枝杆菌耐药情况。方法分析本院2012年1月-2015年10月分离的6198株结核分枝杆菌对7种抗结核药物的耐药情况。结果 6198株结核分枝杆菌复合群菌株耐药率顺位前5位依次为INH(14.18%)、RFP(13.57%)、SM(12.31%)、EMB(3.87)、OFLX(2.60);总耐药率为20.56%,耐多药占9.31%,多耐药占4.52%,广泛耐药占0.45%;除2012年20岁以下年龄组女性耐药结核菌的检出率略高于男性外,其余年份各年龄组男性均高于女性;复治患者的耐药率(24.76%)高于初治患者(19.49%),两者差异有统计学意义(χ~2=176.21,P0.001);结论本院结核分枝杆菌耐药率总体低于全国第五次结核病流行病学调查结果,但耐多药率高于全国水平,耐药状况仍然严峻。 相似文献
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目的 探讨非结核分枝杆菌(non - tuberculosis mycobacterium,NTM)的流行病学特征和耐药现状,为NTM肺病的防治策略提供科学依据.方法 对2002 - 2011年四川省结核病参比实验室收集的分枝杆菌进行药物敏感性检测及菌种鉴定.对确诊为NTM病例进行流行病学分析.结果 2002 - 2011年四川省结核病参比实验室对2356个分枝杆菌菌株进行菌种鉴定,确诊为NTM的为251株,占10.65%,其中245株对异烟肼、对氨基水杨酸钠、乙胺丁醇、利福平、链霉素等常用抗结核药物存在不同程度的耐药,耐药率高达97.60%,且大多菌株同时对多种抗结核药物耐药.结论 四川省NTM对抗结核药物的耐药率高,研究、探索抗NTM的新药及更为有效的诊断方法是当务之急. 相似文献
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目的 探讨MLVA基因分型法在云南大理地区合并HIV双重感染者结核分枝杆菌基因分型中的运用,初步研究其基因型特征。方法 选取大理地区61株合并HIV双重感染者结核分枝杆菌临床分离株,采用聚合酶链反应(PCR)分别对VNTR位点进行检测分析,应用BioNumerics(6.6)软件进行聚类分析。结果 共对61株合并HIV双重感染者的结核分枝杆菌的15个VNTR位点进行检测,呈现出明显的基因多态性。各个位点的分辨能力不同,其中MIRU26(0.839)最高,MIRU4(0.341)最低。经聚类分析,61株双重感染结核分枝杆菌菌株可分为5个基因群,61个基因型,以Ⅰ型占比例最大占51.6%(32/61);H37Rv减毒株在Ⅱ型。结论 大理地区合并HIV双重感染者结核分枝杆菌VNTR基因存在明显多态性,主要流行菌群为北京家族基因型。 相似文献
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据Medscape.com10月25日报道(原载Am J Respir Crit Care Med2004;170:793—798),堪萨斯分枝杆菌是一种致病性很强的非结核分枝杆菌。在痰涂片镜检和支气管灌洗物中找到病原菌时,为了保证长期生存,HIV感染者肺部堪萨斯分枝杆菌感染一般需要积极治疗。但对所有的HIV感染者呼吸道分离出堪萨斯分枝杆菌是否都需要抗生素治疗的问题上存在不同意见。 相似文献
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目的:探讨母牛分枝杆菌菌苗对HIV合并结核分枝杆菌潜伏感染(latent tuberculosis infection, LTBI)者T细胞亚群的影响及其使用的安全性。方法:采用多中心前瞻性队列研究方法,连续纳入2003年6月至2020年6月宁夏回族自治区银川市AIDS管理机构管理的经结核菌素皮肤试验筛查确诊的96例HIV感染合并LTBI者作为研究对象。研究对象按照银川市所辖县区划分为试验组(63例)和对照组(33例)。试验组在高效抗逆转录病毒治疗的基础上,注射母牛分枝杆菌菌苗22.5μg/次,每2周注射1次,共3次。对照组在高效抗逆转录病毒治疗的基础上,口服异烟肼300 mg/次,1次/d,连续服用6个月。于治疗前和治疗结束后1个月、3个月随访时,检测并比较两组研究对象的CD4+、CD8+、CD3+T细胞等免疫细胞水平及肝功能指标变化情况;同时,评价两组研究对象不良反应发生情况。结果:试验组在治疗结束后1个月,CD3+T细胞水平为(1583.83±584.69)个/μl,明显高于治疗前[(1221... 相似文献
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因耐药甚至耐多药的结核分枝杆菌(Mycobac-terium tuberculosis,MTB)的感染,使原来可治愈的结核病变成难以治疗的致死性疾病。据WHO估计全球有5000万人感染耐药结核杆菌,其中中国最多,占到11%^[1-2],耐药性结核病的暴发流行已成为世界范围内的严重的公共卫生问题。最新研究发现, 相似文献