多囊卵巢综合征相关miRNA调控网络的构建及生物信息学分析

目的 利用生物信息学方法对多囊卵巢综合征（PCOS）患者卵巢颗粒细胞差异表达的miRNA靶基因进行分析,通过构建miRNA-mRNA调控网络,为PCOS潜在发病机制研究提供新思路。方法 选择PCOS患者卵巢颗粒细胞miRNA表达数据集GES84376作为分析对象,并利用Limma分析差异表达miRNA。利用在线分析网站对差异表达的miRNA靶基因进行预测。应用DAVID网站进行生物信息学分析,并利用SRTING网站及Cytoscape软件构建miRNA-mRNA调控网络。结果 共筛选出251个miRNAs,其中3个miRNA显著上调（miR-3188、miR-4433及miR-3135b）。富集通路（KEGG）分析显示,miR-3188、miR-4433及miR-3135b的靶基因在mTOR信号通路、MAPK信号通路及PI3K/Akt信号通路中富集程度最高。通过STRING网站进行蛋白互作分析,其互作程度最高的前10位关键基因分别为：MAPK1、MDM2、FRS2、AGT、IGF1R、HDAC1、AGO1、AKT3、MTOR及CREB1。通过构建miRNA-mRNA调控网络图,结果显示...     

HER2高表达胃癌细胞中miR-4728-3p表达及生物信息学分析

目的 探讨HER2高表达的胃癌细胞中miR-4728-3p表达状况及其调控靶基因所涉及的信号通路,旨在初步分析miR-4728-3p在胃癌中的作用机制及其与HER2的相关性.方法 首先采用Real-time PCR技术检测胃癌细胞株NCI-N87中miR-4728-3p及HER2 mRNA,然后通过miRanda、DIANA-microT、Targetscan和Targetmine软件预测miR-4728可能的靶基因,并通过DAVID数据库进行靶基因功能富集分析及信号转导通路富集分析.结果 miR-4728-3p及HER2 mRNA在胃癌细胞中均高表达,二者呈正相关(r=0.990,P=0.000).miR-4728-3p预测靶基因共有54个,靶基因功能主要富集于转录活性调节(P=0.014)、DNA结合(P=0.019)及蛋白质磷酸化氨基酸结合(P=0.036)等分子功能,RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录调控(P=0.001)、转录调控(P=0.003)及细胞内信号级联(P=0.021)等生物学过程以及轴突部分(P=0.008)等细胞组分上;信号转导通路则主要富集于肿瘤通路(P=0.013)和卵母细胞减数分裂通路(P=0.041).结论 miR-4728-3p在HER2高表达的胃癌细胞中表达上调,二者表达呈正相关;生物信息学分析提示miR-4728-3p通过调控其靶基因参与胃癌的发生发展.     

基于生物信息学构建上皮性卵巢癌组织中miRNA-mRNA调控网络

目的 通过生物信息学构建上皮性卵巢（EOC）组织中miRNA-mRNA调控网络,以期为卵巢癌机制学研究提供研究思路。方法 选择GEO数据库中关于上皮性卵巢癌细胞外泌体及裂解物差异表达miRNA数据集GSE197892,选取其交集miRNA及各自表达显著的miRNA作为研究对象。应用在线分析网站预测其靶基因,并对其进行生物信息学分析,同时构建miRNA-mRNA调控网络。结果 外泌体组共筛选出的差异表达miRNA共30个,裂解物组共有32个,两组交集miRNA共有3个。外泌体组可筛选出3个显著差异表达miRNA,裂解物组则有4个。生物信息学分析显示,三组靶基因均于癌症通路中富集程度最高;同时,交集组靶基因于PTEN/Akt、FoxO等信号通路中显著富集;外泌体组靶基因于Hippo、Wnt等信号通路中显著富集;裂解物组靶基因则还显著富集于mTOR、MAPK等信号通路中。调控网络显示外泌体组、裂解物组、交集miRNA及其靶基因之间均有联系,多个靶基因可受多个miRNA的共同调控;同时,miR-214-3p及其靶基因FAT4、TMX4、SEMA4D、IGSF3及RRP7A处于调控网络的核心位置...     

基于HepG2细胞胰岛素抵抗模型探讨miR-7-5p对Itch基因的靶向作用

目的:通过体外建立Hep G2细胞胰岛素抵抗模型,检测胰岛素抵抗状态下微小RNA-7-5p(miR-7-5p)及其预测靶基因Itch的差异表达,初步探讨miR-7-5p对Itch基因的靶向作用及其与胰岛素抵抗的关系。方法:采用适宜浓度的软脂酸诱导Hep G2细胞,建立体外胰岛素抵抗模型;基于生物信息学分析预测miR-7-5p可能作用的靶基因及其富集的相关信号通路;运用RT-q PCR和Western blot技术检测在胰岛素抵抗状态下miR-7-5p和Itch的表达变化。结果:0.25 mmol/L的软脂酸作用于Hep G2细胞24 h可诱导细胞产生胰岛素抵抗,RT-q PCR检测表明,与阴性对照组相比,胰岛素抵抗组的miR-7-5p表达下调(P0.01)。生物信息学分析结果表明,miR-7-5p有相当数量的靶基因富集于泛素-蛋白酶体系统,其中E3泛素连接酶Itch基因是与胰岛素抵抗最为相关的靶基因;Western blot结果揭示,在胰岛素抵抗状态下,Hep G2细胞中Itch蛋白表达上调(P0.01)。结论:miR-7-5p可能参与了胰岛素抵抗的病理生理过程,其机制可能通过靶向调控Itch基因的表达,进而直接或间接影响胰岛素信号通路的正常转导。     

自发性高血压大鼠延髓microRNA差异表达分析

目的　探讨自发性高血压大鼠延髓microRNA（miRNA）差异表达谱及其靶基因生物信息学分析。 方法　采用自发性高血压大鼠模型（SHR组）,同周龄SD大鼠为对照组（Control组）。利用miRNA芯片检测大鼠延髓中miRNAs差异表达谱。 结果　与对照组比较,SHR组尾动脉收缩压显著升高（P＜0.0001）;SHR组延髓组织miRNAs有显著差异表达谱,16个miRNAs表达上调和7个miRNAs表达下调（1.5-fold change cutoff, P<0.05）。qRT-PCR验证结果显示,与对照组比较,SHR组延髓miR-153、miR-193及miR-301a表达显著下降,与芯片结果一致。生物信息学分析显示,差异表达miRNAs可能调控2775个靶基因（target score≥83）。这些靶基因主要富集在12个信号通路,包括磷脂酰肌醇3-激酶（Phosphatidylinositide3-kinase,PI3K）通路等。 结论　自发性高血压大鼠延髓组织中miR-153、miR-193及miR-301a明显下调,且生物信息学分析提示PI3K通路介导神经炎症可能作为高血压中枢相关差异表达miRNAs调控靶基因介导的主要致病通路。     

结肠癌化疗耐药相关miRNA表达谱的初步研究

目的:应用基因芯片技术筛选结肠癌耐药相关微小RNAs (miRNAs),探究miRNAs对化疗耐药的调控机制。方法:采用基因芯片技术分析结肠癌细胞系HCT8及其耐长春新碱细胞系HCT8/v中miRNAs的表达差异,对部分差异表达的miRNAs应用RT-qPCR进行验证,对表达差异显著的miRNAs进行靶基因预测,利用Gene Ontology (GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对预测到的靶基因进行生物信息学分析。结果:筛选出342个差异表达miRNAs,其中190个表达上调,152个表达下调。RT-qPCR验证结果示miR-125-5p、miR-181c-5p和miR-153-3的表达情况和芯片检测结果一致;miR-130a-3p和miR-149-3p的表达与芯片检测结果不一致。GO分析结果显示,耐药相关基因主要富集的旁路是RNA聚合酶II调控区序列特异性DNA结合旁路,主要通过正向调节发挥作用,位置主要是在细胞内有界细胞器上。KEGG分析结果显示,耐药相关基因最为富集的是轴突导向通路、胰岛素信号通路及磷脂酶D信号通路。结论:miRNAs与结肠癌化疗耐药密切相关。对这...     

hsa-miR-429的靶基因预测及功能分析

目的通过生物信息学方法预测hsa-miRNA-429的靶基因及其靶基因的可能功能。方法通过miRbase和Clustal在线数据库对miR-429的碱基序列及序列在各物种间的保守性和进化发展进行分析;应用TargetScan和miRDB数据库预测hsa-miR-429的靶基因;将预测得到的两个数据库的靶基因交集用DAVID在线数据库进行组织器官表达程度分析、功能富集分析和信号转导通路富集分析。结果 miR-429在人、大猩猩、鼠等多个物种之间具有高度保守性;人的miR-429与猕猴的hsa-miR-429-3p更为接近。两个靶基因预测软件预测的靶基因取交集后共有252个,在血管、肾组织中表达丰富度较高;涉及转录调控、心脏血管平滑肌细胞发育、心肌细胞增殖等51个生物过程,影响蛋白结合、DNA结合、转录因子结合等17个分子功能,显著富集于癌症通路、肾细胞癌、心肌细胞肾上腺素能信号转导等16个信号通路中。结论 hsa-miR-429的靶基因参与体内多种生物活动,且在癌症及心血管疾病的进展中起着重要作用。     

miR-194-5p在微流控芯片筛选的肺癌间质表型亚系的作用

目的分析肺癌间质表型亚系A3细胞中上皮间质转化(EMT)相关的miR-194-5p鉴定、分析及其靶基因功能富集的生物学过程和信号通路。方法使用微流控芯片筛选母系肺癌A549细胞获得间质表型亚系A3细胞,利用miRCURYTM芯片筛选差异性表达的miRNA。利用MTT、Transwell实验检测miR-194-5p对亚系细胞增殖、迁移、侵袭能力的影响。应用Miranda、MiRBase、TargetScan数据库和DAVID在线软件对miR-194-5p进行靶基因预测及相关信号通路、生物学功能富集分析。结果成功筛选获得具有间质表型亚系A3细胞,与母系A549细胞相比,在A3亚系中miR-194-5p的表达水平显著下调,转染miR-194-5p mimics后细胞迁移和侵袭能力发生显著降低但增殖未受影响;转染miR-194-5p inhibitor后细胞的迁移和侵袭能力增强。miR-194-5p的48个靶基因主要在蛋白质结合等生物学过程中起作用,信号通路显著富集于TGF-β等EMT相关信号转导通路。结论从微流控芯片获得的间质表型细胞亚系成功筛选EMT相关miRNA,其中miR-194-5p抑制肺癌EMT进程,是潜在的治疗靶点。     

lncRNA ZFAS1调节miR-136-5p/IGF1R轴对多囊卵巢综合征小鼠胰岛素抵抗的影响

目的 探究长链非编码RNA(lncRNA)锌指结构反义转录本1(ZFAS1)调节miR-136-5p/胰岛素样生长因子1受体（IGF1R）轴对多囊卵巢综合征（PCOS）小鼠胰岛素抵抗（IR）的影响。方法 随机把C57BL/6J小鼠分为Ctrl组、PCOS组、Si-NC组、Si-ZFAS1组、antagomir-NC组、miR-136-5p antagomir组、miR-136-5p antagomir+Si-ZFAS1组,采用高脂饮食联合脱氢表雄酮建立PCOS小鼠模型（Ctrl组除外）,检测性激素指标、糖代谢指标水平变化;H-E染色观察卵巢组织形态学特征;RT-qPCR检测卵巢组织ZFAS1、miR-136-5p表达水平;Western blot检测卵巢组织IGF1R蛋白表达水平;双荧光素酶报告基因法（DLR）验证ZFAS1/miR-136-5p、miR-136-5p/IGF1R靶向关系。结果 与Ctrl组比较,PCOS组小鼠性激素水平紊乱,卵巢呈多囊样改变,伴随明显胰岛素抵抗,同时卵巢组织中ZFAS1、IGF1R表达增加,miR-136-5p表达减少;下调ZFAS1表达后,PCOS小...     

甲状腺癌中miR-222关键靶基因预测及其信号通路分析

目的 利用生物信息学技术预测人类miR-222的靶基因，并分析其可能参与甲状腺癌的生物学过程和信号通路。方法 通过TCGA数据库研究miR-222的表达与甲状腺癌的关系，然后TCGA中表达下调的基因和网站预测的miR-222靶基因进行取交集得到重叠基因，再进行生物信息学分析确定与甲状腺癌相关的关键miR-222靶基因和通路，最后通过GEPIA对靶基因进行表达验证以及miR-222和靶基因的相关性分析。结果 miR-222在甲状腺癌中表达上调，富集分析表明miR-222很有可能参与血管紧张素受体-配体结合的调节，其中一个可能的靶基因是AGTR1，其在甲状腺癌中表达下调，与miR-222的表达呈负相关。结论 上调的miR-222可能以AGTR1为靶标，从而调节甲状腺癌中血管紧张素受体-配体结合发挥作用。     

miR-122-5p 靶向PPP2R2A 在婴儿胆道闭锁中的作用机制研究

目的:探究miR-122-5p在婴儿胆道闭锁(BA)中的作用及其机制。方法:RT-qPCR检测miR-122-5p在BA患儿及胆总管囊肿(CC)患儿血清中的表达,及miR-122-5p和PPP2R2A mRNA在LX-2细胞中的表达。CCK-8检测不同组别中LX-2细胞的增殖活性。Western blot检测p-AKT、AKT、PPP2R2A及Ki67蛋白在LX-2细胞内的表达。通过生物信息学网站预测miR-122-5p的下游靶基因,并通过双荧光素酶报告基因实验验证其靶向关系。结果:miR-122-5p在BA患儿血清中的表达水平显著升高。抑制miR-122-5p的表达显著抑制LX-2细胞的增殖、细胞内AKT的激活并促进LX-2细胞的凋亡,过表达PPP2R2A对LX-2细胞生物学行为的影响与前述一致。双荧光素酶报告基因实验证实PPP2R2A是miR-122-5p的下游靶基因。同时过表达LX-2细胞内miR-122-5p及PPP2R2A的表达水平对LX-2细胞的生物学行为无显著影响。结论:miR-122-5p在BA患儿血清中过表达,并通过体外实验证实miR-122-5p靶向PPP2R2A影响AKT信号通路的激活调控肝纤维化的进程。     

系统性红斑狼疮患者中miR-410 表达及其靶基因生物信息学分析

目的:检测miR-410 在系统性红斑狼疮患者(SLE)中的表达水平,运用生物信息学方法研究miR-410 及其靶基因在SLE 发生发展过程中的作用。方法:定量检测miR-410 在SLE 患者外周血单个核细胞中的表达水平,并通过miR-410序列分析,靶基因预测和Genecards 数据库分析,进一步对其靶基因进行GO 富集和KEGG Pathway 分析。结果:miR-410 在SLE 患者中表达显著降低,其核苷酸序列在多物种间呈高度保守性。受miR-410 调控且与SLE 疾病相关的潜在靶基因包括FASLG、CSF2、IFNAR2、MAPK1、PLCG2、IL4 等。GO 分析发现miR-410 的靶基因参与细胞生长增殖、程序性死亡、细胞分化、免疫系统发育等多个生物过程。KEGG Pathway 分析发现miR-410 的靶基因显著富集在肿瘤途径信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路、胶质瘤信号通路、黑色素瘤信号通路、TGF-β和JAK-STAT 信号通路等。结论:miR-410 可能通过直接靶向作用其调控靶分子,影响SLE 患者体内多条信号通路的网络调控,从而参与SLE 疾病的发生和发展。     

过表达miR-151a-3p抑制PC-3前列腺癌细胞增殖和迁移

目的研究上调微小RNA-151a-3p(miR-151a-3p)对前列腺癌细胞增殖和迁移的影响和机制。方法采用实时荧光定量PCR检测PC-3M、C4-2B、22RV1、DU-145、PC-3、LNCaP人前列腺癌细胞和RWPE-1人正常前列腺上皮细胞中miR-151a-3p的表达量。以miR-151a-3p表达量最低的PC-3细胞为研究对象,生物信息学预测并采用双荧光素酶报告基因实验检验miR-151a-3p的潜在靶基因。转染miR-151a-3p模拟物或阴性对照微小RNA(miR-NC)至PC-3细胞。实时荧光定量PCR检测miR-151a-3p和潜在靶基因mRNA的表达量,Western blot法检测靶基因及下游信号通路蛋白表达量。采用MTT法检测PC-3细胞的增殖,Transwell~(TM)实验检测PC-3细胞的迁移能力。结果 miR-151a-3p在前列腺癌细胞的表达量明显低于RWPE-1人正常前列腺上皮细胞,其中PC-3细胞中的表达量最低。生物信息学预测及双荧光素酶报告基因实验表明NIMA相关激酶2(NEK2)是miR-151a-3p的潜在靶基因。转染miR-151a-3p模拟物后,PC-3细胞中miR-151a-3p的表达量明显上升,NEK2基因的表达量明显降低,NEK2基因下游磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B-哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(PI3K-AKT-mTOR)信号通路蛋白水平降低。上调miR-151a-3p明显抑制前列腺癌PC-3细胞的增殖和迁移。结论miR-151a-3p在前列腺癌细胞中表达降低,上调miR-151a-3p的表达可通过降低NEK2基因及下游PI3K-AKT-mTOR信号通路蛋白的表达抑制前列腺癌PC-3细胞的增殖和迁移。     

乳腺癌相关成纤维细胞miRNA表达的检测和分析

目的研究人乳腺癌微环境癌相关成纤维细胞(CAF)与正常成纤维细胞(NF)miRNA表达的差异及其对CAF的生物学功能的影响。方法运用1型胶原酶消化法分别处理临床乳腺癌患者的癌组织和对应癌旁组织标本,原代分离培养CAF和NF细胞;利用免疫荧光法和Western blot法分析CAF和NF细胞成纤维细胞分泌蛋白(FSP)的表达情况,对所分离培养的细胞进行纯度和特性鉴定;利用TranswellTM实验比较CAF与NF细胞的侵袭能力;利用miRNA芯片和芯片结果显著性差异(SAM)分析法分析CAF与NF细胞miRNA表达的差异;对差异miR-205和miR-221,在原代培养的CAF和NF进行实时定量PCR(qRT-PCR)验证;利用多种生物信息学软件预测差异miRNA的靶基因;利用DAVID软件对靶基因进行信号通路富集度分析。利用ELISA检测TGF-β和IL-6信号通路的核心蛋白基质金属蛋白酶1(MMP-1)、MMP-2和MMP-9的表达差异。结果成功分离得到原代培养的CAF与NF细胞,纯度大于95%;与NF细胞相比,CAF细胞的侵袭能力明显增强;miRNA芯片分析结果显示,CAF有10个变化倍数1.5的异常表达miRNA(P0.05),其中3个上调表达(miR-221-5p、miR-31-3p、miR-221-3p),7个下调表达(miR-205、miR-200b、miR-200c、miR-141、miR-101、miR-342-3p、let-7g)。信号通路富集度分析发现,miRNA靶基因与细胞分化、细胞黏附、细胞迁移、细胞增殖、细胞分泌和细胞间相互作用等密切相关,其中,异常表达的miR-200b/c和miR-141等miRNA通过抑制其靶基因,影响TGF-β信号通路、IL-6信号通路,进而影响CAF的侵袭和转移。结论人乳腺癌微环境CAF的miRNA表达谱发生显著变化,CAF细胞中异常表达miRNA可能参与了NF向CAF的转化,并与CAF细胞的增殖、黏附、侵袭、转移有密切关系。     

肝细胞癌中microRNA-375调控的基因网络分析

 目的: 探讨肝细胞癌中miR-375的表达及其调控的相关靶基因和信号通路。方法: 采用原位杂交检测miR-375在人肝癌组织芯片的表达情况;人全基因组表达谱芯片检测4株肝癌细胞株;MAS生物信息学软件筛选miR-375调控靶基因及相关信号通路。结果: 原位杂交结果显示miR-375在肝癌组织中的表达明显高于癌旁组织(P < 0.05);人全基因组表达谱芯片结果分析显示4株转染miR-375的肝癌细胞的共上调基因有20个,共下调基因有17个;MAS生物信息学软件分析显示4株转染miR-375的肝癌细胞共有的上调信号通路有54条,下调信号通路有48条。结论: miR-375与肝细胞癌有密切的关系。对miR-375调控的肝细胞癌相关靶基因与信号通路进行多元化筛选,为后续全面深入的研究肝细胞癌发生发展的机制提供了便利。     

严重烫伤大鼠早期胫骨前肌组织中微小RNA表达谱数据的靶基因分析

目的初步确定严重烫伤大鼠早期胫骨前肌组织中差异表达微小RNA(miRNA)的靶基因,从而为进一步机制研究指明方向。 方法采用高通量芯片技术检测严重烫伤大鼠早期胫骨前肌miRNA表达谱数据,筛选部分差异明显且相关性较好的miNRA,包括miR-1-3p、miR-206-3p、miR-133a-3p、miR-22-3p、miR-30a-5p、miR-30d-3p、miR-190b-5p、miR-628和miR-678,利用互联网络检索数据库Mirbase、Miranda和Mirdb,对这些差异miRNA进行靶基因预测。 结果3大数据库预测结果显示差异miRNA主要调控79个靶基因,网络关系图显示了miR-1-3p、miR-206-3p、miR-133a-3p、miR-22-3p、miR-30a-5p、miR-30d-3p、miR-190b-5p、miR-628和miR-678等miRNA及其预测靶基因之间复杂的调控网络关系。 结论根据初步的预测结果,miR-1-3p和miR-206-3p共同调控的靶基因较多,可作为进一步机制研究的理论依据。     

中重度哮喘和轻度哮喘差异表达microRNA及生物信息学分析

目的 探讨中重度哮喘生物标志物和致病机制，为更有效的中重度哮喘治疗和控制提供线索。方法 采用microRNA芯片检测中重度哮喘患者与轻度哮喘患者血清中的差异表达microRNA。通过miRanda,TargetScan,RNAhybrid和miRTarbase数据库对microRNA的靶基因进行预测，并使用GO功能聚类分析和KEGG信号通路富集分析对microRNA的靶基因进行功能解析。使用qRT-PCR检验慢性哮喘小鼠肺组织中microRNA的含量。结果 与轻度哮喘患者相比，miR-4746-3p、miR-6798-5p和miR-762等在中重度哮喘患者血清中上调，而miR-26a-5p、miR-377-3p和miR-410-3p等下调。与轻度哮喘相比，慢性炎症调控、脂质吸收、储存、分解代谢功能及PI3K-Akt信号通路、Wnt信号通路、TOR复合体等细胞增殖相关通路在中重度哮喘中显著富集。此外，慢性哮喘模型鼠呈现出与重度哮喘患者类似的病理表型如炎性细胞浸润与气道重塑，且miR-377-3p和miR-410-3p在慢性哮喘小鼠肺组织中也显著下调。结论 我们的研究提供了中重度哮喘可能的...     

上调miR-34b-5p通过抑制胰岛素样生长因子1受体干扰肾癌Caki-1细胞的增殖和侵袭

目的观察微小RNA-34b-5p(miR-34b-5p)对人肾癌细胞增殖和侵袭的影响及分子机制。方法采用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR, qRT-PCR)检测人肾癌细胞ACHN、Caki-1、OS-RC-2、786-O、A498和人正常肾小管上皮细胞HK-2中miR-34b-5p的表达量。以miR-34b-5p表达量最低的Caki-1细胞为转染对象,应用脂质体转染miR-34b-5p或微小RNA(miR-NC)。采用qRT-PCR检测各组细胞中miR-34b-5p的表达水平。MTT法和Transwell侵袭实验检测肾癌细胞的增殖和侵袭能力。生物信息学预测并采用双荧光素酶报告基因验证miR-34b-5p的潜在靶基因。qRT-PCR和Western blot法分别检测miR-34b-5p潜在靶基因及下游通路蛋白的表达。结果肾癌细胞中miR-34b-5p的表达量低于正常肾小管上皮细胞。用脂质体转染miR-34b-5p后Caki-1细胞中miR-34b-5p的表达量明显高于miR-NC组,提示过表达成功。上调miR-34b-5p可抑制肾癌细胞的增殖能力和侵袭能力。生物信息学预测和双荧光素酶报告基因证实胰岛素样生长因子1受体(insulin like growth factor 1 receptor, IGF1R)为miR-34b-5p的靶基因。上调miR-34b-5p可降低肾癌Caki-1细胞中IGF1R基因及PI3K/Akt信号通路蛋白的表达量。结论上调miR-34b-5p可抑制人肾癌Caki-1细胞的增殖和侵袭,其可能的分子机制为降低IGF1R基因及下游PI3K/Akt信号通路蛋白的表达。     

胰腺癌患者中miR-34a 表达及其靶基因生物信息学分析

目的:应用生物信息学分析方法检测miR-34a及其靶基因在胰腺癌发生发展过程中的作用。方法:运用Oncomine工具检测胰腺癌患者miR-34a靶基因差异表达水平;使用miRecords在线软件进行靶基因预测,并结合Genecards数据库中胰腺癌相关基因,对所得到的靶基因进一步进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果:miR-34a在胰腺癌患者中表达水平明显降低,其核苷酸序列在多物种间呈高度保守性,受miR-34a调控且与胰腺癌相关的潜在靶基因共73个,包括BCL2、MYC、Met、CDK6、SIRT1等。GO分析发现miR-34a的靶基因参与生物过程调节、细胞过程调节、器官发育、多细胞有机体发育、系统开发、胚胎发育等多个生物过程; KEGG分析发现miR-34a显著富集在结肠癌通路、小细胞肺癌通路、膀胱癌通路、Notch、Wnt等信号通路中。结论:miR-34a通过靶向作用及其靶基因调控,影响胰腺癌患者体内多种信号通路的网络调控,从而参与胰腺癌疾病的发生和发展。