应用R软件HSROC程序包联合RevMan 5软件实现诊断准确性试验Meta分析

目的 介绍R软件HSROC程序包联合RevMan 5软件实现基于HSROC模型的诊断准确性试验Meta分析.方法 通过对实例中的数据采用R软件HSROC程序包来拟合HSROC模型,采用RevMan 5软件进行Meta分析.结果 通过R软件HSROC程序包联合RevMan 5软件能够进行相关统计学计算及HSROC曲线的绘制,制作完整的诊断准确性试验Meta分析.结论 R软件HSROC程序包联合RevMan 5软件可以作为系统评价制作者处理诊断准确性试验Meta分析的一种方法,可以弥补其他软件的不足之处.     

诊断准确性试验Meta分析分层受试者工作特征曲线的SAS实现

RevMan 5软件实现诊断准确性试验的Meta分析时,需要借助SAS软件来实现分层受试者工作特征(HSROC)曲线的绘制。此功能由SAS软件中的"METADAS"完成。本文介绍如何使用"METADAS"宏在RevMan 5软件中绘制HSROC曲线,并比较"METADAS"宏与RevMan的计算结果。     

双变量模型在诊断试验Meta分析中的应用

目的 阐述灵敏度和特异度双变量Meta分析模型对于诊断试验的评价效果,为选择更好的诊断试验评价方法 提供依据. 方法 通过最近发表的评价2种血吸虫免疫学诊断方法 的Meta分析数据来阐述双变量随机效应模型分析方法 .结果双变量模型可直接得出待比较的几种诊断方法 的logit灵敏度、特异度及诊断优势比(DOR)均值及各自的95%CI,还可得出灵敏度均值、特异度均值以及DOR均值在2种诊断方法 间有无统计学差异,同时还能合并估计不同研究间灵敏度和特异度可能存在的关联性.结论 双变量模型保留了数据的二维特性,可以将灵敏度和特异度的效应分开估计,这比传统的SROC法得出诊断优势比的净效应更加合理.因此,双变量模型用于诊断试验评价是恰当的、灵活的,可作为经典SROC法的改进与补充.     

有序数据的Meta分析方法及SAS实现

目的介绍有序数据的Meta分析方法及其在SAS软件的实现。方法以实例说明,采用两步法：第一步,基于累积比数模型,采用SAS中的GENMOD过程计算产生每个研究的效应量及其标准误;第二步,采用固定效应模型和随机效应模型以SAS中的MIXED过程进行经典Meta分析。结果固定效应和随机效应模型Meta分析结果显示,汇总比值比及95％可信区间均为2．8539（2．1064,3．8648）。结论对于有序数据,可以应用SAS中的GENMOD过程和MIXED过程进行Meta分析。     

回归模型在Meta分析中的应用及Stata实现

Meta回归是循证医学研究中一种重要的统计方法,可以用于分析异质性过大的原因,进而发现与筛检异质性的来源;也可以用于预测因变量与自变量的变化关系。本研究主要介绍了Meta回归的数学模型以及如何运用Stata软件建立Meta回归模型,寻找合并效应异质性过大的原因,并通过亚组分析来降低Meta分析中的异质性。另外,还介绍了如何应用回归模型自身性质来评估预测因变量与自变量之间的变化关系,并对Stata软件分析结果进行了解读。通过案例分析让读者可以重复文中Meta结果,验证文献中最终结果的产生过程。掌握回归方法在Meta分析中的应用与实现对于处理Meta分析中的各种问题具有重要价值。     

Meta-DiSc软件在诊断试验Meta分析中的应用

准确的诊断是临床实践的基础，如果没有它，医师不能正确地治疗疾病和预测疾病转归，随着循证医学的发展．不少学者致力于诊断试验的Meta分析方法及软件研究。其中，Meta-DiSc软件是一免费软件．可用于多个诊断或筛检试验评价的Meta分析。与另一DOS下操作的诊断试验Meta分析软件Meta-Test相比．它功能强大，可以视窗操作（可运行于Windows95、2000、XP等视窗操作系统下），界面友好，操作简单，易学易用，目前最新版本为1．4。现以实例说明其在诊断试验Meta分析中的应用。     

R软件metamisc程序包在Meta分析中的应用

R是当前国际最受欢迎的软件之一,在Meta分析方面应用广泛且功能强大。metamisc程序包是Thomas Debray等基于经典统计学方法研发的用于实现诊断准确性资料Meta分析的程序包,该程序包具备实现汇总敏感度和特异度、亚组分析、回归分析等功能。本文结合实例对R软件metamisc程序包实现诊断准确性数据Meta分析的方法进行详细介绍。     

应用GeMTC软件实现网状Meta分析

网状Meta分析亦称为混合比较Meta分析,GeMTC软件是首款基于贝叶斯框架下MCMC法设计的制作网状Meta分析的专用非编程软件。该软件具有操作简洁、使用方便、结果准确性高及图形绘制方便等特点。该软件可以通过一致性模型、非一致性模型和节点分裂模型实现网状Meta分析;同时,该软件亦可实现传统的头对头比较的Meta分析。     

腹部平片诊断成人肠梗阻价值的Meta分析

目的评价腹部平片对成人肠梗阻的诊断价值。方法搜集现有国内公开发表的以手术或病检结果为诊断金标准的关于腹部平片诊断成人肠梗阻的中文文献,按照Meta分析的要求和诊断性试验公认的质量标准对所有纳入研究进行质量评估,并提取各纳入研究的特征信息。采用STATA 10.0软件检验异质性,根据异质性结果选择相应的效应模型,应用Meta Disc 1.4软件计算出汇总灵敏度和特异度,以诊断性试验Meta分析特有的综合受试者工作特征(SROC)曲线分析方法定性、定量地评价该诊断方法的准确性。结果符合纳入标准的文献共14篇,汇总的诊断指标和SROC分析显示,腹部平片的诊断均有较高的诊断效能,表示诊断试验准确度的指标汇总灵敏度为0.90(95%CI 0.88~0.92),汇总特异度为0.48(95%CI 0.42~0.55),曲线下面积为0.9104,Q指数为0.8426。结论汇总目前关于腹部平片诊断成人肠梗阻的研究显示,腹部平片是一种灵敏度较高的检查方法,但特异度较低,可作为筛查手段。     

超声造影对甲状腺肿瘤诊断价值的Meta分析

目的用Meta分析方法评价超声造影(CEUS)对甲状腺肿瘤诊断的价值。方法搜索Cochranelibrary、Pubmed数据库、Embase数据库、CBM以及万方数据库,检索所有用超声造影对甲状腺肿瘤进行诊断的文献,提取相关文献数据。根据Cochrane协作网筛选与诊断试验方法组推荐的诊断试验纳入标准筛选文献,对文献进行质量评价,并提取纳入研究的特征信息,进行Meta分析,绘制受试者工作特征曲线(SROC)。结果共纳入的5篇文献具有同质性,利用双变量固定效应模型,合并诊断敏感度和特异度分别为89%(CI:0.81～0.94)、89%(CI:0.81～0.94),合并阳性和阴性似然比分别为7.98(CI:4.71～13.51)、0.12(CI:0.07～0.21),SROC曲线下面积为0.89,SE=0.02。结论 Meta分析及SROC曲线提示,CEUS对甲状腺肿瘤具有较高临床诊断价值。     

Diagnostic value of Epstein-Barr virus capsid antigen-IgA in nasopharyngeal carcinoma: a meta-analysis

Background Non-invasive nasopharyngeal carcinoma （NPC） screening usually involves serological testing for the presence of IgA antibodies to Epstein-Barr virus （EBV） capsid antigen （VCA）. The present meta-analysis determined the accuracy of VCA-lgA in the diagnosis of NPC.Methods A systematic review of studies was conducted and data on the accuracy of VCA-lgA concentrations in the diagnosis of NPC were pooled using random effects models. Receiver operating characteristic curves were used to summarize the overall test performance. Results Twenty studies met the inclusion criteria for the meta-analysis. The summary estimates for VCA-lgA in the diagnosis of NPC were： sensitivity 0.91 （95% confidence interval （Cl）： 0.90-0.92）, specificity 0.92 （95% Cl： 0.92-0.93）, positive likelihood ratio 31.65 （95% Cl： 10.99-91.15）, negative likelihood ratio 0.10 （95% Cl： 0.07-0.13） and diagnostic odds ratio 414.59 （95% Cl： 174.96-982.42）. The area under the summary receiver operating characteristic curves was 0.98.Conclusion The sensitivity and the specificity of serum VCA-lgA are very high, suggesting that the presence of VCA-lgA in peripheral blood is a valuable predictor for NPC.     

腺苷脱氨酶对结核性心包炎诊断价值的Meta分析

目的：评估腺苷脱氨酶（ADA）对结核性心包炎的诊断价值。方法：检索Pubmed、Embase、CNKI、维普、万方等数据库,查找利用检测心包积液中ADA诊断结核性心包炎的文献。QUADAS工具评价纳入文献的质量。提取数据并利用Meta-Disc 1.4软件合并数据,计算纳入研究的合并敏感性、特异性等指标,绘制汇总受试者工作特征（SROC）曲线,综合评价ADA对结核性心包炎的诊断价值。结果：共有8篇文献共计716例研究对象纳入本次研究,meta分析显示ADA对结核性心包炎的合并诊断价值分别为：敏感度为0.88,特异度为0.87,阳性似然比为5.94,阴性似然比为0.13,诊断优势比为41.43。SROC曲线下面积为0.91。结论：检测心包积液中ADA对结核性心包炎具有较高的诊断价值。     

CT对创伤性膈疝及膈肌损伤的诊断价值-8个相关研究的Meta分析

目的系统评价计算机断层扫描对创伤性膈疝及膈肌损伤的诊断价值。方法检索PubMed、OVID和中文科技期刊全文数据库、维普中文科技期刊数据库,检索时间截至2008年8月。按照文内所述纳入标准收集计算机断层扫描诊断创伤性膈疝及膈肌损伤的研究文献,采用QUADAS工具进行质量评价,Metadisc1．4、RevMan4．2软件进行异质性分析同时利用随机效应模型对诊断准确性指标进行Meta分析并绘制综合受试者工作特征曲线。结果共纳入8项研究（n=728）,8项研究的合并诊断比值比为45．74（95％可信区间23．39-89．44）,各研究间异质性较小（P=0．25,I^2=22．1％）;合并灵敏度0．82（95％可信区间0．78～0．86）,各研究间有中度异质性（P=0．169,I^2=32．5％）;合并特异度为0．92（95％可信区间0．89～0．95）,各研究问有高度异质性（P=0,I^2=82％）;综合受试者工作特征曲线下面积0．9350,SE=0．0156,Q^＊=0．8712。结论综合考虑目前影响诊断的各种因素,CT仍显示较好的诊断效能。可以作为诊断创伤性膈疝及膈肌损伤的一种相对可靠而稳定的无创性检测工具。     

定量CT对骨质疏松症诊断价值的meta分析

目的 对定量CT在骨质疏松症中的诊断价值进行meta分析。方法 按照循证医学诊断meta分析的相关原则,对PubMed、Google学术、中国知网、百度学术中定量CT诊断骨质疏松症的相关文献进行检索,时间与语言不限。对筛选出的文献分别进行双变量混合效应及层次综合受试者工作曲线模型分析,并对其异质性进行分析。结果 共筛选出13篇文献,15组研究,两种分析方法均表明纳入文献的总敏感性为0.84(95% CI: 0.68～0.93),总特异性为0.78(95% CI: 0.66～0.87),SROC曲线下面积为0.88(95% CI: 0.84～0.90),表明该诊断方法具有较高的诊断价值。结论 定量CT骨质疏松症的筛查中具有较高的价值,在疾病的确诊中尚需要结合其他临床资料进行综合诊断。     

肿瘤型M2丙酮酸激酶对肺癌诊断价值的Meta分析

目的系统评价肿瘤型M2丙酮酸激酶对肺癌的诊断价值。方法全面检索Medline、Embase、中国期刊网、万方、维普等数据库,收集利用肿瘤型M2丙酮酸激酶诊断肺癌的文献。利用QUADAS评分工具评价纳入文献的质量。采用Meta-Disc 1.4软件计算合并敏感度、特异度、阳性似然比、阴性似然比、诊断优势比等指标,绘制汇总受试者工作特征（SROC）曲线,并计算其曲线下面积。结果共12篇文献1 408例研究对象纳入本次Meta分析,分析结果显示,肿瘤型M2丙酮酸激酶对肺癌的综合诊断价值为：敏感度为70%,特异度为92%,阳性似然比为8.15,阴性似然比为0.34,诊断优势比为26.16。SROC曲线下面积为0.91。结论肿瘤型M2丙酮酸激酶对肺癌具有重要的诊断价值,与其他肿瘤标志物物联合检测可提高诊断准确性。     

可溶性细胞间黏附分子-1诊断新生儿败血症的系统评价

目的系统评价可溶性细胞间黏附分子-1在诊断新生儿败血症中的临床价值。方法计算机检索Pubmed、Embase、万方数据、中国期刊全文数据库、维普网等数据库中利用可溶性细胞间黏附分子-1诊断新生儿败血症的文献。所纳入文献的质量利用诊断性试验准确性质量评价工具评价,利用Meta-Disc 1.4软件计算纳入研究的合并敏感度、特异度、阳性似然比、阴性似然比与诊断比值比,绘制汇总受试者工作特征曲线,并计算曲线下面积。结果根据设定纳入标准,共有7篇文献纳入本次Meta分析,Meta分析显示可溶性细胞间黏附分子-1对新生儿败血症的合并诊断价值分别为:敏感度为0.83[95%CI(0.78,0.88)],特异度为0.68[95%CI(0.63,0.73)],阳性似然比2.56[95%CI(1.88,3.49)],阴性似然比0.25[95%CI(0.16,0.40)],诊断比值比为11.87[95%CI(5.58,25.24)]。SROC曲线下面积为0.84。结论可溶性细胞间黏附分子-1对新生儿败血症具有一定的诊断价值,可作为诊断新生儿败血症的辅助检测指标。     

Use of real-time polymerase chain reaction for the diagnosis of Pneumocystis pneumonia in immunocompromised patients: a meta-analysis

Background The diagnosis of Pneumocystis pneumonia (PCP) in immunocompromised patients is still challenging today due to the absence of an in vitro culture system and the low diagnostic accuracy of mic...