肾透明细胞癌中预后相关RNA编辑位点的筛选

目的 探讨肾透明细胞癌(ccRCC)中与患者生存预后相关的RNA编辑位点。方法 下载癌症基因组图谱(TCGA)中RNA编辑位点的表达数据,使用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)及Cox回归筛选出与ccRCC预后密切关联的RNA编辑位点。根据多因素Cox结果计算患者的风险评分后构建预后模型和列线图,进一步采用接受者操作特征(ROC)曲线评估预后模型和列线图的准确性,并进行相关的功能学分析。结果 共筛选出25个与ccRCC预后相关的RNA编辑位点。根据风险评分的中位值将患者分为高风险组(n=222)与低风险组(n=226)。Kaplan-Meier生存分析结果显示,高风险组患者的总生存时间与疾病无进展生存时间均低于低风险组(P<0.001)。预后模型和列线图预测患者1、3、5年生存的曲线下面积(AUC)值分别为0.801、0.824和0.806、0.858,0.833和0.821。风险分组之间具备不同的生物学功能及药物敏感性。结论 通过公共数据库筛选出的25个RNA编辑位点有望会成为ccRCC患者新的预后标记物。     

Copines蛋白家族在肾透明细胞癌中的潜在预后价值

目的 探讨Copines蛋白家族(CPNEs)在肾透明细胞癌(KIRC)中的潜在预后价值。方法 在GEPIA、HPA、Kapian-Meier Plotter、cBioPortal GeneMANIA、STRING、TIMER2.0等数据库中对KIRC患者的CPNEs表达差异、生存预后、临床分期、基因突变、蛋白互作、免疫浸润等数据进行生物信息学分析和整理。结果 CPNE1、CPNE2、CPNE5、CPNE7、CPNE8在KIRC组织中表达水平均显著升高(P<0.05),CPNE3、CPNE4、CPNE6在KIRC组织中表达水平均显著降低(P<0.05),CPNE1、CPNE3、CPNE7的mRNA的表达水平与KIRC的临床分期明显相关(P<0.05)。高表达CPNE1、CPNE7的KIRC患者的总体生存率(OS)明显低于低表达的患者(P<0.05),低表达CPNE3、CPNE6的KIRC患者的OS明显低于高表达的患者(P<0.05)。此外,差异表达的CPNEs的功能主要依赖于钙依赖性磷脂结合蛋白参与的信号通路的跨膜运输和与蛋白质的相互作用。CPNEs在KI...     

m5C甲基化相关基因预测肾透明细胞癌的预后

目的：利用肿瘤基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中的数据,构建m5C甲基化相关基因组成的生存预后模型,分析与肾透明细胞癌生存有关的独立预后影响因素以预测肾透明细胞癌患者的预后。方法：从TCGA数据库下载肾透明细胞癌患者资料,从已发表的文献中获取m5C甲基化相关基因并分析其在肿瘤组和对照组间的表达差异。对这些基因进行共识聚类分析以揭示m5C甲基化相关基因与肾透明细胞癌预后之间的关系。通过单变量Cox分析和Lasso?Cox回归分析构建出生存预后模型并分析与肾透明细胞癌相关的预后影响因素,GO和KEGG富集分析进一步探索生物功能和潜在的信号通路。通过qRT?PCR验证m5C甲基化相关基因在肾透明细胞癌细胞系及组织和正常肾细胞系及组织之间的差异表达。 结果：m5C甲基化相关基因在肾透明细胞癌肿瘤组和正常组之间存在差异性表达。共识聚类分析结果显示亚群1的肾透明细胞癌患者预后优于亚群2。构建的生存预后模型将肾透明细胞癌分为高风险组和低风险组,单变量和多变量Cox分析显示分级和分期可能是肾透明细胞癌的独立预后因素,而GO和KEGG分析显示m5C?RNA甲基化修饰可影响肾透明细胞癌的进展。 此外,qRT?PCR实验也证实m5C甲基化相关基因在肾透明细胞癌肿瘤组和正常组之间表达存在差异。结论：本文构建的m5C 甲基化相关基因的生存预后模型可以预测肾透明细胞癌患者的预后。     

肾透明细胞癌患者预后危险因素分析

目的 探讨术前纤维蛋白原和血小板计数在预测肾透明细胞癌患者(CCRCC)预后中的价值.方法 回顾性分析我院2005年1月至2015年1月行手术治疗的300例非转移性CCRCC患者的临床资料.应用Kaplan-Meier法和Log-rank检验进行单因素生存分析,比较患者临床病理特征与肿瘤特异性生存(CSS)和无复发生存...     

m6A修饰相关的长链非编码RNA 对肾透明细胞癌预后和免疫治疗的研究

目的 探究与N6-甲基腺嘌呤(m6A)相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)对肾透明细胞癌(renal clear cell carcinoma, ccRCC)预后和免疫治疗的特征。方法 通过TCGA数据库下载532例ccRCC患者组织和72例正常肾组织的转录组数据和临床特征数据,利用共表达和单因素COX回归分析筛选与预后和m6A相关的lncRNA。基于预后和m6A相关的lncRNA的表达进行聚类分析,分析两种聚类分型与免疫检查点程序性死亡配体1(programmed death-ligand 1, PD-L1)和细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4(cytotoxic T lymphocyte-associated antigen-4, CTLA-4)表达的相关性。构建LASSO COX回归风险预后模型,验证其临床应用价值,利用ESTIMATE方法比较ccRCC肿瘤微环境的差异,免疫表观评分(immunophenoscore,IPS)预测ccRCC对免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitor, ICI)的敏感度。结果 通过共表达和单因素COX回归分析筛选出29个与预后和m6A相关的lncRNA,大多数在ccRCC组织中表达上调,而COL18A1-AS1、AC007066.2和AC018752.1则表达下调。通过聚类分析将532例ccRCC组织样本分为cluster1组和cluster2组,cluster2组预后更差,PD-L1和CTLA4表达更高。利用LASSO COX回归算法确定8个与预后和m6A相关的lncRNA,建立ccRCC风险预后模型,该模型在不同临床特征中均有较好的预测价值。依据模型计算风险值将患者分为高风险组和低风险组。高风险组患者预后更差,富含更多免疫细胞成分,对ICI治疗更敏感。结论 m6A相关的lncRNA对ccRCC患者的预后预测和免疫治疗指导具有重要意义。     

PTEN与肾透明细胞癌预后的关系

目的探讨PTEN在肾透明细胞癌中的表达情况与生物学意义。方法应用免疫组织化学S-P法检测84例肾透明细胞癌(TNM病理分期:Ⅰ期45例,Ⅱ期29例,Ⅲ期8例,Ⅳ期2例;细胞核分级:1级49例,2级21例,3级11例,4级3例)中PTEN的表达情况,分析PTEN的表达与肾透明细胞癌TNM病理分期、细胞核分级之间的关系。结果 PTEN的表达与肾透明细胞癌的TNM病理分期、细胞核分级呈负相关(r=-0.354,P=0.001;r=-0.402,P=0.000 1),即PTEN的表达随着TNM病理分期和细胞核分级的增高逐步降低。结论肾透明细胞癌中PTEN的表达是了解其预后的重要指标。     

基于TCGA数据库分析PODNL1基因在肾透明细胞癌中的表达及临床价值

目的 探讨Podocan样1(PODNL1)基因在肾透明细胞癌(KIRC)中的表达和临床价值.方法 从TCGA数据库下载KIRC患者的PODNL1基因转录本测序数据和临床资料;利用WilCox检验分析比较PODNL1基因在KIRC组织和正常组织样本中的表达;Kaplan-Meier方法分析PODNL1的表达与KIRC患...     

肾透明细胞癌PDCD5表达及与预后的关系

目的探讨PDCD5在。肾透明细胞癌发生、发展巾的作用及与预后关系。方法采用免疫组织化学方法．对46例肾透明细胞癌组织中PDCD5表达进行研究，对患者存活率进行回顾性随访：结果癌旁。肾组织中PDCD5阳性表达率显著高于肾癌组织。PDCD5阳性表达率随肾透明细胞癌病理分级和临床分期的上升而下降，染色强度也减弱。PDCD5阳性表达组3年及5年存活率高于阴性表达组：结论PDCD5为肾透明细胞癌的负性调节因子，对抑制肾透明细胞癌的恶性转化和进展可能有重要的意义。     

CENPW基因在肾透明细胞癌中的表达特征及预后评估价值

目的 分析着丝粒蛋白W(CENPW)基因在肾透明细胞癌(KIRC)中的表达特征及预后评估价值。方法从TCGA数据库获取KIRC患者的CENPW基因表达转录本测序数据和临床资料;使用Wilcoxon rank sum检验和Wilcoxon signed rank检验分析CENPW基因在KIRC正常组织和肿瘤组织中的表达;运用Kaplan-Meier方法分析CENPW基因的表达与KIRC患者总体生存率关系;通过Kruskal-Wallis检验和Wilcoxon rank sum检验分析CENPW基因表达与KIRC患者临床病理参数的关系;采用COX回归分析CENPW基因表达水平在KIRC预后中的价值;RT-qPCR检测CENPW基因mRNA在KIRC细胞系和正常肾上皮细胞系表达差异。结果 与正常肾组织相比,CENPW基因在KIRC组织中高表达(P<0.001);在KIRC组织中CENPW基因高表达组的总体生存率明显低于低表达组(P<0.001),且其表达水平与肿瘤分级、临床分期、病理T分期、病理N分期、病理M分期均显著相关(P<0.001);COX回归分析提示CENPW基因...     

透明细胞乳头状肾细胞癌的研究进展

2016年WHO正式将透明细胞乳头状肾细胞癌作为一种肾细胞癌新类型。该肿瘤可以为散发性也可以发生于终末期肾病或Von Hippel?Lindau综合征（VHL综合征）,具有相对特征性的病理组织学形态、免疫表型和分子遗传学特点,诊断时应与透明细胞肾细胞癌、乳头状肾细胞癌以及Xp11.2易位/TFE3基因融合相关性肾癌相鉴别。鉴于透明细胞乳头状肾细胞癌生物学行为相对惰性或低度恶性,因此准确诊断对指导临床治疗和判断预后具有十分重要的意义。     

FBXO11蛋白在透明细胞性肾细胞癌中表达的意义

目的 探讨FBXO11在透明细胞性肾细胞癌（clear cell renal cell carcinoma,CCRCC）中表达的意义。方法 采用免疫组织化学方法检测77例CCRCC患者肿瘤及35例癌旁组织FBXO11蛋白的表达,分析FBXO11蛋白表达与患者临床病理特征的关系。将CCRCC患者临床病理特征及FBXO11蛋白表达进行COX单因素分析。将单因素分析中有统计学意义的因素引入COX多因素模型,分析影响CCRCC患者总生存期（overall survival,OS）缩短的独立危险因素。结果 FBXO11蛋白阳性表达率在CCRCC中为48.1%,明显高于癌旁组织的25.7%（P<0.05）。FBXO11蛋白阳性表达率在无静脉内癌栓组明显低于有静脉内癌栓组（P<0.05）。COX单因素分析显示高组织学分级、伴有远处转移和高表达FBXO11蛋白是CCRCC患者OS缩短的危险因素（P<0.05）。COX多因素分析显示高表达FBXO11蛋白是CCRCC患者OS缩短的独立预后因素。结论 FBXO11蛋白的高表达可能与CCRCC进展快及患者生存时间短密切相关,检测FBXO11蛋白对CCRCC患者的预后判断有参考价值。     

成纤维细胞生长因子受体2在肾透明细胞癌中的表达及意义

目的: 研究成纤维细胞生长因子受体2(fibroblast growth factor receptor 2,FGFR2)在肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC;or kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)中的表达情况,对FGFR2的表达与ccRCC临床病理特征及预后关系进行分析,并研究FGFR2的表达与其他分子之间作用关系,探讨其在ccRCC发生发展中的作用。方法: 从肿瘤基因图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库及基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中下载ccRCC患者的基因表达及临床信息资料,进行转化及整理,并收集北京大学第一医院泌尿外科104例临床ccRCC样本及癌旁正常组织样本,进行免疫组织化学染色(immunohistochemistry, IHC),对染色结果进行评分,从而比较ccRCC和癌旁正常组织中FGFR2的蛋白表达情况;采用实时荧光定量聚合酶链反应(quantify real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测正常的肾上皮细胞系(293)和肾细胞癌细胞系(786-O、769-P、OSRC-2、Caki-1、ACHN、A498)中FGFR2的mRNA表达水平;对数据库中的ccRCC患者进行进一步分析,研究FGFR2表达与ccRCC患者临床病理特征(包括TNM分期和病理分级)以及生存预后的关系,分析ccRCC患者中FGFR2表达与B细胞、T细胞、自然杀伤(natural killer,NK)细胞及中性粒细胞浸润的关系,并使用生物交互数据集通用存储库(Biological General Repository for Interactionh Datasets,BioGRID)构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,利用网络研究与FGFR2蛋白相互作用的分子。结果: 在TCGA数据库中,相较于正常组织样本,FGFR2在ccRCC组织样本中表达下调,在GEO数据库中的表达也呈现出这一差异,并且FGFR2在ccRCC临床样本及ccRCC细胞系中表达下调,此外,FGFR2表达水平与ccRCC高分级分期相关,与ccRCC患者较好的预后相关,并且FGFR2表达与B细胞、T细胞、NK细胞及中性粒细胞浸润无明显相关关系。PPI网络显示FGFR2蛋白与某些分子间存在相互作用。结论: 本研究揭示了FGFR2与ccRCC发生发展的潜在作用关系,提示FGFR2可能作为ccRCC患者的预后标志物和潜在治疗靶点。     

肾透明细胞癌合并肾门节细胞神经纤维瘤临床病理观察

目的探讨肾透明细胞癌合并肾门节细胞神经纤维瘤的临床病理特点。方法对1例肾透明细胞癌合并肾门节细胞神经纤维瘤进行临床资料分析和光镜、免疫组化观察。结果肾下极肿物由透明细胞构成,细胞异型性明显,伴出血、坏死;肾门肿物由节细胞及神经纤维构成。免疫组化示肾下极肿物为肾细胞癌（＋）,Vi mentin（＋＋）,CD10（＋）;肾门肿物为CgA（＋）,Syn（＋）,NSE（＋）。结论肾透明细胞癌合并肾门节细胞神经纤维瘤极少见,病理学检查是诊断的主要依据。     

肾透明细胞癌相关特异性miRNAs差异表达谱

目的研究证实肿瘤组织miRNAs表达水平较正常组织可特异性下调或上调,这一现象揭示miRNA在肿瘤发生、发展等过程中扮演重要角色。文中就肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)肿瘤相关特异性微小RNA(mi-croRNAs,miRNAs)表达谱及意义进行探讨。方法取手术切除新鲜肾透明细胞癌及其癌旁正常肾组织,提取总RNA,进行RNA质量检测后采用微阵列基因芯片对其相关特异性miRNAs进行分析,应用荧光定量RT-PCR方法验证。结果Ⅰ级ccRCC与癌旁正常肾组织共有24个差异表达miRNAs,其中12个上调,12个下调;Ⅱ级共有35个差异表达miRNAs,其中18个上调,17个下调;Ⅲ级共有34个差异表达miRNAs,其中18个上调,16个下调;Ⅰ级+Ⅱ级+Ⅲ级ccRCC与癌旁正常肾组织共有81个差异表达miRNAs,其中33个上调,48个下调;以表达差异在2倍及以上为标准进行比较,ccRCC与癌旁正常肾组织共有11个差异表达的miRNAs,其中,hsa-miR-487a、hsa-miR-491-3p、hsa-miR-452表达上调,hsa-miR-142-3p、hsa-miR-22、hsa-miR-299-3p、hsa-miR-29a、hsa-miR-429、hsa-miR-532-5p、hsa-miR-199a-5p、hsa-miR-125b表达下调。结论与癌旁正常肾组织中存在肿瘤相关特异性miRNAs表达谱,这种miRNAs差异可能导致ccRCC的发生及发展。     

高危局限进展性肾透明细胞癌术后辅助应用干扰素-α的生存分析

目的回顾性分析高危局限进展性肾透明细胞癌(ccRCC)术后辅助应用干扰素-α预防术后肿瘤复发和进展的效果。方法对1999年至2007年华西医院泌尿外科176例高危局限进展性ccRCC患者的资料进行分析。其中79例(治疗组)患者术后予常规处理加干扰素-α进行辅助治疗,97例(对照组)患者术后行常规处理。分析两组患者无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)的差异性及其影响因素。结果随访中位时间为48月。176例患者中,发生进展53例(30.11%),死亡37例(21.02%),治疗组患者肿瘤复发率高于对照组(44.3%vs.18.6%,P<0.001)。单因素分析结果显示,治疗组患者的PFS短于对照组〔(59.12±5.04)月vs.(81.42±5.84)月,P=0.005〕;治疗组的OS同样短于对照组〔(74.66±4.77)月vs.(85.18±4.92)月,P=0.031〕。多因素分析显示,该类药物的使用是影响高危局限进展性肾细胞癌患者生存的独立危险因素。结论高危局限进展性肾透明细胞癌术后应用干扰素-α辅助治疗不能预防术后肿瘤复发及进展,目前没有临床证据支持干扰素-α可以作为肾癌术后的辅助用药。     

EPAS-1在透明细胞性肾细胞癌中的表达及意义

目的 探讨内皮PAS结构域包含蛋白-1（EPAS-1）在透明细胞性肾细胞癌中的表达特征,分析其与细胞增殖的关系及其临床意义。 方法 收集在我院确诊为透明细胞性肾细胞癌的患者共78例,留取术后肿瘤组织作为观察组,留取距肿瘤标本肉眼可见的边缘＞3 cm的正常肾组织作为对照组,应用免疫组化法检测两组中EPAS-1及观察组中增殖细胞核抗原（PCNA）的表达,分析其临床意义;选择人肾透明细胞癌786-0细胞系和人肾皮质近曲小管上皮HK-2细胞系,应用Western Blot方法检测EPAS-1蛋白的表达,实时荧光定量PCR法（RT-PCR）检测EPAS-1 mRNA 的表达。选择人肾透明细胞癌786-0细胞系,建立小干扰RNA EPAS-1（siRNA EPAS-1组）,并设立786-0细胞系的空白对照组（NC组）,Western Blot检测PCNA蛋白,应用RT-PCR法检测PCNA mRNA。 结果 观察组中EPAS-1表达的阳性率明显高于对照组（P＜0.05）,EPAS-1的阳性率在不同Fuhrman分级、肿瘤最大径及PCNA增殖指数的表达中差异均有统计学意义（P＜0.05）,而在有无肾窦累犯、不同性别及年龄分组的表达中差异无统计学意义（P＞0.05）。EPAS-1的表达与生存时间有关（P＜0.05）。人肾透明细胞癌786-0细胞系中EPAS-1蛋白和mRNA的表达明显高于人肾皮质近曲小管上皮HK-2细胞系（P＜0.05）。siRNA EPAS-1组中PCNA蛋白和mRNA的表达明显低于NC组（P＜0.05）。 结论 EPAS-1在透明细胞性肾细胞癌中表达明显升高,在不同临床病理特征中的表达有差异。EPAS-1可能对促进肿瘤细胞增殖有一定作用。检测EPAS-1的表达可能与肿瘤的预后有关。     

常规超声结合超声造影对肾透明细胞癌与肾血管平滑肌脂肪瘤的鉴别诊断价值

目的 研究肾透明细胞癌(ccRCC)与肾血管平滑肌脂肪瘤(RAML)的常规超声及超声造影声像图表现,探讨2种检查方法联合使用在鉴别ccRCC与RAML中的应用价值.方法 对经病理学确诊或增强CT或MRI检查及随访确诊的86例ccRCC患者88枚病灶和31例RAML患者38枚病灶的常规超声及超声造影声像图进行回顾性分析....     

Prognostic value of clinical and pathological factors for surgically treated localized clear cell renal cell carcinoma

Background Surgical resection is the most effective treatment for renal cell carcinoma （RCC）.Currently several prognostic factors and models are used for outcome prediction.However,whether intratumoral changes are independent prognostic factors for RCC or not remains unclear.The aim of the study was to investigate the prognostic roles of intratumoral changes in surgical treated localized clear cell renal cell carcinoma （ccRCC）.Methods Patients who received partial or radical nephrectomy between 2004 and 2009 in our center were retrospectively reviewed.Univariate and multivariate analyses were used to assess gender,age,body mass index （BMI）,intratumoral hemorrhage,tumor necrosis,cystic degeneration,sarcomatoid change,Ki-67 expression,Fuhrman grade,and T stage on recurrence-free survival （RFS） and cancer-specific survival （CSS）.Results A total of 378 patients were included in our study.In univariate analysis,age,BMI,intratumoral hemorrhage,tumor necrosis,sarcomatoid change,Ki-67 expression level,Fuhrman grade,and T stage were prognostic factors for RFS.Age,BMI,tumor necrosis,sarcomatoid change,Ki-67 expression level,Fuhrman grade,and T stage were prognostic factors effecting CSS.In multivariate analysis,age,BMI,tumor necrosis,sarcomatoid change,Ki-67,Fuhrman grade,and T stage were independent prognostic factors for both RFS and CSS.Conclusion Intratumoral changes such as tumor necrosis and sarcomatoid change are independent prognostic factors for ccRCC.