脂联素基因单核苷酸多态性与阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征的关系

目的:探讨脂联素基因单核苷酸多态性(SNP)与阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(OSAHS)之间的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,分析了南京地区40例正常对照者、78例OSAHS患者脂联素基因的两个单核苷酸多态性(SNP 45,SNP 276)。结果:脂联素SNP 45,SNP 276的多态性分布与OSAHS的发病无直接相关性(P>0.05)。但在OSAHS患者中,携带脂联素基因SNP 276G/G基因型与(G/T T/T)基因型相比:颈围增粗,最长呼吸暂停时间延长,胆固醇升高,低密度脂蛋白增加(P<0.05)。结论:SNP 45,SNP 276的多态性分布与南京地区汉族人群OSAHS的发病无直接相关性,但在OSAHS患者中,携带脂联素SNP 276G/G基因型者与G/T T/T基因型者相比,促使OSAS发展和加重的潜在危险性可能更大。     

人趋化素样因子上游启动子区的单核苷酸多态性及其与哮喘的相关性

目的 寻找趋化素样因子(CKLF)基因上游启动子区的单核苷酸多态性(SNP),明确其与支气管哮喘发病的相关性.方法 提取245例北京地区汉族人(其中哮喘患者119例,健康对照126例)基因组DNA,采用PCR方法扩增CKLF上游启动子区1553碱基的DNA片段并进行直接测序,分析发现的SNPs的等位基因频率、基因型频率和单倍型分布频率及其与哮喘的发病和临床表现的相关性.结果 在CKLF上游启动子区共发现4个SNPs:SNP88(T>C)、SNPl96(T>C)、SNP568(C>G)、SNP1047(C>G).其等位基因频率分别为0.168(SNP88C)、0.168(SNP196C)、0.352(SNP568G)和0.167(SNP1047G),与以往报道的其他种族的结果明显不同.SNP88与SNP196之间、SNP88与SNP1047之间,以及SNP196与SNP1047之间存在完全连锁不平衡(D1=1.000,r2=1.000),SNP568与SNP88、SNP196及SNP1047问存在连锁不平衡(r2=0.366).哮喘组与对照组4个SNPs的等位基因频率、基冈型频率和单倍型频率差异无显著性.结论 北京地区汉族人群CKLF编码基因上游调控区的基因多态性有其独特的分布特点及连锁不平衡特征,虽然与哮喘的发病无明显相关性,但其分布特点可能为其他疾病相关性研究提供有价值的资料.     

应用单核苷酸多态性技术筛查2型糖尿病易感基因

目的利用单核苷酸多态性(SNP)标记,在中国北方汉族2型糖尿病相关基因定位区域(1p36.33-p36.23、1q24.3-25.1及1q42.12-42.13)内寻找疾病易感基因位点以及与疾病相关的单倍型.方法通过公共SNP数据库和对样本库全基因测序寻找SNP位点的途径,在定位区域内选择了33个候选基因中的124个SNP位点,用测序法对236例北方汉族散发2型糖尿病患者及152例正常对照个体进行SNP基因分型及病例-对照关联分析,并对具显著性差异的SNP位点进行单倍型分析.结果124个SNP位点中有4个SNP位点的分布频率在病例组和正常对照组存在显著差异(P＜0.05),分别为sAC基因中的rs203849(P=0.005,OR=1.60)和rs203826(P=0.016,OR=1.60),PANK4基因中的rs7535528(P=0.028,OR=1.45)和CASP9基因中的rs884363(P=0.043,OR=1.37).在这4个SNP位点构成的组合型中发现,有2种组合型的频率分布在病例组与对照组之间差异有显著性(P＜0.001).此外,对sAC基因的单倍型分析发现,有4种单倍型与疾病发生相关.结论sAC、PANK4和CASP9基因为中国北方汉族人群2型糖尿病候选易感基因,这3个基因可能在2型糖尿病易感性上有协同作用.     

MYH9和ABI2基因SNP在2型糖尿病人群中与血糖、胰岛素抵抗和血压的相关性

目的:研究MYH9和ABI2基因的单核苷酸多态性(SNP)在2型糖尿病人群中与血糖、胰岛素抵抗及高血压的关系。方法:应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术,对773例天津地区的2型糖尿病患者的MYH9基因的8个SNP位点和ABI2基因的4个SNP位点进行基因分型,以PLINK软件进行数量性状的关联分析及基因型交互作用分析。结果:MYH9和ABI2基因SNP位点与血糖和胰岛素抵抗表型存在较广泛的关联,包括糖化血红蛋白、2 h血糖、空腹和2 h胰岛素及胰岛素抵抗指数(P<0.05)。ABI2基因SNP位点rs62183937(P=0.000),rs11675251(P=0.008)等均与血压相关。结论:MYH9和ABI2基因的多态性可能与2型糖尿病患者的血糖、胰岛素抵抗相关表型及2型糖尿病合并高血压的发病相关。     

海南黎族、汉族人群VEGFA基因SNP与血浆VEGFA表达水平的相关性分析

目的:分析海南黎族、汉族血管内皮生长因子A(VEGFA)基因单核苷酸多态性(SNP)和血浆VEGFA表达水平之间的关系,探讨VEGFA基因SNP对慢性阻塞性肺疾病(COPD)诊断的意义。方法:2014年7月至2015年3月,选取海南COPD患者249例,其中黎族109例,汉族140例;对照组246例,其中黎族89例,汉族157例。通过对VEGFA基因的9个SNP位点进行分型,测定VEGFA的表达水平,分析VEGFA基因SNP与血浆VEGFA表达水平的相关性。结果:VEGFA基因rs833068,rs3024994,rs3024997和rs3025000四个位点的等位基因在汉、黎两族中分布规律有所不同。rs3025030和rs3025033位点与汉族COPD发病明显相关。rs3025030及rs3025033可增加血浆中VEGFA表达水平。结论:VEGFA基因的SNP对汉族、黎族群体血浆VEGFA表达水平的影响存在差异。     

糖皮质激素受体基因多态性与LASIK术后高眼压的相关性研究

目的 探讨LASIK术后高眼压和正常眼压者糖皮质激素受体(GR)基因N363S及BclⅠ SNP的差异.方法 采取LASIK术后正常眼压(37例)及高眼压者(39例)外周血,提取DNA,通过PCR扩增进行基因分型,计算GR基因N363S及BclⅠ位点SNP频率,并进行χ2检验进行组间比较,分析两组间的差异.结果 LASIK后正常眼压和高眼压患者中GR基因内含子BclⅠ位点存在SNP,两组间差异无统计学意义,不存在N363位点SNP.结论 LASIKS后发生高眼压的发生与GR基因BclⅠ、N363S位点SNP无相关性.     

蛋白激酶Cξ亚型基因及UrotensinⅡ基因中各有一个单核苷酸位点与中国北方汉族人群2型糖尿病相关

目的采用单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)标记,在以往中国北方汉族人群2型糖尿病相关基因定位区域(1p36.33-p36.23)内寻找疾病易感基因位点。方法通过生物信息学方法在公共SNP数据库中查找定位区域内10个候选基因中的23个SNP位点,用单碱基延伸反应(singlebaseextension,SBE)法对北方汉族人群散发2型糖尿病患者(192例)及对照组(172例)进行分型及病例-对照关联分析。结果23个SNP位点中有8个为中国北方人群常见SNP位点;对病例组和对照组分型分析显示,位于蛋白激酶Cξ亚型(PRKCZ)基因中的一个位点(rs436045)及urotensinⅡ(UTS2)基因中的一个位点(rs228648),其等位基因频率在两组的差异具有统计学意义(P<0.05)。结论上述两个SNP位点可能和中国北方汉族人群2型糖尿病相关,以上结果为进一步研究上述两个位点所在的基因与2型糖尿病的关系提供了理论依据。     

蛋白激酶Cξ亚型基因内SNP的连锁不平衡分析

目的：对中国北方汉族人群2型糖尿病候选易感基因蛋白激酶Cξ亚型（PRKCZ）内的单核苷酸多态性（single nuceotide polymorphism,SNP),标记进行群体相关分析及连锁不平衡（linkage disequilibrium,LD)分析,寻找疾病相关单体型。方法：通过生物信息学方法公共SNP数据库中查找PRKCZ基因中的SNP位点,用单碱基延伸反应（single base extension,SBE)法对北方汉族散发2型糖尿病患者173例及对照组152例进行分型及病例－对照关联分析和LD分析,构建SNP单体型区段（haplotype block)。结果：PRKCZ基因中有多个SNP位点与疾病相关,它们在病例组和对照组构成不同的hahpltype block结构,由5个SNP位点组成的单体型频率在两组人群间存在显著差异,结论：PRKCZ基因内由5个SNP位点组成的单体型可能和中国北方汉族人2型糖尿病相关,进一步从统计学角度证了PRKCZ基因为该人群疾病易感基因。     

中国南方地区人群FCGR2A基因多态性与强直性脊柱炎的相关性

[目的]验证中国南方地区人群的FCGR2A基因多态性与强直性脊柱炎(AS)易感性是否相关.[方法]共纳入350例AS患者及295例健康志愿者,采用盐析法全血中抽提样本基因组DNA,分别在患者及健康志愿者中随机抽取58例病人和90例对照者,采用外显子测序法筛选FCGR2A基因单核苷酸多态性(SNP),然后针对筛选出来的SNP在剩余的292例患者及205例健康志愿者中采用飞行质谱方法进行验证.[结果]通过外显子测序,一共在FCGR2A基因外显子区域筛选出了7个SNP位点,其中有5个SNP(rs1801274、rs150991486、rs12046367、rs143182858、rs1542042)在其他文献中已有报道,另外2个是本研究新发现的SNP(1:161488855和1:161481042),但质谱验证有1个SNP(1:161481042)不符合Hardy-Weinberg平衡(P＜ 0.001),其他SNP位点在关联分析中显示,在病例和健康对照者之间没有显著性差异(P＞0.05).连锁不平衡分析结果发现rs150991486和rs12046367之间存在连锁,但是关联分析结果亦显示两组无明显差异性(P值分别为0.917 1、0.861 1、0.972 3).[结论]FCGR2A基因多态性与中国南方地区强直性脊柱炎易感性无关联.     

RRAGA基因的单核苷多态的研究

目的:通过对ras相关GTP结合蛋白A(Ras-relatedGTPbindingA,RRAGA)基因的单核苷酸多态(Singlenucleotidepolymorphism,SNP)进行检测,研究RRAGA基因与肺癌的相关性。方法:对RRAGA基因的启动子、外显子区域,使用PCR扩增和DNA测序方法,分别在24例肺癌患者的肺癌组织及24例正常人的外周血进行测序,比较它们之间可能存在的差异,确定该基因是否与肺癌相关。结果:RRAGA基因有4个SNP,其中3个SNP出现在RRAGA基因的启动子区,1个SNP出现在RRAGA基因的3'非翻译区,这4个SNP在正常人与肺癌患者无差异;但这4个SNP与国际公共数据库公布的SNP完全不同。结论:RRAGA基因与肺癌无相关性,中国人RRAGA基因的SNP与外国人的有很大差别。     

广西壮族人群骨桥蛋白基因位点rs4754多态性研究

目的分析骨桥蛋白基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs4754的各等位基因和基因型在广西壮族人群中的分布频率,以及对比其在不同种族中的分布差异。方法采用SNaPshot SNP的分型技术检测150例广西壮族人群骨桥蛋白基因SNP位点rs4754基因型,并对比国际人类基因组单倍型图谱计划(HapMap)上欧洲人群、非洲人群、日本人群以及北京人群的骨桥蛋白基因SNP分型数据,分析这几个人群的骨桥蛋白基因SNP位点rs4754的等位基因和基因型频率差异。结果在广西壮族人群中存在骨桥蛋白基因rs4754多态性,骨桥蛋白基因rs4754位点的等位基因和基因型频率在广西壮族人群中与在欧洲人群、非洲人群、日本人群及中国北京人群中差异均具有统计学意义(P<0.001或P<0.01)。结论骨桥蛋白基因SNP位点rs4754等位基因和基因型在广西壮族人群中的分布频率与其他地区人群相比存在差异,不同种族间骨桥蛋白相关疾病临床表现及发病率的差异可能是种族间的差异导致的。     

一氧化氮合酶1、神经细胞PAS域蛋白4和外中心粒物质1基因型与偏执型精神分裂症表型的关联性

目的探讨一氧化氮合酶1(NOS1)、神经细胞PAS域蛋白4(NPAS4)和外中心粒物质1(PCM1)基因单核甘酸多态性(SNP)与精神分裂症的关联性。方法选择来自豫北地区在河南省精神病医院住院的偏执型精神分裂症患者516例(病例组)和同地区健康正常人516例(对照组),采用荧光定量聚合酶链反应对NOS1、NPAS4和PCM1基因的5个功能SNP位点进行基因分型,分析SNP与疾病的关联性。进一步分析阳性和阴性症状量表(PANSS)因子分与NOS1、NPAS4和PCM1基因多态性的关联。结果 NOS1(rs3782219、rs3782221)、NPAS4(rs7947391)及PCM1(rs445422、rs370429)5个SNP位点基因型和等位基因频率在病例组和对照组中的分布差异均无统计学意义(P>0.05)。病例组与对照组NOS1基因的2个SNP位点(rs3782219、rs3782221)组成3种单体型(A-A、G-A、G-G)及PCM1基因2个SNP位点(rs445422、rs370429)组成3种单体型(A-A、G-A、G-G)频率的差异均无统计学意义(P>0.50)。NOS1基因的rs3782219基因型与兴奋/敌对因子,rs3782221基因型与抑郁/焦虑因子、兴奋/敌对因子的差异有统计学意义(P<0.05);NPAS4基因的rs7947391与阳性因子分的差异有统计学意义(P<0.05);PCM1基因的rs445422与PANSS总分、阴性因子分、认知因子分的差异有统计学意义(P<0.05),rs370429与PANSS总分、阴性因子、认知因子分的差异有统计学意义(P<0.05)。结论 NOS1基因的rs3782219和rs3782221位点、NPAS4基因的rs7947391位点以及PCM1基因的rs445422和rs370429位点可能不是精神分裂症的易感位点,但这些基因SNP位点基因型可能参与了精神分裂症表型特征。     

变性高效液相色谱检测IRS-2基因3′-非翻译区单核苷酸多态性

目的 :探讨变性高效液相色谱 (DHPLC)在胰岛素受体底物 2 (IRS 2 )基因 3′ 非翻译区单核苷酸多态性 (SNP)检测中的应用。方法 :采用聚合酶链式反应 (PCR) ,DHPLC ,单链构象多态性 (SSCP)和DNA序列分析对 30例正常对照和 30例 2型糖尿病患者IRS 2基因 3′ 非翻译区进行SNP和突变检测。结果 :PCR DHPLC检测出 4例PCR SSCP分析未能发现的 2型糖尿病患者IRS 2基因 3′ 非翻译区的SNP ,并得到测序验证。结论 :DHPLC是一种快速、自动化程度高、操作简单、检测片段长、准确率高的SNP检测技术。它为进一步研究IRS 2基因 3′ 非翻译区的变异与 2型糖尿病的关系奠定了基础。     

Calpain-10基因多态性与PCOS患者遗传易感性的相关性研究

目的 了解Calpain-10 SNP43与多囊卵巢综合症(PCOS)的关系.方法 采用以年龄、体重指数(BMI)配对的病例对照研究,对96例PCOS患者[其中PCOS胰岛素抵抗(PCOS-IR)和非抵抗(PCOS-NIR)各48例]及96例对照进行研究.以聚合酶链式反应-限制性内切酶长度多态性(PCR-RFLP)技术对Calpain-10基因SNP43进行检测.结果 PCOS患者中SNP43位点各基因型所对应的表型中GG基因型与GA(AA)基因型比较,其对应的雄烯二酮(DHT)、硫酸脱氢表雄酮(DHEA-S)、胰岛素水平增加(P均<0.05);在对照组中,GG基因型与GA(AA)基因型比较,其对应的DHT水平增加(P<0.05);运用logistic回归分析发现高雄激素血症(HA)、高胰岛素血症(HI)是PCOS发病的危险因素;多毛、肥胖和父亲秃顶是PCOS-IR发病的危险因素.结论 Calpain-10基因SNP43位点G等位基因可能与高雄激素、胰岛素抵抗有关.     

磷酸二酯酶4D基因多态性与缺血性脑卒中的相关性

目的探讨中国汉族人群磷酸二酯酶4D(PDE4D)基因多态性与缺血性脑卒中(IS)的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测440例IS病人和486例健康对照者PDE4D基因单核苷酸多态性(SNP)83和SNP87位点的突变情况,用Logistic回归分析去除混杂因素的影响,比较两组间基因型分布及等位基因频率的差异。结果两组SNP83基因型分布差异有显著性(χ2=8.293,P<0.05),IS组C等位基因频率明显高于对照组(χ2=8.386,P<0.05)。两组SNP87基因型分布差异无显著性(χ2=4.716,P>0.05),IS组T等位基因频率与对照组比较差异无显著性(χ2=2.300,P>0.05)。结论中国汉族人群中,PDE4D基因SNP83可能与IS的发病有关,C等位基因可能是IS的危险因素。     

中国北方汉族人VISA基因相关位点单核苷酸多态性分析

目的〓〖HTK〗分析中国北方汉族正常人群VISA基因相关位点单核苷酸多态性(SNP)的分布特征。〖HTW〗方法〓〖HTK〗用DNA序列测定技术分析100例正常人VISA 基因上下游侧翼序列、外显子及外显子/内含子连接区的核苷酸序列。用核酸序列分析软件与Genbank的VISA基因序列比对，分析SNP的基因型、等位基因分布特点，并与高加索人种比较。〖HTW〗结果〓〖HTK〗发现8个SNP，其中5个为已知的SNP,新发现3个；NCBI数据库中有报道而本研究人群中未出现的SNP位点有6个。中国北方汉族正常人群与高加索人VISA基因多个相关位点基因型及等位基因分布有差异(P＜0.05)。〖HTW〗结论〓〖HTK〗本研究结果对了解中国北方正常人群VISA 基因多态性分布特征有一定的参考价值。     

脂联素基因多态性与代谢综合征的相关性研究

目的 探讨脂联素基因多态性与代谢综合征(MetS)的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测脂联素基因单核苷酸多态性位点(SNP)SNP 45和SNP 276在昆明地区代谢综合征患者和正常对照者的分布,从而探讨脂联素基因多态性与代谢综合征的相关性.结果 脂联素基因SNP 45和SNP 276的基因型、等位基因及单倍型频率在代谢综合征组和正常对照组无统计学差异.结论 脂联素基因SNP 45和SNP 276及其单倍型与代谢综合征无相关性.     

变性高效液相色谱检测IRS-2基因3''''-非翻译区单核苷酸多态性

目的探讨变性高效液相色谱(DHPLC)在胰岛素受体底物-2(IRS-2)基因3′-非翻译区单核苷酸多态性(SNP)检测中的应用.方法采用聚合酶链式反应(PCR),DHPLC,单链构象多态性(SSCP)和DNA序列分析对30例正常对照和30例2型糖尿病患者IRS-2基因3′-非翻译区进行SNP和突变检测.结果PCR - DHPLC检测出4例PCR-SSCP分析未能发现的2型糖尿病患者IRS-2基因3′-非翻译区的SNP,并得到测序验证.结论DHPLC是一种快速、自动化程度高、操作简单、检测片段长、准确率高的SNP检测技术.它为进一步研究IRS-2基因3′-非翻译区的变异与2型糖尿病的关系奠定了基础.     

肿瘤坏死因子基因组多态性在脓毒症发病中的作用

目的　探讨肿瘤坏死因子 (TNF)及内毒素受体 (CD14 )基因组上单个核苷酸多态性(SNP)的频率、基因型与外科感染病人脓毒症发病的关系 ,观察SNP对在体单个核细胞 (PBMC)内TNF αmRNA表达的影响。方法　选择 113例外科感染的患者 ,10 0例正常人群为对照组 ,对TNF基因上 3个位点及CD14基因 1个位点进行PCR扩增、限制性内切酶酶切分析SNP基因型。患者分全身炎症反应综合征 (SIRS)组和脓毒症组 ,对各SNP基因型的频率进行分析。在出现脓毒症临床表现 2 4h内 ,对PBMC内TNF αmRNA表达水平进行测定。结果　TNF基因组上的 3个SNP均可影响在体PBMC内TNF αmRNA的表达。CD14基因组 - 15 9位点C→T、TNF基因组上 - 30 8位点G→A、- 86 3C→A 3个SNP与脓毒症的发生有相关性 (P <0 .0 5 )。结论　TNF基因组上的SNP通过影响TNF αmRNA的表达而影响机体对感染的反应性 ,产生SIRS甚至脓毒症等临床表现。     

宁夏回族人群脂联素水平及基因单核苷酸多态性与冠心病相关性研究

目的探讨宁夏回族人群血浆脂联素(APN)水平及其单核苷酸基因多态性(SNP45T/G和SNP276G/T)两个位点与冠心病(CHD)之间的关系。方法将193例回族研究对象根据造影结果和临床资料分为2组:CHD组95例和正常对照组98例;应用酶联免疫吸附法及聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,检测回族正常对照组及CHD组血浆APN水平及APN2个位点基因多态性。结果回族CHD组APN水平降低;回族CHD组SNP+45TG+GG基因型和G等位基因的分布频率明显高于正常对照组,回族CHD组SNP+276TG+TT基因型和T等位基因的分布频率明显高于正常组,差异均有统计学意义(P<0.05)。回族SNP+45TG+GG基因型血浆APN水平低于TT基因型者,回族SNP+276TT+TG基因型APN水平低于GG基因型,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论回族CHD组APN水平降低;回族CHD组SNP+45TG+GG基因型和G等位基因的分布频率明显高于正常对照组;回族CHD组SNP+276TG+TT基因型和T等位基因的分布频率高于正常组。