上海市闵行区2003—2009年志贺菌菌型分布及变迁

目的了解上海市闵行区志贺菌的菌型分布及优势菌型,为痢疾的防治工作提供科学依据。方法收集该地区2003—2009年送检样品中分离到的志贺菌进行流行病学分型。结果 7年中共检出1 324株志贺菌,分为14个血清型,福氏志贺菌933株,宋内志贺菌391株。其中福氏4c 255株,福氏2b 206株,福氏2a 197株,福氏1a 136株,福氏X变种77株,还包括福氏1b、福氏3a、福氏4a、福氏4b、福氏5a、福氏5b、福氏6a、福氏Y变种共62株。2003年,优势菌型为福氏2 b,到2009年福氏2 a成为优势菌型。结论该地区流行的志贺菌为福氏志贺菌和宋内志贺菌,其中优势菌型为福氏2b型、福氏2a型、福氏4c型和宋内志贺菌,优势菌型出现了变迁。     

上海市闵行区2003～2006年痢疾病原菌菌型分布及变迁分析

[目的]了解本地区志贺菌的菌型分布及优势菌型,为痢疾防治工作提供科学依据.[方法]收集本地区2003～2006年送检样品中分离到的志贺菌进行流行病学分型.[结果]在4年中共检出1058株志贺菌,分为14个血清型,福氏志贺菌737株,宋内氏志贺菌321株.其中福氏4c 219株,福氏2b 193株,福氏1a 120株,福氏2a 93株,福氏X变种71株,还包括福氏1b、福氏3a、福氏4a、福氏4b、福氏5a、福氏5b、福氏6a、福氏Y变种共41株.2003年,优势菌种为福氏2b, 2003年后福氏4c和宋内氏成为优势菌种.[结论]本地区流行的志贺菌为福氏志贺菌和宋内氏志贺菌,其中优势菌型为福氏2b型、福氏4c型和宋内氏志贺菌,优势菌型出现了变迁.     

上海市嘉定区5年间志贺氏菌菌型分布

目的：了解2000-2004年嘉定区志贺氏菌的菌型分布情况。方法：细菌性痢疾，阿米巴痢疾诊断标准及处理原则GB16002—1995。结果：2000-2004年期间检测出志贺氏菌总计400株；400株志贺氏菌共分2个群，B群383株，D群17株；400株志贺氏菌共分11个血清型。F2a96株，占24．00％；F2b73株，占18．25％；F4c72株，占18．00％。结论：5年间R2a志贺氏菌检出率最高，5年间R2a的传染由强势转为弱势；2002年检出嘉定区首例F4c志贺氏菌，此后该菌型检出逐年增多，位于2004年阳性检出量第1位。     

36株志贺菌菌型及耐药性检测

细菌性痢疾（简称菌痢）是常见肠道传染病，过去认为以福氏志贺菌2a（简称F2a）菌型引起，但最近有Kais“等报道福氏志贺菌2b（简称F2b）为常见病原菌，并有新菌型发现，1997年1月至2000年6月期间，国际腹泻病研究中心在检出的469株福氏志贺菌（简称福菌）中39株（8.3％）为新菌型。作者对菌痢病人的病原菌进行检测，并作药敏试验，现报告如下。     

嘉定区2004年志贺氏菌的分布特征及耐药性研究

目的：了解本地区志贺氏菌的分布情况和耐药水平。方法：收集本地区肠道门诊腹泻患者的肛拭标本，进行志贺氏菌的分离鉴定，并对所分离到的菌株用K-B法进行药物敏感试验。结果：从2626份肛拭中检出237株志贺氏菌，检出率为9．03％，其中B群占95．78％，为优势菌群。本地区出现了一种新的志贺氏菌血清型F4c占28．69％，是引起本地区菌痢的优势菌型。志贺氏菌对复方新诺明、氯霉素、氨苄青霉素的耐药性较高，分别为92．41％、89．45％、88．61％，对2种及2种以上药物耐药的占92．83％，主要耐药谱为CMP-SXT-AMP。结论：本地区志贺氏菌的检出率和耐药性较高，存在明显的季节性分布，优势菌型出现了变迁，应加强对菌痢的长期监测。     

福氏志贺菌菌型变异分析

目的 了解在盐城市人群中流行的福氏志贺菌变异情况.方法 采用肠道致病菌检验方法对收集到的菌株进行鉴定,用多种因子血清进行血清学鉴定.结果 共鉴定出福氏志贺菌48株,F2a占29.2％、F4c占25％,其他菌型有F1b、Fy和F?型(均为8.3％)、F2c等等.结论 盐城市流行的福氏志贺菌中有新的福氏亚型菌F2c、F4c、F?型等,其中F4c已经成为主要流行菌株之一.     

志贺菌261株菌型分布及耐药分析

目的了解上海市闵行区志贺菌菌型分布及药物敏感特点,为痢疾防治提供科学依据。方法将2007—2009年送检的肠道腹泻病人中分离出的志贺菌进行菌型分型,采用K-B法进行药物敏感试验。结果 2007—2009年间共检出261株志贺菌,主要为福氏志贺菌和宋氏志贺菌。其中福氏志贺菌190株(72.80%),宋氏志贺菌71株(27.20%)。190株福氏志贺菌中有10个血清型(F1 a14株,F2 a100株,F2b13株,F4 a4株,F4 c38株,FX变种7株,FY变种11株,F4b、F5 a、F6型各1株)。261株志贺菌对复方新诺明、氨苄西林、四环素、利福平、萘啶酸的耐药率分别为87.36%、88.12%、86.97%、81.23%、96.93%。结论该区志贺菌的耐药情况严重,且多重耐药,所以应加强耐药性监测和防治。     

安阳市2006年腹泻病人志贺菌分离株的群型分布特征

目的掌握安阳市志贺菌属的血清分群特征及变迁。方法采集安阳市各大医院肠道病门诊腹泻病人粪便标本，进行志贺菌分离培养，生化鉴定，并对其进行血清分群。结果289份标本共检出志贺菌70株，分离率为24．2％。其血清分群结果：福氏Ⅰ型志贺菌占12．9％，福氏Ⅱ型志贺菌占7．1％，福氏X变种占57．1％，宋内志贺菌占21．4％。结论2006年安阳市志贺菌引起的腹泻中，福氏志贺菌占首位，且以福氏X变种为主，并发现1株新型菌F4C亚型，该菌型在河南省属首次报道。     

福氏志贺菌血清型单重PCR鉴定方法的建立及应用

目的 建立基于O抗修饰基因的福氏志贺菌血清型PCR鉴定方法.方法 根据福氏志贺菌O抗原合成及修饰特异基因设计引物,以常见的14种福氏志贺菌血清型(包括1a、1b、1c、2a、2b、3a、3b、4a、4b、5a、Y、X、Xv和F6)为标准菌株,建立福氏志贺菌血清型单重PCR鉴定方法;并以痢疾志贺菌、宋内志贺菌、鲍氏志贺菌和腹泻相关的其他菌属菌株验证特异性;应用该方法对106株福氏志贺菌临床分离株进行PCR血清分型.结果 建立一种福氏志贺菌血清型单重PCR鉴定方法,通过8个PCR反应,能够鉴定目前已知的15种血清型中的14种(Xv除外).检测灵敏度在10 pg至1 ng DNA(20μl反应体系).对106株福氏志贺菌临床分离株的检测结果提示,PCR分型方法与玻片凝集法具有很高的一致性.结论 本研究建立的福氏志贺菌血清型单重PCR鉴定方法具有特异性、灵敏性,可用于临床检测.     

北京市2004年-2010年志贺菌菌型分布及毒力基因分析

目的:了解近年来北京市志贺菌菌型变化及毒力基因分布特征。方法:对2004年-2010年监测到的1413株志贺菌进行血清分型;应用荧光PCR方法进行ipaHs、et1和sen基因的检测。结果:宋内志贺菌741株(52.4%),福氏志贺菌664株(47.0%),痢疾和鲍氏志贺菌各4株(1.2%)。福氏志贺菌共分为19种血清型,以F4c、F2a、F1a为主。宋内志贺菌自2007年首次超过福氏成为优势菌型后,所占比例逐渐加大,2010年已达到79.3%。福氏志贺菌也逐步由F4c转向以F2a为主,并伴有其它血清型交替出现。ipaH s,et1和sen三种基因的携带率分别为95.4%,82.3%和57.5%。set1和sen在福氏志贺菌的携带率明显高于宋内志贺菌。结论:近8年北京市志贺菌菌型发生了显著变化,宋内志贺菌正逐步成为主导菌型。毒力相关基因在不同菌型的分布存在差异。     

对从江西分离的福氏志贺氏菌噬菌体的型别鉴定

采用大肠埃希氏菌的噬菌体Ｅ－１、Ｅ－２、Ｅ－３、Ｅ－４和志贺氏菌的噬菌体Ｓｈ（又称Ｅ－５），对自江西省临床痢疾病人分离的２９０株福氏志贺氏菌进行噬菌体分型结果，与肠杆菌科噬菌体裂解模式相配合，可将福氏志贺氏菌分为１８个噬菌体型。与血清学分型结果相配合，共可将其分为５７个血清噬菌体型。分型结果表明，来自南昌市的菌株主要是散在发生；但福氏２ａ型的２７／４－１、２３／４－１、０３／４－１型和福氏１ｂ型的０３／４－１型，分别在宜春、吉安、抚州、赣州等地区形成局部流行。     

福氏志贺菌4c型暴发和散发菌株的脉冲场凝胶电泳分型

目的了解杭州地区福氏志贺菌4c型暴发菌株和散发菌株的分子分型特征。方法对2003和2005年杭州地区的2次食物中毒暴发分离的福氏志贺菌菌株（暴发1和暴发2,菌株数分别为13株和12株）和2005年1例散发腹泻患者分离的福氏志贺菌4c型离株（1株）进行生化鉴定和血清分型,PCR检测侵袭性抗原基因ipaH,改良Kirby-Bauer纸片法检测菌株的耐药谱及脉冲场凝胶电泳（pulse field gel electrophoresis,PFGE）进行分子分型。结果暴发1中分离的13株菌株均为福氏4c型,但检测的6株菌株间的PFGE图谱存在着相当的差异,Dice系数为0．78至0．92。暴发2中分离的菌株有10株福氏4c型和2株福氏x型,所有菌株的PFGE图谱几乎完全一致。暴发2分离株和暴发1的部分分离株可能存在着一定相关性（Dice系数大于0．8）,而散发菌株与2起暴发的绝大部分菌株间的距离较远（Dice系数小于0．8）。暴发1、暴发2的分离株和1株散发菌株对14种抗生素的耐药谱略呈差异,暴发2中分离的福氏4c型和x型菌株的耐药谱一致。结论PFGE能够很好地辨别福氏志贺菌4c型的两起暴发菌株和1株散发菌株。福氏志贺菌4c型菌株具有易变性,可在暴发流行过程中产生PFGE图谱的差异、血清亚型的转换、耐药谱的变化等。     

福建省2005～2006年细菌性痢疾病原学监测结果分析

目的:了解福建省志贺菌属感染的病原学特征及药敏特点,为细菌性痢疾的防治和临床合理用药提供依据。方法:复核鉴定监测点送检的阳性菌株,按《全国细菌性痢疾监测方案》提供的方法进行系统检测。结果:两年共复核鉴定阳性菌株70株,检出志贺菌49株,其中宋内志贺菌34株,福氏志贺菌15株,分别占检出菌株数的69.4%和30.6%。药敏试验显示,49株志贺菌对头孢噻肟及环丙沙星高度敏感,全部耐药药物为四环素、利福平及复方新诺明。结论:2005～2006年福建省分离的菌株以宋内志贺菌所占比重较大,其次为福氏志贺菌,并对目前常用的抗菌药物表现一定的耐药性,应引起重视。     

Epidemiology and genetic characterization of Shigella flexneri strains isolated from three paediatric populations in Egypt (2000-2004)

Ninety-seven isolates of Shigella flexneri from children seeking medical care from three sites in Egypt were characterized. Overall, 46.4% of children (median age 17 months) were febrile or reported blood in their stools, 25.8% were dehydrated and 16.5% were admitted to hospital. Serotypes 2a (37.1%), 1b (18.6%), 1c (17.5%), and 6 (15.5%) comprised over 88.7% of the total isolates. We observed marked resistance to ampicillin (87.6%), tetracycline (84.5%) and trimethoprim-sulfamethoxazole (63.9%). Pulsed-field electrophoresis grouped the majority of isolates within a serotype together, separately from isolates of an alternative serotype. The set gene was present in all serogroup 2a isolates, however, the sen gene was detected in every isolate. Our results show S. flexneri 1c has emerged as a dominant S. flexneri serotype in Egypt. Development and application of a Shigella vaccine should consider the diversity of Shigella serotypes within a geographical region prior to administration.     

Species diversity and antimicrobial resistance of Shigella spp. isolated between 2001 and 2004 from hospitalized children with diarrhoea in Kolkata (Calcutta), India

The incidence, phenotypic characteristics and antimicrobial resistance patterns of 193 Shigella strains isolated from 2489 hospitalized children with acute diarrhoea were studied during January 2001 to August 2004. S. flexneri (60%) was the most prevalent serogroup, followed by S. sonnei (23.8%), S. dysenteriae (9.8%) and S. boydii (5.7%). Since 2002, S. flexneri 2a was the most dominant serotype. Almost all S. flexneri strains exhibited resistance to ampicillin, co-trimoxazole, tetracycline, nalidixic acid and fluoroquinolones. After a lapse of almost 14 years, S. dysenteriae type 1 strains reemerged for the first time during 2002 and these strains were resistant to more than two antibiotics (multidrug resistance), including fluoroquinolones. An upsurge of similar resistance patterns was also noted among S. flexneri type 2a since December 2003. Resistance to fluoroquinolone increased year on year among S. dysenteriae type 1 and S. flexneri, but not in S. boydii or S. sonnei. Monitoring of antimicrobial susceptibility through a surveillance programme is recommended to select appropriate antibiotics for the effective treatment of shigellosis in this region.     

Shigella serotypes among hospitalized patients in urban Bangladesh and their antimicrobial resistance

We studied the isolation of Shigella spp., and their antimicrobial resistance. S. flexneri (54 %) was most frequently isolated, followed by S. dysenteriae (20 %), S. boydii (16 %) and S. sonnei (10 %). Among S. flexneri (n = 122), 29 (24 %) were 2a, and 23 (19 %) were 2b. None of the Shigella strains were resistant to mecillinam or ciprofloxacin. Resistance to nalidixic acid was most frequent among S. dysenteriae type 1 (100%) followed by S. flexneri 2a (69%), and S. flexneri 2b (52 %). Systematic monitoring is needed to identify most prevalent serotypes, and to detect changes in the prevalence and antimicrobial resistance pattern.     

济源市福氏志贺菌毒力基因分型与分析

目的：对河南省济源市2002—2005年分离之福氏志贺菌株进行基因分型和分析。方法：应用多重PCR方法检测志贺菌肠毒素1基因（ShET-1B）、志贺菌肠毒素2基因（ShET-2）、侵袭性质粒抗原H基因（ipaH）和侵袭相关基因（ial），根据产物分子量定性判断结果。结果：90株福氏志贺菌具有2种毒力基因型，ShET-1阳性率达到98．9％。结论：济源市福氏志贺菌毒力基因型具有高度的一致性。     

上海市闵行区2005—2009年细菌性痢疾流行特征分析

[目的]分析上海市闵行区2005—2009年细菌性痢疾流行特征,探讨发病规律,为细菌性痢疾的防治提供依据。[方法]收集2005—2009年细菌性痢疾疫情数据进行描述性流行病学分析,并对2007—2009年检出的55株志贺菌进行血清学分型。[结果]闵行区2005—2009年细菌性痢疾发病率为5.43/10万~39.01/10万,年均发病率为19.06/10万,总体呈下降趋势。发病主要集中在5—10月,发病高峰期为9月,月均发病率达4.09/10万。0~4岁婴幼儿发病率最高,为189.38/10万。发病数居前三位的人群是散居儿童、学生和工人。55株痢疾杆菌分型结果,福氏志贺菌36株,占65.45%,宋内志贺菌19株,占34.55%,福氏志贺菌以F2 a、F4 c和F1 a为主。菌株对阿莫西林、头孢噻吩、头孢噻肟以及庆大霉素较敏感。[结论]闵行区近年来细菌性痢疾发病率明显下降。应在夏秋季将0~4岁组婴幼儿、散居儿童、学生和工人作为细菌性痢疾重点防治的对象。阿莫西林、头孢噻吩、头孢噻肟和庆大霉素可作为临床首选药物。     

福氏志贺菌4c亚型的分子生物学特征分析

目的 了解杭州地区2003-2007年从爆发和散发细菌性痢疾患者中分离之福氏志贺菌4c亚型(F4c)菌株的分子生物学特征.方法 对24株F4c菌株以生化反应和血清分型进行鉴定,利用PCR法检测侵袭性质粒抗原H基因(ipaH)及脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分型分析.结果 24株菌株全部为F4c,均具有ipaH毒力基因.用PFGE分型方法将24株菌株分成17种不同的带型,Dice系数为0.71～1.00.2005年、2006年、2003年三次爆发(分别简称为爆发1、2、3)中各自分离到的菌株基因型紧密相关.三次爆发中的部分菌株可能存在一定的相关性(Dice系数>0.8).散发菌株和爆发1、3菌株间的距离较远(Dice系数<0.8),和爆发2菌株间可能存在一定的相关性(Dice系数>0.8).结论 F4c菌株具有ipaH毒力基因,PFGE提示杭州地区近年F4c三起爆发菌株可能属共同的克隆群.     

北京市2010年细菌性痢疾病原学分析

目的掌握北京市2010年细菌性痢疾的血清学分布以及脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)分子分型特征,为流行病学研究提供合理依据。方法从形态特征、生化反应、血清分型、PFGE分子分型方面对北京市6个区的肠道多病原监测点分离到的195株志贺菌进行了系统鉴定和病原学分析。结果 195株志贺菌包括福氏志贺菌33株(16.92%)、宋内志贺菌162株(83.08%);福氏志贺菌血清型以F2a为主。7、8、9三个月志贺菌的发病率最高。选择其中55株宋内志贺菌进行脉冲场凝胶电泳分析,结果显示55株菌可以分为27个带型,其中以J16X01.BJ0016带型(11株)和J16X01.BJ0011(7株)为主。结论北京市2010年6个监测区县分离到的志贺菌包括福氏和宋内2种血清群,以宋内志贺菌为优势血清群,福氏志贺菌以F2a血清型为主。8月份为志贺菌高发季节。J16X01.BJ0016为宋内志贺菌PFGE优势型别。