基因芯片在白念珠菌耐药基因研究中的应用

近年来,临床上白念珠菌耐药现象日趋增多,利用基因芯片来绘制基因表达图谱是目前研究白念珠菌酎药基因最常用的手段.通过基因芯片对菌株在不同药物处理或经不同途径产生耐药表型后大量差异表达基因进行分析,可用来寻找耐药相关基因,并阐明其功能,更有助于多基因协同作用机制的深入研究.     

基因表达谱芯片在肿瘤研究中的应用

20世纪人类最宏伟的基因组 (ｈｕｍａｎｇｅｎｏｍｅｐｒｏｊｅｃｔ,ＨＧＰ)计划已基本完成。目前已逐步进入了功能基因组时代[1] 。人类面临的更艰巨的任务是研究基因组功能 ,今后相当长一段时间的主要工作将集中在揭示所有基因转录表达层次上的信息。基因芯片 (ｇｅｎｅｃｈｉｐ)又称ＤＮＡ芯片 ,ＤＮＡ微阵列 (ＤＮＡｍｉｃｒｏａｒｒａｙ)、ｃＤＮＡ微阵列、寡核苷酸微阵列(ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓｍｉｃｒｏａｒｒａｙ) ,是近几年发展起来的一项前沿生物技术[2 ] 。基因芯片技术的出现使全面、综合分析某些生命现象成为可能…     

捕获显微切割及基因芯片技术对前列腺病变基因表达谱的分析

目的:应用基因芯片技术,分析前列腺上皮内瘤变(PIN)及前列腺癌的基因表达谱,并将其与良性增生(BPH)前列腺组织的基因表达谱进行对比,探讨与前列腺癌的发生、发展密切相关的基因,检测PIN及前列腺癌的肿瘤标志物。方法:采用美国Affymetrix公司的HG-U133A基因芯片,检测了5例良性标本,6例PIN以及5例前列腺癌标本;采用激光捕获显微切割技术,分别得到了3组纯的上皮细胞群。结果:3组间基因表达谱存在非常显著的差异。与良性增生及前列腺癌相比,PIN有其独特的基因表达谱。有些基因的表达强度在从良性增生到PIN再到癌的过程中,呈逐渐改变的趋势,表现为逐渐上调或逐渐下调。结论:基因表达谱中显著改变的特异性基因可以将PIN和BPH及前列腺癌中区分开来;在从良性增生到PIN再到癌的过程中,有些基因的改变呈渐进性发展。     

基因芯片技术在医学研究中的应用

基因芯片 (Ｇｅｎｅｃｈｉｐ)又称ＤＮＡ芯片 (ＤＮＡｃｈｉｐ)、ＤＮＡ阵列 (ＤＮＡａｒ ｒａｙｓ)、寡核苷酸微芯片 (Ｄｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｍｉｃｒｏｃｈｉｐ) ,是近年发展起来的又一新的分子生物学研究工具 ,它综合了分子生物学、半导体微电子技术、激光化学、计算机科学等众多学科领域的相关技术 ,使研究者得以自动化、快速、平行地对大量的生物信息加以分析 ,从而成为基因测序、基因突变分析、基因表达等方面研究的高效手段之一。这项技术是 90年代初由美国Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ公司首先发展起来的 ,在随后的几年内技术不断…     

生物芯片技术在肿瘤研究中的应用

恶性肿瘤是一类严重威胁人类健康的多发病和常见病。根据世界卫生组织2003年公布的数据,2000年全球共有恶性肿瘤患者1 000万,其中男530万,女470万,因恶性肿瘤死亡者高达620万,占总死亡人数的12%,在多数发达国家可达     

应用基因芯片技术筛选生长激素腺瘤相关基因

目的应用基因芯片技术筛选人生长激素腺瘤发生、发展相关基因,为后续研究奠定基础。方法应用人全基因组寡核苷酸芯片HG-U133 Plus2.0检测8例生长激素腺瘤组织、2例混合正常垂体组织的基因表达谱,差异表达基因进行筛选和生物信息学分析。Real-time qPCR验证芯片结果。结果筛选出与生长激素腺瘤相关的上调基因187条,下调基因899条;差异表达基因功能主要涉及分子结合、凋亡或肿瘤相关、代谢、信号转导、细胞周期、物质运输等多个生物过程。结论基因芯片技术可初步筛选出人生长激素腺瘤相关基因;生长激素腺瘤的发生、发展是多基因、多分子、多通路的网络调控过程。     

基因芯片的应用及其数据分析方法

基因芯片是生物芯片的一种，是最先研究也是最成熟的生物芯片。基因芯片又称DNA芯片、DNA微阵列，是近几年发展起来的又一新的分子生物学研究工具。它综合了分子生物学、半导体微电子技术、激光化学、计算机科学等众多学科领域的相关技术，使其具有高通量、快速、并行化采集生物信息的特点。基因芯片技术以一种系统、整体的方法进行研究。打破了“一种疾病，一种基因”的陈旧模式，整体宏观地研究生物体基因的表达及功能。笔者就基因芯片的应用及数据分析方法作一简要介绍。     

导流杂交基因芯片技术在人乳头瘤病毒基因分型的应用

目的 探讨对人乳头瘤病毒(HPV)感染进行准确快速基因诊断和分型的方法.方法 采用导流杂交基因芯片技术和实时荧光PCR对75例疑似HPV感染的标本进行基因诊断和分型.结果 基因芯片阳性28例,其中单一感染21例,多重感染7例;实时荧光PCR阳性25例.二者在阳性结果中有很好的一致性.结论 导流杂交基因芯片技术适合临床筛查HPV感染及对HPV进行基因分型.     

基因芯片技术在医药领域应用研究进展

基因芯片技术是伴随人类基因组计划实施而发展起来的一门新兴技术，具有高度的并行性、多样化、微型化和自动化等优点，在人类重大疾病发病机理、诊断治疗、药物开发等方面的研究发挥巨大作用。     

基因芯片技术及其在肾脏病学研究中的应用

基因芯片技术是生命科学和信息工程相结合的高科技结晶,是高效率的核酸杂交分析技术,以其连续化、微型化、自动化等优势在基因组结构和功能的研究上起着重要作用。目前该技术主要应用于基因组功能研究、临床诊断及预后判断、新药开发及药物筛选等方面,在肾脏病研究领域也作了初步探索,但在开发应用中还存在一些问题。     

基因芯片在药物研究中的应用

20世纪90年代中期出现的分子生物学技术——基因芯片,已经对基因科学的发展产生了革命性的影响,被认为是21世纪最有发展前途的20项高新技术之一。基因芯片具有同时检测成百上千个基因表达的能力,现在正广泛应用于基因表达分析、基因型和多态性分析、疾病诊断与治疗和药物开发等研究中、特别是在药物研究中的应用,大大提高了筛选的效率,使药物研究技术有了极大的提高。本文就近年来基因芯片在药物研究中应用的研究进展作一综述。     

基因芯片技术在脑损伤研究中的应用

基因芯片技术是最近发展起来的新兴分子生物学技术,它的并行处理特点使大规模研究脑损伤后的基因改变成为切实可能。本文综述了新近用基因芯片技术在脑损伤后基因表达时序性改变及基因表达谱分析等研究中的应用。     

基因芯片技术在乳腺癌病理研究中的应用

一般说来,正常人的乳腺组织基因表达谱比较相似,而乳腺癌的癌组织基因表达谱相差很大,这种肿瘤异质性使乳腺癌的分子病理诊断变得十分复杂.基因芯片是利用核酸杂交原理来检测未知分子的一项有力工具.它可以高通量并行检测1个组织细胞中成千上万的核酸序列.     

基因芯片在产前诊断中的应用进展

产前诊断是一种预防遗传病胎儿出生的主要途径,其最先进的诊断手段是基因诊断。基因芯片技术应用于产前胎儿基因诊断,对提高人口素质具有重大意义。基因芯片是近些年高新技术领域的重大研究进展,该技术综合了微电子学、物理学和分子生物学的技术原理和优势,现已成为人们准确获取相关信息的手段之一。     

基因芯片在癫痫研究中的应用进展

近年来,基因芯片技术发展迅速.随着功能基因组研究时代的到来,基因芯片在生命科学研究中发挥着越来越重要的作用,其在癫痫研究中的应用也越来越深入.该文对基因芯片在癫痫的基础研究、临床研究及药物研究等方面的应用进展作一综述.     

基因芯片在癫痫研究中的应用进展

近年来,基因芯片技术发展迅速。随着功能基因组研究时代的到来,基因芯片在生命科学研究中发挥着越来越重要的作用,其在癫痫研究中的应用也越来越深入。该文对基因芯片在癫痫的基础研究、临床研究及药物研究等方面的应用进展作一综述。     

新型十万目六边形微腔芯片数字PCR对肺癌基因突变的绝对定量分析

目的 以表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)G719S突变为对象,建立用于肺癌基因突变绝对定量分析的新型十万目六边形微腔芯片(novel 100 000 hexagonal microchamber chip,NHMC)数字PCR(digital PCR,dPCR)平台.方法 首先构建并优化适用于EGFRG719S突变的PCR检测体系;然后用NHMC-dPCR平台检测8个浓度梯度的EGFR G719S标准品质粒和4种干扰物质,评估该方法的灵敏度、特异性和抗干扰能力;最后分别用NHMC-dPCR、液滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)和DNA测序法检测6例EGFR G719X突变的肺癌组织样本,验证NHMC-dPCR在临床样本检测中的可靠性.结果 NHMC-dPCR对EGFR G719S的最低检测浓度为3.01 copies/μL,检测值与期望值的线性方程为Y=0.725X-0.581,相关系数R2=0.984.该平台检测4种干扰物未发现阳性拷贝,检测G719S突变及其与4种干扰物混合的结果分别为23 194.4 copies和22 095.7 copies.NHMC-dPCR、ddPCR和DNA测序3种方法检测6例临床样本的定性结果符合率为100％,其中2例由NHMC-dPCR定量的结果为1 822.4 copies和451.7 copies,其对应由ddPCR定量的结果为1 581.8 copies和218.3 copies.结论 本研究建立的核酸绝对定量技术—NHMC-dPCR具有成本低、操作简单、速度快、抗干扰能力强等优点,可用于肺癌基因突变的绝对定量分析.     

非小细胞肺癌E-钙粘蛋白基因异常的研究

目的 观察非小细胞肺癌组织中E—钙粘蛋白(E—cadherin）的基因异常。方法 采用PCR—SSCP及序列分析，研究了24例非小细胞患者肺癌组织中E—cadherin基因外显子6、7、8、9的基因突变。结果 24例非小细胞肺癌中发现2例存在E—cadhetrin exon9的基因插入、缺失及突变。结论 E—cadherin在非小细胞肺癌中存在基因异常改变，尤其集中在E—cadherin的细胞外区域，主要表现为插入及缺失，细胞外区域的某因异常改变可能是赞成上皮细胞粘附力下降的主要原因。     

小波神经网络模型在肺癌中的应用研究

目的探索小波神经网络模型在肺癌研究中的应用价值。方法给出了小波神经网络模型的理论分析，在肺癌生物医学实验研究的基础上，利用小波神经网络模型综合研究肺癌患者的各项指标对预后的影响。结果小波神经网络模型能够反映包括调控基因在内的诸多因素与肺癌患者预后之间的关系。结论小波神经网络模型可以为肺癌研究提供新途径。