浙江省男男性接触HIV-1感染者病毒基因特征分析

目的分析浙江省2004—2011年117名男男性接触者（MSM）HIV-1感染病毒的序列特征,了解HIV-1毒株类型和特征。方法从实验室留样的MSM HIV感染者血液中提取DNA或RNA,用巢式PCR或RT-PCR方法扩增gag、pol基因区片段,测定序列并分析。结果 117名MSM HIV感染者中,序列结果按户籍来源覆盖21个省（市、自治区）,感染毒株包括CRF01_AE 99名（84.62%）、B亚型7名（5.98%）、CRF07_BC 6名（5.13%）、CRF08_BC和CRF59_01B各1名（0.85%）。3名（2.56%）疑似01_B重组毒株与安徽感染者在系统进化树上聚集成可靠的次级进化簇（99%）,且具有类似重组断点模式。84个CRF01_AE毒株的pol区基因序列聚集成簇,形成多个可靠的次级进化簇（30个节点的bootstrap值高于70%）。结论浙江省MSM HIV感染者主要流行CRF01_AE毒株,该人群HIV感染率高,应加强监测。CRF59_01B和新的01B重组毒株在浙江首次检出。     

珠海市男男性行为人群HIV-1感染者原发性耐药基因突变分析

目的 研究珠海市男男性行为（MSM）人群中未经治疗的HIV-1感染者耐药突变发生和基因亚型分布。方法 采集2011—2016年珠海市386名未经治疗的MSM人群HIV-1抗体阳性血浆标本,提取病毒RNA,采用In-house方法扩增HIV-1 pol基因并进行测序,通过系统进化树和数据库分析基因亚型和耐药情况。结果 共得到309份样本的pol区序列。CRF07_BC（占48.87%,151/309）和CRF01_AE（占32.03%,99/309）重组亚型占主要地位,其次是CRF55_01B亚型（30/309,占9.71%）。原发性耐药率为1.29%（4/309）,传播性耐药（TDR）相关突变率为15.53%（48/309）,30例CRF55_01B亚型中有25例出现TDR相关突变,位点均在非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）的V179E。结论 珠海市MSM人群HIV-1基因亚型以CRF01_AE和CRF07_BC重组亚型为主,其他多种基因亚型共同流行;该人群HIV-1耐药率处于低度水平,应关注复杂的亚型组成、CRF55_01B亚型高占比及大部分携带V179E突变等特点,加强对该人群耐药株的监测。     

福建省3市男男性行为者HIV-1感染率与新发感染率初探

目的了解福建省男男性行为（MSM）人群HIV-1感染的流行状况,为制定防治策略提供依据。方法对2010—2012年福州、泉州和厦门市哨点监测MSM人群进行问卷调查和HIV-1抗体筛查和确证,计算感染率;用BED HIV-1捕获酶联法对HIV抗体阳性样本进行检测,估算HIV-1血清阳转时间在168d内的新发感染率。结果 2010、2011和2012年福州、泉州和厦门市MSM人群HIV-1感染率分别为7.1%（39/553）、8.7%（94/1 078）和9.3%（95/1026）;在HIV抗体阳性者中,新发感染率分别为5.8%、2.2%和10.9%。结论 2010—2012年福建省3地市MSM人群HIV的感染率与新发感染率均达到较高水平,且有上升的趋势。     

西安市男男性行为人群感染HIV-1的分子流行病学研究

目的 了解西安市MSM感染HIV-1毒株亚型分布。方法 采集2010--2012年西安市确证的经男男同性传播的HIV感染者外周静脉血5ml,抗凝后分离血浆,提取总RNA,利用巢式反转录PCR扩增HIulgag和env基因,利用Mega5.2软件与国际参考序列进行拼接、比对、计算基因离散率和构建系统进化树;同时进行流行病学问卷调查,行为学调查重点包括性行为特征、吸毒史、献血史等。结果 168份样本中,165例gag与env序列分型结果 一致,分别为79例(47.0%)CRF01AE、74例(44.o%)CRF07BC、12例(7.1%)B亚型。3例gag与env序列分型结果不一致,分别为2例(1.2%)CRF01AE/A1、1例(0.6%)CRF07BC/CRF01AE。结论 西安市MSM感染HIV-1毒株亚型主要为CRF01AE、CRF07BC。     

昆明市2018年男男性行为者HIV-1基因型及耐药特征分析

目的 了解2018年昆明市MSM的HIV-1基因型及耐药特征。方法 收集昆明市2018年1-12月新报告HIV-1感染的MSM的血浆样品193份,提取病毒RNA,采用巢式PCR扩增gag、pol和env区基因片段,进行基因分型和耐药分析,通过Bayesian Markov Chain Monte Carlo（MCMC）方法分析昆明市MSM感染者中CRF55_01B和CRF68_01B的进化特征。结果 193份样品中发现多个HIV-1基因型,包括CRF07_BC（39.4%,76/193）、CRF01_AE（34.2%,66/193）、独特型重组（20.2%,39/193）、CRF08_BC（3.1%,6/193）、CRF55_01B（1.6%,3/193）、B亚型（1.0%,2/193）和CRF68_01B（0.5%,1/193）。Bayesian进化分析结果显示CRF55_01B从外省进入昆明市后已开始在本地传播,而CRF68_01B可能来自于我国东部地区。2018年昆明市MSM抗病毒治疗前的HIV-1耐药株流行率为2.6%（5/190）,对非核苷类反转录酶抑制剂的耐药突变发生率最高（2.1%,4/190）。结论 昆明市MSM的HIV-1基因型多样性逐年增加。MSM未接受抗病毒治疗HIV-1感染者耐药发生率虽然较低,但存在抗病毒治疗一线药物的多重耐药株。     

南阳市男男性行为人群艾滋病认知及感染情况分析

目的了解南阳市MSM人群艾滋病防治知识知晓情况、行为特征,为制定干预措施提供信息。方法以集中培训的形式,开展问卷调查、自愿咨询检测。结果自我认同性取向以同性恋者和双性恋为主,分别占42.70%、42.18%。MSM人群对艾滋病防治知识及正确使用安全套可预防艾滋病有一定的认知,但最近6个月与男性发生肛交性行为每次都用安全套使用率较低(23.49%),知识与行为分离现象严重。51.70%的MSM人群已结婚,近6个月与异性发生过性行为者占37.36%,与异性发生性行为时每次都用安全套者仅占2.94%。64.39%的调查者最近6个月与男性发生过肛交性行为,平均性伴数为2.1个,安全套、润滑剂等干预覆盖面小于40%。HIV、梅毒、丙肝的感染率分别为5.59%(10/179)、5.45%(9/165)、2.17%(3/138)。结论我市MSM人群艾滋病、梅毒感染率较高,且存在艾滋病流行的高危危险行为,应尽快制定有效的干预措施,遏制艾滋病、性病的流行。     

2014—2017年上海市长宁区男男性行为人群HIV-1型感染者原发性耐药分析

【目的】了解上海市长宁区2014—2017年男男性行为(MSM)人群HIV-1型感染者亚型分型及原发性耐药情况,为制定该人群抗病毒治疗方案提供依据。【方法】选取2014—2017年首次确证HIV-1型阳性、未接受过抗病毒治疗的MSM感染者363例,对其血浆标本采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增、DNA测序,并对序列进行亚型及原发性耐药分析。【结果】363例感染者的标本经RT-PCR筛选,最终获得300例的HIV-1 pol基因片段,扩增率为82. 6%。年龄18～78岁;非上海市户籍212例,占70. 7%;大专及以上文化程度165例,占55. 0%;未婚为主占71. 7%; CRF01_AE亚型154例(51. 3%),CRF07_BC亚型104例(34. 7%),其他亚型和重组体42例(14. 0%); 18例有耐药突变,原发耐药率为6. 0%(18/300),其中对非核苷类反转录酶抑制剂的耐药率为4. 3%(13/300),对核苷类反转录酶抑制剂的耐药率为2. 7%(8/300),突变位点PI区的耐药率为1. 3%(4/300),2种及以上合并耐药率为2. 0%(6/300)。【结论】上海市长宁区MSM人群HIV-1型感染者以CRF01_AE亚型为主,且对非核苷类反转录酶抑制剂类药物的原发性耐药率较高,临床治疗中使用非核苷类的药物需谨慎;另外,仍要加强对MSM感染者耐药的监测工作。     

济南市男男性行为者和嫖客艾滋病知识、行为及感染状况调查

目前经性途径传播已经成为中国艾滋病的主要传播途径,中国艾滋病流行形式正处于从高危人群向一般人群扩散的关键时期,在没有有效药物和疫苗控制的情况下,开展针对各类人群的预防艾滋病的健康教育以及行为干预是非常必要的。     

湖北省抗病毒治疗和未治疗的HIV-1感染者耐药基因变异研究

目的研究湖北省流行的HIV-1毒株在经过高效抗逆转录病毒治疗（HAART）及未治疗人群中耐药基因变异情况。方法采集HIV-1感染者抗凝外周血，提取前病毒DNA，用巢式PCR方法扩增HIV-1 pol基因约2kb的核酸序列，进行序列测定并通过斯坦福耐药基因数据库进行耐药基因型分析。结果抗病毒治疗组19例，未治疗组25例。在所有的HIV-1感染者样本序列中，发现针对蛋白酶抑制剂（PIs）的耐药突变：D30N（2．27％），D30G（2．27％），M461（4．55％），M46N（2．27％），147V（4．55％），184V（4．55％），184L（2．27％），N88S（2．27％），L90S（2．27％），以及针对PIs的次要耐药基因突变；A71T（29．55％）。在治疗组中出现针对逆转录酶抑制剂（NRTIs及NNRTIs）的主要耐药基因突变的样本5例，突变主要有M41L（5．26％），A62V（5．26％），D67N（5．26％），L210W（5．26％），T215Y（15．79％）；K103E（5．26％），K103N（10．53％），Y181C（5．26％），G190A（5．26％），K238N（5．26％）。在未治疗组中出现针对逆转录酶抑制剂（NRTIs及NNRTIs）的主要耐药基因突变的样本5例，突变主要有M184V（4％），K65N（4％），Y115M（4％），F116L（4％），M1841（4％）；V179D（4％），G190R（4％）。在逆转录酶（RT）基因中耐药意义不明的突变F214L，与药物的使用有统计学上的相关性（P=0．03）。结论湖北省HIV-1感染者RT基因的耐药突变，在治疗和未治疗人群样本中差异有统计学意义，说明药物治疗已经对HIV耐药基因突变的产生有了一定影响。同时，耐药意义尚未明确的突变位点F214L也可能与治疗或是某些药物的使用有一定的相关性。     

我国6个省19个城市男男性行为人群HIV-1 基因亚型及抗病毒治疗前耐药分析

目的分析我国6个省19个城市男男性行为人群(MSM)HIV-1基因亚型分布及抗病毒治疗前耐药情况。方法 2019年4-11月, 在河北、山东、江苏、浙江、福建和广东6个省19个城市收集未接受抗病毒治疗MSM HIV-1感染者的血浆样本574份, 提取RNA, 反转录后经巢式PCR扩增HIV-1pol 基因区片段。PCR 产物测序后进行序列分析, 构建系统进化树判定病毒基因亚型, 提交斯坦福耐药数据库分析耐药。结果有479份样本PCR扩增成功并获得核酸序列, 检出的HIV-1基因亚型有9种, 其中CRF01_AE(43.4%)和CRF07_BC(36.3%)所占比例较大, 随后依次为B(6.3%)、CRF55₀1B(5.9%)、CRF59₀1B(0.8%)、CRF65_cpx(0.8%)、CRF103₀1B(0.4%)、CRF67₀1B(0.4%)和CRF68₀1B(0.2%);另有26份(5.5%)样本的基因亚型为未知...     

2004～2005年广西HIV-1耐药横断面调查

目的 了解广西壮族自治区未接受抗病毒治疗的HIV感染者和已经接受抗病毒治疗一段时间的AIDS病人中的耐药情况.方法 收集我区2004～2005年部分HIV感染者的伞血标本201份,其中未接受抗病毒治疗的56人(27.86%),已接受抗病毒治疗的145人(72.14%),分别对他们进行问卷调查,并采集10毫升的抗凝血,分...     

广东省艾滋病患者HIV-1基因亚型分析

目的 了解目前广东省HIV/AIDS患者HIV-1基因型的流行状况.方法 用套式PCR对222例HIV/AIDS患者外周血单核细胞(PBMC)中HIV前病毒DNA膜蛋白env基因C2-V4区及其邻近区域片段进行扩增,并对片段进行序列测定,与国际HIV-1标准毒株序列进行比较,依据同源性确定基因型.结果 222例患者中,...     

合肥市HIV-1感染者基因亚型和耐药性突变调查与研究

目的 了解合肥地区艾滋病病毒Ⅰ型(human immundeficiency virus 1,HIV -1)基因亚型及耐药性HIV-1的流行情况,为制定防治措施提供科学依据.方法 应用巢式RT-PCR扩增HIV-1 POL区聚合酶基因,经DNA测序后进行进化系统树分析和重组分析,以确定HIV-1基因亚型和重组体,并与国际耐药数据库比对,辨别耐药性突变位点,结合流行病学资料进行分析.结果 收集93例合肥地区HIV-1感染者,经RT-PCR扩增并获得有效基因亚型序列77例,基因分型以CRF01 _AE重组亚型为主,有46例(59.7％);其次是CRF07_BC亚型23例(29.9％)、B亚型6例(7.8％)和CRF08_BC亚型2例(2.6％).耐药分析结果表明,在65例未治疗人群中,发现1例(1.5％)蛋白酶抑制剂(PIs)主要耐药基因突变,2例(3.1％)反转录酶抑制剂( RTIs)耐药基因突变.抗病毒治疗组出现耐药突变位点6例(50.0％)高于非治疗组3例(4.6％)(x2=20.21,P＜0.001).结论 本研究分析了合肥地区HIV-1基因亚型和耐药突变的流行情况,初步了解合肥地区的HIV-1遗传变异多样性并建立耐药检测体系,对合肥地区的艾滋病预防和控制工作有一定指导意义.     

男男同性恋HIV-1感染者原发耐药性分析

目的 研究辽宁省男男同性恋者中未经抗病毒治疗的人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)感染人群中耐药突变的发生和流行情况。方法 收集辽宁省1999~2007年门诊随访的46例HIV-1感染者外周血,提取血浆中HIV基因组RNA,逆转录PCR(RT-PCR)和巢式PCR方法扩增蛋白酶基因全序列和逆转录酶基因1~250氨基酸编码序列,产物纯化后直接进行基因序列测定。序列拼接后,上传至美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线进行耐药性分析。结果 1例B亚型HIV-1感染者携带针对蛋白酶抑制剂的L90M原发耐药变异,另1例CRF01.AE亚型毒株感染者携带M46I原发耐药变异,而其余病例在蛋白酶编码区只存在次要变异,由高到低依次为L10I 3例,A71T 1例。逆转录酶编码区未发现任何耐药变异。结论 在辽宁省男男同性恋人群中已经发现有针对蛋白酶抑制剂的耐药毒株的传播。     

湖南省HIV一1耐药警戒线调查

目的<\b> 了解湖南省开展艾滋病抗病毒治疗以来，年龄<25岁新近感染HIV一1且未服抗病毒药者出现耐药毒株的变异情况。方法<\b> 通过横断面调查，采集15～24岁HIV一1感染者的血清样本．进行HIV一1 pol区耐药基因变异检测分析。结果<\b>69份有效样本中，在RT区1份样本出现可以导致针对NNRTIs系列的NVP、DLV和EFV药物的高度耐药性的K103N、V181C的2个主要耐药突变，1份样本出现可以导致对D4T的低度耐药性和对DDI的潜在耐药性的V75M耐药突变。PR区没有检测到高度耐药突变株。在RT区高度耐药株检出率为2．9％(2/69)，说明湖南省HIV耐药株的传播仍处于低度范围内(<5％)。结论<\b>表明现有的一线治疗方案是有效的，个体病例尚不需要在治疗开始前进行耐药性检测。但也提示应该加强对早期感染者的耐药监测工作。     

河南省艾滋病毒I型膜蛋白基因序列特征和亚型研究

目的　了解在河南省流行的人类免疫缺陷病毒(HIV)毒株的流行情况及亚型特征。方法　用套式聚合酶反应(nested -PCR)对28份河南省内的HIV-1感染者外周血单个核细胞(PBMc)中的膜蛋白基因进行扩增,并对C2-V3及其邻区350 -450个核苷序列进行测定和分析。结果　28份样品间的基因离散率为5.72%,与流行于云南的(泰国B)毒株基因离散率 为5.80%,与其它国际亚型,欧美B、A、C、D、F、G、H、J、O亚型基因离散率均在18.05%以上。系统树分析显示,28份毒株与 泰国B亚型聚在一起而远离其它国际亚型。其毒株V3环四肽序列泰国B亚型基因型GPGQ8例占28.57%,欧美B亚型基 因型GPGR13例占46.43%.结论　河南省流行的HIV株属B′亚型,其毒株来自与泰国接壤的云南,在河南流行的时间约在 6～10年,其V3环顶端四肽序列特征以GPGR为主。     

云南省2008-2009年HIV-1病毒株亚型分布

目的 了解云南省目前HIV-1流行株的基因型及其地区和人群分布。方法 收集2008-2009年云南省15个地市788例HIV感染者/艾滋病患者（HIV/AIDS）的血浆标本和背景信息,采用RT-PCR法分别扩增HIV-1 gag、pol全长基因（1584 bp和3147 bp）及env基因的C2V3片段（558 bp）,序列编辑后用Genotyping及Mega 5.03软件工具确定病毒基因型,分析HIV-1株的地区和人群分布特征。结果 788例标本获得1728条HIV-1基因序列,其中全长gag基因序列599条、全长pol基因序列564条、env基因C2V3区序列525条,确定617例基因亚型,构成比分别为CRF08 BC（50.2%）、CRF01 AE（25.0%）、未知重组（10.2%）、CRF07_BC（9.2%）、C亚型（2.9%）和B（B''）亚型（2.4%）。HIV-1株在云南省具有地域分布特征,可分为以临沧和昆明为代表的CRF08_BC为主的地区,以德宏和西双版纳为代表的CRF08_BC与CRF01 _AE构成比相近的地区;未知重组型在云南省少数民族中所占比例（17.0%）显著高于汉族（6.7%）;异性性传播感染者和静脉注射吸毒感染者的CRF08 BC亚型均占总数的50.0%以上,但前者CRF01_AE的构成比占约30.0%,后者未知重组型和CRF07 BC的比例分别达到约15。0%。未知重组病毒株呈现两种重组模式,分别为B（B''）/C重组和以CRF01 AE为母株嵌入B（B''）和/或C片段重组,并以前者为主（74.6%）。结论 云南省HIV-1株组成复杂,具有显著的地域、民族和传播途径相关的特征,并出现新型重组病毒株,应密切监测。     

河南省柘城县艾滋病患者抗病毒治疗后HIV-1耐药发生率及其影响因素

目的 了解河南省柘城县AIDS患者抗病毒治疗后HIV-1耐药毒株流行情况及影响耐药的主要因素.方法 采用横断面调查,对柘城县自2003年7月开始国家免费抗病毒治疗以来到2009年3月接受抗病毒治疗的378例患者进行访谈和血样采集,使用实时荧光定量PCR法测定病毒载量,利用扩增-测序(In-House)法扩增HIV-1...