基于“中药作用机理辅助解析系统”的四逆散抗抑郁作用机制研究

四逆散作为调和肝脾的经典名方,临床上广泛用于治疗肝郁气滞引起的各种疾病,且疗效显著。近年来发现四逆散在神经系统疾病治疗上有效,如抑郁症。但是,目前四逆散抗抑郁症机制还不是很清楚,该文采用网络药理学方法和"中药作用机理辅助解析系统"研究四逆散方剂,探索其多成分-多靶点-抑郁症相互作用关系。结果显示,四逆散的315个化学成分中有263个能够作用于抑郁症的19个靶点,通过调控第二信使G-蛋白偶联受体转导通路、cAMP环核苷酸系统、神经系统及其递质、免疫炎症反应、神经内分泌、钙离子及其他离子转运等多途径、多靶点发挥抗抑郁作用。这些结果为四逆散抗抑郁症的机制研究及探讨抑郁症治疗提供了有价值的线索。     

中药作用机理辅助解析系统的构建

针对目前基于网络药理学的中药作用机制解析存在对生物过程缺乏详细描述及网络模型构建效率比较低的问题,构建"中药作用机理辅助解析系统",实现中药作用机制生物网络模型的自动建模。该研究以实体语法系统为理论框架,融合中药方剂、单味药、化学成分、化学成分作用靶点、生化反应、信号通路及疾病相关靶点数据,建立形式化模型,编写推理引擎,构建界面友好、操作简单的中药作用机制辅助解析平台,可实现中药作用机制网络生物学模型的自动建模。"中药作用机理辅助解析系统"将为中药作用机制网络药理学模型提供自动高效的建模方法,发挥其辅助解析中药作用机制的功能,有助于对中药药性理论、配伍理论开展深入研究,为中药新药的研究和开发提供参考。     

基于“中药作用机理辅助解析系统”的金钗石斛降糖作用机制研究

构建金钗石斛降糖生物网络,阐释金钗石斛治疗2型糖尿病的分子作用机制。检索数据库和文献整理金钗石斛中的化学成分,通过疾病相关数据库收集整理2型糖尿病相关靶点,利用"中药作用机理辅助解析系统",构建金钗石斛-2型糖尿病整体生物网络。通过对网络的分析,阐明金钗石斛治疗糖尿病的主要机制包括5个方面:①通过降低甘油三酯等调节脂质代谢;②减少胰岛素抵抗;③保护胰岛细胞;④促进葡萄糖依赖性促胰岛素释放肽(GIP)的分泌;⑤抑制钙离子通道。以网络药理学为指导,通过"中药作用机理辅助解析系统"初步阐明了金钗石斛降糖的分子作用机制,为金钗石斛的二次开发利用提供了依据。     

基于“中药作用机理辅助解析系统”的丹参治疗心血管疾病作用机制解析

丹参作为临床上治疗心血管疾病的常用药物,虽然其治疗心血管疾病的作用机制已有研究,但是对其作用机制进行系统解析的报道却并不多见。该研究基于"中药作用机理辅助解析系统",综合数据挖掘技术,以生物反应数据库为背景构建丹参有效成分靶点与心血管疾病相关蛋白相互作用的分子网络,以期从网络药理学的角度系统解析丹参治疗心血管疾病的作用机制。结果表明,丹参主要通过以下10条途径来治疗心血管疾病:促进脂质代谢;抗炎;调节血压稳定;负向调节凝血因子;抗血栓形成;调节细胞增殖;抗应激损伤;促进血管新生;抑制细胞凋亡;调节血管收缩与扩张;促进伤口愈合。该研究结果较为系统地解析了丹参治疗心血管疾病的作用机制,为临床治疗心血管疾病新药的研发,尤其是中药组分配伍的现代中药研发提供了线索。     

基于“中药作用机理辅助解析系统”的大黄抗高血脂作用机制研究

大黄是治疗高脂血症的一味常用中药,但其所含化学成分复杂,至今仍然难以明确其各种成分在血脂调节中的具体作用,因此要系统地对大黄治疗高血脂的作用机制进行研究。该文通过多个数据库的整合,利用实体语法系统模型,构建大黄治疗高脂血症的分子作用网络,网络包括有231个节点和638条边。从此推断药物作用靶点与疾病相关蛋白的相互作用关系,发现大黄可以通过促进胆固醇排泄,抑制凝血因子改善血液流变学特征,抑制炎症因子的释放维持体内脂肪代谢平衡,抑制胆固醇、甘油三酯的合成途径达到调节血脂的目的。该研究为新药开发及有效成分的配伍提供了参考,为中药作用机制的系统解析提供了新的途径。     

网络药理学视角下杜仲抗骨质疏松的作用机制研究

目的:基于网络药理学方法,根据杜仲活性化合物结构预测其作用靶点,与骨质疏松(OP)相关治疗靶点进行扩展后映射,拓扑出Hub节点并进行富集分析,揭示杜仲抗OP的物质基础及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP),根据药代动力学特征筛选出杜仲的主要活性成分,并使用有机小分子生物活性数据库(PubChem)和Swiss Target Prediction数据库,根据化合物结构相似性预测出可能作用靶点,然后通过Drugbank搜集目前OP治疗药物及其相关靶点,结合预测靶点分别进行扩展后取交集,将所得重合靶点借助CytoNCA软件,根据相关节点参数拓扑出相互作用的关键节点,再导入String构建蛋白质相互作用网络图,最后通过DAVID数据库对关键节点进行生物功能及代谢通路分析。结果:筛选出15个杜仲活性成分,根据靶点预测技术预测出相关靶点196个;检索出OP相关靶点43个,经扩展-取交集-拓扑分析后共得152个Hub节点,根据String数据库构建蛋白相互作用网络,富集分析显示杜仲可能通过多条主流信号通路及细胞代谢全过程对OP产生调控作用。结论:杜仲可能通过直接或间接作用于靶点,参与调控上下游多条信号通路以干预OP的进展,为揭示其抗OP的机制及后续研究奠定了基础。     

细胞因子网络与中药的作用机理

复方中药的作用机理和物质基础的研究,是当今生物医学领域里的一个重大科学难题,中医证的本质不明确是中药作用机理长期不能被阐明的重要原因。分子生物学理论技术的飞速发展为解决这一问题奠定了理论基础和技术保证。我们的理论研究和初步的实验研究结果表明“中医虚证的基本发病机理是由于细胞因子网络紊乱的结果”。根据中医学“药证对应原理”和相关的现代医学理论知识,我们从理论上提出了“复方中药的作用机理是调节细胞因子网络功能态平衡”的假说。     

基于网络药理学探究杜仲治疗高血压作用机制

目的采用网络药理学方法探究杜仲治疗高血压的作用机制。方法利用TCMSP数据库,对影响杜仲吸收、分布、代谢和排泄行为的活性成分进行筛选,并运用Uniport数据库预测作用靶点,利用GeneCards数据库获取高血压作用靶点;采用Cytoscape3.6.1软件将药物作用靶点和疾病靶点进行映射,运用STRING11.0数据库构建映射靶点蛋白互作网络;最后利用R软件进行GO功能富集分析和KEGG通路分析。结果通过对杜仲活性成分、作用靶点查找与筛选,获得杜仲有脂醇二葡萄糖苷、槲皮素、山奈酚、β-胡萝卜素、β-谷甾醇等27个主要活性成分,作用靶点181个,并绘制出杜仲的活性成分-作用靶点网络图;用GeneCards数据库获取高血压相关靶点703个,经在线工具分析,获取75个杜仲的活性成分与高血压共同作用靶点;GO和KEGG富集分析提示:杜仲参与多种生物学过程调控,其可能通过抑制cAMP活性和钙离子内部流量、调节NO和肾素-血管紧张素系统,舒张血管并增加冠脉流量来发挥降压活性。结论杜仲可通过多成分协同作用,实现多通路、多靶点的降血压作用。     

基于网络药理学的忍冬藤抗类风湿关节炎作用机制研究＊

目的 利用网络药理学相关技术和方法，阐释忍冬藤抗类风湿关节炎的作用机制。方法 通过检索数据库和文献，收集整理忍冬藤的化学成分、化学成分靶点和类风湿关节炎相关靶点，利用实体语法系统构建忍冬藤化学成分、化学成分靶点和类风湿关节炎相关靶点的生物网络，通过网络分析，辨识忍冬藤抗类风湿关节炎的有效成分群，阐释其作用机制。结果 本研究通过网络拓扑结构分析得到有效成分31个、关键靶点13个，通过富集分析，得到忍冬藤抗类风湿关节炎的作用机制为：氮化合物代谢过程的正向调控、细胞生物合成过程的正向调控、转录的正调控、基因表达的正调控、靶向输送、调节脂质分解代谢过程、细胞分解代谢过程的正调控、聚合酶II启动子转录的正调控、细胞凋亡的正向调控、细胞死亡的正调控等。结论 本研究较为系统地解析了忍冬藤治疗类风湿关节炎的作用机制，为临床治疗类风湿关节炎新药的研发和类风湿关节炎病因病机的研究奠定了基础。     

基于网络药理学研究杜仲抗骨质疏松的分子机制

目的:基于网络药理学探究杜仲抗骨质疏松可能的分子机制。方法:采用活性成分筛选、靶点预测技术,结合生物信息学手段,预测杜仲防治骨质疏松症的作用靶点,并进行信号通路富集分析,从而探讨其治疗骨质疏松症的分子机制。结果:杜仲在TCMSP数据库中共检索到94个相应成分,根据口服生物利用度(oral bioavailability,OB)和药物相似性(drug-likeness,DL)参数共筛选到25个入血活性成分,同时利用相关靶点预测技术,共获得101个预测靶点。通过对GEO芯片数据库的基因芯片进行二次挖掘分析,共获取124个明显的差异基因;在疾病基因相关数据库共检索到356个与骨质疏松症发生、发展密切相关的已知靶点基因。利用cytoscape构建并合并活性成分及疾病的蛋白质相互作用关系网络,通过网络拓扑分析共筛选出232个关键基因;Clue GO富集分析显示,杜仲除与直接作用于骨质疏松症关键节点涉及的信号通路,如Wnt信号通路、NF-kappa B信号通路、Fox O信号通路等有关,还对P13K-Akt信号通路、GnRH信号通路、甲状腺素信号通路、雌激素信号通路等同时进行调控。结论:杜仲治疗骨质疏松症具有多成分、多靶点的特点;其主要通路不仅可能直接参与骨重建的细胞分化,调节成骨、破骨代谢平衡,还可能通过全身其他系统,如循环系统、神经系统等来干预和影响骨微环境,与目前抗骨质疏松的作用机制相符合。     

杜仲民间代用品的原植物研究

据研究结果,用检索表的形式区别鉴定了杜仲民间代用品的原植物10科17属48种及与正品杜仲的区别。     

杜仲治疗股骨头坏死分子机制的网络药理学研究

目的:基于中药网络药理学理论与生物信息学研究方法,探讨杜仲治疗股骨头坏死的潜在分子作用机制.方法:通过中药系统药理学成分分析平台BATMAN-TCM预测杜仲的活性成分及治疗作用靶点,与GeneCards、Gene、GAD等人类基因数据库获取的股骨头坏死作用靶点取交集,获得最终的靶标基因,通过STRING构建靶标基因间蛋...     

开展中药复方研究的系统生物学思路

中药复方是通过大量临床实践产生的具有显著疗效的治疗方法，它强调整体观及辨证论治。将系统生物学宏微并举的成果渗透到中药复方的研究中，形成中药复方研究的系统生物学思路，从药材和制剂的获得、药理和药物代谢动力学的研究，到中药复方二次开发研究，以中医药理论为指导，充分利用现代科学技术揭示中药复方治疗疾病的实质，并进行新药创制，对中医药传承、发扬和光大具有重要意义。     

论建立网络毒理学及中药网络毒理学研究思路

提出网络毒理学研究理念,并对开展中药网络毒理学研究提出了思路和技术途径,最后展望了中药网络毒理学发展前景.     

试析中药新药药效与非临床毒性研究的相关性

该文根据中医药的临床证候与西医疾病的相互关系,对部分中药新药药效与非临床毒性研究的相关性进行了分类。如果中药药效靶点与现代医学一致,或者是以毒为能的中药制剂,中药复方的毒性表现往往可见到药效的放大与延伸;中药药效靶点与现代医学有交叉但又不完全一致,或者二者之间无交叉的情况下,中药复方的毒性往往不能从药理作用预测。随着中药活性部位提取分离技术的提高,中药新辅料的应用,某些中药复方制剂毒性可能来自于与药效无关的反应。分析结果提示研究人员应关注中药毒理学试验方案的设计及研究过程的质控等问题,综合多学科分析评价中药的药效及毒性特点。     

网络靶标:中药方剂网络药理学研究的一个切入点

目前中药研究的一个重点和难点问题是理解中药方剂复杂化学体系与病证复杂生物系统的相互作用.作者通过多年研究,从网络药理学、系统生物学角度对该问题提出“网络靶标”这一新的概念与方法.网络靶标概念指的是将病证生物分子网络当作靶标,由此设计和预测最佳的药物干预方式.网络靶标方法旨在将病证、方药映射于生物分子网络,然后在网络上对病证与方药的关系进行机制性的计算、分析与预测,以期发现药效物质及其作用机制,阐释方剂配伍规律与方证关联,并进行组方用药的理性设计.该文概述作者课题组在网络靶标方法及其在中药方剂中的应用进展,希望能为中药方剂的网络药理学研究提供参考.