人类基因组和人类自身的观点

或许对重实效的生物学家来说,人类基因组序列的确定(一种非常有力的工具的产生)不过是一件平凡而单调的事情。然而对于一般公众来说,人类基因组序列却具有巨大的象征性意义,他们对在近期的《科学》杂志和《自然》杂志上公布的人类基因组序列的感觉可能等同于人类首次登上月球和发射第一颗原子弹。为什么某些成就——首次登月、原子弹发射、人类基因组序列的确定——会受到此种象征性意义的感染?作者认为主要原因是它们改变了人类如何看待自身的问题。将人送上月球赋予人类在外星球生存的希望;原子分裂则赋予人类力量去建立巨大的能量贮备并消灭地球上所有的生命。目前人类基因组序列又为人们提供了内遗传学支架的观点,每     

鼠类基因组中具有同人类相似的致病基因

超过95％的鼠类基因组的测序和分析结果已于本周发表,首次为我们提供了一份鼠类基因组的完整草图。 研究盟示鼠类90％与疾病有关的基因与人类相同。这一结果说明利用鼠类作为研究人类疾病的生物学模型     

“功能基因组和生物芯片”重大科技专项人类病症相关基因研究取得进展

科技部“功能基因组和生物芯片？重大科技专项目前共克隆鉴定了676个人类新基因，在人类重大疾病诊治等方面功能明确的基因278个、包括126个有重要生理功能基因，57个与肝癌有关的基因，49个与高血压、冠心病、糖尿病等相关基因，27个与心血管疾病及血糖调节相关新基因，19个与心血管及血糖调节相关功能基因；     

HBV基因组C基因分子生物学的研究进展

乙型肝炎病毒(HBV)C基因包含前C区基因和C区基因,分别编码乙型肝炎e抗原(HBeAg)和乙型肝炎核心抗原(HBcAg)。HBeAg参与免疫调节,并且是乙型肝炎传染性的标志之一。HBcAg是核衣壳的组成蛋白,在病毒颗粒的组装、成熟、诱导免疫反应以及致肝病、肝癌的分子机制中起着重要的作用。文章就HBV基因组C基因分子生物学的研究进展作一综述。 更多还原     

类风湿关节炎易感基因的全基因组关联分析研究进展

类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种炎性侵润关节及其周围结缔组织的系统性自身免疫疾病,也是一种具有复杂遗传模式的多基因遗传病。环境因素和遗传因素共同影响RA的发生、发展。它的易感基因研究给临床的诊断、治疗提供了理论基础。新兴的全基因组关联分析作为寻找易感基因的高通量技术,是发现多基因遗传性疾病包括RA易感基因的强大工具。它不仅能够验证已有的易感基因位点,还能够发现新的候选易感位点。近5年来,用全基因组关联分析研究易感基因取得了很多新的进展,为探明RA的发病机制和治疗RA提供了新的契机。本文就近年来全基因组关联分析技术研究RA易感基因的进展做一综述。     

基因-环境相互作用与人类疾病的关系

分子生物学技术的飞速发展通过对人类基因的鉴别和诊断,使人们对疾病的发生与发展有了更深刻的认识。现代科学观点认为个体差异的产生不能归结为完全的遗传因素或完全的环境因素,事实上,绝大多数人类疾病是遗传易感性和环境因子相互作用的结果。基因-环境交互作用可以理解为遗传因素对环境因素易感性的影响。本文从环境污染物对基因的影响、环境应答基因对疾病易感性的影响及基因-环境相互作用与环境基因组计划三方面对基因-环境相互作用与人类疾病的关系加以阐述。     

MTHFR多态性与结直肠癌关系的人类基因组流行病学

机体叶酸缺乏和/或代谢障碍是罹患结直肠肿瘤的危险因素.叶酸代谢循环中,亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)是关键酶,该编码基因存在遗传多态性.其中,部分多态的存在将影响酶的活性及稳定性,进而影响叶酸的正常代谢.本文就MTHFR基因的基本特性、国人多态基因频率分布及其与结直肠癌的关系作一综述.     

血清中乙型肝炎病毒全基因组及X基因的克隆与鉴定

目的:建立从血清样品直接扩增乙型肝炎病毒(HBV)全长DNA的方法,构建HBV全基因组克隆.方法:用长链PCR从血清样品一次性扩增HBV全长DNA,测序鉴定后插入质粒puc19构建含HBV全基因组的重组质粒,再从重组质粒扩增X基因并进行序列分析.结果:经DNA序列测定和酶切分析,获得HBV全基因组克隆,从克隆的HBV全基因组扩增到X基因.结论:从血清中可直接扩增到HBV全基因组DNA,为整体水平研究HBV基因组的变异与其致病及宿主抗感染免疫之间的关系奠定了实验基础.     

全基因组测序用于宁夏羊种3型布鲁氏菌毒力基因筛选的研究

目的 从3株布鲁氏菌分离株的全基因组序列中筛选出可能导致脑损害的关键毒力基因,为后续筛选布鲁氏菌致脑损害毒力基因的研究奠定基础.方法 通过BCSP31PCR、传统生化实验对3株分离于布鲁氏菌病患者外周血中的布鲁氏菌进行鉴定分型.利用Illumina Hiseq2000平台对3株布鲁氏菌进行全基因组测序与比较基因组学分析,根据文献报道分析筛选出布鲁氏菌的经典毒力基因,通过检索NCBI核酸数据库查找出所选毒力基因的参考序列,利用所选参考序列分别与3株布鲁氏菌全基因组序列做BLAT比对分析.结果 3株布鲁氏菌经BCSP31PCR、传统生化实验鉴定为羊种3型;比较基因组分析显示3株布鲁氏菌与标准株参考序列的同源性比例均达到99.02％.BLAT比对分析发现所选毒力基因wbkA、pgm、hemolysin、hemolysin Ⅲ和Omp25在这3株布鲁氏菌全基因组序列中的比对分数均达到99％以上.结论 本研究所选取的3株羊种3型布鲁氏菌的全基因组中存在经典的毒力基因序列.     

基于多组全基因组表达谱的阳虚人群关键候选基因集和通路筛选及生物信息学分析

目的 基于多组全基因组表达谱筛选阳虚人群关键候选基因集和通路,探讨不同阳虚人群与对照组差异基因的异同,提出阳虚与基因表达关系的可能结论.方法 查找GEO基因表达数据库及PubMed、Embase、CNKI、万方、维普等中英文文献数据库,筛选出其中存在阳虚人群及其对照组的基因表达谱数据或基因表达谱分析结果.应用R语言和生...     

基因变异相关的肺腺癌分子分型及其靶向治疗

肺腺癌常见的基因变异有表皮生长因子受体(EGFR)、Kirsten鼠肉瘤病毒基因(K-ras)、原癌基因人类表皮生长因子受体2(HER2)、鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体B1(BRAF)基因突变,棘皮动物微管相关类蛋白4(EML4)与间变性淋巴瘤激酶(ALK)融合基因EML4-ALK、驱动蛋白家族5B基因(KIF5B)与酪氨酸激酶受体(RET)融合基因KIF5B-RET,EGFR突变与EML4-ALK融合并存以及活性氧基团基因1(ROS1)的重排,不同的基因变异型患者存在不同的治疗靶点,临床治疗及疗效存在明显的个体差异性。该文从基因变异角度将肺腺癌分为9型(包括8种变异型和全野生型),并对其相关的靶向治疗进行综述。     

人轮状病毒非结构蛋白NSP4基因特征的初步分析

目的：初步了解重症腹泻轮状病毒株NSP4基因特征及变异情况，方法：在2002年100例秋冬季腹泻患儿轮状病毒分子流行特征的研究中，确诊为轮状病毒腹泻的10例患儿的粪便标本。用PCR方法对其NSP4基因进行测定，并挑选出一株重症腹泻轮状病毒毒株(简称02′K1)。采用一步法RT-PCR对其NSP4基因进行扩增获得NSP4 cDNA，利用银染测序方法对所扩增获得NSP4 cDNA进行测定，采用Winegene231核酸分析软件对02′K1株NSP4核苷酸序列进行翻译，同时利用Omiga生物软件对02′K1株、ST3株(人轮状病毒G4血清型)及代表NSP4四个主要基因型的之一的Wa株(简称Wa-1株)、Wa-a株、Wa-v株的核苷酸和氨基酸序列进行比较，分析其同源性及02′K1株的NSP4氨基酸变异位点，结果：(1)经一步法RT-PCR扩增获得的NSP4 cDNA约725bp，NSP4基因全长686个核苷酸，含有一个开放读码框架，编码一个由175个氨基酸组成的蛋白；(2)02′K1株与ST3株、Wa-1株、Wa-a株、Wa-v株的核苷酸和氨基酸同源性均达90％以上；(3)与ST3比较，02′K1株的NSP4氨基酸序列有14个位点发生了变异。即aa16、aa26、aa60、aa72、aa76、aa124、aa135、aa140、aa141、aa145、aa146、aa161、aa162、aa169，结论：(1)02′K1株的NSP4基因型属于Wa组；(2)02′K1株的NSP4氨基酸序列有14个位点发生了变异。     

脂联素基因和钙蛋白酶10基因多态性与结直肠癌发生风险的关系

目的 探讨脂联素基因(ADIPOQ)rs2241766和rs1501299、钙蛋白酶10基因(CAPN-10)rs3842570和rs3792267多态性以及基因之间的交互作用与结直肠癌发生风险的关系.方法 采用1:1匹配的病例对照研究,对400例经组织病理学确诊的结直肠癌原发、新发病例和400例同期未患结直肠癌的健康体检者进行问卷调查,收集两组研究对象的一般情况、生活方式及饮食习惯等资料.应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析法检测研究对象ADIPOQ(rs2241766和rs1501299)和CAPN-10(rs3842570和rs3792267)的基因型.采用条件logistic回归模型分析4个位点的基因多态性与结直肠癌发生风险的关系,并应用GMDR法分析4个位点间的交互作用.结果 ADIPOQ rs2241766 TG+GG基因型携带者结直肠癌发生风险较TT型携带者高(OR=1.354,95%CI:1.004～1.827),rs1501299 GT+TT基因型携带者结直肠癌发生风险较GG型携带者低(OR=0.680,95%CI:0.501～0.923);CAPN-10 rs3792267 GA+AA基因型携带者较GG型携带者结直肠癌发生风险高(OR=1.507,95%CI:1.009～2.250),未见 rs3842570 Del/Ins+Ins/Ins基因型与结直肠癌的发生风险有关(OR=1.345,95%CI:0.849～2.130).GMDR法分析结果显示,4个位点在结直肠癌的发生中可能存在交互作用(P=0.001).趋势χ²分析结果表明,风险基因型携带个数与结直肠癌发生风险之间存在剂量-反应关系(χ²=13.302,P<0.001).结论 ADIPOQ(rs2241766和rs1501299)和CAPN-10 rs3792267 多态性可能与结直肠癌的发生风险有关,4个位点间可能存在交互作用,共同影响结直肠癌的发生.     

中低度近视眼遗传流行病学研究

目的探讨中低度近视眼与遗传的关系。方法对51对双生子进行扩瞳视网膜检影验光,视力不良者进行眼科常规检查及眼底检查,统计中低度近视眼的发病情况,并分别计算单卵双生和双卵双生发病一致率及遗传率。结果单卵双生和双卵双生发病一致率分别为77.27％,31.03％;中低度近视眼的遗传率为67.04％。结论遗传因素对中低度近视眼的形成起重要作用,并且其遗传因素大于环境因素,其遗传方式为多基因遗传。     

小鼠的遗传分析技术及疾病模型

小鼠作为人类理想的疾病生物模型，不仅同人类具有生理相似性，而且为建立人类疾病模型提供了大量的遗传资源.“人类基因组和小鼠基因组计划”完成后，转基因动物、基因剔除和基因剔入、大规模突变、特异位点检测系统等一些新技术的出现，提高了克隆新易感基因和建立人类疾病小鼠模型的能力、本文对一些与小鼠疾病模发展有关的最新技术进行了总结。     

基因多态性与移植

本综述的目的是总结基因多态性领域(特别是肾移植方面)的新进展，并讨论其临床应用的潜力。由于近来分子技术的发展，已有大量章描述与移植后果相关的分子的基因变异性。许多研究正致力于有关候选基因多态性与器官移植预后之间的联系。这些研究强调基因变异性在器官移植中可能发挥的作用，以及为阐明基因型分析在移植受体危险度分层中作用的大型前瞻性研究提供理论依据。     

人类疾病基因工程动物模型的研究与应用

人类疾病动物模型是研究疾病发生机制、确定治疗方案及药物研究的重要载体,在人类医学发展史中占有十分重要的地位。基因工程动物模型作为21世纪人类研究疾病的理想动物模型,在生命科学的各个领域得到了广泛重视和研究。本文就转基因动物模型和基因剔除动物模型在医学和药学方面的应用研究予以综述。     

NAT2基因多态性与疾病遗传易感性的关系

许多疾病的发病与环境因素以及个体对解毒酶的遗传易感性相关,N-乙酰基转移酶-2突变导致酶活性功能减少。本文就代谢酶NAT2基因多态性与肿瘤、帕金森病、阿尔茨海默病遗传易感性进行综述。     

昆明地区汉族人群9个Y-STRs基因座遗传多态性及法医学应用研究

目的 调查昆明地区汉族人群Y染色体DYS390、DYS393、DYS437、DYS438、DYS439、DYS447、DYS448、DYS460、H4 9个基因座的遗传多态性,获取9个基因座的群体遗传学数据,并探讨该9个Y-STR基因座的法医学应用价值.方法 应用酚-氯仿及Chelex-100萃取法提取DNA,采用STR-PCR、非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染显带分析技术和测序技术,对昆明地区汉族群体216例男性个体、1例父子二联体亲子鉴定、1例旁系亲子鉴定、14个男性样本和1例3人混合斑就上述9个基因座进行分析.结果 216例样本中9个基因座各检出4-9个等位基因,等位基因分布最多的基因频率为0.6019,最少的基因频率为0.0046.结论 DYS390、DYS393、DYS437、DYS438、DYS439、DYS447、DYS448、DYS460、H4基因座具有遗传多态性.9个基因座在法医学个人识别、亲子鉴定中均具有较高的应用价值.     

Comparative Study of the Genetic Diversity,Antimicrobial Resistance,and Pathogenicity of Aeromonas Isolates from Clinical Patients and Healthy Individuals

Objective This study was performed to compare the genetic diversity, virulence, and antimicrobial resistance of Aeromonas strains isolated from patients and healthy individuals. Methods A total of 38 clinical strains and 19 strains from healthy individuals were isolated from the samples collected in Ma'anshan City, Anhui Province. Their taxonomy was investigated using concatenated gyrB-cpn60 sequences, and their resistance to 12 antibiotics was evaluated. The pathogenicity of these strains was examined through beta-hemolysis, protease activity, and virulence gene assays. Results The 57 Aeromonas strains were divided into 55 sequence types. Of these types, 21 were novel, suggesting that their genetic diversity was high. These Aeromonas isolates could be divided into 7 species, and the positive rates of beta-hemolysis and protease activity were 49.1％ and 73.7％, respectively. The detection rate of clinical patients in terms of beta-hemolysis and protease activity was higher than that of healthy individuals. Among the four most common Aeromonas strains, A. dhakensis had the highest detection rate of virulence genes. The multidrug resistance rate of the clinical isolates was much higher than that of the strains isolated from healthy individuals. Conclusions The taxonomy, virulence properties, and antibiotic resistance of Aeromonas isolates from patients differ from those of the isolates from healthy individuals.