杜氏利什曼原虫蛋白鳞酸酶—2C的基因克隆化与序列分析

目的 克隆杜氏利什曼原虫（Leishmania donovani,Ld)1S株蛋白磷酸酶2C（PP2C）的编码基因，为应用这种编码T细胞抗原的基因进行基因疫苗研究奠定基础。方法 体外培养杜氏利什曼原虫1S株无鞭毛体，常规方法从虫体提取制备基因组DNA。以夏科氏利什曼原虫（Leishmania chagasi,Lc)的PP2C基因序列为参照，设计并合成利什曼原虫PP2C基因序列特异性的引物。结果 以杜氏利什曼原虫的基因组为模板，利用多聚酶链反应（PCR）技术，扩增获得了杜氏利什曼原虫PP2C的全长编码基因。基因序列测定结果表明，杜氏利什曼原虫1S株PP2C基因序列长度为1317bp，开放读码框架由1221bp组成，编码产物为406个氨基酸残基。获得的杜氏利什曼原虫1S株的PP2C基因与来源于夏科氏利什曼原虫的PP2C氨基酸残基序列的同源性为95％（387／406）。结论 本研究克隆了杜氏利什曼虫的PP2C基因，为应用诱导T细胞免疫应答抗原的编码基因进行杜氏利什曼虫的基因疫苗研究奠定了基础。     

杜氏利什曼原虫激活蛋白激酶C受体的基因克隆化与序列分析

目的　克隆杜氏利什曼原虫 (LeishmaniadonovaniLd) 1S株激活蛋白激酶C受体 (RACK ,receptorofactivatedpro teinCkinase)的编码基因 ,为应用这种编码T细胞抗原的基因进行基因疫苗的研究奠定基础。方法　体外培养杜氏利什曼原虫 1S株无鞭毛体 ,常规方法提取制备基因组DNA。以硕大利什曼原虫 (Leishmaniaamjor)的RACK基因的核苷酸序列为参照 ,设计并合成利什曼原虫RACK基因序列特异性的引物。以杜氏利什曼原虫的基因组DNA为模板 ,利用多聚酶链反应(PCR)技术 ,扩增获得了杜氏利什曼原虫RACK的全长编码基因。结果　基因序列测定结果表明 ,杜氏利什曼原虫 1S株RACK基因序列长度为 981bp ,开放读码框架由 831bp组成 ,编码产物为 2 76个氨基酸残基。获得的杜氏利什曼原虫 1S株的RACK基因与来源于硕大利什曼原虫的RACK基因序列同源性达 98% (2 6 4 / 2 6 7)。结论　本研究克隆了杜氏利什曼原虫的RACK基因 ,为应用诱导T细胞免疫应答抗原的编码基因进行杜氏利什曼原虫的基因疫苗研究奠定了基础     

我国山丘疫区杜氏利什曼原虫LACK保护性抗原基因克隆和序列分析

利什曼原虫的LACK抗原是利什曼原虫的蛋白激酶C受体的同源物 ,是新发现的一种抗原蛋白。本实验用分子克隆的方法获得我国山丘疫区杜氏利什曼原虫编码LACK保护性抗原的基因片段 ,测序并对其序列分析比较。我国山丘疫区杜氏利什曼原虫 (L dSC10 )LACK抗原基因片段的大小为 94 2bp ,与GenBank中LACK的核苷酸序列一致性在 94 %以上 ,呈高度同源性 ;推导的氨基酸序列与GenBank中LACK的氨基酸序列一致性达 95 %以上 ,具有高度保守性 ;该蛋白质属于WD蛋白家族 ,有重要的生物学意义。     

亚马逊利什曼原虫无鞭毛体蛋白基因的克隆化与序列分析

目的：克隆亚马逊利什曼原虫（L.ama)无鞭毛蛋白（amastin)的编码基因,并对其同源基因序列进行分析,方法：根据我们首次克隆的硕大利什曼原虫（L.major)无鞭毛体蛋白的编码基因,设计并合成核苷酸序列特异性引物,以亚马逊利什曼原虫基因组DNA为模板,以多聚酶链反应PCR技术扩增无鞭毛体的编码基因DNA片段,并进行核苷酸 列测定以及核苷酸序列的同源性分析。结果：克隆了亚马逊利什曼原虫无鞭毛体蛋白的编码基因,含有单一开放读框,长度为552bp,编码的无鞭毛体蛋白由183个氨基酸残基（aa)组成,亚马逊利什曼原虫与硕大利什曼原虫无鞭毛体蛋白编码基因之间高度同源,在核苷酸与氨基酸残基序列水平上的同源性分别为96％和94％,结论：首次实现亚马逊利什曼原虫无鞭毛体蛋白基因的克隆化。     

杜氏利什曼原虫平原和荒漠疫区分离株LACK基因克隆及序列分析

目的　测定我国平原疫区和荒漠疫区杜氏利什曼原虫分离株活性蛋白激酶 C受体同源物 (L ACK)基因序列 ,并与山丘疫区分离株及国外利什曼原虫分离株进行比较。　方法　应用 RT- PCR扩增 L ACK基因 ,将其克隆入p UC18载体后用双脱氧链末端终止法测序 ,并与 Gen Bank中相关数据进行比较。　结果　用 RT- PCR成功扩增出约95 0 bp的 L ACK基因片段 ,测序结果表明其片段大小均为 94 2 bp,与 Gen Bank中多种利什曼原虫 L ACK基因的核苷酸序列一致性达 97%以上。我国山丘、平原和荒漠 3个不同疫区杜氏利什曼原虫分离株的 L ACK基因序列的一致性达95 %以上。　结论　获得了我国平原和荒漠疫区杜氏利什曼原虫 L ACK基因序列。我国 3个不同疫区杜氏利什曼原虫分离株的 L ACK基因具有高度同源性。     

墨西哥利什曼原虫无鞭毛体蛋囟的基因克隆化与序列分析

目的　克隆墨西哥利什曼原虫(L.mer)WR972株的无鞭毛体蛋白(amastin)的编码基因,并对其同源核苷酸序列进行分析。方法　根据已克隆的亚马逊利什曼原虫无鞭毛体蛋白的编码基因序列,设计并合成无鞭毛体蛋白基因特异性引物,以墨西哥利什曼原虫VR972株的基因组DNA作为模板,进行多聚酶链反应(PCR)扩增。将扩增的DNA片段克隆到pCR2.1T载体中,进行测序,并对同源的核苷酸序列分析、比较。结果　从体外培养的墨西哥利什曼原虫WR972株提取基因组DNA,以无鞭毛体蛋白基因特异性引物进行PCR扩增获得550bp的DNA片段。克隆到pCR2.1T载体片段进行的序列测定结果　表明,获得了墨西哥利什曼原虫的无鞭毛体蛋白编码基因片段,与亚马逊利什曼原虫的无鞭毛体蛋白基因之间具有高度的同源性。结论　实现了墨西哥利什曼原虫无鞭毛体蛋白基因的克隆化,为进一步研究其表达及作为疫苗研究的候选基因奠定了基础。     

杜氏利什曼原虫四川分离株无鞭毛体蛋白基因的克隆及真核表达

目的克隆、真核表达杜氏利什曼原虫四川株的无鞭毛体蛋白(amastin)编码基因。方法PCR扩增杜氏利什曼原虫四川汶川人株L．d．SC10H2与四川南坪犬株L．d．SC7的无鞭毛体蛋白基因,将该基因导入pcDNA3．1( ),构建真核表达重组质牲,转染NIH3T3细胞,采用免疫荧光法鉴定重组质粒的瞬时表达;RT-PCR和Western blotting鉴定稳定表达,结果2株杜氏利什曼原虫均扩增出552 bp的无鞭毛体蛋白基因。同源性为86％。转染后在NIH3T3细胞膜和细胞内观察到较强的绿色荧光,表明无鞭毛体蛋白基因在NIH3T3细胞中获得短暂表达。细胞裂解产物经Western blotting,在相对分子质量(Mr)约20000处检测到阳性杂交信号,表明无鞭毛体蛋白基因在NIH3T3细胞内获得了稳定表达。结论获得了我国杜氏利什曼原虫四川分离株L．d．SC10H2和L．d．SC7的无鞭毛体蛋白基因序列,并在NIH3T3细胞中稳定表达。     

杜氏利什曼原虫中国山丘疫区分离株磷脂多糖1(LPG1)基因及两侧非编码区序列的获取及分析

通过PCR技术获得杜氏利什曼原虫中国山丘疫区分离株磷脂多糖1(LPG1)基因上游序列约2.2 kb,对该序列测序,根据测得序列设计引物,以染色体步移技术获得该序列下游约2 kb的核苷酸序列。将上述所获的2个序列拼接获得杜氏利什曼原虫中国山丘疫区分离株LPG1基因及其两侧非编码区核苷酸序列4 121 bp(GenBank登录号为HMO27899)。该序列与GenBank中相关序列进行序列一致性分析,结果显示,LPG1基因与多种利什曼原虫LPG1基因的核苷酸序列一致性为72%～78%。     

硕大利什曼原虫无鞭毛体蛋白的基因克隆与序列分析

[目的 ]克隆硕大利什曼原虫无鞭毛体蛋白 (amastin)的编码基因序列。 [方法 ]应用核苷酸序列数据库 (GenBank)和表达序列末端片段数据库 (dbEST)的计算机检索与DNA文库的杂交筛选方法。 [结果 ]从dbEST数据库中获得一段 30 9nt的来源于硕大利什曼原虫的基因片段 ,据此设计探针 ,筛选硕大利什曼原虫的DNA文库 ,获得硕大利什曼原虫无鞭毛体蛋白的编码基因。其开放读码框架由 5 5 2个核苷酸组成 ,编码产物由183个氨基酸残基组成。序列分析表明 ,硕大利什曼原虫与锥虫无鞭毛体蛋白一级结构的同源性为 2 3 5 %。 [结论 ]克隆的基因系硕大利什曼原虫表面蛋白编码基因 ,即无鞭毛体蛋白的编码基因。     

利什曼原虫无鞭毛体蛋白的基因克隆化与序列分析

目的 克隆4株利什曼原虫表面无鞭毛体蛋白（amastin）的编码基因,并进行序列分析。方法 根据锥虫（T.cruzi)与利什曼原虫亲缘关系相近的原则,首先以锥虫无鞭毛体蛋白的基因为参考。对GenBank中的dbFST数据库检索,获得硕大利什曼原虫（L.major)一段309核苷酸片段,根据其序列合成探针,对硕大利什曼原虫基因组DNA文库筛选,首先获得硕大利什曼原虫无鞭毛体蛋白编码基因,再以硕大利什曼原虫无鞭 毛体蛋白编码 基因序列为依据,合成特异性引物,以多聚酶链反应（PCR）扩增获得亚马逊利会曼原虫（L.ama.)、巴西利什曼原虫（L.bra.)和墨西哥利什曼原虫（L.mex.)的无鞭毛体蛋白基因。结果 克隆了4株利什曼原虫无鞭毛体蛋白编码的基因。均为国际上首次克隆化基因,已被美国GenBank收录。结论 实现了4株利什曼原虫无鞭毛体 蛋白编码基因的克隆化。     

Evolution of the genus Leishmania as revealed by comparisons of nuclear DNA restriction fragment patterns.

Restriction endonuclease DNA fragment patterns have been used to examine the relationships among 28 isolates of Leishmania as well as Crithidia, Endotrypanum, and Trypanosoma cruzi. Fragments of nuclear DNA were generated with six restriction enzymes, and blots were hybridized with probes from three loci. Among the major lineages the fragment patterns are essentially completely different, while within the major lineages various degrees of divergence are found. Molecular evolutionary trees were constructed using the method of Nei and Li to estimate the percent nucleotide sequence divergence among strains from the fraction of fragments shared. Defined groups, such as species or subspecies within the major lineages, are also grouped by nuclear DNA comparisons. Within the donovani complex, we find Leishmania donovani chagasi and Leishmania donovani infantum to be as similar as strains within Leishmania donovani donovani, consistent with the proposal by other workers that New World visceral leishmaniasis originated quite recently.     

Acquisition and analysis of lipophosphonoglycan 1 gene and the noncoding region of Leishmania donovani isolates from hilly foci of China

A fragment about 2.2 kb located at upstream of lipophosphonoglycan 1 (LPG1) gene of Leishmania donovani isolate from hilly foci of China was obtained by PCR. The nucleotide sequence of the fragment was determined by sequencing. The sequence of the LPG1 gene and its downstream fragment (about 2 kb) was determined by using genome walking method. The above two fragment splicing result showed that the nucleotide sequence of the LPG1 gene with the noncoding region was 4 121 bp (GenBank accession number: HMO27899). The BLAST results showed that the LPG1 gene of L. donovani isolate from hilly foci of China had 72%-78% nucleotide identity compared to that of other Leishmania spp. in GenBank.     

墨西哥利什曼原虫无鞭毛体蛋白的基因克隆化与序列分析

目的 克隆墨西哥利什曼原虫（Ｌ．ｍｅｘ）ＷＲ９７２株的无鞭毛体蛋白（ａｍａｓｔｉｎ）的编码基因,并对其同源核苷酸序列进行分析。方法 根据已克隆的亚马逊利什曼原虫无鞭毛体蛋白的编码基因序列,设计并合成成无鞭毛体蛋白基因特异性引物,以墨西哥利什曼原虫ＷＲ９７２株的基因组ＤＮＡ作为模板,进行多聚酶链反应（ＰＣＲ）扩增。将扩增的ＤＮＡ片段克隆到ｐＣＲ２．１Ｔ载体中,进行测序,并对同源的核苷酸序列分析、比较     

Characterization of Leishmania chagasi DNA topoisomerase II: a potential chemotherapeutic target

DNA topoisomerase II (topo II), an enzyme essential for cellular replication, is an eminent target for antimicrobial therapy against Leishmania chagasi, the major cause of visceral leishmaniasis in Latin America. The complete L. chagasi (Lch) TOP2 gene, encoding L. chagasi topo II, was isolated from genomic DNA using the polymerase chain reaction. The LchTOP2 gene revealed an open reading frame (ORF) of 3,711 base pairs predicting a protein with 1,236 amino acids and an estimated molecular weight of 140 kDA. The L. chagasi topo II sequence had high identity with the L. donovani topo II (98.8%) and L. infantum topo II (98.7%), followed by Crithidia fasciculata topo II (84.4%), Trypanosoma cruzi topo II (67.6%) and Trypanosoma brucei topo II (66.6%). Lch topo II had low identity with the human homologs htopo II alpha (26.3%) and htopo II beta (26.4%). Differences between L. chagasi TOP2 and human TOP2 genes suggest that leishmanial topo II is a potential target for the development of new antileishmanial agents.     

Restriction endonuclease analysis of Leishmania kinetoplast DNA characterizes parasites responsible for visceral and cutaneous disease

The kinetoplast DNA (kDNA) from promastigotes of Leishmania responsible for Old and New World cutaneous and visceral disease was characterized to determine if species and strains causing similar or different diseases could be identified. Restriction enzymes were used to digest kDNA into fragments that were separated into characteristic banding patterns after electrophoresis in agarose or linear gradient polyacrylamide gels. Hybridization was conducted with a 32P-kDNA probe and kDNA fragments transferred from agarose gels to nitrocellulose paper. Leishmania species causing cutaneous diseases in the New and Old Worlds all had different kDNA digest patterns. Visceralizing Leishmania from the New and Old Worlds also had different kDNA restriction fragment patterns although Leishmania donovani parasites with similar fragment patterns were isolated from several humans from central Kenya. Nucleotide sequences were shared among kDNA networks from L. donovani, Leishmania d. chagasi, Leishmania d. infantum, Leishmania tropica, and Leishmania major as determined by hybridization with a 32P-kDNA probe from L. donovani. However, no hybridization was detected between the L. donovani 32P-kDNA probe and kDNA from Leishmania aethiopica or Leishmania braziliensis panamensis. Leishmania characterization results for the same isolates from the published literature were compared and kinetoplast DNA analysis was found to be one of the most sensitive procedures for species and strain identification.     

利什曼原虫K26序列应用于我国利什曼原虫分离株鉴定的价值分析

目的评价利什曼原虫K26序列应用于我国利什曼原虫分离株鉴定的价值。方法收集我国不同流行区的利什曼原虫16个分离株和6个国际参照株,培养后收集前鞭毛体,提取DNA,扩增K26序列并测序,应用ClustalX2进行序列比对,从GenBank下载同源性较高的利什曼原虫分离株的K26序列,构建系统进化树,分析我国不同流行区的利什曼原虫分离株的亲缘关系。结果我国16个利什曼原虫分离株和国际参照株DD8均扩增出单一条带,而5个非杜氏利什曼原虫复合体虫株均未扩增出任何条带。序列分析结果表明,我国人源型利什曼病流行区的3个分离株801、KS-2和KS-6均扩增出920 bp片段,自然疫源型利什曼病流行区的4个分离株XJ771、JIASHI-1、JIASHI-2和JIASHI-5均扩增出491 bp片段,人犬共患型利什曼病流行区4个分离株Cy、SC6、Hebei-Lv和Shanxi-Yang均扩增出404 bp片段,皮肤利什曼病流行区的5个分离株KXG-Xu、KXG-Liu、KXG-65、KXG-918和KXG-927均扩增出449 bp片段,且各流行区内虫株间的序列一致性均为100%。各流行区之间的虫株间的序列一致性较低,为40.2%~91.4%。系统进化树分析结果显示,我国16个利什曼原虫分离株聚集成2个群3个亚群,其中KXG-Xu、KXG-Liu、KXG-65、KXG-918、KXG-927、XJ771、JIASHI-1、JIASHI-2、JIASHI-5分离株聚集为A亚群,Cy、SC6、Hebei-Lv、Shanxi-Yang与婴儿利什曼原虫聚集为B亚群,A亚群和B亚群聚集为Ⅰ群;801、KS-2和KS-6分离株与杜氏利什曼原虫聚集为C亚群,进一步与国际参照株DD8聚集为Ⅱ群。结论利什曼原虫K26序列可应用于我国利什曼原虫分离株的鉴定。