基于iTRAQ技术卵巢癌铂耐药的蛋白质组学分析

目的 研究卵巢癌化疗铂耐药的蛋白质表达,探寻卵巢癌铂耐药的相关生物标志物及新的治疗靶标。方法 收集2019年1月至2022年12月在莆田市第一医院住院卵巢癌化疗铂敏感与铂耐药患者各20例,应用同位素标记相对和绝对定量(i TRAQ)技术联用液相色谱分离、质谱鉴定（LC-MS/MS）卵巢癌铂敏感组与铂耐药组的血浆蛋白质,筛选表达差异蛋白质。结果 共鉴定蛋白质477个,铂耐药组与铂敏感组比较分析表达差异蛋白质点10个,其中上调的有FUCA1、SOD3、PROZ,下调的有KRT14、KRT6B、KRT2、KRT17、GPLD1、MMRN2、LYVE1, GO富集分析生物学过程包括磷脂酰肌醇代谢、糖胺聚糖分解代谢、中间丝组织、血管生成、细胞角化,KEGG富集主要参与的通路有聚糖降解、磷脂酰肌醇合成、雌激素、溶酶体。结论 10个差异表达蛋白可能与卵巢癌化疗铂耐药相关,有望成为卵巢癌铂耐药新的生物标志物或治疗靶标。     

24 h 快速眼动睡眠剥夺大鼠血清的蛋白质组学初步研究

摘要： 目的 探讨睡眠剥夺大鼠血清蛋白质组中差异表达蛋白质及其意义。方法 采用改良多平台水环境法 建立 24 h 快速眼动睡眠剥夺大鼠模型。采用随机数字表法将大鼠均分为模型（M）组、 模型对照（MC）组、 空白对照 （BC） 组, 每组 8 只大鼠。观察大鼠体质量变化, 采用 Morris 水迷宫实验检测睡眠剥夺对大鼠学习记忆能力的影响, 并用双向电泳技术筛选血清差异蛋白, LC-MS/MS 技术鉴定差异蛋白。结果 BC 组和 MC 组大鼠建模前后体质量 差异均无统计学意义。M 组大鼠毛发光泽下降, 精神稍差, 较亢奋, 体质量在睡眠剥夺后显著降低。24 h 快速眼动 睡眠剥夺对大鼠学习记忆能力无显著性影响。各组之间蛋白质点数目差异无统计学意义。质谱鉴定出 4 种表达下 降的蛋白, 分别为 Serotransferrin; Glutathione peroxidase 3; Ig kappa chain C region, B allele; Collagen alpha-2(I) chain。 结论 短期睡眠剥夺对机体的损伤可能与铁离子代谢、 氧化应激和免疫功能等有关     

利用iTRAQ技术对2型糖尿病模型大鼠与正常大鼠的肝脏进行比较蛋白质组学研究

目的：研究2型糖尿病模型大鼠与正常大鼠肝脏蛋白表达差异。方法：采用相对和绝对定量同位素标记法（iTRAQ）进行比较蛋白质组学研究。结果：检测到模型组和空白对照组有161个蛋白差异,其中上调的61种,下调的100种。结论：iTRAQ法可以比较2型糖尿病模型大鼠与正常大鼠的肝脏蛋白表达的差异,为后续研究打下基础。     

低砷染毒大鼠肾脏蛋白质组学研究

目的对低剂量砷暴露大鼠肾脏进行蛋白质组学研究,探讨早期砷暴露的生物学标志物。方法选取健康雄性SD大鼠48只,按体质量随机分为4组,每组12只,即对照组(0μg/L),低剂量染毒组(50μg/L),中剂量染毒组(150μg/L),高剂量染毒组(450μg/L)。染毒4周后处死大鼠,取其肾脏运用蛋白质组学技术(双向凝胶电泳)分离蛋白,凝胶经扫描后用Pdquest图形分析软件对2-DE图谱进行了分析,鉴定染毒SD大鼠和正常SD大鼠肾脏蛋白质的差异表达。结果定性分析发现,与对照组比较,低剂量组新出现了2个蛋白质点,消失了4个蛋白质点;中剂量组新出现了4个蛋白质点,消失了3个蛋白质点;高剂量组新出现了3个蛋白质点,消失了7个蛋白质点。定量分析发现,与对照组比较,低剂量组表达量升高的蛋白质点有4个,降低的有4个;中剂量组表达量升高的蛋白质点有11个,降低的有2个;高剂量组表达量升高的蛋白质点有3个,降低的有4个。结论低砷染毒导致大鼠肾组织中蛋白质差异表达,这些蛋白质可能与砷暴露的毒性作用有关。     

酒精诱发大鼠肝损伤的分子机制与蛋白质组学研究

目的 探讨参与酒精性肝损伤病理生理过程的分子机制.方法 采用双向电泳技术结合生物信息学分析方法,对造模成功的酒精性肝损伤模型大鼠及正常对照组大鼠的肝匀浆全蛋白进行比较蛋白质组学分析.结果 获得了7个有明显规律性变化的差异表达蛋白点,其中一个蛋白点表达量有所升高,6个差异蛋白点表现为明显下调趋势.结论 研究发现的这些差异表达蛋白质可能直接或间接参与了酒精性肝损伤病理生理过程的分子机制.     

挤压综合征的护理体会

挤压综合征在矿山是极易发生的,与工作场所有密切关系,此病危害生命的因素比较多[1]。2003-2005年我科收治挤压综合征患者10例,采取了多指标连续监测的方法,取得了较好的效果,现将护理体会报道如下。     

基于双向电泳技术的体液蛋白质组学研究进展

目前 ,蛋白质组技术被大量应用于临床和生物学研究各个领域 ,其中的大部分研究都在双向电泳技术的支持下展开。体液样品 (包括血浆、脑脊液、尿液等 )蛋白质的全面分析主要依赖于蛋白质组学分析。本文综述了基于双向电泳技术的体液蛋白质组学研究中样品制备、生物标志物探索、药物效应评价和化合物毒性分析等方面的研究进展     

基于基因组学和蛋白质组学的疟疾疫苗

疫苗学研究受益于新的生物信息学技术。疟原虫的完整基因组序列已经被破译,因此当前的疫苗研究可以指向传统疫苗研究未能发现的特异基因产物。疫苗发展的先进技术,诸如基因组序列分析、微阵列、蛋白质组学方法、高通量克隆、生物信息学数据库工具及计算疫苗学,可被用于开发包括疟疾在内的各种疾病的疫苗。疟疾基因组学、蛋白质组学和及免疫组学的新进展也将促进疟疾疫苗的成功研发。     

严重创伤病人并发挤压综合征的护理

目的:探讨挤压综合征的护理措施.方法:回顾总结12例挤压综合征病人所采取的针对性护理措施,加强脏器功能的保护,减少相对并发症的发生,促进病人早日康复.结果:治愈11例,死亡1例.结论:采取针对性的护理措施可以大大促进挤压综合征的康复,降低死亡率.     

基于液质联用蛋白质组学技术的阿尔茨海默病血清生物标志物及生物信息学研究

为了寻找有效的阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)血液生物标志物,本研究采用非标记液相色谱-串联质谱技术对AD患者和健康对照受试者(healthy control subjects, HC)的血清进行比较蛋白质组学分析,成功鉴定到387个蛋白,其中61个蛋白是显著变化的。基因本体(gene ontology, GO)富集分析结果显示,一些与AD发病有关的GO功能条目在差异蛋白中显著富集,包括胆固醇和脂质代谢、炎症反应、凝血和止血过程以及免疫反应等生物学过程。因此,根据上述结果和蛋白在8个比较组中含量变化的一致性程度,共选取了18个蛋白作为AD候选生物标志物。蛋白-蛋白相互作用结果提示这18个蛋白与淀粉样β(A4)前体蛋白[amyloid beta (A4) precursor protein,APP]都具有直接或间接的作用,因此,推测这些蛋白表达水平或功能的改变可能会影响淀粉样蛋白(amyloid-β,Aβ)代谢和参与AD的发生,具有成为AD血液生物标志物的潜能。     

基于蛋白质组学分析奈比洛尔改善UUO大鼠肾间质纤维化

目的:观察奈比洛尔改善单侧输尿管梗阻(UUO)大鼠肾间质纤维化(RIF)的作用,并利用蛋白质组学探讨其机制。方法:SD大鼠分为：Sham组;UUO组;Neb组(UUO大鼠给予奈比洛尔10 mg·kg^-1·d^-1,i.g.)。各组分别在造模7 d, 14 d和21 d时,麻醉大鼠,分离左侧梗阻肾。HE染色观察肾脏结构,Masson染色测RIF程度。利用蛋白质组学筛选造模21 d, UUO/Sham和Neb/UUO之间共有,且奈比洛尔回调差异蛋白,进行生物信息学分析。Western blot验证关键蛋白表达。结果:与Sham组比较,UUO大鼠RIF呈渐进性加重。奈比洛尔给药21 d显著改善UUO大鼠左肾RIF。与UUO/Sham比较,奈比洛尔回调差异蛋白179个。KEGG富集分析和PPI网络显示,回调差异蛋白主要涉及剪接体通路。Western blot证实Rbm8a、Srsf9、Sart1蛋白表达与蛋白组学结果一致。结论:奈比洛尔改善UUO大鼠肾间质纤维化可能与调节剪接体密切相关。     

氯丙嗪致大鼠肝脏损伤的蛋白质组学研究*

目的:应用蛋白质组学技术研究氯丙嗪致大鼠肝脏损伤时肝脏蛋白质表达谱的变化,为从分子水平上阐明氯丙嗪毒性机制奠定基础。方法:18只雄性SD大鼠随机分成溶剂对照组、氯丙嗪37.5和75.0 mg.kg-1组,每组6只。单次给药,24 h后采集血液测定生化指标,之后处死大鼠,取肝脏做组织病理检查和提取肝脏总蛋白质。应用蛋白质组学技术分离和鉴定肝损伤大鼠与溶剂对照组大鼠之间的差异蛋白质。结果:发现9个差异有统计学意义的蛋白质点,鉴定出8个蛋白,其中,肝损伤大鼠组葡萄糖调节蛋白58、支链α-酮酸脱氢酶、儿茶酚邻位甲基转移酶、载脂蛋白A-I、碳酸酐酶3和过氧还蛋白Ⅰ表达下降,调钙素和微管蛋白表达上升。结论:氯丙嗪可能造成大鼠肝细胞钙离子浓度紊乱,肝脏抗氧化系统、能量代谢、胆固醇代谢等异常。     

基于蛋白质组学的中医药防治脑卒中应用研究进展

脑卒中具有致残率、致死率、复发率高的特点,是世界范围的公共卫生问题。目前,主要基于患者临床症状、体征及影像学检查等对脑卒中进行诊断,效果相对有限;脑卒中治疗药物研究也需寻找新方法、新技术的参与,为其提供物质解释。中医药在防治脑卒中方面具有独特优势,且随着现代中医的发展,干预方法逐渐丰富,基础研究日渐深入。蛋白质组学能够动态、整体和定量地考察疾病发生、发展过程中蛋白质种类和数量的改变,在中医药防治脑卒中方面取得了很大的进展,可能为脑卒中的预防、诊断及治疗提供新思路。有利于推进精准医学的发展和人民健康水平的提高。因此,本文将对蛋白质组学在揭示脑卒中发病机制、诊断及应用于中医药治疗脑卒中的情况作一简要综述。     

血液系统疾病的蛋白质组学研究

随着人类基因组计划的完成和后基因时代的到来,蛋白质组学研究已成为生命科学重点研究方向之一。直接运用蛋白质组学分析将对不明发病机制的疾病研究有较大突破,并对新的治疗方法、诊断技术和新的药物靶点提供直接线索。由于蛋白质翻译调控和翻译后修饰的存在,蛋白质组学能弥补基因组学和转录组学的缺陷,提供比基因组学更多的信息,直接揭示基因的功能。本文拟将蛋白质组学及其在血液病研究中的有关技术和研究进展综述如下。     

利用蛋白质组学技术研究Z24对大鼠给药肝脏蛋白质表达的改变

目的利用2-DE-MAIDI-TOF MS/MS技术研究Z24对大鼠给药肝脏蛋白质表达的改变,探索Z24对大鼠肝毒性的作用机制。方法雌性Wistar大鼠,每组6只,以不同剂量Z24(0、50、100和200mg/(kg.d))连续5d灌胃给药后处死动物,一部分做病理检查,一部分用于蛋白质组分析。考马斯亮蓝R-250染色,Image Master 2D Platinum5.0软件进行图像分析,确定发生表达变化的差异蛋白点(P<0.05),选取分离好且呈一定剂量关系的蛋白点进行质谱鉴定,MS/MS-MS方法获取差异蛋白的肽质量指纹图谱和序列信息,在IPI-RATv3.23数据库中进行搜索,以C.I.%>95%作为判断依据鉴定差异蛋白,检索差异蛋白的生物学功能,分析Z24肝毒性的作用机制。结果血浆生化检测结果显示,与对照组相比,50mg/kg组ALP、Tch含量升高(P<0.05),100mg/kg组ALP、TG和Tch含量升高(P<0.05),200mg/kg组ALT、AST、ALP、AL、TBI、TG和Tch含量升高(P<0.05);AST、ALP、TBI和Tch含量变化呈剂量-效应关系。肝组织病理结果显示,各给药组动物肝脏均发生了不同程度的肝细胞空泡变性及纤维组织增生,且病变程度随剂量增加而加重。以上结果表明本实验剂量下Z24已引起了大鼠肝损伤。2-DE结果显示,与对照组相比,50、100和200mg/kg组分别有101、115和139个蛋白点发生明显的表达改变(P<0.05),其中100和200mg/kg组同时改变的有28个,50、100和200mg/kg组同时改变的有29个;对其中的31个差异点进行了质谱分析,共鉴定出22种蛋白,其中下调的有烯醇基辅酶A水解酶、丙酰辅酶A羧化酶α链、甘油-3-磷酸脱氢酶1、支链酮酸脱氢酶E1、二氢硫辛酰胺脱氢酶、甘氨酸N-甲基转移酶、3-α-羟化类固醇脱氢酶、电子转移黄素蛋白脱氢酶、ATP合酶D链、醛脱氢酶和硒结合蛋白2等,上调的有谷胱甘肽S-转移酶等。结论支链酮酸脱氢酶E1和二氢硫辛酰胺脱氢酶是α-酮酸脱氢酶复合体成分,参与糖有氧氧化;烯醇基辅酶A水解酶参与脂肪酸β氧化;甘氨酸N-甲基转移酶参与甲硫氨酸循环;电子转移黄素蛋白脱氢酶和ATP合酶与能量代谢有关;醛脱氢酶和谷胱甘肽S-转移酶等与生物转化有关,这些蛋白表达的改变提示Z24肝毒性作用与糖代谢、脂类代谢、氨基酸代谢、能量代谢紊乱有关。     

挤压综合征伴急性肾损伤的救治

地震后很多患者出现严重的肾脏问题,除了照料常规透析患者,急性肾损伤（AK I）患者是肾脏病工作者需要预防和治疗的主要问题。因为在大地震中受伤的患者人数远高于其他自然灾害,挤压综合征被认定为地震后造成AK I的最主要的原因。各种原因引起的高钾是另外一个需要肾脏病学家处理的问题,高钾血症是需要透析和死亡的显著预测因素。强烈地震灾害所造成的严重挤压伤发生率一般估计约为3%~5%,由于强烈地震可使成千上万人受伤,     

老龄大鼠膀胱生理特性改变的实验研究

目的：探讨老龄大鼠膀胱生理特性的改变及其可能机制。方法：雌性Wistar大鼠分为年轻成年组（6月龄）和老龄组（24月龄），通过在体充盈期膀胱测压，判定逼尿肌不稳定的发生率，比较两组最大膀胱容量和漏尿点压的差异；在水浴条件下，分别测量两组新鲜逼尿肌条的自发收缩频率、应力作用下的反应张力、对电刺激的反应强度等指标，并对实验结果进行统计学分析。结果：与年轻成年组相比，老龄大鼠表现为更易出现逼尿肌不稳定；麻醉条件下最大膀胱容量显著增加（P〈0．01），漏尿点压无明显差异；自发收缩频率显著增高（P〈0．05）。老龄大鼠逼尿肌条在应力增加时，张力上升缓慢；应力降低时，张力下降迅速。应力改变时电刺激诱发收缩表现为与单纯应力改变时的张力改变相似，张力增加值在两组问无差异。结论：老龄膀胱功能的改变与自身逼尿肌兴奋性增加、高顺应性、弹性降低有关，肌源性改变是其主要因素。     

抑郁大鼠海马组织的比较蛋白质组学研究

目的比较慢性不可预见性温和应激(chronic unpredictable mild stress,CUMS)大鼠与健康大鼠的海马组织,筛选差异表达蛋白质。以期从蛋白质组学角度阐明其发病机制,并为寻找生物标志物提供靶标。方法采用CUMS建立大鼠抑郁模型。运用8标ITRAQ技术,结合2D LC-MS/MS分析CUMS大鼠与健康大鼠的海马组织差异表达蛋白质。结果共鉴定出5 109个蛋白,差异蛋白33个,其中8个蛋白表达上调,25个蛋白表达下调。结论 ITRAQ结合LCMS/MS技术能快速有效地进行蛋白质组学研究,为我们研究抑郁症的发生、发展机制以及发现新的生物标志物提供了有力平台。     

硫辛酸抗神经细胞老化的蛋白质组学分析

目的研究硫辛酸在神经细胞老化过程中对细胞保护作用的蛋白质分子基础。方法采用无血清培养神经母细胞瘤细胞方法建立实验性神经细胞老化模型。设立硫辛酸（IA）作用组和对照组,运用蛋白质组学技术平台,采用双向电泳结合基质辅助激光电离-飞行时间质谱技术分析,并鉴定表达受到硫辛酸调控的蛋白。结果经蛋白质组学技术分析,发现硫辛酸能阻止19个蛋白在老化过程中表达改变,成功鉴定出其中5个蛋白,其中STMN1、TPM4、SERB和PARK7在老化过程中表达下降,DLDH在老化过程中表达上升。结论硫辛酸抗老化保护神经细胞的作用机制涉及到对STMN1、TPM4、SERB、PARK7和DLDH等蛋白的调控。