基于网络药理学探讨清肠化湿方治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的:运用网络药理学方法探讨清肠化湿方治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的作用靶点与信号通路,从而解释其治疗湿热型UC的分子作用机制.方法:应用中药系统药理学技术平台(TCMSP)筛选清肠化湿方的潜在活性成分(OB≥30％,DL≥0.18)及作用靶点.利用Cytoscape软件,通过TCMS...     

基于网络药理学分析附子-干姜药对治疗溃疡性结肠炎作用机制

目的 运用网络药理学方法探讨附子-千姜药对治疗溃疡性结肠炎的作用机制.方法 检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),筛选附子-干姜药对活性成分;通过UniProt数据库获取活性成分的可能作用靶点;采用GeneCards数据库获取溃疡性结肠炎疾病靶点;采用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网...     

基于网络药理学探讨左金丸治疗功能性消化不良作用机制

目的 基于网络药理学分析左金丸治疗功能性消化不良（FD）的作用靶点和分子机制。方法 检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获得左金丸的有效成分及作用靶点,检索GeneCards数据库获取FD的疾病靶点,并使用韦恩图获取药物与疾病的共同靶点。采用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析,使用Cytoscape 3.7.1进行PPI网络拓扑分析。使用Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析。采用Cytoscape 3.7.1构建“药物-有效成分-关键靶点-通路”网络。结果 获得左金丸33个有效成分,作用靶点203个,其关键有效成分为槲皮素、异鼠李素、β-谷甾醇、吴茱萸次碱、氢化小檗碱等,关键靶点为AKT1、TP53、TNF、IL6、VEGFA。GO功能富集到1 989个条目,KEGG通路富集到202条通路,主要包括癌症通路、脂质与动脉粥样硬化、PI3K-Akt信号通路、乙型肝炎等。结论 左金丸治疗FD具有多成分、多靶点、多通路的特点,通过调控AKT1、TP53、TNF、IL6、VEGFA等核心靶点和PI3K-Akt信号通路等,发挥抗凋亡、抗炎、...     

基于网络药理学研究葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎的分子作用机制

目的:通过网络药理学方法探讨葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎的具体分子机制.方法:通过TCMSP、BATMAN-TCM数据库对葛根芩连汤主要成分及潜在作用靶点进行收集.从DisGeNET数据库中寻找与溃疡性结肠炎相关的疾病基因与潜在靶点进行映射,得出该方治疗溃疡性结肠炎的最终作用靶标.将最终靶标输入STRING数据库得出"蛋白-蛋白"相互作用关系,并用Cytoscape软件进行可视化.输入DAVID数据库进行GO、KEGG PATHWAY富集,得出其可能作用的分子机制并构建"成分-靶标-信号通路"网络图.结果:通过网络药理学预测后发现,葛根芩连汤中有127个有效成分可用于治疗溃疡性结肠炎,其中涉及155个靶基因及包括TNF、NF-kB、HIF-1等在内的22个信号通路.结论:从网络药理学角度初步揭示了其治疗溃疡性结肠炎的分子机制,为后续的研究提供了基础.     

基于网络药理学的左金丸治疗胃癌作用机制研究

目的基于网络药理学方法探讨左金丸治疗胃癌的作用机制。方法利用TCMSP数据库获得左金丸所含中药的化学成分及对应作用靶点基因,检索GeneCards和OMIM数据库获得疾病胃癌相关靶点基因,然后取两者的交集,得到左金丸作用于胃癌的预测靶基因;利用Cytoscape 3.7.1软件构建左金丸化合物-作用靶点-疾病三者相互关系网络,采用STRING数据库对左金丸作用于胃癌的预测靶基因进行蛋白互作网络分析,利用Cytoscape3.7.1软件的插件cytohubba筛选出关键靶基因,并利用ONCOMINE数据库分析关键靶基因在胃癌中的表达情况;利用在线工具DAVID进行GO功能富集分析并利用Cytoscape3.7.1软件的ClueGO插件进行KEGG通路富集分析。结果共筛选出左金丸作用于胃癌的预测靶基因68个,关键靶基因15个,这些关键基因在ONCOMINE数据库的胃癌样本和正常样本中的表达存在显著性差异。GO功能富集分析显示,左金丸作用于胃癌的预测靶基因主要涉及对有机物质的反应、细胞凋亡的负调控、细胞程序性死亡的负调控等生物过程;KEGG通路富集分析主要涉及癌症通路、p53信号通路、VEGF信号通路等。结论本研究初步揭示了左金丸治疗胃癌的主要作用靶点及多靶点、多维调控、协同作用、整体调节的作用机制,可为后续进一步深入研究其作用机制提供参考。     

基于网络药理学预测白藜芦醇治疗溃疡性结肠炎靶点与分子机制

目的：运用网络药理学方法探寻白藜芦醇治疗溃疡性结肠炎的关键靶点及分子作用机制。方法：通过SwissTargetPrediction数据库查找白藜芦醇的作用靶点;采用GeneCards数据库搜索溃疡性结肠炎的相关蛋白。将白藜芦醇作用靶点和溃疡性结肠炎靶点取交集,即为白藜芦醇治疗溃疡性结肠炎潜在靶点。采用STRING数据库找出靶点的作用关系,使用Cytoscape 3.9.2软件筛选核心靶点。使用基因微生信网站进行GO与KEGG通路富集分析,以Cytoscape3.9.2软件构建“成分-靶点-通路”网络。使用SwissDock进行分子对接。结果：从SwissTargetPrediction得到69个白藜芦醇作用靶点,GeneCards数据库得到的533个溃疡性结肠炎相关靶点,两者取交集后共得到22个白藜芦醇抗溃疡性结肠炎的作用靶点。在蛋白相互作用网络中EGFR、SRC、MMP9、MMP2处于核心位置。在GO富集分析和KEGG通路分析中,EGFR、SRC、MMP9、MMP2均存在于内分泌抵抗、松弛素信号通路、雌激素信号通路中。分子对接结果显示,白藜芦醇与核心靶点均有较强的相互作用。结论：白藜...     

基于网络药理学探讨真人养脏汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的 应用网络药理学方法探讨真人养脏汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制。方法 利用TCMSP数据库及相关文献筛选真人养脏汤的活性成分及对应靶点,通过GEO、Dis Ge NET、GeneCards、PharmGKB、DrugBank数据库获取与溃疡性结肠炎相关的靶点,并获取药物与疾病的交集靶点,通过STRING数据库和R语言对交集靶点进行蛋白相互作用分析和富集分析,借助Cytoscape3.7.2软件筛选关键靶点和关键成分,然后通过AutoDock软件进行分子对接验证。结果 共筛选出活性成分82个,包括山柰酚、人参皂苷rh2、柯里拉京、甘草查尔酮A、鞣花酸、芒柄花黄素、人参皂苷rf、油酸、玫瑰树碱、肉桂醛等,其作用主要涉及IL6、TNF、IL1B、CASP3、HMOX1、CASP8、CASP1等74个靶点,靶点主要与NF-кB、C型凝集素受体、Toll样受体、NOD样受体、EB病毒感染、人类巨细胞病毒感染、细胞凋亡等信号通路有关;分子对接结果显示关键成分与对应的关键靶点具有较强的结合活性。结论 真人养脏汤可能通过参与炎症、感染、细胞凋亡等相关信号通路及生物功能发挥治疗溃疡性结肠炎的作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨白及治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的:探讨中药白及治疗溃疡性结肠炎的潜在作用机制。方法:在中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCSMP)上获取白及的有效活性成分和作用靶点,通过GeneCards、OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、Disgent数据库中检索溃疡性结肠炎的疾病靶点,进一步获取药物和疾病的共同靶点,使用Cytoscape软件构建相关网络图,利用STRING数据库对供电靶点进行PPI分析并筛选出核心靶点,利用R语言进行GO和KEGG富集分析靶点的生物学过程和相关通路,最后针对核心靶点和关键成分进行分子对接。结果:筛选得到9个活性成分,疾病靶点共1159个,通过拓扑分析得到核心靶点10个。GO富集分析得到BP、CC、MF条目共30条,KEGG富集分析得到相关信号通路20条。分子对接提示活性成分和核心靶点对接构想稳定。结论:白及治疗溃疡性结肠炎主要与抗炎、调节免疫、促进溃疡愈合等功能相关,作用机制主要涉及PI3K/Akt、Rap1、MAPK等信号通路。     

基于网络药理学和分子对接探讨葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制*

目的 应用网络药理学和分子对接探讨葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制。方法 TCMSP数据库中检索葛根芩连汤的活性成分及靶点。收集DrugBank、DisGeNET、TTD数据库中溃疡性结肠炎疾病靶点。应用Pubchem、Chem3D、PyMOL进行对接配体的构建，Autodock对受体蛋白处理，利用命令符（CMD vina）进行分子对接。应用DAVID进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果 葛根芩连汤作用于溃疡性结肠炎114个核心靶点，其中 MAPK3、MAPK1、STAT3、FOS、MAPK14等蛋白是重要作用靶点。橡黄素、山柰酚、汉黄芩素、柚皮素、黄芩素、甘草查尔酮A等是葛根芩连汤的主要活性成分，其可能作用于Cancer、PI3K-Akt、TNF、HIF-1、MAPK、Toll-like receptor、FoxO、Ras等信号通路，从而发挥抗炎、抗氧化损伤、控制细胞凋亡、抑制免疫、延缓肿瘤进展等作用。结论 葛根芩连汤可能通过多成分、多靶点网络作用于溃疡性结肠炎发挥抗炎、抗氧化损伤、延缓肿瘤进展等作用。     

基于网络药理学和分子对接研究白芍-防风治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的 采用网络药理学方法和分子对接探索白芍-防风治疗溃疡性结肠炎的作用机制。方法 借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索白芍-防风活性成分及作用靶点;利用GeneCards、OMIM、TTD数据库检索疾病相关基因,以Uniprot数据库对相关基因标准化;运用Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点-疾病网络图;用STRING数据分析蛋白相互作用(PPI);应用DAVID数据库对关键靶基因进行GO与KEGG富集分析;用AutoDock和Pymol将核心有效成分β-谷甾醇、山柰酚、汉黄芩素与关键靶标进行分子对接。结果 白芍-防风药对共筛选出33种活性成分,潜在的药物靶标108个,与UC的交集靶点54个。其中山柰酚与UC交集基因数目27个、汉黄芩素27个、β-谷甾醇11个。白芍-防风药对与UC交集的核心靶点26个,主要作用于AKT1、IL6、TP53、MAPK8等基因,涉及NF-κB信号通路、PI3K-Ak信号通路和MAPK信号通路。结论 白芍-防风可能通过山柰酚、β-谷甾醇和汉黄芩素等活性成分作用于多个炎症和免疫相关的分子靶点和信号通路治疗UC。     

香青兰提取物治疗溃疡性结肠炎的网络药理学分析

目的:基于网络药理学探讨香青兰提取物治疗溃疡性结肠炎的作用机制。方法:利用数据库收集香青兰提取物和溃疡性结肠炎的靶基因,通过蛋白质互作网络(Protein-Protein Interaction Networks, PPI)网络分析以及中心网络拓扑筛选,对靶基因进行基因本体论(GO)功能富集分析、《京都基因与基因组百科全书》(KEGG)通路富集分析。结果:通过检索数据库共获得172个香青兰提取物活性成分治疗溃疡性结肠炎的潜在靶点,同时,利用PPI网络分析筛选出了关键治疗基因,并对蛋白质群进行了生物学功能注释,此外,KEGG通路富集分析表明香青兰提取物治疗溃疡性结肠炎时涉及消化、免疫系统反应和炎症反应的多条相关通路。结论:香青兰提取物中的活性成分具有多种生物学功能,可作用于多条炎症、免疫及癌症相关通路,具有多成分、多靶点协同作用的特点。     

基于网络药理学探讨"白术-白芍"药对治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的:基于网络药理学,构建"药物-成分-基因-疾病"网络图,探讨中药药对"白术-白芍"治疗溃疡性结肠炎(UC)的关键靶点及作用机制.方法:通过中药系统药理学技术平台,自定义筛选条件:OB≥30％,DL≥0.18,筛选出"白术-白芍"的有效成分及潜在靶点;在Genecards及OMIM数据库中搜集UC的疾病靶点,并制作venny图寻找共同靶点,结合Cytoscape软件构建层次分明的网络图,借助STRING数据库绘制蛋白相互作用(PPI)网络,并对关键靶点进行进行GO及KEGG富集分析.结果:分析共筛选出"白芍-白术"药对主要成分有9种,与溃疡性结肠炎相关的靶点44个,GO富集分析得到74个生物学过程,KEGG富集分析得到121条通路,即药对的主要成分可以直接或通过121条信号通路间接作用于UC的相关受体靶点,从而产生治疗作用.结论:"白术-白芍"药对对难治病UC具有潜在的治疗作用,且该作用具有是靶点多样、通路复杂、层次分明的特点.本次研究实现了中药药物有效成分与疾病基因的有效对接,为中医药在UC治疗作用中提供依据,提高了依据的可信度与科学性.     

基于网络药理学的党参替代人参治疗溃疡性结肠炎的可行性研究

目的:利用网络药理学方法探究党参替代人参治疗溃疡性结肠炎的可行性。方法:利用YATCM数据库筛选人参、党参和白术化学成分并通过Swisstargetpredition数据库预测可能靶点；在Gene Cards、Drug Bank、Disgenet数据库中筛选疾病靶点，利用Venny在线软件分别获得党参-白术和人参-白术与溃疡性结肠炎(UC)的交集靶点，使用Metascape数据库进行京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集分析，利用STRING数据库和Cystoscope 3.8.2软件分别构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络和“通路-靶点-成分-药物”网络。结果:人参-白术与UC有93个交集靶点(RS组),党参-白术与UC有76个交集靶点(DS组),两组药对共同作用于TNF、AKT1、STAT3、VEGFA等核心靶点，通过细胞因子-细胞因子受体相互作用等关键KEGG通路和蛋白质磷酸化的正调控、激素水平的调节和对肽的反应等生物学过程对UC发...     

半夏泻心汤合左金丸治疗溃疡性结肠炎

目的 探讨半夏泻心汤合左金丸加减治疗寒热错杂型溃疡性结肠炎(UC)的临床效果.方法 选取寒热错杂型UC患者98例,随机数字表法分为观察组(n=49)、对照组(n=49).对照组予以常规治疗,观察组在常规治疗基础上予以半夏泻心汤合左金丸加减治疗.结果 观察组总有效率高于对照组(P<0.05);治疗后观察组内镜分级、中医证...     

白头翁汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制研究进展

溃疡性结肠炎由遗传、感染、外界及肠道环境等多种因素共同作用所致.白头翁汤及其主药白头翁的提取物具有防治溃疡性结肠炎的作用,其机制包括调节肠道免疫环境、抑制肿瘤生长、调节肠道微生态及保护黏膜屏障功能等.其相关研究为溃疡性结肠炎的临床治疗以及白头翁汤对溃疡性结肠炎作用机制的后续研究提供了理论依据和数据支持,也对中医药治疗溃...     

黄芩汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制研究进展*

动物实验及临床研究发现黄芩汤及其加减方在治疗溃疡性结肠炎方面具有显著的疗效。近年来,关于黄芩汤治疗溃疡性结肠炎作用机制的研究越来越多,多与免疫、信号通路、肠道菌群、氧化应激等途径有关。现主要从以上几个方面,就黄芩汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制研究进行以下综述,旨在为进一步研究黄芩汤治疗溃疡性结肠炎提供一定的理论依据和参考。     

基于网络药理学和体外细胞实验探讨芍药甘草汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的：利用网络药理学、差异基因分析、分子对接技术和体外细胞实验,探究芍药甘草汤（SYGCD）治疗溃疡性结肠炎（UC）的初步作用机制。方法：通过中药系统药理学分析平台（TCMSP）和文献检索,获取SYGCD中白芍和甘草的活性成分和作用靶点。从基因表达综合（GEO）数据库中筛选获得GSE47908芯片数据,绘制差异基因热图和火山图。运用Cytoscape软件构建SYGCD治疗UC分子基因网络图,借助Bisogenet和CytoNCA绘制核心靶点拓扑网络,使用R 3.6.3软件对差异基因进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析。采用分子对接解析活性成分与关键靶点的相互作用。采用RAW264.7巨噬细胞,通过MTT实验和RT-qPCR实验初步验证SYGCD的抗炎作用的相关靶点。结果：(1)获得SYGCD治疗UC的102个活性成分,主要为槲皮素、山柰酚、异鼠李素等,拓扑网络筛选出关键候选基因为过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)、诱导型一氧化氮合酶（NOS2）等。富集分析显示,与UC治疗相关的信号通路主要为白介素（IL）-17信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路等。(2)分子对接结果...     

中医药治疗溃疡性结肠炎机制研究进展

溃疡性结肠炎（UC）是一种病因尚不明确的直肠和结肠慢性非特异性炎症性肠病,以腹痛、腹泻、粘液脓血便、里急后重等为主要症状,属中医“久泻”、“久痢”、“肠风”等范畴。因其病因不明,发病环节多,缠绵难愈,易癌变,故被世界卫生组织列为现代难治病之一。